FuNGI

A0A0C3SDD3

Protein Details

Accession

A0A0C3SDD3

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
478-517	TVSRDKNESKEDKKMRKQAIKAEKQTRRADKKANKERFAS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
274-276	KRR
487-537	KEDKKMRKQAIKAEKQTRRADKKANKERFASEIKQQAKKLSDKEKTKMRKL

Subcellular Location(s)

nucl 22, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKSIFRQPGAKHFQLVHRSQRDPLIHDPAASKHVLKEFERGNTKKGKSRADLEKVLHPADLAHDGERANIGEAAAYGVYFDDTNYDYMQHLRSVGIQEDGVESVLIEAPSTRPKAKGKAVEPITLVDLPPETLPSTSEVPRNYESQQAIPSSLSGFQPDMDPHLRQVLEALEDDAFVEESLEDGFFAGLVADGERDEEVDFDYEFREDGVEDELEEDEDDEDGGWEARFARFKREQKSFVATADHTSDLDEYSDGGDTLGTLPQFSVIGGKKRRKGASDASGYSMSSSSMFRNEGLTTLDERFDQVQKEYESDEDSEDRGSDSDEAPELITSREDFNDMMNEFLENYEIIGGKMQPVLAGETSVDKLDTIRKALGEAKIRDDDDSDREEDILMPTDIDEAKDRWDCETILTTYSNLENHPRLIRARQAKSIPKIQVDPKTGLPIVDGQRYSAKGKQIVTIEEDDEEGEDDRLVHVTVSRDKNESKEDKKMRKQAIKAEKQTRRADKKANKERFASEIKQQAKKLSDKEKTKMRKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.59
3	0.58
4	0.61
5	0.61
6	0.6
7	0.6
8	0.59
9	0.63
10	0.58
11	0.54
12	0.54
13	0.53
14	0.46
15	0.45
16	0.44
17	0.39
18	0.38
19	0.34
20	0.29
21	0.24
22	0.29
23	0.32
24	0.32
25	0.36
26	0.37
27	0.44
28	0.53
29	0.51
30	0.52
31	0.56
32	0.6
33	0.61
34	0.63
35	0.64
36	0.6
37	0.67
38	0.7
39	0.69
40	0.71
41	0.66
42	0.66
43	0.61
44	0.56
45	0.47
46	0.36
47	0.28
48	0.24
49	0.25
50	0.19
51	0.15
52	0.16
53	0.16
54	0.17
55	0.18
56	0.16
57	0.13
58	0.12
59	0.11
60	0.09
61	0.09
62	0.1
63	0.08
64	0.07
65	0.06
66	0.05
67	0.06
68	0.06
69	0.06
70	0.07
71	0.08
72	0.1
73	0.1
74	0.11
75	0.11
76	0.14
77	0.15
78	0.14
79	0.14
80	0.13
81	0.15
82	0.17
83	0.17
84	0.16
85	0.14
86	0.14
87	0.14
88	0.14
89	0.11
90	0.09
91	0.07
92	0.07
93	0.08
94	0.08
95	0.06
96	0.07
97	0.09
98	0.14
99	0.18
100	0.19
101	0.23
102	0.28
103	0.35
104	0.43
105	0.5
106	0.47
107	0.54
108	0.56
109	0.54
110	0.5
111	0.44
112	0.39
113	0.31
114	0.27
115	0.18
116	0.15
117	0.12
118	0.11
119	0.11
120	0.09
121	0.08
122	0.09
123	0.11
124	0.15
125	0.17
126	0.21
127	0.21
128	0.25
129	0.27
130	0.29
131	0.27
132	0.3
133	0.29
134	0.27
135	0.29
136	0.25
137	0.24
138	0.21
139	0.2
140	0.15
141	0.15
142	0.13
143	0.12
144	0.11
145	0.1
146	0.12
147	0.12
148	0.16
149	0.16
150	0.17
151	0.16
152	0.2
153	0.2
154	0.18
155	0.19
156	0.15
157	0.13
158	0.13
159	0.13
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.08
164	0.07
165	0.05
166	0.05
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.03
175	0.03
176	0.03
177	0.03
178	0.03
179	0.03
180	0.03
181	0.03
182	0.04
183	0.04
184	0.05
185	0.04
186	0.05
187	0.05
188	0.06
189	0.06
190	0.06
191	0.07
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.07
199	0.06
200	0.06
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.06
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.05
