Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O13821

Protein Details
Accession O13821    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
225-256CYSLRTKPKGSKSRARNERKFHAKTRKTPSKPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
230-254TKPKGSKSRARNERKFHAKTRKTPS
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR017073  HGS/VPS27  
IPR003903  UIM_dom  
IPR002014  VHS_dom  
IPR000306  Znf_FYVE  
IPR017455  Znf_FYVE-rel  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0010008  C:endosome membrane  
GO:0033565  C:ESCRT-0 complex  
GO:0000329  C:fungal-type vacuole membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005628  C:prospore membrane  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0032266  F:phosphatidylinositol-3-phosphate binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0061659  F:ubiquitin-like protein ligase activity  
GO:0031321  P:ascospore-type prospore assembly  
GO:0120113  P:cytoplasm to vacuole transport by the NVT pathway  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0045324  P:late endosome to vacuole transport  
GO:0006623  P:protein targeting to vacuole  
GO:0043328  P:protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway  
KEGG spo:SPAC19A8.05c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01363  FYVE  
PF02809  UIM  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50330  UIM  
PS50179  VHS  
PS50178  ZF_FYVE  
CDD cd15735  FYVE_spVPS27p_like  
cd21385  GAT_Vps27  
cd16979  VHS_Vps27  
Amino Acid Sequences MSRWWNSNSQFASDIEKATSETLPAGSEEISLYLEISDQIRSKSVDPKFAMRILKSRIDHSNPNVQIMALKLTDTCVKNGGSGFLLEIASREFMDNLVSILRSPAGIDEDVKMVILRYIQSWALAVPDTNSPLSYIIHVYQNLKDGDYEFPEPSQNITSKFLDTETPPDWTDSEVCLRCRTPFTFTNRKHHCRNCGGVFCNQCSSKTLSLPHLGINQPVRVCDSCYSLRTKPKGSKSRARNERKFHAKTRKTPSKPVTNNEDEDIKRAIELSLKEMPQSREPPSYERPSEANVVISQDQHLTEDEDEELKRAIAISLEEAQKSSQKDDNVTAPNNMNISYPSVPAHTVSTDIRSSPFSGRPSDNPSTLISTADADNITLYATLVQKLKKLPPGSIFTEYQLQELHENMGVMRTRMMRSLGETMSKYNGLIQALQKLQTCMRLNDALIEQRLSSTYAHHYIDSSMDSNRSIEPEPDVISTVRNSSTIPQASSSSVPKIVVDSSPVTENPPSHSDVMGQKDTISSYYSTDTDVSANVMGNRHDEVVFSDTASGEKNTKLNIDESTNYYNTDSIDKVGEPFDEISSGYDDLMNGNDKQGNDIPEVQEASLIEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.26
3 0.24
4 0.22
5 0.22
6 0.21
7 0.15
8 0.14
9 0.13
10 0.13
11 0.13
12 0.13
13 0.11
14 0.11
15 0.1
16 0.1
17 0.1
18 0.09
19 0.09
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.09
24 0.12
25 0.13
26 0.15
27 0.17
28 0.2
29 0.22
30 0.3
31 0.33
32 0.39
33 0.4
34 0.45
35 0.46
36 0.5
37 0.53
38 0.47
39 0.51
40 0.48
41 0.53
42 0.49
43 0.49
44 0.52
45 0.52
46 0.57
47 0.54
48 0.59
49 0.51
50 0.52
51 0.47
52 0.38
53 0.34
54 0.27
55 0.26
56 0.15
57 0.15
58 0.12
59 0.14
60 0.21
61 0.21
62 0.21
63 0.21
64 0.21
65 0.23
66 0.23
67 0.23
68 0.17
69 0.16
70 0.15
71 0.13
72 0.13
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.08
80 0.08
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.1
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.11
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.09
113 0.08
114 0.1
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.13
124 0.16
125 0.18
126 0.2
127 0.2
128 0.25
129 0.24
130 0.22
131 0.21
132 0.19
133 0.2
134 0.21
135 0.22
136 0.18
137 0.18
138 0.19
139 0.19
140 0.19
141 0.2
142 0.19
143 0.19
144 0.22
145 0.23
146 0.22
147 0.23
148 0.21
149 0.2
150 0.19
151 0.22
152 0.19
153 0.2
154 0.2
155 0.2
156 0.2
157 0.19
158 0.19
159 0.15
160 0.22
161 0.22
162 0.23
163 0.25
164 0.26
165 0.26
166 0.29
167 0.29
168 0.28
169 0.31
170 0.38
171 0.46
172 0.51
173 0.59
174 0.64
175 0.69
176 0.73
177 0.73
178 0.73
179 0.69
180 0.71
181 0.67
182 0.64
