FuNGI

Q6CJW7

Protein Details

Accession

Q6CJW7

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-42	RDQMRREFLRARQRSNNPKPIVKKEDP	Hydrophilic
284-309	HGGGRFRRGNSKRKTRQLKRLDEEAK	Basic
544-568	SEKDNEKQSRRSSPKKKASDTPSGP	Hydrophilic
650-670	IRQLKEKVGRHPDNKERMKVF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
287-303	GRFRRGNSKRKTRQLKR
553-560	RRSSPKKK

Subcellular Location(s)

nucl 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	kla:KLLA0_F15411g -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSNATKSNDASPFIKRDQMRREFLRARQRSNNPKPIVKKEDPEQAAEEARKLLQPEALSRRVKREPGKSGYSEFPLRAIDMRDKENVKTNLVKFQSKKPIDPEDFHLPIRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVQRQKEIAEFKQRQLEEAGGAGPGTGGSNSTPTASKGNSTGGSFSQSNGKPYNSKQGTPVPGTLNGPKVGVTNYNNTDGPNVNNNGSSSSELKTGTDSGSPPNGKEGTPSNTVTILEEAGVAEDPTKVGMVKYDGKAEPEIHEEGTIDPMADVAPHGGGRFRRGNSKRKTRQLKRLDEEAKRLRFEEFYPWVMEDFDGFNTWVGSYEAGNSDSYVLLSVEDDGSFTMIPADKVYRFTARNKYNTLTIEEAEKRMEKNKEGAPRWFMKHLDESSKTTTRYDRTLRRLRAVDGNTRQAEDDEDRGDNSEVELDYDEEFADDEEAPIIDGNEEENKESEQRIKKEMLQANALGLRDDDGEESDDELFGEKKIDEEGEKVKKALLKTDLGALYESDAEENPYLSHSEEDEEQADSDKKDSEKDNEKQSRRSSPKKKASDTPSGPPKLVVKSINQNIVVLTGEKSVLSNFPAGAWNPNLKKRPAESQPQESMDNKRAKSDHSADDLLTEDDIINAIEGKQLTLKQLIRQLKEKVGRHPDNKERMKVFVKKLVKLNGKFLELSK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.44
3	0.49
4	0.55
5	0.62
6	0.64
7	0.63
8	0.71
9	0.7
10	0.75
11	0.77
12	0.74
13	0.73
14	0.75
15	0.79
16	0.81
17	0.84
18	0.86
19	0.81
20	0.82
21	0.83
22	0.82
23	0.82
24	0.77
25	0.73
26	0.7
27	0.73
28	0.67
29	0.61
30	0.54
31	0.48
32	0.47
33	0.42
34	0.36
35	0.28
36	0.27
37	0.26
38	0.24
39	0.22
40	0.2
41	0.21
42	0.28
43	0.33
44	0.41
45	0.45
46	0.47
47	0.53
48	0.57
49	0.63
50	0.63
51	0.65
52	0.66
53	0.67
54	0.71
55	0.67
56	0.65
57	0.61
58	0.58
59	0.52
60	0.42
61	0.37
62	0.31
63	0.28
64	0.26
65	0.26
66	0.28
67	0.28
68	0.31
69	0.36
70	0.37
71	0.38
72	0.45
73	0.44
74	0.41
75	0.45
76	0.44
77	0.46
78	0.49
79	0.54
80	0.48
81	0.55
82	0.61
83	0.57
84	0.59
85	0.57
86	0.63
87	0.6
88	0.6
89	0.58
90	0.56
91	0.55
92	0.5
93	0.48
94	0.38
95	0.4
96	0.46
97	0.43
98	0.41
99	0.46
100	0.53
101	0.57
102	0.67
103	0.7
104	0.7
105	0.68
106	0.68
107	0.64
108	0.59
109	0.56
110	0.48
111	0.38
112	0.3
113	0.32
114	0.3
115	0.35
116	0.38
117	0.33
118	0.32
119	0.32
120	0.35
121	0.35
122	0.36
123	0.39
124	0.38
125	0.4
126	0.47
127	0.46
128	0.44
129	0.41
130	0.36
131	0.25
132	0.22
133	0.19
134	0.11
135	0.11
136	0.09
137	0.07
138	0.05
139	0.05
140	0.04
141	0.04
142	0.05
143	0.06
144	0.07
145	0.09
146	0.09
147	0.11
148	0.14
149	0.14
150	0.15
151	0.15
152	0.19
153	0.19
154	0.19
155	0.19
156	0.17
157	0.21
158	0.2
159	0.19
160	0.24
161	0.23
162	0.27
163	0.28
164	0.29
165	0.29
166	0.31
167	0.42
168	0.36
169	0.36
170	0.37
171	0.41
172	0.45
173	0.43
174	0.44
175	0.36
176	0.35
177	0.37
178	0.35
179	0.3
180	0.25
181	0.23
182	0.19
183	0.18
184	0.17
185	0.19
186	0.19
187	0.22
188	0.24
189	0.27
190	0.27
191	0.26
192	0.27
193	0.23
194	0.23
195	0.22
196	0.22
197	0.2
198	0.2
199	0.2
200	0.2
201	0.2
202	0.19
203	0.16
204	0.15
205	0.16
206	0.15
207	0.15
208	0.15
209	0.15
210	0.14
211	0.14
212	0.13
213	0.14
214	0.2
215	0.21
216	0.19
217	0.23
218	0.23
219	0.2
220	0.22
221	0.24
222	0.22
223	0.25
224	0.26
225	0.23
226	0.23
227	0.23
228	0.21
229	0.17
230	0.13
231	0.08
232	0.08
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.05
237	0.05
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.05
242	0.04
243	0.04
244	0.06
245	0.09
246	0.14
247	0.15
248	0.2
249	0.2
250	0.22
251	0.24
252	0.23
253	0.21
254	0.2
255	0.2
256	0.15
257	0.15
258	0.14
259	0.12
260	0.13
261	0.11
262	0.07
263	0.06
264	0.06
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.03
