Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3PH01

Protein Details
Accession A0A0C3PH01    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-57YTQGTVRKSRREKEKEAADAKRKEBasic
286-330VRSESRSRSRSRSRSRPRNLRPSRSRSPVRQRSRSPARGRRRSYSHydrophilic
347-371GHGRRRPYSRPRRYSRSPSRSRSRHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-55KSRREKEKEAADAKR
291-377RSRSRSRSRSRPRNLRPSRSRSPVRQRSRSPARGRRRSYSRSVSRSRSLSRPRSHAGHGRRRPYSRPRRYSRSPSRSRSRHSRSPHG
467-479GRKNKLGRLAKRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
PS50102  RRM  
PS50128  SURP  
Amino Acid Sequences MDKTKSKLAAFFGDDDEEPAFPPKAVDEQKLSHYTQGTVRKSRREKEKEAADAKRKEEEENAAKAYAEFLHTFQGEDVDRKKSGAAFVKAGQEASYTPSLQAAESSRTGQMFALDPPSPPPVAAKPKGKRAMDSFLEEIKREQATRESRFGRHVQGRSVTAMAAYEGQSGSKDRGDPETSNIFVANLPPYVNEQTLGMFFARIGPVGSVKIMWPRGDATIGPGNDMTVTRRSKNSGLSGFVAFMKRKDAEAALRELDGFDWGGSVLRVGWSKAVPVAAKPMYGETVRSESRSRSRSRSRSRPRNLRPSRSRSPVRQRSRSPARGRRRSYSRSVSRSRSLSRPRSHAGHGRRRPYSRPRRYSRSPSRSRSRHSRSPHGKHDAEEEVSEQFIRTVAAEVKGHGEEYAKSLQEREVSNAKFGFLKRGHRQYRMYTNLVKRNRSMEPEFDDEGYNSVYSTDSAEESEREHGRKNKLGRLAKRRFEAMLRALSGRRGELARCMAFSLEHAEAASEVADIIVASLLVDGTPVPRKVARLHLICDILHNSAAPLPMAWKFRQEFQARLGIVFDHLSTIYHSFPGRITAETFKNQITAIVDIWDDWIVFPPDYTGELRQRLEGMTLPSAEEQEVAPAVEQKEVTPTFKSKFKSSSFKPAEEVSPDAPQAVSATARTTSTAASDDDGEPMDVESDVDGAPVDDIDGEPVDDVDGEPVDDDVDGAPIAEDVDGESIGEDVDGEPMTEDLDGEPVAEDVDGAPLDVDGDPMDDVDALLPI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.29
3 0.26
4 0.2
5 0.18
6 0.19
7 0.17
8 0.14
9 0.14
10 0.14
11 0.22
12 0.27
13 0.3
14 0.32
15 0.35
16 0.42
17 0.47
18 0.46
19 0.42
20 0.39
21 0.37
22 0.39
23 0.45
24 0.46
25 0.51
26 0.56
27 0.62
28 0.69
29 0.75
30 0.79
31 0.79
32 0.79
33 0.79
34 0.82
35 0.82
36 0.81
37 0.82
38 0.81
39 0.78
40 0.73
41 0.71
42 0.62
43 0.55
44 0.51
45 0.51
46 0.48
47 0.47
48 0.46
49 0.38
50 0.37
51 0.34
52 0.31
53 0.23
54 0.19
55 0.15
56 0.14
57 0.18
58 0.18
59 0.19
60 0.17
61 0.2
62 0.18
63 0.22
64 0.25
65 0.25
66 0.25
67 0.25
68 0.27
69 0.25
70 0.3
71 0.34
72 0.35
73 0.33
74 0.36
75 0.42
76 0.41
77 0.39
78 0.32
79 0.24
80 0.21
81 0.21
82 0.21
83 0.15
84 0.15
85 0.17
86 0.17
87 0.16
88 0.18
89 0.16
90 0.17
91 0.18
92 0.2
93 0.21
94 0.2
95 0.21
96 0.18
97 0.17
98 0.15
99 0.15
100 0.18
101 0.16
102 0.17
103 0.19
104 0.21
105 0.2
106 0.18
107 0.2
108 0.23
109 0.32
110 0.39
111 0.46
112 0.5
113 0.6
114 0.69
115 0.67
116 0.64
117 0.6
118 0.61
119 0.55
120 0.54
121 0.46
122 0.44
123 0.44
124 0.39
125 0.35
126 0.3
127 0.29
128 0.24
129 0.23
130 0.26
131 0.33
132 0.38
133 0.45
134 0.45
135 0.45
136 0.5
137 0.52
138 0.52
139 0.52
140 0.5
141 0.47
142 0.47
143 0.47
144 0.43
145 0.4
146 0.31
147 0.22
148 0.19
149 0.14
150 0.12
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.11