183 0.6
184 0.57
185 0.54
186 0.47
187 0.45
188 0.38
189 0.31
190 0.28
191 0.3
192 0.26
193 0.25
194 0.26
195 0.25
196 0.28
197 0.28
198 0.27
199 0.27
200 0.25
201 0.25
202 0.24
203 0.24
204 0.21
205 0.2
206 0.21
207 0.17
208 0.19
209 0.17
210 0.2
211 0.19
212 0.22
213 0.27
214 0.28
215 0.36
216 0.38
217 0.43
218 0.46
219 0.54
220 0.61
221 0.63
222 0.68
223 0.7
224 0.76
225 0.8
226 0.83
227 0.81
228 0.79
229 0.81
230 0.82
231 0.78
232 0.77
233 0.77
234 0.75
235 0.76
236 0.79
237 0.81
238 0.75
239 0.78
240 0.75
241 0.75
242 0.72
243 0.68
244 0.66
245 0.59
246 0.57
247 0.48
248 0.47
249 0.36
250 0.33
251 0.29
252 0.2
253 0.16
254 0.15
255 0.14
256 0.12
257 0.12
258 0.14
259 0.17
260 0.17
261 0.18
262 0.22
263 0.24
264 0.25
265 0.28
266 0.27
267 0.28
268 0.29
269 0.34
270 0.36
271 0.4
272 0.36
273 0.34
274 0.32
275 0.29
276 0.3
277 0.25
278 0.2
279 0.14
280 0.15
281 0.14
282 0.13
283 0.11
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.04
301 0.05
302 0.06
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.14
309 0.15
310 0.16
311 0.16
312 0.16
313 0.18
314 0.2
315 0.25
316 0.25
317 0.25
318 0.25
319 0.22
320 0.22
321 0.2
322 0.19
323 0.14
324 0.1
325 0.13
326 0.12
327 0.12
328 0.11
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.09
334 0.1
335 0.1
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.13
341 0.15
342 0.16
343 0.2
344 0.19
345 0.22
346 0.24
347 0.26
348 0.33
349 0.34
350 0.31
351 0.29
352 0.28
353 0.27
354 0.25
355 0.22
356 0.15
357 0.13
358 0.13
359 0.12
360 0.11
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.05
366 0.04
367 0.06
368 0.06
369 0.09
370 0.11
371 0.12
372 0.15
373 0.18
374 0.23
375 0.27
376 0.28
377 0.29
378 0.32
379 0.36
380 0.38
381 0.38
382 0.35
383 0.3
384 0.35
385 0.32
386 0.27
387 0.23
388 0.19
389 0.16
390 0.16
391 0.15
392 0.1
393 0.09
394 0.09
395 0.12
396 0.11
397 0.11
398 0.13
399 0.14
400 0.14
401 0.15
402 0.17
403 0.14
404 0.17
405 0.21
406 0.2
407 0.21
408 0.21
409 0.21
410 0.21
411 0.21
412 0.18
413 0.15
414 0.17
415 0.14
416 0.16
417 0.16
418 0.2
419 0.21
420 0.23
421 0.22
422 0.22
423 0.22
424 0.27
425 0.28
426 0.23
427 0.26
428 0.26
429 0.25
430 0.26
431 0.27
432 0.22
433 0.21
434 0.2
435 0.16
436 0.15
437 0.15
438 0.14
439 0.12
440 0.11
441 0.15
442 0.19
443 0.2
444 0.19
445 0.19
446 0.19
447 0.2
448 0.19
449 0.16
450 0.13
451 0.13
452 0.14
453 0.14
454 0.14
455 0.16
456 0.15
457 0.15
458 0.16
459 0.17
460 0.18
461 0.17
462 0.18
463 0.16
464 0.16
465 0.16
466 0.15
467 0.14
468 0.13
469 0.13
470 0.14
471 0.21
472 0.22
473 0.22
474 0.22
475 0.23
476 0.25
477 0.27
478 0.27
479 0.22
480 0.21
481 0.21
482 0.19
483 0.19
484 0.18
485 0.16
486 0.17
487 0.16
488 0.16
489 0.18
490 0.18
491 0.2
492 0.21
493 0.21
494 0.22
495 0.23
496 0.25
497 0.24
498 0.24
499 0.25
500 0.28
501 0.34
502 0.31
503 0.28
504 0.25
505 0.25
506 0.25
507 0.22
508 0.19
509 0.13
510 0.13
511 0.16
512 0.16
513 0.16
514 0.16
515 0.16
516 0.14
517 0.14
518 0.13
519 0.12
520 0.13
521 0.13
522 0.14
523 0.14
524 0.16
525 0.17
526 0.17
527 0.16
528 0.15
529 0.16
530 0.18
531 0.17
532 0.16
533 0.15
534 0.13
535 0.14
536 0.16
537 0.15
538 0.13
539 0.16
540 0.18
541 0.19
542 0.21
543 0.22
544 0.23
545 0.24
546 0.27
547 0.27
548 0.3
549 0.34
550 0.32
551 0.32
552 0.3
553 0.28
554 0.24
555 0.25
556 0.2
557 0.16
558 0.18
559 0.17
560 0.18
561 0.18
562 0.17
563 0.16
564 0.17
565 0.16
566 0.14
567 0.14
568 0.14
569 0.15
570 0.15
571 0.13
572 0.12
573 0.12
574 0.12
575 0.14
576 0.16
577 0.13
578 0.16
579 0.19
580 0.19
581 0.24
582 0.28
583 0.28
584 0.29
585 0.33
586 0.31
587 0.32
588 0.33
589 0.28
590 0.25