Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CIR1

Protein Details
Accession Q6CIR1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-85DVSANRIYRSKKSKRSRKQIKAQEYEIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-76RSKKSKRSRKQ
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000690  Matrin/U1-C_Znf_C2H2  
IPR031590  PRP9_N  
IPR031774  SF3A3_dom  
IPR024598  SF3a60/Prp9_C  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG kla:KLLA0_F24662g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16958  PRP9_N  
PF16837  SF3A3  
PF11931  SF3a60_Prp9_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50171  ZF_MATRIN  
Amino Acid Sequences MNAPTYLCFEERRKILEELEVIEDAISSRLRRNPEIFYRFNEALHNLGVEAWAVPKLDVSANRIYRSKKSKRSRKQIKAQEYEIALFLGRYRRLLKSLQKHKLSEEHLEYFRDTNASFEQFETVTTEVLEGQVNSRSLVEVKSDYEMFSGPQAASKNIISPIGQIIDLSRNFARDENFGTYLDLSEQFKKWLNIIKRADLTILSFLKMLESFETYDYLLNPSLDRDTKEYNQLVTELLKYYKAYYSKAYPLVDKEILSKTIHNGFDKYVRTGITESPSKESGKMYSVVFNRWFDSQSEFNTHVQTEQFNIALSRNRKRLMKEYTFHCFSKFLSKVLQNTISFTERKLAFTDEEFTEELEKLQEQYESPIYAKDESEDKPSYIDNAEDTAQKESMDPTNPYNLPLGPDGFPIPRWLIKVQGLDVKYVCEICGNQIYHGRREFEKHFPLKKHSEGLKSLGITPSLAFKDVTTIVEVTELWKALQAKSTLKSGEPFSKISTVKEPEMVLETEDNEGNVMSVQVYEELKKQGLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.41
3 0.41
4 0.39
5 0.34
6 0.34
7 0.29
8 0.25
9 0.22
10 0.2
11 0.14
12 0.14
13 0.13
14 0.11
15 0.16
16 0.21
17 0.27
18 0.33
19 0.37
20 0.43
21 0.52
22 0.58
23 0.56
24 0.57
25 0.59
26 0.54
27 0.51
28 0.46
29 0.37
30 0.31
31 0.29
32 0.24
33 0.16
34 0.15
35 0.14
36 0.1
37 0.09
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.1
44 0.14
45 0.16
46 0.2
47 0.28
48 0.32
49 0.36
50 0.4
51 0.42
52 0.48
53 0.56
54 0.61
55 0.63
56 0.7
57 0.77
58 0.84
59 0.91
60 0.93
61 0.94
62 0.94
63 0.94
64 0.94
65 0.9
66 0.82
67 0.77
68 0.68
69 0.58
70 0.47
71 0.37
72 0.26
73 0.18
74 0.18
75 0.18
76 0.16
77 0.18
78 0.22
79 0.24
80 0.27
81 0.35
82 0.42
83 0.47
84 0.57
85 0.63
86 0.66
87 0.66
88 0.67
89 0.67
90 0.62
91 0.59
92 0.54
93 0.5
94 0.46
95 0.45
96 0.43
97 0.36
98 0.32
99 0.26
100 0.19
101 0.16
102 0.17
103 0.18
104 0.17
105 0.17
106 0.18
107 0.16
108 0.16
109 0.16
110 0.13
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.07
118 0.08
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.12
125 0.13
126 0.14
127 0.12
128 0.13
129 0.15
130 0.15
131 0.15
132 0.14
133 0.14
134 0.12
135 0.11
136 0.12
137 0.09
138 0.12
139 0.13
140 0.12
141 0.14
142 0.14
143 0.16
144 0.15
145 0.16
146 0.13
147 0.13
148 0.14
149 0.13
150 0.12
151 0.1
152 0.1
153 0.15
154 0.14
155 0.17
156 0.15
157 0.15
158 0.16
159 0.18
160 0.19
161 0.15
162 0.19
163 0.2
164 0.21
165 0.2
166 0.2
167 0.18
168 0.17
169 0.16
170 0.14
171 0.13
172 0.14
173 0.14
174 0.16
175 0.19
176 0.19
177 0.2
178 0.26
179 0.28
180 0.35
181 0.38
182 0.41
183 0.39
184 0.39
185 0.37
186 0.29
187 0.26
188 0.22
189 0.19
190 0.14
191 0.13
