Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3SA25

Protein Details
Accession A0A0C3SA25    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
179-205SDTTAHFSSRRRRVPKRPLHVKVEDRDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
188-196RRRRVPKRP
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MHDGRAFYSTRQLSMRPMYPIPYPPPCYPYPPMAHNDAAMYHPQMYYPVARRDPYSDMLPLESHILKMSLDNEKVPVKSTQPAPPVPPPTPSSTATEASSPTSTTSAHFAGSESARLLEEQQAPRERANSCGSFYRTKPCKFFHERGSCVKGNRCNFIHDYNQDRRGSVSESDSQPQLSDTTAHFSSRRRRVPKRPLHVKVEDRDKRSNFYPVMWRVISGRTMMGGPRRPGLSGFPAERLYSNRVQVRPSHVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.41
3 0.36
4 0.37
5 0.36
6 0.37
7 0.42
8 0.42
9 0.44
10 0.46
11 0.43
12 0.47
13 0.46
14 0.49
15 0.47
16 0.48
17 0.45
18 0.43
19 0.44
20 0.44
21 0.43
22 0.37
23 0.34
24 0.27
25 0.24
26 0.21
27 0.19
28 0.15
29 0.14
30 0.13
31 0.14
32 0.15
33 0.18
34 0.22
35 0.28
36 0.31
37 0.32
38 0.34
39 0.37
40 0.39
41 0.37
42 0.33
43 0.28
44 0.25
45 0.25
46 0.24
47 0.2
48 0.19
49 0.16
50 0.14
51 0.12
52 0.12
53 0.1
54 0.11
55 0.14
56 0.16
57 0.16
58 0.17
59 0.19
60 0.21
61 0.22
62 0.23
63 0.21
64 0.18
65 0.22
66 0.26
67 0.29
68 0.31
69 0.33
70 0.35
71 0.4
72 0.43
73 0.39
74 0.38
75 0.34
76 0.35
77 0.37
78 0.34
79 0.32
80 0.3
81 0.31
82 0.28
83 0.26
84 0.21
85 0.19
86 0.18
87 0.14
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.1
92 0.12
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.11
106 0.16
107 0.16
108 0.21
109 0.24
110 0.25
111 0.25
112 0.27
113 0.23
114 0.22
115 0.25
116 0.22
117 0.2
118 0.23
119 0.25
120 0.26
121 0.27
122 0.32
123 0.35
124 0.38
125 0.41
126 0.4
127 0.46
128 0.5
129 0.54
130 0.55
131 0.56
132 0.57
133 0.58
134 0.61
135 0.55
136 0.5
137 0.51
138 0.48
139 0.42
140 0.44
141 0.39
142 0.37
143 0.37
144 0.38
145 0.38
146 0.35
147 0.4
148 0.4
149 0.46
150 0.42
151 0.39
152 0.36
153 0.32
154 0.31
155 0.25
156 0.23
157 0.22
158 0.24
159 0.25
160 0.25
161 0.23
162 0.2
163 0.19
164 0.16
165 0.11
166 0.1
167 0.09
168 0.14
169 0.14
170 0.16
171 0.17
172 0.22
173 0.32
174 0.4
175 0.48
176 0.53
177 0.62
178 0.71
179 0.8
180 0.85
181 0.87
182 0.88
183 0.86
184 0.85
185 0.84
186 0.81
187 0.77
188 0.78
189 0.74
190 0.69
191 0.7
192 0.64
193 0.6
194 0.56
195 0.56
196 0.46
197 0.43
198 0.46
199 0.41
200 0.46
201 0.41
202 0.38
203 0.33
204 0.34
205 0.31
206 0.23
207 0.19
208 0.14
209 0.15
210 0.17
211 0.23
212 0.27
213 0.28
214 0.32
215 0.32
216 0.32
217 0.32
218 0.34
219 0.33
220 0.33
221 0.33
222 0.33
223 0.34
224 0.34
225 0.35
226 0.34
227 0.34
228 0.32
229 0.38
230 0.41
231 0.41
232 0.44
233 0.47