Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FMD6

Protein Details
Accession Q6FMD6    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-73KALRHFKKKLMEHRRYDDQLBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 13, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005937  26S_Psome_P45-like  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR041569  AAA_lid_3  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR003960  ATPase_AAA_CS  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR032501  Prot_ATP_ID_OB_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008540  C:proteasome regulatory particle, base subcomplex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0036402  F:proteasome-activating activity  
GO:0019904  F:protein domain specific binding  
GO:0031625  F:ubiquitin protein ligase binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0045899  P:positive regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0070682  P:proteasome regulatory particle assembly  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
KEGG cgr:CAGL0K08910g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF17862  AAA_lid_3  
PF16450  Prot_ATP_ID_OB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00674  AAA  
Amino Acid Sequences MSEEQDPLLAALNESNNNGGSGDNAAVSGEASAEPLEAAPEPEPVDPEKEAYEKALRHFKKKLMEHRRYDDQLKQRRQTIRDLEKIYDKTENDIKALQSIGQLIGEVMKELSEEKYIVKASSGPRYIVGVRNSVDRSKLKKGVRVTLDITTLTIMRILPRETDPLVYNMTSFEQGEISFEGIGGLTDQIRELREVIELPLKNPEIFQRVGIKPPKGVLLYGPPGTGKTLLAKAVAATIGANFIFSPASGIVDKYIGESARIIREMFAYAKEHEPCIIFMDEVDAIGGRRFSEGTSADREIQRTLMELLTQMDGFDNLGQTKIIMATNRPDTLDPALLRPGRLDRKIEIPLPNEAGRLEIFKIHTSKVKKSGEFDFDAAVKMSDGFNGADIRNCATEAGFFAIRDDRDHIIPEDLMKAVRKVAEVKKLEGTLEYQKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.16
4 0.17
5 0.16
6 0.13
7 0.11
8 0.11
9 0.11
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.08
14 0.08
15 0.07
16 0.06
17 0.05
18 0.06
19 0.06
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.07
24 0.07
25 0.09
26 0.09
27 0.11
28 0.13
29 0.13
30 0.15
31 0.16
32 0.19
33 0.18
34 0.19
35 0.2
36 0.2
37 0.2
38 0.23
39 0.27
40 0.26
41 0.32
42 0.41
43 0.42
44 0.47
45 0.53
46 0.55
47 0.58
48 0.65
49 0.7
50 0.7
51 0.76
52 0.78
53 0.79
54 0.82
55 0.78
56 0.74
57 0.72
58 0.71
59 0.71
60 0.72
61 0.7
62 0.69
63 0.71
64 0.69
65 0.7
66 0.7
67 0.69
68 0.68
69 0.66
70 0.61
71 0.61
72 0.6
73 0.53
74 0.49
75 0.39
76 0.36
77 0.38
78 0.36
79 0.3
80 0.31
81 0.28
82 0.24
83 0.24
84 0.2
85 0.15
86 0.14
87 0.13
88 0.1
89 0.1
90 0.08
91 0.09
92 0.08
93 0.07
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.12
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.16
107 0.19
108 0.26
109 0.28
110 0.25
111 0.25
112 0.27
113 0.29
114 0.3
115 0.28
116 0.24
117 0.23
118 0.27
119 0.29
120 0.27
121 0.3
122 0.3
123 0.34
124 0.38
125 0.45
126 0.43
127 0.47
128 0.51
129 0.54
130 0.52
131 0.5
132 0.45
133 0.39
134 0.37
135 0.32
136 0.27
137 0.19
138 0.16
139 0.11
140 0.1
141 0.07
142 0.08
143 0.1
144 0.1
145 0.12
146 0.13
147 0.16
148 0.15
149 0.17
150 0.17
151 0.17
152 0.18
153 0.15
154 0.14
155 0.12
156 0.12
157 0.11
158 0.1
159 0.09
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.17
187 0.17
188 0.17
189 0.17
190 0.18
191 0.16
192 0.16
193 0.17
194 0.2
195 0.21
196 0.27
197 0.31
198 0.3
199 0.27
200 0.27
201 0.28
202 0.21
203 0.2
204 0.15
205 0.15
206 0.17
207 0.16
208 0.16
209 0.13
210 0.13
211 0.14
212 0.13
213 0.09
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.06
223 0.05
224 0.04
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.04
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.11
247 0.12
248 0.11
249 0.1
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.13
256 0.18
257 0.18
258 0.18
259 0.17
260 0.17
261 0.16
262 0.17
263 0.16
264 0.11
265 0.1
266 0.12
267 0.1
268 0.09
269 0.09
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.1
279 0.11
280 0.14
281 0.18
282 0.2
283 0.23
284 0.24
285 0.25
286 0.22
287 0.22
288 0.19
289 0.15
290 0.15
291 0.12
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.07
299 0.07
300 0.08
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.11
312 0.16
313 0.2
314 0.21
315 0.22
316 0.21
317 0.22
318 0.24
319 0.27
320 0.22
321 0.2
322 0.26
323 0.26
324 0.25
325 0.25
326 0.3
327 0.33
328 0.36
329 0.38
330 0.33
331 0.39
332 0.43
333 0.46
334 0.44
335 0.39
336 0.39
337 0.4
338 0.38
339 0.33
340 0.28
341 0.24
342 0.19
343 0.19
344 0.16
345 0.15
346 0.16
347 0.2
348 0.22
349 0.23
350 0.29
351 0.32
352 0.39
353 0.45
354 0.51
355 0.49
356 0.51
357 0.56
358 0.56
359 0.54
360 0.48
361 0.41
362 0.34
363 0.32
364 0.28
365 0.21
366 0.15
367 0.12
368 0.11
369 0.09
370 0.1
371 0.09
372 0.1
373 0.13
374 0.13
375 0.16
376 0.17
377 0.18
378 0.17
379 0.18
380 0.16
381 0.13
382 0.14
383 0.12
384 0.16
385 0.15
386 0.14
387 0.16
388 0.2
389 0.21
390 0.22
391 0.24
392 0.23
393 0.23
394 0.26
395 0.26
396 0.24
397 0.24
398 0.23
399 0.22
400 0.2
401 0.21
402 0.2
403 0.19
404 0.2
405 0.21
406 0.22
407 0.28
408 0.34
409 0.42
410 0.43
411 0.46
412 0.49
413 0.48
414 0.46
415 0.4
416 0.37