216	0.07
217	0.12
218	0.12
219	0.2
220	0.28
221	0.35
222	0.42
223	0.48
224	0.49
225	0.48
226	0.54
227	0.47
228	0.4
229	0.37
230	0.3
231	0.25
232	0.23
233	0.2
234	0.14
235	0.13
236	0.12
237	0.09
238	0.09
239	0.07
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.04
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.09
256	0.09
257	0.17
258	0.24
259	0.3
260	0.34
261	0.4
262	0.43
263	0.41
264	0.45
265	0.45
266	0.46
267	0.46
268	0.43
269	0.39
270	0.37
271	0.34
272	0.3
273	0.22
274	0.14
275	0.09
276	0.09
277	0.07
278	0.09
279	0.09
280	0.09
281	0.11
282	0.1
283	0.1
284	0.11
285	0.11
286	0.12
287	0.12
288	0.12
289	0.11
290	0.12
291	0.13
292	0.13
293	0.13
294	0.12
295	0.15
296	0.15
297	0.16
298	0.16
299	0.15
300	0.14
301	0.14
302	0.15
303	0.12
304	0.11
305	0.11
306	0.1
307	0.1
308	0.08
309	0.08
310	0.08
311	0.07
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.08
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.08
322	0.08
323	0.09
324	0.09
325	0.09
326	0.12
327	0.12
328	0.11
329	0.1
330	0.1
331	0.09
332	0.09
333	0.09
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.06
345	0.07
346	0.08
347	0.07
348	0.08
349	0.07
350	0.08
351	0.09
352	0.09
353	0.08
354	0.07
355	0.08
356	0.13
357	0.14
358	0.15
359	0.15
360	0.15
361	0.17
362	0.21
363	0.26
364	0.29
365	0.29
366	0.31
367	0.34
368	0.34
369	0.32
370	0.3
371	0.27
372	0.23
373	0.24
374	0.21
375	0.18
376	0.18
377	0.18
378	0.16
379	0.15
380	0.14
381	0.11
382	0.09
383	0.09
384	0.11
385	0.1
386	0.11
387	0.12
388	0.1
389	0.15
390	0.18
391	0.18
392	0.18
393	0.2
394	0.19
395	0.19
396	0.23
397	0.2
398	0.19
399	0.19
400	0.17
401	0.17
402	0.18
403	0.17
404	0.14
405	0.19
406	0.18
407	0.21
408	0.23
409	0.25
410	0.26
411	0.29
412	0.37
413	0.41
414	0.44
415	0.48
416	0.53
417	0.59
418	0.62
419	0.66
420	0.62
421	0.56
422	0.58
423	0.58
424	0.58
425	0.54
426	0.51
427	0.45
428	0.46
429	0.42
430	0.36
431	0.3
432	0.29
433	0.28
434	0.31
435	0.29
436	0.25
437	0.29
438	0.31
439	0.34
440	0.31
441	0.33
442	0.32
443	0.33
444	0.37
445	0.36
446	0.36
447	0.36
448	0.35
449	0.3
450	0.25
451	0.24
452	0.19
453	0.16
454	0.15
455	0.11
456	0.09
457	0.08
458	0.08
459	0.08
460	0.09
461	0.09
462	0.08
463	0.1
464	0.14
465	0.22
466	0.28
467	0.3
468	0.34
469	0.36
470	0.4
471	0.47
472	0.52
473	0.49
474	0.54
475	0.62
476	0.68
477	0.77
478	0.82
479	0.83
480	0.83
481	0.83
482	0.83
483	0.84
484	0.84
485	0.84
486	0.85
487	0.83
488	0.83
489	0.86
490	0.87
491	0.85
492	0.82
493	0.83
494	0.82
495	0.85
496	0.87
497	0.87
498	0.82
499	0.78
500	0.73
501	0.7
502	0.68
503	0.61
504	0.58
505	0.56
506	0.58
507	0.61
508	0.6
509	0.6
510	0.59
511	0.62
512	0.63
513	0.65
514	0.67
515	0.68
516	0.74
517	0.77

A0A0C3SDD3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer