Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3NY74

Protein Details
Accession A0A0C3NY74    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
297-316DGQPKKKKKKADGPGVTARNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
300-307PKKKKKKA
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MSMKTEDGVQAPQQPQAQQPPPPQQPTTTTFSAAQWGSQIPIDPALQQQSQPQTQTQQHATTPQYSHYQAYQQYQHSYSHYQYAPQATQQTQMATLPAAPAKPAAAPTPATSALDTTDVTKLNDALGSAGVDLRAEEESLHRTFDQYQSYRPYEDRSRKQPPRPSFDTRILGTRIRDIGTQHKVTKVPEESVNYLALALRARLQDVVEAMIEASTHRTDTQFDRPPSQYEDGTSMWRILVRADVSKQLATIERVEREEETKIRRERKERSEMAAAHAAALAAQASGSNMVVDGEMEDGQPKKKKKKADGPGVTARNMSEDVRKKMSNAVASQAAGLGTKYAWMNASAAAAPAAKAKAAAAPAPAAPSALTPATTTTPAASAGNASTWARPYVLSKSSQQNSTTPESDDKRRPITLRDAMFVIEKEKGHGGGRGAARGWT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.37
3 0.43
4 0.46
5 0.45
6 0.53
7 0.58
8 0.63
9 0.67
10 0.64
11 0.58
12 0.59
13 0.56
14 0.55
15 0.46
16 0.41
17 0.36
18 0.35
19 0.38
20 0.31
21 0.26
22 0.22
23 0.2
24 0.19
25 0.18
26 0.18
27 0.13
28 0.15
29 0.16
30 0.15
31 0.17
32 0.21
33 0.21
34 0.21
35 0.26
36 0.3
37 0.33
38 0.35
39 0.34
40 0.37
41 0.41
42 0.47
43 0.46
44 0.43
45 0.41
46 0.45
47 0.45
48 0.43
49 0.39
50 0.36
51 0.36
52 0.34
53 0.34
54 0.3
55 0.33
56 0.32
57 0.36
58 0.4
59 0.38
60 0.41
61 0.41
62 0.41
63 0.39
64 0.39
65 0.34
66 0.35
67 0.32
68 0.3
69 0.32
70 0.35
71 0.32
72 0.32
73 0.35
74 0.28
75 0.31
76 0.3
77 0.27
78 0.23
79 0.21
80 0.18
81 0.13
82 0.13
83 0.11
84 0.12
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.11
90 0.12
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.15
95 0.18
96 0.18
97 0.18
98 0.17
99 0.16
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.11
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.14
108 0.13
109 0.12
110 0.12
111 0.1
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.07
125 0.11
126 0.12
127 0.14
128 0.13
129 0.14
130 0.16
131 0.2
132 0.26
133 0.23
134 0.27
135 0.32
136 0.34
137 0.35
138 0.33
139 0.35
140 0.37
141 0.46
142 0.49
143 0.51
144 0.6
145 0.67
146 0.75
147 0.79
148 0.77
149 0.76
150 0.75
151 0.74
152 0.7
153 0.68
154 0.64
155 0.55
156 0.51
157 0.45
158 0.41
159 0.33
160 0.3
161 0.24
162 0.21
163 0.21
164 0.19
165 0.24
166 0.28
167 0.31
168 0.29
169 0.31
170 0.32
171 0.31
172 0.35
173 0.3
174 0.26
175 0.26
176 0.27
177 0.26
178 0.25
179 0.25
180 0.19
181 0.17
182 0.14
183 0.11
184 0.09
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.08
206 0.12
207 0.21
208 0.27
209 0.28
210 0.32
211 0.33
212 0.35
213 0.37
214 0.36
215 0.27
216 0.21
217 0.23
218 0.19
219 0.2
220 0.18
221 0.14
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.11
230 0.14
231 0.14
232 0.14
233 0.14
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.16
238 0.15
239 0.16
240 0.17
241 0.18
242 0.18
243 0.18
244 0.2
245 0.2
246 0.22
247 0.28
248 0.34
249 0.41
250 0.46
251 0.52
252 0.58
253 0.63
254 0.69
255 0.64
256 0.63
257 0.62
258 0.57
259 0.53
260 0.48
261 0.39
262 0.29
263 0.25
264 0.2
265 0.13
266 0.12
267 0.08
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.04
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.07
284 0.08
285 0.13
286 0.2
287 0.27
288 0.35
289 0.4
290 0.49
291 0.58
292 0.67
293 0.73
294 0.78
295 0.79
296 0.77
297 0.82
298 0.75
299 0.66
300 0.56
301 0.45
302 0.36
303 0.29
304 0.23
305 0.22
306 0.26
307 0.3
308 0.35
309 0.35
310 0.34
311 0.39
312 0.42
313 0.39
314 0.33
315 0.32
316 0.29
317 0.29
318 0.28
319 0.22
320 0.17
321 0.12
322 0.11
323 0.07
324 0.05
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.11
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.1
339 0.1
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.11
344 0.12
345 0.13
346 0.12
347 0.13
348 0.13
349 0.15
350 0.14
351 0.12
352 0.11
353 0.1
354 0.11
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.12
359 0.14
360 0.14
361 0.15
362 0.12
363 0.13
364 0.14
365 0.14
366 0.12
367 0.11
368 0.1
369 0.11
370 0.12
371 0.12
372 0.13
373 0.14
374 0.15
375 0.15
376 0.15
377 0.18
378 0.22
379 0.25
380 0.27
381 0.31
382 0.4
383 0.45
384 0.49
385 0.48
386 0.45
387 0.47
388 0.5
389 0.46
390 0.4
391 0.43
392 0.43
393 0.49
394 0.54
395 0.55
396 0.54
397 0.58
398 0.57
399 0.55
400 0.6
401 0.6
402 0.54
403 0.5
404 0.45
405 0.41
406 0.41
407 0.35
408 0.28
409 0.24
410 0.21
411 0.21
412 0.23
413 0.24
414 0.23
415 0.25
416 0.25
417 0.28
418 0.3
419 0.31