FuNGI

A0A0C3SC43

Protein Details

Accession

A0A0C3SC43

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
272-298	YELSDKPKEKGRDKRRKNSTSSAQRFG	Hydrophilic
301-321	KDPAKEPKKVKPRATVKWPWS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
277-313	KPKEKGRDKRRKNSTSSAQRFGDQKDPAKEPKKVKPR

Subcellular Location(s)

mito 8, cyto 7.5, extr 6, cyto_nucl 5, plas 2, nucl 1.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MKVITTLHPPSAVISSVKCTLSAKSELGHLVVAKPNRIEVSSLQPEGLKAECSLEIWGRIMSIRAVPAETAGVSNILVLTDHPDPKLILLKYTETEESSFLTDVWSDSLFDRNSRPAEYLTDIIMHPAGRAAVVSCYVGKLRILTFKAGKVDKNFDAILPELNLLALSFLYSESNGHTHTLAIAHIDHRQRIQLLARELDVNTLDLAVEVAYTIPHAILPANEFPFTEYPLRIVSIPPFSITQSPNGEDPEAGPARCRGGVIVLGGRKINFYELSDKPKEKGRDKRRKNSTSSAQRFGDQKDPAKEPKKVKPRATVKWPWSEVAACCPADDEMRRFFIGDVYGRMSLLVLSDTPELILIPLGETSAPTTISYLTSQVFYLGSLSGDSQLIRVCASPQSDIDSDTLPIPASISTIAPSALGVPRAESPDDDYDMRIVDMREARGGKVVKTKGNYIEVLSRFKNIAPILDAVLADPDESGQSQIVTCSGGSNTGALNLIRTGADFQELAMLDEVPNVTNIWPIRASHEDACDKYVLATTLYESYLLRVDGRDSVHRVEAADTGFVLEQRTLAVGNIPRRTVSPAGASSYVNSSLVIQITPHGLALLEYDPTLDTFTKVGNGWYLPQQDNPLWRPREIVAAAINPSQFAVALSGGIVVQFNLSPDNQITLVSSKEFEGREIAAVSCTSFDQTKSFSLYVAVSFWESNTVALLDIKHGLQIKTESTPLPALPRSLLLHNFGTGNSKKEPDFQPYVVAGLADGTVACVTFRNEELKDHKLFSLGTAPVSLSRWDVEGRRSVFATGSRSAVFYWDRQRLRQSPVMLKSATAGSSLNTAGFPACQIIATPSSLVIGQTRGVDKMQIRSIILGLESPRRIAYNPRLNLFGVSLFRTTPARIGDADNQESIFRILDGTTMNSLNEFIVELDEEITAVHALTHRDVAATFAVGTMRNQIGEYEPSAGRLLLFNHSIGREMQKIAEIDVGGCVYAIASIASFIALAVNTSVDLYTTVEHLGNVTLQKVASWNHNYIVASLVAKGNKLIAGDAISSVSILEVAQGSLRTVARDYGPVWPVAIEATRDGGVIVSNTDSNILTFSLPEAREGRVLERTGNYYLGENINKFIVGGLSVQASTDGQRPLFETEHIFFTATGRIGLVHHVNDDISLDLTAIQRNMANRIVGPGQTKHAQWRTPANSRGRSDIDDSAIGFLDGDFLEQFLTHPDQENILEGKISAERISRSVEDVEDILEKLQGLQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.21
3	0.25
4	0.25
5	0.24
6	0.23
7	0.23
8	0.27
9	0.29
10	0.27
11	0.23
12	0.26
13	0.27
14	0.26
15	0.25
16	0.21
17	0.2
18	0.25
19	0.27
20	0.26
21	0.26
22	0.28
23	0.28
24	0.28
25	0.27
26	0.24
27	0.31
28	0.35
29	0.35
30	0.32
31	0.31
32	0.3
33	0.3
34	0.28
35	0.19
36	0.13
37	0.15
38	0.15
39	0.15
40	0.18
41	0.17
42	0.18
43	0.18
44	0.17
45	0.15
46	0.15
47	0.16
48	0.14
49	0.14
50	0.15
51	0.15
52	0.16
53	0.15
54	0.15
55	0.15
56	0.14
57	0.12
58	0.1
59	0.1
60	0.08
61	0.09
62	0.08
63	0.07
64	0.06
65	0.06
66	0.1
67	0.15
68	0.17
69	0.17
70	0.19
71	0.19
72	0.21
73	0.29
74	0.25
75	0.23
76	0.24
77	0.27
78	0.27
79	0.31
80	0.3
81	0.24
82	0.25
83	0.23
84	0.21
85	0.2
86	0.19
87	0.15
88	0.14
89	0.13
90	0.12
91	0.13
92	0.12
93	0.11
94	0.11
95	0.18
96	0.18
97	0.2
98	0.23
99	0.27
100	0.29
101	0.3
102	0.31
103	0.26
104	0.3
105	0.31
106	0.29
107	0.24
108	0.24
