Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FJM4

Protein Details
Accession Q6FJM4    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MGKIGKVGKASKKKSRLTSELVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-14KASKKK
315-316KK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014720  dsRBD_dom  
IPR040540  RNase_3_N  
IPR011907  RNase_III  
IPR000999  RNase_III_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
Gene Ontology GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG cgr:CAGL0M05159g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00035  dsrm  
PF00636  Ribonuclease_3  
PF18497  RNase_3_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00517  RNASE_3_1  
PS50142  RNASE_3_2  
CDD cd00593  RIBOc  
Amino Acid Sequences MGKIGKVGKASKKKSRLTSELVDLYEKNSTEQVGTYQYSNAIQIEHAVHKLVEAYQRILKLSPNIVQYYETLNSLSDPEKVPPQLISLFTRYPLKLAAEIKTLHDLNKSTLLDDISGYEAKFDASNREPVLGDLELSDLQDLEDDDIGRLDLDLSVAKSSESSECITSKEKSSKWPPEMPEIKDHVIRARVFMHKSLVNDKVYLNESDIIKSNNERLEFLGDSILNTVMTMIIYNKFPSLNEGNLTELRKKLVKNETLREWSELYELPKQLKSNLSPDVDLSTSKTSADIFEAYIGGLMEDDPKTNLVKIRKWLKKLAKPKIEEAMKTSIQLEPTNNLDMNAKRKLYSLIGYAALKLHYHTVQRPTNENPVTIVQCRTGDGTILGVGKARNIKLAGVKAAEDVLRKEDVIEKYAKLRASIPREQSVSKNEQPRTTNKEQGEKDICELSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.83
3 0.81
4 0.77
5 0.75
6 0.72
7 0.67
8 0.6
9 0.53
10 0.44
11 0.39
12 0.35
13 0.29
14 0.23
15 0.19
16 0.19
17 0.17
18 0.17
19 0.18
20 0.18
21 0.2
22 0.19
23 0.19
24 0.2
25 0.19
26 0.2
27 0.18
28 0.14
29 0.12
30 0.14
31 0.17
32 0.18
33 0.18
34 0.17
35 0.17
36 0.16
37 0.17
38 0.18
39 0.2
40 0.19
41 0.22
42 0.25
43 0.27
44 0.28
45 0.27
46 0.27
47 0.26
48 0.28
49 0.29
50 0.3
51 0.3
52 0.3
53 0.3
54 0.28
55 0.28
56 0.25
57 0.21
58 0.17
59 0.16
60 0.15
61 0.16
62 0.16
63 0.14
64 0.14
65 0.16
66 0.21
67 0.22
68 0.22
69 0.2
70 0.22
71 0.22
72 0.23
73 0.25
74 0.24
75 0.24
76 0.25
77 0.3
78 0.27
79 0.25
80 0.25
81 0.23
82 0.24
83 0.26
84 0.26
85 0.25
86 0.26
87 0.27
88 0.3
89 0.29
90 0.25
91 0.25
92 0.24
93 0.22
94 0.29
95 0.27
96 0.22
97 0.23
98 0.22
99 0.19
100 0.18
101 0.17
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.14
111 0.15
112 0.2
113 0.2
114 0.22
115 0.21
116 0.21
117 0.23
118 0.17
119 0.15
120 0.1
121 0.11
122 0.1
123 0.1
124 0.09
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.1
150 0.12
151 0.12
152 0.15
153 0.18
154 0.18
155 0.22
156 0.26
157 0.26
158 0.33
159 0.41
160 0.48
161 0.51
162 0.55
163 0.52
164 0.56
165 0.61
166 0.55
167 0.52
168 0.48
169 0.44
170 0.39
171 0.38
172 0.31
173 0.3
174 0.27
175 0.23
176 0.23
177 0.25
178 0.25
179 0.25
180 0.25
181 0.22
182 0.24
183 0.26
184 0.27
185 0.23
186 0.23
187 0.22
188 0.22
189 0.21
190 0.2
191 0.16
192 0.15
193 0.14
194 0.14
195 0.16
196 0.14
197 0.13
198 0.13
199 0.16
200 0.15
201 0.15
202 0.15
203 0.14
204 0.16
205 0.16
206 0.15
207 0.13
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.09
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.11
226 0.13
227 0.13
228 0.13
229 0.14
230 0.15
231 0.18
232 0.2
233 0.18
234 0.16
235 0.17
236 0.19
237 0.19
238 0.24
239 0.3
240 0.36
241 0.4
242 0.44
243 0.48
244 0.5
245 0.51
246 0.46
247 0.38
248 0.31
249 0.27
250 0.24
251 0.2
252 0.2
253 0.2
254 0.2
255 0.22
256 0.22
257 0.22
258 0.25
259 0.24
260 0.24
261 0.28
262 0.27
263 0.25
264 0.25
265 0.25
266 0.21
267 0.19
268 0.17
269 0.14
270 0.13
271 0.12
272 0.12
273 0.1
274 0.1
275 0.12
276 0.1
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.09
292 0.11
293 0.16
294 0.19
295 0.23
296 0.31
297 0.41
298 0.47
299 0.51
300 0.59
301 0.64
302 0.69
303 0.75
304 0.77
305 0.75
306 0.72
307 0.72
308 0.72
309 0.66
310 0.57
311 0.51
312 0.47
313 0.39
314 0.36
315 0.33
316 0.25
317 0.23
318 0.24
319 0.21
320 0.17
321 0.19
322 0.21
323 0.2
324 0.19
325 0.21
326 0.22
327 0.27
328 0.3
329 0.28
330 0.26
331 0.27
332 0.29
333 0.28
334 0.27
335 0.24
336 0.21
337 0.23
338 0.23
339 0.22
340 0.2
341 0.18
342 0.16
343 0.14
344 0.15
345 0.15
346 0.19
347 0.23
348 0.31
349 0.36
350 0.39
351 0.43
352 0.44
353 0.51
354 0.48
355 0.44
356 0.38
357 0.37
358 0.37
359 0.35
360 0.32
361 0.25
362 0.24
363 0.25
364 0.24
365 0.2
366 0.17
367 0.14
368 0.14
369 0.13
370 0.13
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.15
375 0.2
376 0.19
377 0.21
378 0.21
379 0.24
380 0.27
381 0.31
382 0.31
383 0.27
384 0.27
385 0.24
386 0.25
387 0.24
388 0.2
389 0.19
390 0.18
391 0.18
392 0.17
393 0.18
394 0.23
395 0.24
396 0.26
397 0.28
398 0.26
399 0.3
400 0.35
401 0.34
402 0.29
403 0.32
404 0.37
405 0.42
406 0.49
407 0.5
408 0.53
409 0.55
410 0.56
411 0.56
412 0.55
413 0.56
414 0.55
415 0.58
416 0.56
417 0.59
418 0.62
419 0.65
420 0.66
421 0.65
422 0.67
423 0.63
424 0.69
425 0.64
426 0.69
427 0.67
428 0.6
429 0.56