157 0.13
158 0.13
159 0.14
160 0.14
161 0.2
162 0.24
163 0.25
164 0.28
165 0.31
166 0.3
167 0.29
168 0.27
169 0.22
170 0.18
171 0.18
172 0.15
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.14
177 0.16
178 0.16
179 0.14
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.14
184 0.1
185 0.08
186 0.07
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.09
197 0.14
198 0.16
199 0.16
200 0.16
201 0.17
202 0.17
203 0.18
204 0.17
205 0.17
206 0.2
207 0.2
208 0.19
209 0.18
210 0.17
211 0.16
212 0.17
213 0.14
214 0.16
215 0.19
216 0.21
217 0.23
218 0.27
219 0.29
220 0.33
221 0.37
222 0.33
223 0.33
224 0.32
225 0.31
226 0.28
227 0.27
228 0.26
229 0.2
230 0.17
231 0.19
232 0.17
233 0.17
234 0.18
235 0.18
236 0.2
237 0.22
238 0.25
239 0.21
240 0.21
241 0.2
242 0.18
243 0.16
244 0.12
245 0.09
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.1
260 0.12
261 0.1
262 0.1
263 0.16
264 0.15
265 0.15
266 0.15
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.15
271 0.11
272 0.15
273 0.16
274 0.18
275 0.19
276 0.21
277 0.28
278 0.33
279 0.36
280 0.4
281 0.49
282 0.58
283 0.66
284 0.73
285 0.77
286 0.81
287 0.88
288 0.9
289 0.89
290 0.9
291 0.89
292 0.89
293 0.87
294 0.85
295 0.82
296 0.8
297 0.77
298 0.75
299 0.77
300 0.77
301 0.77
302 0.77
303 0.73
304 0.75
305 0.79
306 0.79
307 0.78
308 0.77
309 0.79
310 0.8
311 0.81
312 0.79
313 0.77
314 0.74
315 0.71
316 0.71
317 0.69
318 0.67
319 0.69
320 0.65
321 0.62
322 0.61
323 0.56
324 0.55
325 0.56
326 0.57
327 0.55
328 0.55
329 0.54
330 0.52
331 0.53
332 0.52
333 0.52
334 0.54
335 0.56
336 0.57
337 0.6
338 0.59
339 0.63
340 0.66
341 0.68
342 0.68
343 0.71
344 0.72
345 0.74
346 0.79
347 0.83
348 0.83
349 0.82
350 0.8
351 0.79
352 0.81
353 0.79
354 0.78
355 0.78
356 0.75
357 0.72
358 0.69
359 0.72
360 0.72
361 0.73
362 0.75
363 0.72
364 0.65
365 0.57
366 0.55
367 0.47
368 0.37
369 0.3
370 0.22
371 0.14
372 0.13
373 0.12
374 0.08
375 0.06
376 0.05
377 0.05
378 0.04
379 0.05
380 0.06
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.11
385 0.11
386 0.1
387 0.09
388 0.09
389 0.07
390 0.1
391 0.12
392 0.11
393 0.11
394 0.12
395 0.13
396 0.16
397 0.16
398 0.17
399 0.21
400 0.21
401 0.23
402 0.23
403 0.22
404 0.21
405 0.2
406 0.25
407 0.21
408 0.29
409 0.33
410 0.44
411 0.48
412 0.51
413 0.55
414 0.53
415 0.59
416 0.56
417 0.53
418 0.5
419 0.52
420 0.56
421 0.57
422 0.53
423 0.46
424 0.45
425 0.43
426 0.42
427 0.38
428 0.33
429 0.33
430 0.35
431 0.34
432 0.3
433 0.28
434 0.22
435 0.21
436 0.17
437 0.12
438 0.08
439 0.07
440 0.06
441 0.06
442 0.07
443 0.06
444 0.06
445 0.07
446 0.08
447 0.08
448 0.09
449 0.14
450 0.16
451 0.16
452 0.21
453 0.27
454 0.31
455 0.37
