Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FUX0

Protein Details
Accession Q6FUX0    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MGKPRGRKLEKKIKDQEFHPBasic
605-630WKNWQLEKYIRKRWEWKKIIKESDLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-11RGRKLEK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR040000  NOP9  
IPR033133  PUM-HD  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0017148  P:negative regulation of translation  
GO:0065008  P:regulation of biological quality  
GO:0000056  P:ribosomal small subunit export from nucleus  
KEGG cgr:CAGL0E06534g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50303  PUM_HD  
Amino Acid Sequences MGKPRGRKLEKKIKDQEFHPEQDSEKISENYNYDGHPESDTSNPQMFFGVLDRDELEYFKQTEATLSLDTFETEEEKAQFVTNVIQEAEGKELKLVTSQICSKLMERLILNCNDIQLKKLFQAFNGNFYNISCHKYASHVVETLLVRSASLVEKELITPHFDNMDASVDGSDVFAPMESLFLFMLNEIKPHLKSMINHQYASHVLRLIILILSSKTLPSTTQNNSIVRSKKSKIARKMIDLKDNEDFNKVYQTPESFKSELKMMLNDLYSDLTGHAKPKAEINPTVITKFREFCVDKVASPVIQLIIQVEGIFDRDRSFWRLAFNTNDEKDAKEQSFMEYLLSDPVGSHFLENVISFAKTKYVERLYRVYIKDQIVRLAKRDTTGAFVIQSLLKNMKDKEVKEILDALLPDLSILLNSNMDFGTTIINACIKQNNYKRDEVIGQLMKKYYPDGSSEKNILESCLLLASSTLGNTKDDWPTAEERRRSIFLEELIDFDDKFLEVAIESMLNLPEERLLQMCYHGVFSHVVEHVLQVQRVDIIKRKLLLNILIKDIVKLACNAYGSHIVDKLWDFTAKLTLYKERIAAALVENSEMVKNSVYGRQVWKNWQLEKYIRKRWEWKKIIKESDLETFPNMRVLQPNMQERAAIKRKNDDKAFDSMKKSRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.78
3 0.78
4 0.74
5 0.7
6 0.63
7 0.55
8 0.46
9 0.47
10 0.47
11 0.39
12 0.37
13 0.33
14 0.32
15 0.34
16 0.34
17 0.31
18 0.29
19 0.27
20 0.25
21 0.26
22 0.25
23 0.22
24 0.22
25 0.21
26 0.24
27 0.27
28 0.29
29 0.31
30 0.29
31 0.28
32 0.27
33 0.25
34 0.21
35 0.2
36 0.19
37 0.15
38 0.16
39 0.17
40 0.18
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.18
45 0.19
46 0.19
47 0.19
48 0.17
49 0.18
50 0.18
51 0.19
52 0.16
53 0.14
54 0.15
55 0.14
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.11
60 0.1
61 0.13
62 0.13
63 0.14
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.17
69 0.15
70 0.16
71 0.15
72 0.15
73 0.15
74 0.16
75 0.2
76 0.17
77 0.15
78 0.14
79 0.15
80 0.14
81 0.15
82 0.16
83 0.13
84 0.17
85 0.21
86 0.23
87 0.25
88 0.26
89 0.25
90 0.29
91 0.29
92 0.28
93 0.26
94 0.28
95 0.32
96 0.32
97 0.34
98 0.28
99 0.28
100 0.29
101 0.28
102 0.25
103 0.22
104 0.22
105 0.23
106 0.3
107 0.28
108 0.25
109 0.36
110 0.33
111 0.38
112 0.39
113 0.36
114 0.29
115 0.29
116 0.33
117 0.24
118 0.27
119 0.2
120 0.19
121 0.19
122 0.22
123 0.27
124 0.27
125 0.28
126 0.26
127 0.26
128 0.3
129 0.29
130 0.26
131 0.24
132 0.18
133 0.14
134 0.13
135 0.15
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.14
143 0.14
144 0.17
145 0.17
146 0.16
147 0.16
148 0.16
149 0.16
150 0.14
151 0.16
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.05
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.05
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.12
176 0.12
177 0.14
178 0.17
179 0.17
180 0.18
181 0.28
182 0.37
183 0.37
184 0.37
185 0.36
186 0.36
187 0.35
188 0.36
189 0.27
190 0.17
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.12
195 0.09
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.11
206 0.17
207 0.2
208 0.28
209 0.32
210 0.33
211 0.36
212 0.41
213 0.42
214 0.4
215 0.43
216 0.38
217 0.4
218 0.48
219 0.55
220 0.57
221 0.63
222 0.63
223 0.65
224 0.73
225 0.71
226 0.7
227 0.62
228 0.56
229 0.5
230 0.47
231 0.39
232 0.32
233 0.27
234 0.19
235 0.24
236 0.21
237 0.17
238 0.17
239 0.19
240 0.2
241 0.23
242 0.28
243 0.23
244 0.23
245 0.23
246 0.23
247 0.24
248 0.21
249 0.19
250 0.15
251 0.16
252 0.15
253 0.14
254 0.13
255 0.1
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.1
262 0.12
263 0.12
264 0.13
265 0.17
266 0.22
267 0.23
268 0.24
269 0.27
270 0.3
271 0.3
272 0.31
273 0.28
274 0.25
275 0.23
276 0.23
277 0.19
278 0.22
279 0.22
280 0.21
281 0.26
282 0.25
283 0.23
284 0.25
285 0.25
286 0.17
287 0.16
288 0.16
289 0.09
290 0.08
291 0.08
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.07
303 0.09
304 0.13
305 0.14
306 0.14
307 0.17
308 0.19
309 0.2
310 0.22
311 0.24
312 0.26
313 0.25
314 0.26
315 0.24
316 0.23
317 0.22
318 0.23
319 0.2
320 0.16
321 0.15
322 0.14
323 0.15
324 0.14
325 0.13
326 0.09
327 0.09
328 0.08
329 0.07
330 0.06
331 0.04
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.05
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.15
349 0.2
350 0.23
351 0.26
352 0.29
353 0.3
354 0.36
355 0.37
356 0.34
357 0.34
358 0.34
359 0.34
360 0.32
361 0.34
362 0.32
363 0.32
364 0.32
365 0.29
366 0.27
367 0.24
368 0.25
369 0.2
370 0.17
371 0.17
372 0.15
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.12
377 0.12
378 0.1
379 0.11
380 0.12
381 0.15
382 0.15
383 0.22
384 0.25
385 0.25
386 0.31
387 0.34
388 0.34
389 0.31
390 0.32
391 0.26
392 0.23
393 0.22
394 0.15
395 0.1
396 0.09
397 0.08
398 0.06
399 0.05
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.05
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.07
415 0.08
416 0.09
417 0.13
418 0.13
419 0.22
420 0.29
421 0.37
422 0.4
423 0.42
424 0.42
425 0.41
426 0.41
427 0.34
428 0.35
429 0.32
430 0.28
431 0.28
432 0.28
433 0.25
434 0.23
435 0.23
436 0.17
437 0.14
438 0.17
439 0.2
440 0.23
441 0.27
442 0.29
443 0.27
444 0.28
445 0.26
446 0.22
447 0.19
448 0.14
449 0.11
450 0.09
451 0.09
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.08
458 0.08
459 0.09
460 0.11
461 0.14
462 0.15
463 0.15
464 0.16
465 0.18
466 0.23
467 0.31
468 0.36
469 0.36
470 0.37
471 0.41
472 0.42
473 0.4
474 0.37
475 0.32
476 0.26
477 0.28
478 0.25
479 0.22
480 0.21
481 0.2
482 0.17
483 0.14
484 0.12
485 0.08
486 0.08
487 0.07
488 0.05
489 0.04
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.06
495 0.06
496 0.07
497 0.07
498 0.06
499 0.07
500 0.08
501 0.09
502 0.09
503 0.1
504 0.1
505 0.11
506 0.13
507 0.12
508 0.12
509 0.12
510 0.12
511 0.12
512 0.12
513 0.15
514 0.14
515 0.14
516 0.13
517 0.13
518 0.18
519 0.19
520 0.19
521 0.15
522 0.15
523 0.17
524 0.19
525 0.22
526 0.23
527 0.25
528 0.28
529 0.3
530 0.31
531 0.31
532 0.33
533 0.37
534 0.38
535 0.36
536 0.36
537 0.36
538 0.35
539 0.32
540 0.32
541 0.25
542 0.18
543 0.17
544 0.15
545 0.15
546 0.16
547 0.16
548 0.17
549 0.22
550 0.23
551 0.24
552 0.23
553 0.21
554 0.22
555 0.23
556 0.22
557 0.17
558 0.16
559 0.15
560 0.15
561 0.21
562 0.2
563 0.21
564 0.22
565 0.26
566 0.29
567 0.31
568 0.31
569 0.26
570 0.25
571 0.24
572 0.22
573 0.18
574 0.19
575 0.17
576 0.16
577 0.15
578 0.15
579 0.15
580 0.14
581 0.12
582 0.09
583 0.1
584 0.12
585 0.17
586 0.18
587 0.22
588 0.29
589 0.36
590 0.4
591 0.47
592 0.54
593 0.57
594 0.61
595 0.6
596 0.6
597 0.61
598 0.66
599 0.68
600 0.68
601 0.67
602 0.69
603 0.76
604 0.79
605 0.82
606 0.82
607 0.82
608 0.83
609 0.87
610 0.88
611 0.82
612 0.76
613 0.69
614 0.66
615 0.59
616 0.5
617 0.43
618 0.37
619 0.33
620 0.34
621 0.31
622 0.25
623 0.27
624 0.31
625 0.35
626 0.4
627 0.47
628 0.45
629 0.45
630 0.44
631 0.41
632 0.46
633 0.48
634 0.46
635 0.42
636 0.49
637 0.56
638 0.64
639 0.69
640 0.65
641 0.59
642 0.63
643 0.68
644 0.64
645 0.65