109	0.21
110	0.21
111	0.2
112	0.16
113	0.12
114	0.12
115	0.11
116	0.08
117	0.09
118	0.08
119	0.08
120	0.09
121	0.11
122	0.1
123	0.12
124	0.12
125	0.13
126	0.13
127	0.14
128	0.16
129	0.22
130	0.24
131	0.29
132	0.32
133	0.34
134	0.41
135	0.42
136	0.45
137	0.43
138	0.47
139	0.43
140	0.43
141	0.4
142	0.33
143	0.32
144	0.28
145	0.24
146	0.18
147	0.17
148	0.13
149	0.12
150	0.11
151	0.08
152	0.08
153	0.05
154	0.04
155	0.04
156	0.05
157	0.06
158	0.06
159	0.07
160	0.09
161	0.11
162	0.12
163	0.13
164	0.13
165	0.12
166	0.13
167	0.13
168	0.11
169	0.11
170	0.11
171	0.11
172	0.18
173	0.21
174	0.22
175	0.23
176	0.25
177	0.24
178	0.27
179	0.31
180	0.31
181	0.32
182	0.32
183	0.32
184	0.31
185	0.3
186	0.29
187	0.23
188	0.17
189	0.13
190	0.11
191	0.1
192	0.07
193	0.07
194	0.05
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.03
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.05
204	0.05
205	0.06
206	0.1
207	0.15
208	0.16
209	0.17
210	0.17
211	0.2
212	0.2
213	0.23
214	0.22
215	0.18
216	0.17
217	0.18
218	0.2
219	0.17
220	0.17
221	0.18
222	0.19
223	0.19
224	0.19
225	0.19
226	0.2
227	0.24
228	0.24
229	0.26
230	0.25
231	0.26
232	0.27
233	0.28
234	0.26
235	0.21
236	0.21
237	0.23
238	0.22
239	0.2
240	0.19
241	0.19
242	0.21
243	0.21
244	0.2
245	0.12
246	0.12
247	0.14
248	0.15
249	0.18
250	0.17
251	0.18
252	0.19
253	0.19
254	0.18
255	0.16
256	0.17
257	0.13
258	0.14
259	0.2
260	0.23
261	0.31
262	0.36
263	0.37
264	0.37
265	0.44
266	0.49
267	0.52
268	0.59
269	0.62
270	0.67
271	0.76
272	0.85
273	0.88
274	0.88
275	0.87
276	0.85
277	0.85
278	0.85
279	0.81
280	0.78
281	0.68
282	0.63
283	0.59
284	0.53
285	0.5
286	0.43
287	0.43
288	0.41
289	0.45
290	0.51
291	0.54
292	0.58
293	0.58
294	0.63
295	0.67
296	0.7
297	0.73
298	0.74
299	0.77
300	0.78
301	0.81
302	0.8
303	0.76
304	0.76
305	0.71
306	0.61
307	0.53
308	0.47
309	0.38
310	0.35
311	0.32
312	0.23
313	0.21
314	0.21
315	0.19
316	0.2
317	0.22
318	0.19
319	0.18
320	0.21
321	0.21
322	0.21
323	0.2
324	0.19
325	0.19
326	0.17
327	0.16
328	0.16
329	0.16
330	0.16
331	0.15
332	0.13
333	0.1
334	0.09
335	0.08
336	0.05
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.05
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.07
356	0.07
357	0.09
358	0.1
359	0.1
360	0.1
361	0.1
362	0.1
363	0.1
364	0.1
365	0.08
366	0.08
367	0.07
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.11
381	0.12
382	0.13
383	0.12
384	0.16
385	0.16
386	0.17
387	0.17
388	0.15
389	0.14
390	0.14
391	0.13
392	0.09
393	0.08
394	0.08
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.07
401	0.07
402	0.06
403	0.06
404	0.07
405	0.08
406	0.09
407	0.08
408	0.09
409	0.11
410	0.13
411	0.13
412	0.12
413	0.15
414	0.16
415	0.18
416	0.18
417	0.16
418	0.15
419	0.15
420	0.15
421	0.12
422	0.1
423	0.11
424	0.13
425	0.13
426	0.17
427	0.17
428	0.17
429	0.21
430	0.22
431	0.21
432	0.26
433	0.29
434	0.29
435	0.3
436	0.34
437	0.32
438	0.34
439	0.32
440	0.26
441	0.3
442	0.28
443	0.3
444	0.27
445	0.25
446	0.22
447	0.22
448	0.25
449	0.18
450	0.17
451	0.14
452	0.14
453	0.14
454	0.14
455	0.14
456	0.09
457	0.1
458	0.09
459	0.07
460	0.06
461	0.05
462	0.04
463	0.04
464	0.05
465	0.04
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.06
475	0.06
476	0.07
477	0.06
478	0.06
479	0.07
480	0.06
481	0.07
482	0.06
483	0.07
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.06
488	0.07
489	0.06
490	0.06
491	0.09
492	0.09
493	0.09
494	0.09
495	0.09
496	0.08
497	0.08
498	0.09
499	0.05
500	0.06
501	0.05
502	0.05
503	0.08
504	0.08
505	0.09
506	0.1
507	0.1
508	0.14
509	0.16
510	0.19
511	0.18
512	0.23
513	0.24
514	0.24
515	0.25
516	0.21
517	0.18
518	0.16
519	0.15
520	0.1
521	0.08
522	0.08
523	0.07
524	0.08
525	0.08
526	0.09
527	0.07
528	0.08
529	0.08
530	0.08
531	0.08
532	0.07
533	0.08
534	0.1
535	0.11
536	0.13
537	0.14
538	0.15
539	0.16
540	0.16
541	0.15
542	0.14
543	0.14
544	0.12
545	0.1
546	0.08
547	0.08
548	0.08
549	0.07
550	0.07
551	0.05
552	0.05
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.04
557	0.07
558	0.1
559	0.15
560	0.17
561	0.17
562	0.17
563	0.18
564	0.21
565	0.2
566	0.18
567	0.16
568	0.15
569	0.17
570	0.18
571	0.17
572	0.14
573	0.14
574	0.13
575	0.1
576	0.09
577	0.08
578	0.07
579	0.08
580	0.07
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.05
587	0.04
588	0.04
589	0.06
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.05
595	0.05
596	0.07
597	0.05
598	0.06
599	0.06
600	0.06
601	0.07
602	0.08
603	0.08
604	0.07
605	0.08
606	0.08
607	0.11
608	0.15
609	0.14
610	0.14
611	0.17
612	0.17
613	0.21
614	0.23
615	0.27
616	0.25
617	0.24
618	0.25
619	0.24
620	0.26
621	0.23
622	0.21
623	0.15
624	0.15
625	0.16
626	0.15
627	0.14
628	0.1
629	0.1
630	0.08
631	0.07
632	0.05
633	0.05
634	0.04
635	0.04
636	0.04
637	0.04
638	0.04
639	0.04
640	0.04
641	0.03
642	0.03
643	0.03
644	0.03
645	0.04
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.07
650	0.07
651	0.07
652	0.07
653	0.07
654	0.08
655	0.07
656	0.08
657	0.07
658	0.1
659	0.1
660	0.1
661	0.11
662	0.1
663	0.11
664	0.11
665	0.1
666	0.08
667	0.08
668	0.07
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.07
674	0.07
675	0.09
676	0.1
677	0.13
678	0.13
679	0.12
680	0.13
681	0.13
682	0.12
683	0.1
684	0.09
685	0.07
686	0.07
687	0.07
688	0.07
689	0.07
690	0.07
691	0.07
692	0.06
693	0.06
694	0.06
695	0.07
696	0.06
697	0.07
698	0.06
699	0.08
700	0.1
701	0.1
702	0.11
703	0.12
704	0.13
705	0.13
706	0.15
707	0.13
708	0.12
709	0.13
710	0.13
711	0.14
712	0.14
713	0.13
714	0.12
715	0.14
716	0.14
717	0.15
718	0.16
719	0.16
720	0.16
721	0.16
722	0.16
723	0.14
724	0.18
725	0.17
726	0.19
727	0.17
728	0.19
729	0.19
730	0.24
731	0.27
732	0.27
733	0.3
734	0.27
735	0.29
736	0.27
737	0.27
738	0.21
739	0.18
740	0.12
741	0.08
742	0.07
743	0.04
744	0.03
745	0.03
746	0.03
747	0.03
748	0.03
749	0.04
750	0.05
751	0.06
752	0.07
753	0.11
754	0.12
755	0.16
756	0.2
757	0.25
758	0.26
759	0.26
760	0.25
761	0.23
762	0.22
763	0.2
764	0.21
765	0.16
766	0.15
767	0.13
768	0.13
769	0.13
770	0.14
771	0.13
772	0.08
773	0.08
774	0.09
775	0.11
776	0.12
777	0.14
778	0.19
779	0.21
780	0.21
781	0.21
782	0.21
783	0.2
784	0.21
785	0.23
786	0.18
787	0.17
788	0.16
789	0.16
790	0.16
791	0.18
792	0.16
793	0.16
794	0.22
795	0.29
796	0.3
797	0.32
798	0.4
799	0.41
800	0.46
801	0.47
802	0.45
803	0.45
804	0.47
805	0.49
806	0.41
807	0.37
808	0.32
809	0.28
810	0.23
811	0.15
812	0.12
813	0.08
814	0.1
815	0.1
816	0.09
817	0.07
818	0.07
819	0.07
820	0.06
821	0.06
822	0.05
823	0.05
824	0.05
825	0.05
826	0.07
827	0.08
828	0.08
829	0.08
830	0.07
831	0.08
832	0.08
833	0.08
834	0.07
835	0.07
836	0.08
837	0.09
838	0.1
839	0.11
840	0.11
841	0.15
842	0.16
843	0.19
844	0.21
845	0.21
846	0.2
847	0.2
848	0.2
849	0.17
850	0.15
851	0.12
852	0.1
853	0.14
854	0.14
855	0.14
856	0.14
857	0.15
858	0.16
859	0.22
860	0.3
861	0.35
862	0.38
863	0.39
864	0.4
865	0.4
866	0.4
867	0.33
868	0.25
869	0.17
870	0.15
871	0.15
872	0.13
873	0.14
874	0.14
875	0.14
876	0.15
877	0.14
878	0.14
879	0.15
880	0.19
881	0.24
882	0.29
883	0.3
884	0.27
885	0.26
886	0.24
887	0.23
888	0.2
889	0.14
890	0.08
891	0.07
892	0.06
893	0.07
894	0.08
895	0.09
896	0.1
897	0.1
898	0.1
899	0.1
900	0.11
901	0.09
902	0.08
903	0.07
904	0.05
905	0.05
906	0.06
907	0.06
908	0.06
909	0.06
910	0.06
911	0.05
912	0.05
913	0.05
914	0.04
915	0.05
916	0.06
917	0.07
918	0.08
919	0.1
920	0.09
921	0.1
922	0.1
923	0.11
924	0.09
925	0.09
926	0.08
927	0.07
928	0.08
929	0.08
930	0.09
931	0.11
932	0.11
933	0.11
934	0.11
935	0.11
936	0.13
937	0.14
938	0.15
939	0.15
940	0.15
941	0.16
942	0.16
943	0.16
944	0.14
945	0.13
946	0.14
947	0.13
948	0.14
949	0.13
950	0.15
951	0.15
952	0.16
953	0.16
954	0.18
955	0.17
956	0.17
957	0.17
958	0.18
959	0.18
960	0.18
961	0.18
962	0.15
963	0.13
964	0.12
965	0.12
966	0.08
967	0.07
968	0.06
969	0.04
970	0.04
971	0.04
972	0.03
973	0.03
974	0.03
975	0.03
976	0.04
977	0.03
978	0.03
979	0.04
980	0.04
981	0.04
982	0.04
983	0.04
984	0.05
985	0.05
986	0.05
987	0.04
988	0.05
989	0.06
990	0.06
991	0.07
992	0.08
993	0.08
994	0.09
995	0.09
996	0.09
997	0.1
998	0.1
999	0.1
1000	0.1
1001	0.09
1002	0.1
1003	0.12
1004	0.13
1005	0.19
1006	0.23
1007	0.24
1008	0.24
1009	0.28
1010	0.28
1011	0.26
1012	0.26
1013	0.19
1014	0.15
1015	0.14
1016	0.17
1017	0.14
1018	0.14
1019	0.14
1020	0.13
1021	0.13
1022	0.12
1023	0.11
1024	0.09
1025	0.1
1026	0.1
1027	0.1
1028	0.1
1029	0.08
1030	0.08
1031	0.07
1032	0.06
1033	0.05
1034	0.04
1035	0.05
1036	0.05
1037	0.05
1038	0.06
1039	0.06
1040	0.07
1041	0.1
1042	0.11
1043	0.11
1044	0.12
1045	0.14
1046	0.14
1047	0.16
1048	0.17
1049	0.21
1050	0.22
1051	0.21
1052	0.2
1053	0.18
1054	0.17
1055	0.16
1056	0.16
1057	0.1
1058	0.1
1059	0.11
1060	0.11
1061	0.11
1062	0.11
1063	0.1
1064	0.09
1065	0.08
1066	0.08
1067	0.08
1068	0.08
1069	0.08
1070	0.09
1071	0.09
1072	0.09
1073	0.1
1074	0.09
1075	0.08
1076	0.08
1077	0.1
1078	0.14
1079	0.15
1080	0.18
1081	0.19
1082	0.19
1083	0.22
1084	0.24
1085	0.25
1086	0.25
1087	0.26
1088	0.26
1089	0.27
1090	0.29
1091	0.28
1092	0.28
1093	0.25
1094	0.21
1095	0.23
1096	0.25
1097	0.25
1098	0.23
1099	0.22
1100	0.21
1101	0.2
1102	0.19
1103	0.16
1104	0.11
1105	0.08
1106	0.08
1107	0.08
1108	0.09
1109	0.09
1110	0.09
1111	0.09
1112	0.09
1113	0.1
1114	0.14
1115	0.16
1116	0.15
1117	0.16
1118	0.19
1119	0.22
1120	0.23
1121	0.23
1122	0.24
1123	0.23
1124	0.26
1125	0.26
1126	0.24
1127	0.2
1128	0.2
1129	0.22
1130	0.18
1131	0.16
1132	0.13
1133	0.13
1134	0.12
1135	0.17
1136	0.19
1137	0.16
1138	0.16
1139	0.17
1140	0.17
1141	0.16
1142	0.16
1143	0.13
1144	0.1
1145	0.09
1146	0.08
1147	0.09
1148	0.11
1149	0.13
1150	0.12
1151	0.12
1152	0.14
1153	0.16
1154	0.19
1155	0.2
1156	0.2
1157	0.18
1158	0.22
1159	0.24
1160	0.24
1161	0.27
1162	0.26
1163	0.29
1164	0.31
1165	0.33
1166	0.39
1167	0.43
1168	0.44
1169	0.44
1170	0.53
1171	0.55
1172	0.61
1173	0.67
1174	0.66
1175	0.68
1176	0.67
1177	0.69
1178	0.63
1179	0.58
1180	0.54
1181	0.5
1182	0.44
1183	0.36
1184	0.34
1185	0.29
1186	0.25
1187	0.2
1188	0.15
1189	0.11
1190	0.1
1191	0.08
1192	0.09
1193	0.07
1194	0.07
1195	0.08
1196	0.08
1197	0.08
1198	0.11
1199	0.14
1200	0.15
1201	0.18
1202	0.19
1203	0.21
1204	0.22
1205	0.26
1206	0.23
1207	0.2
1208	0.19
1209	0.16
1210	0.17
1211	0.17
1212	0.18
1213	0.15
1214	0.17
1215	0.19
1216	0.2
1217	0.26
1218	0.24
1219	0.25
1220	0.26
1221	0.25
1222	0.24
1223	0.22
1224	0.22
1225	0.18
1226	0.18
1227	0.15
1228	0.14

A0A0C3SC43

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer