Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3PWJ2

Protein Details
Accession A0A0C3PWJ2    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-112DGSVVVKKKKEQKQEKLVVKAKKHydrophilic
389-412QIPANNKEKKGKQPRAQGERFSRIHydrophilic
448-474IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYRGGDITMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-111KKKEQKQEKLVVKAK
398-400KGK
455-465FRKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 9.833, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSKKDKKVSAEPTPADLATTYTLIYSFLKKQSHSKAAEAVKNAAKEFVVLKDSIKVDGPSLDEVVKAWRALTVASSSSLDDSSSSSSSSDGSVVVKKKKEQKQEKLVVKAKKAPSLSSSSSSSSSSSESDSKKRPVKVAKKSVSKASSSSSSESSSSDSSSSDSSDSEDEQKPAAAAKTESPKPTTKPKSSPPEAVSSETLASDSDSDSDSDSSSDSTSVGVKKVEVKNGKPIQEAKVATAKAVESSSSESDSGSGTEGDSEDSSDEEQGTKPTVDVKKVVKKEESSDSSDSDSDEETKKEAKKVENKMNDGASNSSSDSSSDSDSDSDSDSDSNSATSVKDVKPAKDVKPIAPPAEQPEETATKKRRTNEGGDAVVTATASTSREVSQIPANNKEKKGKQPRAQGERFSRIKVDKVTFADDRLKDNRFESRNAAQSDYGAKASQDLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYRGGDITMASHSIKFTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.45
3 0.35
4 0.27
5 0.19
6 0.18
7 0.13
8 0.11
9 0.11
10 0.12
11 0.14
12 0.16
13 0.2
14 0.27
15 0.3
16 0.33
17 0.42
18 0.5
19 0.57
20 0.56
21 0.53
22 0.55
23 0.59
24 0.62
25 0.56
26 0.53
27 0.48
28 0.47
29 0.44
30 0.37
31 0.28
32 0.25
33 0.23
34 0.21
35 0.19
36 0.17
37 0.18
38 0.22
39 0.23
40 0.23
41 0.24
42 0.21
43 0.19
44 0.21
45 0.22
46 0.18
47 0.19
48 0.17
49 0.15
50 0.15
51 0.17
52 0.17
53 0.15
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.13
60 0.12
61 0.14
62 0.15
63 0.14
64 0.15
65 0.15
66 0.13
67 0.1
68 0.11
69 0.13
70 0.12
71 0.12
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.09
78 0.1
79 0.16
80 0.22
81 0.28
82 0.32
83 0.38
84 0.47
85 0.55
86 0.64
87 0.69
88 0.73
89 0.77
90 0.83
91 0.85
92 0.85
93 0.84
94 0.8
95 0.74
96 0.72
97 0.65
98 0.61
99 0.55
100 0.47
101 0.43
102 0.44
103 0.42
104 0.37
105 0.36
106 0.32
107 0.32
108 0.3
109 0.27
110 0.22
111 0.2
112 0.17
113 0.18
114 0.22
115 0.24
116 0.3
117 0.35
118 0.42
119 0.47
120 0.5
121 0.54
122 0.58
123 0.65
124 0.69
125 0.73
126 0.74
127 0.76
128 0.76
129 0.77
130 0.7
131 0.61
132 0.53
133 0.46
134 0.42
135 0.36
136 0.35
137 0.28
138 0.26
139 0.25
140 0.24
141 0.22
142 0.18
143 0.16
144 0.14
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.1
150 0.09
151 0.1
152 0.11
153 0.12
154 0.16
155 0.17
156 0.17
157 0.17
158 0.17
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.11
163 0.1
164 0.13
165 0.2
166 0.24
167 0.26
168 0.28
169 0.31
170 0.33
171 0.42
172 0.47
173 0.47
174 0.49
175 0.57
176 0.63
177 0.64
178 0.67
179 0.59
180 0.58
181 0.53
182 0.49
183 0.41
184 0.32
185 0.28
186 0.2
187 0.18
188 0.11
189 0.09
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.17
211 0.19
212 0.26
213 0.28
214 0.28
215 0.37
216 0.42
217 0.43
218 0.38
219 0.38
220 0.34
221 0.36
222 0.35
223 0.27
224 0.27
225 0.25
226 0.23
227 0.21
228 0.18
229 0.12
230 0.12
231 0.1
232 0.06
233 0.09
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.07
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.14
261 0.16
262 0.17
263 0.21
264 0.27
265 0.34
266 0.38
267 0.41
268 0.38
269 0.38
270 0.4
271 0.44
272 0.41
273 0.38
274 0.36
275 0.34
276 0.32
277 0.3
278 0.26
279 0.19
280 0.16
281 0.13
282 0.13
283 0.12
284 0.12
285 0.17
286 0.19
287 0.22
288 0.26
289 0.31
290 0.39
291 0.47
292 0.55
293 0.57
294 0.59
295 0.58
296 0.56
297 0.49
298 0.41
299 0.34
300 0.25
301 0.19
302 0.16
303 0.14
304 0.12
305 0.11
306 0.12
307 0.11
308 0.12
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.11
315 0.1
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.08
326 0.13
327 0.13
328 0.2
329 0.23
330 0.24
331 0.31
332 0.37
333 0.38
334 0.42
335 0.45
336 0.41
337 0.48
338 0.5
339 0.45
340 0.42
341 0.4
342 0.36
343 0.4
344 0.37
345 0.28
346 0.29
347 0.31
348 0.31
349 0.38
350 0.39
351 0.4
352 0.45
353 0.49
354 0.54
355 0.55
356 0.59
357 0.6
358 0.6
359 0.54
360 0.5
361 0.45
362 0.36
363 0.3
364 0.23
365 0.14
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.1
373 0.11
374 0.13
375 0.19
376 0.24
377 0.28
378 0.36
379 0.43
380 0.49
381 0.53
382 0.6
383 0.6
384 0.65
385 0.72
386 0.73
387 0.75
388 0.78
389 0.84
390 0.86
391 0.85
392 0.83
393 0.8
394 0.79
395 0.73
396 0.65
397 0.61
398 0.54
399 0.53
400 0.52
401 0.47
402 0.44
403 0.44
404 0.47
405 0.42
406 0.43
407 0.46
408 0.4
409 0.42
410 0.42
411 0.41
412 0.37
413 0.39
414 0.44
415 0.39
416 0.41
417 0.42
418 0.43
419 0.49
420 0.49
421 0.49
422 0.4
423 0.38
424 0.39
425 0.35
426 0.29
427 0.21
428 0.19
429 0.17
430 0.18
431 0.18
432 0.16
433 0.14
434 0.14
435 0.15
436 0.16
437 0.15
438 0.19
439 0.18
440 0.21
441 0.25
442 0.32
443 0.42
444 0.52
445 0.62
446 0.69
447 0.78
448 0.82
449 0.89
450 0.91
451 0.91
452 0.91
453 0.88
454 0.87
455 0.86
456 0.79
457 0.69
458 0.58
459 0.49
460 0.4
461 0.34
462 0.25
463 0.17