FuNGI

Q6FW56

Protein Details

Accession

Q6FW56

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
602-630	SPFISFKTRKKYEHVWKIRKNIKRKGHHL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
611-629	KKYEHVWKIRKNIKRKGHH

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045116 Clp1/Grc3 IPR032319 CLP1_P IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0090730 C:Las1 complex GO:0030874 C:nucleolar chromatin GO:0005524 F:ATP binding GO:0051731 F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity GO:0000448 P:cleavage in ITS2 between 5.8S rRNA and LSU-rRNA of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0016310 P:phosphorylation GO:0006364 P:rRNA processing GO:0006363 P:termination of RNA polymerase I transcription
KEGG	cgr:CAGL0D02816g -
Pfam	View protein in Pfam PF16575 CLP1_P

Amino Acid Sequences

MAETDLNALAYKDSDSTDTSSSSSSDEEYQAEVKVSNQNEKQVDYDSDTDLNTDNKVSSVDAYKPCVGENLIIRDSNIIILLRAKEKLCLSGLFDLKIEKGGLLYNDIHFNASSKTYHYWHPLSNSIPEIKSSFYAGFEDVDISAFYAAYDISPNNDYETVLKISNHKSKSLIDGEILMPSLKSLWITKEDFLQKNGYTNFSFDIIMPATLQEITTLNISKSWTNCLQKLKFINQNSIHDTRIMVIGGKNSGKSTFLRSLVEKVLYSHDISDKSVSEMLYLDLDPGQPEFSHPDCISMTRLTSNDMNFGQSFGQASPEVLKQYYIGSPSPQEYPTRYLNMVNKLITEFEDTMFAGISCINLPGWVKGFGLNILQKVLEIYKPTDIVYLESPSTVRHFSELRIPKSFSSTMMTEYSPRSYRIPAEFSNAAINNSPEIKFAPSDIRTYKLLCLFHRSDTSNVPTFDFRPLIAKSPKKISYGRAGIHTIIINIEFALVPSHELIQALEGTIVAIYHEENTDDEHDSSSDIRVLSNDDLETAKFITLGLVHSVDEERKYFNIYVPENMVATLKNLGNRFMIERLSTETPFCELSPPNKVLKTDQTSPFISFKTRKKYEHVWKIRKNIKRKGHHL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.15
3	0.18
4	0.19
5	0.19
6	0.19
7	0.19
8	0.19
9	0.18
10	0.17
11	0.16
12	0.17
13	0.17
14	0.18
15	0.19
16	0.2
17	0.19
18	0.19
19	0.17
20	0.17
21	0.22
22	0.24
23	0.3
24	0.31
25	0.38
26	0.4
27	0.41
28	0.4
29	0.38
30	0.38
31	0.33
32	0.33
33	0.28
34	0.27
35	0.26
36	0.25
37	0.23
38	0.21
39	0.17
40	0.16
41	0.13
42	0.12
43	0.13
44	0.13
45	0.14
46	0.16
47	0.23
48	0.25
49	0.3
50	0.32
51	0.31
52	0.31
53	0.3
54	0.27
55	0.25
56	0.27
57	0.29
58	0.28
59	0.28
60	0.28
61	0.27
62	0.26
63	0.22
64	0.18
65	0.11
66	0.1
67	0.13
68	0.16
69	0.17
70	0.2
71	0.2
72	0.23
73	0.24
74	0.26
75	0.25
76	0.24
77	0.25
78	0.29
79	0.3
80	0.27
81	0.26
82	0.24
83	0.22
84	0.23
85	0.19
86	0.12
87	0.1
88	0.12
89	0.12
90	0.14
91	0.16
92	0.15
93	0.18
94	0.19
95	0.19
96	0.17
97	0.17
98	0.16
99	0.16
100	0.15
101	0.15
102	0.19
103	0.2
104	0.25
105	0.31
106	0.33
107	0.34
108	0.37
109	0.39
110	0.37
111	0.39
112	0.37
113	0.34
114	0.31
115	0.29
116	0.26
117	0.23
118	0.21
119	0.2
120	0.17
121	0.14
122	0.15
123	0.14
124	0.14
125	0.13
126	0.12
127	0.1
128	0.1
129	0.09
130	0.07
131	0.07
132	0.06
133	0.05
134	0.05
135	0.05
136	0.04
137	0.06
138	0.06
139	0.08
140	0.1
141	0.1
142	0.12
143	0.13
144	0.13
145	0.12
146	0.16
147	0.16
148	0.16
149	0.17
150	0.2
151	0.27
152	0.35
153	0.35
154	0.33
155	0.34
156	0.34
157	0.39
158	0.38
159	0.31
160	0.24
161	0.24
162	0.23
163	0.21
164	0.2
165	0.13
166	0.09
167	0.08
168	0.08
169	0.06
170	0.06
171	0.07
172	0.09
173	0.15
174	0.17
175	0.18
176	0.24
177	0.32
178	0.32
179	0.33
180	0.35
181	0.3
182	0.34
183	0.35
184	0.31
185	0.24
186	0.23
187	0.22
188	0.19
189	0.19
190	0.14
191	0.15
192	0.12
193	0.12
194	0.1
195	0.09
196	0.08
197	0.08
198	0.08
199	0.06
200	0.06
201	0.07
202	0.08
203	0.09
204	0.08
205	0.1
206	0.11
207	0.13
208	0.13
209	0.17
210	0.23
211	0.26
212	0.31
213	0.38
214	0.38
215	0.42
216	0.46
217	0.47
218	0.48
219	0.46
220	0.5
221	0.46
222	0.49
223	0.49
224	0.46
225	0.4
226	0.33
227	0.31
228	0.23
229	0.19
230	0.15
231	0.1
232	0.09
233	0.09
234	0.12
235	0.12
236	0.12
237	0.11
238	0.12
239	0.13
240	0.13
241	0.17
242	0.19
243	0.2
244	0.22
245	0.23
246	0.25
247	0.26
248	0.26
249	0.2
250	0.17
251	0.18
252	0.17
253	0.16
254	0.14
255	0.15
256	0.15
257	0.15
258	0.16
259	0.13
260	0.13
261	0.14
262	0.13
263	0.1
264	0.1
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.08
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.05
275	0.06
276	0.09
277	0.1
278	0.14
279	0.14
280	0.16
281	0.15
282	0.17
283	0.18
284	0.15
285	0.14
286	0.12
287	0.12
288	0.12
289	0.14
290	0.14
291	0.14
292	0.14
293	0.15
294	0.13
295	0.14
296	0.12
297	0.1
298	0.1
299	0.07
300	0.09
301	0.07
302	0.07
303	0.08
304	0.09
305	0.1
306	0.09
307	0.09
308	0.08
309	0.09
310	0.1
311	0.1
312	0.1
313	0.1
314	0.11
315	0.12
316	0.14
317	0.14
318	0.14
319	0.15
320	0.18
321	0.2
322	0.21
323	0.21
324	0.23
325	0.26
326	0.3
327	0.3
328	0.26
329	0.24
330	0.22
331	0.21
332	0.18
333	0.16
334	0.12
335	0.09
336	0.1
337	0.1
338	0.09
339	0.09
340	0.08
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.05
348	0.06
349	0.06
350	0.08
351	0.09
352	0.09
353	0.1
354	0.1
355	0.1
356	0.13
357	0.13
358	0.12
359	0.12
360	0.11
361	0.1
362	0.1
363	0.11
364	0.09
365	0.09
366	0.1
367	0.11
368	0.12
369	0.12
370	0.13
371	0.12
372	0.13
373	0.13
374	0.13
375	0.12
376	0.11
377	0.11
378	0.1
379	0.12
380	0.12
381	0.1
382	0.11
383	0.12
384	0.12
385	0.22
386	0.29
387	0.31
388	0.33
389	0.35
390	0.33
391	0.37
392	0.37
393	0.28
394	0.24
395	0.21
396	0.2
397	0.21
398	0.21
399	0.18
400	0.19
401	0.22
402	0.2
403	0.21
404	0.2
405	0.2
406	0.24
407	0.26
408	0.3
409	0.26
410	0.31
411	0.29
412	0.28
413	0.31
414	0.27
415	0.24
416	0.2
417	0.19
418	0.15
419	0.16
420	0.16
421	0.11
422	0.12
423	0.13
424	0.12
425	0.13
426	0.19
427	0.18
428	0.23
429	0.23
430	0.25
431	0.25
432	0.27
433	0.29
434	0.27
435	0.29
436	0.25
437	0.32
438	0.31
439	0.33
440	0.36
441	0.35
442	0.32
443	0.33
444	0.37
445	0.35
446	0.33
447	0.32
448	0.29
449	0.28
450	0.29
451	0.25
452	0.2
453	0.2
454	0.2
455	0.26
456	0.33
457	0.37
458	0.37
459	0.45
460	0.49
461	0.49
462	0.51
463	0.48
464	0.49
465	0.51
466	0.49
467	0.45
468	0.42
469	0.38
470	0.37
471	0.33
472	0.23
473	0.17
474	0.15
475	0.11
476	0.08
477	0.08
478	0.06
479	0.06
480	0.07
481	0.06
482	0.07
483	0.07
484	0.08
485	0.08
486	0.08
487	0.08
488	0.08
489	0.09
490	0.08
491	0.07
492	0.06
493	0.06
494	0.05
495	0.05
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.05
500	0.06
501	0.07
502	0.07
503	0.1
504	0.12
505	0.15
506	0.15
507	0.15
508	0.15
509	0.15
510	0.16
511	0.14
512	0.14
513	0.12
514	0.12
515	0.11
516	0.15
517	0.15
518	0.16
519	0.15
520	0.14
521	0.15
522	0.14
523	0.15
524	0.12
525	0.11
526	0.09
527	0.09
528	0.09
529	0.09
530	0.1
531	0.11
532	0.1
533	0.1
534	0.12
535	0.14
536	0.15
537	0.16
538	0.16
539	0.17
540	0.17
541	0.21
542	0.21
543	0.23
544	0.29
545	0.29
546	0.31
547	0.32
548	0.32
549	0.28
550	0.28
551	0.25
552	0.17
553	0.16
554	0.18
555	0.16
556	0.19
557	0.2
558	0.22
559	0.22
560	0.24
561	0.26
562	0.23
563	0.24
564	0.2
565	0.21
566	0.25
567	0.28
568	0.27
569	0.25
570	0.23
571	0.23
572	0.24
573	0.22
574	0.21
575	0.21
576	0.25
577	0.32
578	0.35
579	0.39
580	0.41
581	0.43
582	0.43
583	0.49
584	0.52
585	0.52
586	0.55
587	0.54
588	0.53
589	0.55
590	0.53
591	0.44
592	0.45
593	0.44
594	0.47
595	0.52
596	0.58
597	0.58
598	0.63
599	0.72
600	0.75
601	0.79
602	0.81
603	0.81
604	0.82
605	0.89
606	0.9
607	0.88
608	0.87
609	0.86
610	0.85

Q6FW56

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer