Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FSH3

Protein Details
Accession Q6FSH3    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
656-682VLQCKLDRSRHAKRRKTTNNDNHLLKVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11.5, cyto 7, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001606  ARID_dom  
IPR003347  JmjC_dom  
IPR003349  JmjN  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0032453  F:histone H3K4 demethylase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0071041  P:antisense RNA transcript catabolic process  
GO:1904388  P:negative regulation of ncRNA transcription associated with protein coding gene TSS/TES  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0000183  P:rDNA heterochromatin formation  
GO:1902275  P:regulation of chromatin organization  
GO:0060623  P:regulation of chromosome condensation  
KEGG cgr:CAGL0H00528g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02373  JmjC  
PF02375  JmjN  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51011  ARID  
PS51184  JMJC  
PS51183  JMJN  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15489  PHD_SF  
Amino Acid Sequences MYAMEVPVVYPTEEEFADPIDYLNQPALRRLGKVYGMVRIVPPAGFNPPLALDKARFKFKVRWQNLNELQLLNRARLFFINNLNTFNRLKGHPAHLEHTYVRVATARLHLYDLYIHIMQRKGLLPTKSVLVDKPLWRSFLSRNKLSHTVSPEQLVQVFTSYLQDYYSYLYRMYRKTGSGSIYNAMLYKEAIPHSALQTNDLDSQDDQDHQDNQDNQDDRNEQGEETLRTQEPTPDEPVHHMARMSAAVGADDSELQDWCPICKHIPKDNELDDVSYCDSCSQIFHNRCIKNNNYLNNASGEWICNNCIIGNGFYGFKYSTHYFTLKEFEQKYGTDESPDVDKLEKEFWDLVGNQDVKTTVPYGADIHSEDPAELTGFPTNDKTYSTHPMNLLNLPQASSSLLPFLNRNISGMTIPWIYVGSKFSTFCWHLEDQYTLSANYQHEGSPKVWYSIPDNSCDNFHKLLHDLTPDLFEKQPDLLHQLVSLISPYDPLFKKYNVKWYKAVQHPNEYIVTFPKCYHAGFNTGYNINEAVNFTSESWLPYGLEAISDYQLTKKMPVFDMYELMVNILVMYYRDNLPSPVSDAFLQHCHHELLSYINKETRNIFSVMPFIAQERLLHVSNQLHLDSEDTKEYIQEDDEDGFFCASCSTMCSFVFVLQCKLDRSRHAKRRKTTNNDNHLLKVREFKKHLEEDSDSQVLCLTHFLECKDKSETINSLISLREFNELHHILKLSGNKMDGIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.11
3 0.12
4 0.13
5 0.12
6 0.12
7 0.13
8 0.13
9 0.14
10 0.17
11 0.19
12 0.19
13 0.23
14 0.29
15 0.28
16 0.3
17 0.32
18 0.33
19 0.32
20 0.38
21 0.36
22 0.36
23 0.36
24 0.36
25 0.33
26 0.3
27 0.28
28 0.22
29 0.21
30 0.16
31 0.19
32 0.19
33 0.18
34 0.18
35 0.19
36 0.21
37 0.22
38 0.23
39 0.22
40 0.3
41 0.36
42 0.42
43 0.42
44 0.45
45 0.52
46 0.59
47 0.67
48 0.65
49 0.7
50 0.66
51 0.75
52 0.77
53 0.73
54 0.65
55 0.55
56 0.49
57 0.46
58 0.42
59 0.33
60 0.29
61 0.24
62 0.23
63 0.23
64 0.26
65 0.23
66 0.3
67 0.36
68 0.35
69 0.38
70 0.38
71 0.41
72 0.38
73 0.36
74 0.31
75 0.25
76 0.29
77 0.3
78 0.36
79 0.4
80 0.42
81 0.44
82 0.42
83 0.45
84 0.41
85 0.38
86 0.33
87 0.25
88 0.21
89 0.19
90 0.18
91 0.17
92 0.21
93 0.21
94 0.2
95 0.22
96 0.21
97 0.2
98 0.21
99 0.19
100 0.18
101 0.16
102 0.16
103 0.19
104 0.2
105 0.19
106 0.22
107 0.23
108 0.24
109 0.29
110 0.3
111 0.28
112 0.28
113 0.31
114 0.3
115 0.29
116 0.25
117 0.25
118 0.29
119 0.31
120 0.38
121 0.37
122 0.36
123 0.36
124 0.39
125 0.42
126 0.46
127 0.49
128 0.47
129 0.48
130 0.51
131 0.57
132 0.56
133 0.53
134 0.5
135 0.48
136 0.43
137 0.42
138 0.38
139 0.32
140 0.31
141 0.26
142 0.19
143 0.14
144 0.13
145 0.11
146 0.12
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.12
153 0.14
154 0.13
155 0.13
156 0.17
157 0.23
158 0.24
159 0.29
160 0.29
161 0.29
162 0.32
163 0.35
164 0.35
165 0.32
166 0.32
167 0.29
168 0.26
169 0.25
170 0.22
171 0.17
172 0.14
173 0.11
174 0.1
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.13
179 0.14
180 0.16
181 0.19
182 0.18
183 0.18
184 0.18
185 0.19
186 0.21
187 0.2
188 0.19
189 0.15
190 0.18
191 0.16
192 0.17
193 0.17
194 0.16
195 0.18
196 0.18
197 0.24
198 0.24
199 0.25
200 0.31
201 0.3
202 0.28
203 0.31
204 0.31
205 0.26
206 0.26
207 0.24
208 0.17
209 0.18
210 0.22
211 0.19
212 0.19
213 0.22
214 0.19
215 0.2
216 0.21
217 0.22
218 0.22
219 0.23
220 0.26
221 0.24
222 0.24
223 0.27
224 0.31
225 0.29
226 0.26
227 0.23
228 0.18
229 0.17
230 0.16
231 0.13
232 0.09
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.1
248 0.13
249 0.18
250 0.24
251 0.3
252 0.35
253 0.38
254 0.43
255 0.43
256 0.44
257 0.39
258 0.34
259 0.27
260 0.23
261 0.21
262 0.15
263 0.13
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.1
269 0.18
270 0.2
271 0.27
272 0.36
273 0.38
274 0.42
275 0.47
276 0.47
277 0.47
278 0.51
279 0.49
280 0.45
281 0.44
282 0.41
283 0.37
284 0.34
285 0.25
286 0.2
287 0.16
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.12
305 0.13
306 0.14
307 0.17
308 0.18
309 0.18
310 0.19
311 0.23
312 0.2
313 0.25
314 0.23
315 0.22
316 0.23
317 0.22
318 0.23
319 0.23
320 0.22
321 0.17
322 0.16
323 0.15
324 0.15
325 0.15
326 0.13
327 0.1
328 0.1
329 0.1
330 0.12
331 0.11
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.16
339 0.16
340 0.14
341 0.14
342 0.14
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.07
347 0.07
348 0.08
349 0.08
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.07
358 0.07
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.08
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.11
370 0.13
371 0.2
372 0.21
373 0.22
374 0.23
375 0.24
376 0.24
377 0.24
378 0.21
379 0.16
380 0.15
381 0.12
382 0.11
383 0.1
384 0.09
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.12
393 0.11
394 0.12
395 0.1
396 0.11
397 0.11
398 0.1
399 0.11
400 0.08
401 0.08
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.08
406 0.09
407 0.09
408 0.1
409 0.11
410 0.11
411 0.16
412 0.17
413 0.17
414 0.21
415 0.2
416 0.19
417 0.2