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.07
273	0.07
274	0.12
275	0.17
276	0.18
277	0.28
278	0.35
279	0.45
280	0.51
281	0.62
282	0.67
283	0.72
284	0.82
285	0.8
286	0.85
287	0.85
288	0.86
289	0.79
290	0.8
291	0.78
292	0.7
293	0.69
294	0.67
295	0.6
296	0.51
297	0.47
298	0.38
299	0.32
300	0.3
301	0.28
302	0.23
303	0.21
304	0.21
305	0.2
306	0.2
307	0.18
308	0.17
309	0.11
310	0.08
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.05
321	0.06
322	0.07
323	0.08
324	0.08
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.06
329	0.06
330	0.05
331	0.04
332	0.04
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.07
346	0.08
347	0.1
348	0.12
349	0.15
350	0.17
351	0.23
352	0.32
353	0.36
354	0.4
355	0.4
356	0.4
357	0.4
358	0.39
359	0.36
360	0.28
361	0.23
362	0.24
363	0.22
364	0.21
365	0.19
366	0.18
367	0.16
368	0.21
369	0.23
370	0.2
371	0.24
372	0.28
373	0.35
374	0.37
375	0.4
376	0.39
377	0.41
378	0.42
379	0.4
380	0.36
381	0.3
382	0.33
383	0.32
384	0.33
385	0.31
386	0.32
387	0.34
388	0.37
389	0.35
390	0.31
391	0.33
392	0.29
393	0.33
394	0.37
395	0.39
396	0.45
397	0.54
398	0.55
399	0.57
400	0.57
401	0.53
402	0.53
403	0.49
404	0.48
405	0.43
406	0.47
407	0.41
408	0.4
409	0.37
410	0.29
411	0.29
412	0.22
413	0.19
414	0.14
415	0.14
416	0.13
417	0.15
418	0.15
419	0.12
420	0.1
421	0.1
422	0.08
423	0.08
424	0.09
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.08
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.05
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.04
441	0.04
442	0.05
443	0.08
444	0.08
445	0.09
446	0.1
447	0.11
448	0.12
449	0.13
450	0.2
451	0.25
452	0.27
453	0.31
454	0.33
455	0.35
456	0.44
457	0.47
458	0.42
459	0.38
460	0.35
461	0.33
462	0.33
463	0.29
464	0.2
465	0.15
466	0.13
467	0.1
468	0.1
469	0.09
470	0.07
471	0.09
472	0.09
473	0.1
474	0.09
475	0.08
476	0.08
477	0.09
478	0.08
479	0.07
480	0.08
481	0.07
482	0.07
483	0.08
484	0.09
485	0.09
486	0.12
487	0.2
488	0.26
489	0.27
490	0.26
491	0.28
492	0.3
493	0.29
494	0.32
495	0.29
496	0.25
497	0.24
498	0.3
499	0.29
500	0.26
501	0.26
502	0.2
503	0.16
504	0.14
505	0.14
506	0.09
507	0.08
508	0.09
509	0.09
510	0.09
511	0.08
512	0.09
513	0.09
514	0.09
515	0.1
516	0.09
517	0.11
518	0.11
519	0.13
520	0.13
521	0.13
522	0.13
523	0.15
524	0.16
525	0.14
526	0.15
527	0.16
528	0.16
529	0.19
530	0.23
531	0.28
532	0.36
533	0.41
534	0.51
535	0.58
536	0.62
537	0.66
538	0.69
539	0.72
540	0.72
541	0.77
542	0.76
543	0.77
544	0.83
545	0.85
546	0.85
547	0.83
548	0.81
549	0.81
550	0.76
551	0.75
552	0.74
553	0.67
554	0.61
555	0.54
556	0.51
557	0.43
558	0.43
559	0.36
560	0.32
561	0.39
562	0.45
563	0.48
564	0.44
565	0.4
566	0.35
567	0.34
568	0.29
569	0.2
570	0.15
571	0.1
572	0.1
573	0.1
574	0.1
575	0.1
576	0.11
577	0.11
578	0.12
579	0.11
580	0.12
581	0.15
582	0.15
583	0.18
584	0.21
585	0.28
586	0.32
587	0.4
588	0.45
589	0.44
590	0.5
591	0.5
592	0.56
593	0.55
594	0.61
595	0.6
596	0.64
597	0.68
598	0.65
599	0.65
600	0.59
601	0.58
602	0.55
603	0.55
604	0.47
605	0.47
606	0.45
607	0.45
608	0.5
609	0.5
610	0.48
611	0.46
612	0.48
613	0.41
614	0.4
615	0.38
616	0.3
617	0.23
618	0.17
619	0.1
620	0.09
621	0.09
622	0.08
623	0.06
624	0.06
625	0.06
626	0.09
627	0.09
628	0.1
629	0.13
630	0.14
631	0.17
632	0.24
633	0.27
634	0.29
635	0.38
636	0.45
637	0.46
638	0.52
639	0.55
640	0.57
641	0.63
642	0.63
643	0.64
644	0.67
645	0.72
646	0.72
647	0.77
648	0.77
649	0.79
650	0.83
651	0.81
652	0.73
653	0.7
654	0.72
655	0.71
656	0.68
657	0.67
658	0.67
659	0.65
660	0.7
661	0.73
662	0.73
663	0.68
664	0.7
665	0.66
666	0.62

Q6CJW7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer