Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FPT2

Protein Details
Accession Q6FPT2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
334-356ASGNRPPRISRTRRKRSLEDDETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
311-349LRKKKYGIIKSDRHHPRANPAPAASGNRPPRISRTRRKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 15, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006774  BAF1_ABF1  
Gene Ontology GO:0000113  C:nucleotide-excision repair factor 4 complex  
GO:0003688  F:DNA replication origin binding  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0044374  F:sequence-specific DNA binding, bending  
GO:0006261  P:DNA-templated DNA replication  
GO:0070911  P:global genome nucleotide-excision repair  
GO:0000278  P:mitotic cell cycle  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0030466  P:silent mating-type cassette heterochromatin formation  
KEGG cgr:CAGL0J01177g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04684  BAF1_ABF1  
Amino Acid Sequences MDDGMISEGVKDVYEYSHPIINNALAVSASEQQGKEVRRFATLADWYDVINDYEFQSRCPIILKNSHRNKHFTFACHLKNCPFKILLSYSSAGMHHGHAQDDMYRSKDEDVDALNDGAHDHKLEYHDVDDPQVTAAIAAAVAAVGKDSSDPHNAATAAATAAAAATNGGEDHKNLVQDTQPSAHSQAQAQASVRPNSNAPETIRGPFVVTKIIPYHDHPVQDNLSLDKFVLTKIPRILQNELNFDDVLETLVAEGASDGDVAKFRVSEYVEHSGLLDIIKARYDLMDSDITKKFLSQIARRVTTYKARFVLRKKKYGIIKSDRHHPRANPAPAASGNRPPRISRTRRKRSLEDDETEIAQEALKNSMMDDVDHQRHIDDDDEEHARKLARLGEDTDLHSGIHDDGDHSSTQNAAMHEINPLASIDEVTDDKLPREVAEQLRLLSSHFKDVENQNLQDEEGKKNSAEISDENIQPELRGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.15
3 0.17
4 0.21
5 0.21
6 0.21
7 0.23
8 0.21
9 0.2
10 0.17
11 0.15
12 0.1
13 0.11
14 0.12
15 0.13
16 0.14
17 0.17
18 0.17
19 0.19
20 0.25
21 0.28
22 0.3
23 0.33
24 0.32
25 0.32
26 0.32
27 0.3
28 0.33
29 0.35
30 0.33
31 0.3
32 0.29
33 0.26
34 0.27
35 0.27
36 0.19
37 0.15
38 0.13
39 0.12
40 0.19
41 0.19
42 0.19
43 0.22
44 0.22
45 0.21
46 0.24
47 0.25
48 0.24
49 0.34
50 0.43
51 0.48
52 0.59
53 0.65
54 0.67
55 0.71
56 0.68
57 0.68
58 0.63
59 0.57
60 0.55
61 0.56
62 0.6
63 0.57
64 0.57
65 0.55
66 0.58
67 0.56
68 0.52
69 0.44
70 0.36
71 0.38
72 0.38
73 0.34
74 0.3
75 0.29
76 0.25
77 0.25
78 0.25
79 0.2
80 0.18
81 0.17
82 0.17
83 0.17
84 0.17
85 0.16
86 0.17
87 0.18
88 0.21
89 0.21
90 0.19
91 0.18
92 0.19
93 0.2
94 0.21
95 0.18
96 0.17
97 0.17
98 0.16
99 0.17
100 0.16
101 0.14
102 0.13
103 0.12
104 0.11
105 0.1
106 0.08
107 0.07
108 0.09
109 0.12
110 0.14
111 0.14
112 0.15
113 0.18
114 0.18
115 0.19
116 0.17
117 0.15
118 0.13
119 0.12
120 0.1
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.04
125 0.03
126 0.03
127 0.02
128 0.02
129 0.02
130 0.02
131 0.02
132 0.02
133 0.03
134 0.05
135 0.08
136 0.11
137 0.12
138 0.13
139 0.15
140 0.15
141 0.15
142 0.14
143 0.12