418 0.21
419 0.16
420 0.17
421 0.17
422 0.12
423 0.12
424 0.14
425 0.13
426 0.12
427 0.12
428 0.11
429 0.12
430 0.14
431 0.14
432 0.15
433 0.16
434 0.17
435 0.17
436 0.17
437 0.2
438 0.26
439 0.26
440 0.25
441 0.27
442 0.25
443 0.28
444 0.29
445 0.28
446 0.21
447 0.21
448 0.19
449 0.19
450 0.2
451 0.18
452 0.17
453 0.15
454 0.13
455 0.16
456 0.15
457 0.15
458 0.15
459 0.13
460 0.13
461 0.13
462 0.13
463 0.12
464 0.15
465 0.13
466 0.13
467 0.13
468 0.12
469 0.11
470 0.1
471 0.1
472 0.06
473 0.05
474 0.06
475 0.07
476 0.13
477 0.13
478 0.17
479 0.2
480 0.22
481 0.3
482 0.32
483 0.43
484 0.42
485 0.46
486 0.47
487 0.5
488 0.56
489 0.57
490 0.64
491 0.57
492 0.59
493 0.56
494 0.54
495 0.49
496 0.4
497 0.32
498 0.28
499 0.26
500 0.19
501 0.18
502 0.19
503 0.18
504 0.19
505 0.21
506 0.18
507 0.21
508 0.22
509 0.24
510 0.25
511 0.25
512 0.24
513 0.22
514 0.2
515 0.15
516 0.14
517 0.12
518 0.1
519 0.09
520 0.1
521 0.09
522 0.11
523 0.11
524 0.11
525 0.11
526 0.11
527 0.1
528 0.09
529 0.1
530 0.08
531 0.08
532 0.07
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.09
537 0.09
538 0.12
539 0.12
540 0.15
541 0.17
542 0.2
543 0.21
544 0.24
545 0.26
546 0.25
547 0.26
548 0.23
549 0.22
550 0.18
551 0.16
552 0.13
553 0.09
554 0.08
555 0.06
556 0.05
557 0.04
558 0.05
559 0.07
560 0.08
561 0.1
562 0.11
563 0.12
564 0.14
565 0.14
566 0.16
567 0.15
568 0.16
569 0.15
570 0.16
571 0.18
572 0.21
573 0.21
574 0.18
575 0.2
576 0.19
577 0.18
578 0.17
579 0.15
580 0.17
581 0.23
582 0.24
583 0.24
584 0.27
585 0.28
586 0.3
587 0.32
588 0.29
589 0.26
590 0.26
591 0.24
592 0.22
593 0.23
594 0.22
595 0.2
596 0.16
597 0.14
598 0.14
599 0.14
600 0.13
601 0.13
602 0.17
603 0.17
604 0.17
605 0.2
606 0.2
607 0.22
608 0.25
609 0.22
610 0.19
611 0.18
612 0.2
613 0.18
614 0.18
615 0.17
616 0.15
617 0.15
618 0.15
619 0.16
620 0.14
621 0.14
622 0.13
623 0.13
624 0.14
625 0.14
626 0.14
627 0.14
628 0.13
629 0.12
630 0.1
631 0.08
632 0.07
633 0.07
634 0.09
635 0.1
636 0.13
637 0.13
638 0.15
639 0.16
640 0.19
641 0.24
642 0.24
643 0.25
644 0.25
645 0.27
646 0.28
647 0.33
648 0.35
649 0.39
650 0.46
651 0.54
652 0.61
653 0.7
654 0.76
655 0.79
656 0.86
657 0.88
658 0.89
659 0.89
660 0.9
661 0.89
662 0.88
663 0.82
664 0.77
665 0.74
666 0.67
667 0.58
668 0.57
669 0.53
670 0.54
671 0.54
672 0.54
673 0.55
674 0.59
675 0.6
676 0.57
677 0.57
678 0.52
679 0.55
680 0.52
681 0.43
682 0.35
683 0.34
684 0.27
685 0.21
686 0.18
687 0.13
688 0.14
689 0.16
690 0.19
691 0.25
692 0.26
693 0.3
694 0.34
695 0.35
696 0.34
697 0.38
698 0.39
699 0.36
700 0.38
701 0.35
702 0.31
703 0.3
704 0.28
705 0.24
706 0.22
707 0.23
708 0.19
709 0.2
710 0.27
711 0.28
712 0.28
713 0.3
714 0.3
715 0.25
716 0.3
717 0.35
718 0.29
719 0.3
720 0.3