456 0.41
457 0.41
458 0.48
459 0.55
460 0.59
461 0.64
462 0.68
463 0.67
464 0.65
465 0.61
466 0.53
467 0.47
468 0.43
469 0.37
470 0.31
471 0.27
472 0.26
473 0.25
474 0.26
475 0.24
476 0.19
477 0.16
478 0.14
479 0.13
480 0.15
481 0.2
482 0.18
483 0.18
484 0.18
485 0.16
486 0.15
487 0.15
488 0.15
489 0.1
490 0.1
491 0.09
492 0.09
493 0.09
494 0.09
495 0.09
496 0.04
497 0.03
498 0.03
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.02
504 0.02
505 0.02
506 0.02
507 0.02
508 0.03
509 0.03
510 0.05
511 0.09
512 0.1
513 0.11
514 0.13
515 0.15
516 0.18
517 0.27
518 0.33
519 0.32
520 0.34
521 0.37
522 0.38
523 0.36
524 0.35
525 0.28
526 0.21
527 0.18
528 0.16
529 0.11
530 0.11
531 0.12
532 0.09
533 0.07
534 0.08
535 0.12
536 0.16
537 0.16
538 0.21
539 0.22
540 0.26
541 0.35
542 0.36
543 0.35
544 0.34
545 0.41
546 0.35
547 0.34
548 0.3
549 0.21
550 0.19
551 0.17
552 0.14
553 0.08
554 0.07
555 0.08
556 0.09
557 0.1
558 0.1
559 0.11
560 0.12
561 0.11
562 0.12
563 0.16
564 0.16
565 0.15
566 0.18
567 0.21
568 0.25
569 0.27
570 0.28
571 0.24
572 0.24
573 0.23
574 0.22
575 0.18
576 0.15
577 0.13
578 0.12
579 0.12
580 0.11
581 0.12
582 0.1
583 0.08
584 0.07
585 0.1
586 0.11
587 0.11
588 0.1
589 0.1
590 0.11
591 0.13
592 0.15
593 0.17
594 0.21
595 0.26
596 0.27
597 0.27
598 0.28
599 0.26
600 0.25
601 0.23
602 0.2
603 0.17
604 0.17
605 0.17
606 0.17
607 0.17
608 0.16
609 0.13
610 0.1
611 0.09
612 0.09
613 0.08
614 0.08
615 0.11
616 0.12
617 0.13
618 0.14
619 0.12
620 0.19
621 0.2
622 0.22
623 0.22
624 0.26
625 0.28
626 0.34
627 0.37
628 0.36
629 0.42
630 0.47
631 0.52
632 0.53
633 0.61
634 0.61
635 0.6
636 0.57
637 0.52
638 0.49
639 0.42
640 0.41
641 0.32
642 0.29
643 0.27
644 0.24
645 0.21
646 0.18
647 0.15
648 0.13
649 0.11
650 0.09
651 0.11
652 0.11
653 0.12
654 0.13
655 0.13
656 0.12
657 0.13
658 0.14
659 0.13
660 0.13
661 0.16
662 0.15
663 0.15
664 0.16
665 0.14
666 0.12
667 0.12
668 0.11
669 0.08
670 0.08
671 0.06
672 0.07
673 0.06
674 0.06
675 0.06
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.04
681 0.05
682 0.06
683 0.06
684 0.06
685 0.06
686 0.07
687 0.07
688 0.06
689 0.07
690 0.07
691 0.06
692 0.06
693 0.06
694 0.06
695 0.07
696 0.06
697 0.06
698 0.05
699 0.06
700 0.06
701 0.05
702 0.05
703 0.05
704 0.06
705 0.05
706 0.05
707 0.05
708 0.06
709 0.06
710 0.06
711 0.06
712 0.06
713 0.06
714 0.05
715 0.05
716 0.04
717 0.06
718 0.06
719 0.06
720 0.07
721 0.07
722 0.08
723 0.07
724 0.07
725 0.06
726 0.08
727 0.07
728 0.07
729 0.08
730 0.07
731 0.07
732 0.07
733 0.06
734 0.05
735 0.08
736 0.07
737 0.07
738 0.07
739 0.06
740 0.08
741 0.08
742 0.08
743 0.06
744 0.07
745 0.07
746 0.07
747 0.08
748 0.06
749 0.07