192 0.13
193 0.13
194 0.12
195 0.12
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.1
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.11
210 0.12
211 0.13
212 0.14
213 0.18
214 0.19
215 0.25
216 0.25
217 0.23
218 0.23
219 0.22
220 0.19
221 0.15
222 0.15
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.11
228 0.14
229 0.14
230 0.15
231 0.16
232 0.19
233 0.23
234 0.27
235 0.26
236 0.24
237 0.24
238 0.27
239 0.25
240 0.22
241 0.2
242 0.18
243 0.19
244 0.18
245 0.17
246 0.15
247 0.2
248 0.21
249 0.19
250 0.19
251 0.18
252 0.23
253 0.23
254 0.22
255 0.18
256 0.16
257 0.17
258 0.17
259 0.18
260 0.16
261 0.18
262 0.18
263 0.2
264 0.22
265 0.21
266 0.21
267 0.2
268 0.17
269 0.16
270 0.17
271 0.15
272 0.18
273 0.19
274 0.21
275 0.23
276 0.22
277 0.22
278 0.2
279 0.21
280 0.16
281 0.19
282 0.18
283 0.17
284 0.2
285 0.21
286 0.21
287 0.21
288 0.21
289 0.18
290 0.16
291 0.15
292 0.13
293 0.11
294 0.1
295 0.09
296 0.1
297 0.1
298 0.15
299 0.2
300 0.25
301 0.28
302 0.32
303 0.35
304 0.38
305 0.45
306 0.49
307 0.52
308 0.51
309 0.51
310 0.55
311 0.56
312 0.53
313 0.45
314 0.36
315 0.29
316 0.34
317 0.3
318 0.24
319 0.25
320 0.28
321 0.3
322 0.34
323 0.39
324 0.29
325 0.3
326 0.32
327 0.29
328 0.26
329 0.23
330 0.26
331 0.21
332 0.22
333 0.21
334 0.2
335 0.19
336 0.2
337 0.23
338 0.16
339 0.18
340 0.17
341 0.16
342 0.15
343 0.14
344 0.13
345 0.1
346 0.1
347 0.08
348 0.09
349 0.1
350 0.08
351 0.12
352 0.13
353 0.14
354 0.14
355 0.15
356 0.15
357 0.16
358 0.16
359 0.14
360 0.16
361 0.16
362 0.22
363 0.22
364 0.21
365 0.21
366 0.21
367 0.21
368 0.18
369 0.17
370 0.12
371 0.12
372 0.13
373 0.14
374 0.15
375 0.16
376 0.15
377 0.15
378 0.15
379 0.15
380 0.18
381 0.19
382 0.2
383 0.2
384 0.27
385 0.27
386 0.27
387 0.27
388 0.23
389 0.22
390 0.22
391 0.22
392 0.15
393 0.17
394 0.17
395 0.17
396 0.16
397 0.17
398 0.18
399 0.17
400 0.2
401 0.19
402 0.22
403 0.26
404 0.28
405 0.27
406 0.31
407 0.3
408 0.29
409 0.29
410 0.25
411 0.22
412 0.2
413 0.17
414 0.13
415 0.13
416 0.14
417 0.21
418 0.2
419 0.21
420 0.28
421 0.32
422 0.36
423 0.39
424 0.39
425 0.33
426 0.39
427 0.42
428 0.44
429 0.51
430 0.54
431 0.58
432 0.6
433 0.66
434 0.67
435 0.67
436 0.66
437 0.63
438 0.61
439 0.56
440 0.55
441 0.52
442 0.46
443 0.44
444 0.37
445 0.31
446 0.25
447 0.22
448 0.23
449 0.19
450 0.19
451 0.16
452 0.14
453 0.18
454 0.19
455 0.2
456 0.16
457 0.15
458 0.14
459 0.15
460 0.15
461 0.12
462 0.13
463 0.12
464 0.1
465 0.14
466 0.16
467 0.16
468 0.22
469 0.24
470 0.26
471 0.29
472 0.34
473 0.32
474 0.32
475 0.34
476 0.34
477 0.39
478 0.37
479 0.37
480 0.35
481 0.41
482 0.41
483 0.41
484 0.44
485 0.41
486 0.4
487 0.41
488 0.38
489 0.32
490 0.35
491 0.31
492 0.25
493 0.21
494 0.2
495 0.19
496 0.19
497 0.17
498 0.13
499 0.13
500 0.11
501 0.09
502 0.08
503 0.06
504 0.06
505 0.07
506 0.09
507 0.11
508 0.13
509 0.17
510 0.2