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.03
151 0.03
152 0.02
153 0.02
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.13
164 0.15
165 0.17
166 0.16
167 0.15
168 0.16
169 0.19
170 0.2
171 0.19
172 0.17
173 0.2
174 0.19
175 0.2
176 0.2
177 0.21
178 0.23
179 0.25
180 0.25
181 0.2
182 0.2
183 0.21
184 0.22
185 0.2
186 0.17
187 0.2
188 0.21
189 0.22
190 0.21
191 0.19
192 0.19
193 0.17
194 0.16
195 0.13
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.14
200 0.15
201 0.16
202 0.2
203 0.2
204 0.22
205 0.2
206 0.22
207 0.22
208 0.21
209 0.19
210 0.16
211 0.14
212 0.12
213 0.11
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.11
218 0.11
219 0.14
220 0.16
221 0.19
222 0.21
223 0.24
224 0.27
225 0.28
226 0.3
227 0.31
228 0.3
229 0.28
230 0.24
231 0.21
232 0.18
233 0.13
234 0.1
235 0.06
236 0.05
237 0.03
238 0.04
239 0.04
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.08
253 0.09
254 0.1
255 0.14
256 0.19
257 0.19
258 0.19
259 0.19
260 0.16
261 0.15
262 0.14
263 0.1
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.08
273 0.12
274 0.13
275 0.18
276 0.2
277 0.21
278 0.2
279 0.2
280 0.18
281 0.18
282 0.24
283 0.23
284 0.3
285 0.35
286 0.38
287 0.39
288 0.39
289 0.39
290 0.42
291 0.41
292 0.38
293 0.36
294 0.37
295 0.42
296 0.5
297 0.57
298 0.55
299 0.6
300 0.57
301 0.6
302 0.64
303 0.66
304 0.66
305 0.65
306 0.66
307 0.61
308 0.68
309 0.7
310 0.67
311 0.65
312 0.56
313 0.56
314 0.58
315 0.59
316 0.52
317 0.44
318 0.42
319 0.4
320 0.43
321 0.37
322 0.35
323 0.37
324 0.38
325 0.39
326 0.37
327 0.43
328 0.48
329 0.56
330 0.58
331 0.63
332 0.7
333 0.78
334 0.84
335 0.83
336 0.82
337 0.83
338 0.8
339 0.72
340 0.66
341 0.58
342 0.51
343 0.44
344 0.35
345 0.24
346 0.16
347 0.14
348 0.09
349 0.09
350 0.1
351 0.09
352 0.09
353 0.12
354 0.12
355 0.11
356 0.15
357 0.21
358 0.23
359 0.24
360 0.24
361 0.21
362 0.21
363 0.22
364 0.2
365 0.14
366 0.12
367 0.15
368 0.2
369 0.21
370 0.2
371 0.21
372 0.19
373 0.19
374 0.2
375 0.21
376 0.2
377 0.21
378 0.24
379 0.27
380 0.28
381 0.3
382 0.29
383 0.25
384 0.21
385 0.19
386 0.17
387 0.13
388 0.11
389 0.09
390 0.08
391 0.09
392 0.12
393 0.12
394 0.11
395 0.11
396 0.11
397 0.12
398 0.14
399 0.13
400 0.14
401 0.15
402 0.15
403 0.16
404 0.16
405 0.15
406 0.12
407 0.12
408 0.1
409 0.09
410 0.08
411 0.07
412 0.09
413 0.09
414 0.11
415 0.14
416 0.15
417 0.15
418 0.18
419 0.18
420 0.16
421 0.18
422 0.24
423 0.24
424 0.3
425 0.31
426 0.29
427 0.3
428 0.3
429 0.29
430 0.3
431 0.27
432 0.28
433 0.28
434 0.28
435 0.34
436 0.39
437 0.47
438 0.46
439 0.46
440 0.4
441 0.39
442 0.39
443 0.39
444 0.37
445 0.32
446 0.29
447 0.3
448 0.27
449 0.29
450 0.3
451 0.25
452 0.26
453 0.22
454 0.26
455 0.3
456 0.32
457 0.32
458 0.31
459 0.29