Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FNH1

Protein Details
Accession Q6FNH1    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-74LPKGGDKKKKANSKTAQSGKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-68GGDKKKKANSK
219-224ERRMKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0061629  F:RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG cgr:CAGL0J11726g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MSSQKRPSEESTGSGTKKVKLEETKTPSLKSEASNLALPKMNDSSNNINAVPLALPKGGDKKKKANSKTAQSGKNGGKEDGTGQKQKATDPNKMQDVLISAGVDLKEEEALLSSTVNVSKTQQNAVVIPPHPPFLHPDQVSNFMKKVAKTQNFNLSFTKNTEILDMMSSACESYLRDIITNTIVVSRHRRKGVKVNYGRRSQVAAALRSIAINQKKEEERRMKKRIALGLEKEDYENKMDSEETLHRASNVTATLRAGSKKQYGWLTSSINKPASIGVKSAGKVATEIAARGESGLKFREAREEPGIVMRDLLFALEHRRIGVHNIISKGYARIRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.45
3 0.42
4 0.44
5 0.43
6 0.44
7 0.46
8 0.5
9 0.55
10 0.6
11 0.65
12 0.64
13 0.63
14 0.57
15 0.52
16 0.49
17 0.41
18 0.4
19 0.34
20 0.34
21 0.36
22 0.34
23 0.33
24 0.34
25 0.32
26 0.28
27 0.27
28 0.25
29 0.23
30 0.28
31 0.31
32 0.31
33 0.34
34 0.31
35 0.28
36 0.26
37 0.25
38 0.2
39 0.14
40 0.13
41 0.1
42 0.1
43 0.13
44 0.23
45 0.29
46 0.37
47 0.42
48 0.5
49 0.58
50 0.68
51 0.71
52 0.72
53 0.74
54 0.76
55 0.8
56 0.79
57 0.75
58 0.68
59 0.71
60 0.65
61 0.63
62 0.55
63 0.45
64 0.37
65 0.32
66 0.33
67 0.33
68 0.34
69 0.32
70 0.3
71 0.33
72 0.34
73 0.36
74 0.41
75 0.37
76 0.41
77 0.43
78 0.49
79 0.49
80 0.49
81 0.45
82 0.38
83 0.35
84 0.27
85 0.21
86 0.14
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.1
106 0.13
107 0.15
108 0.17
109 0.18
110 0.18
111 0.18
112 0.19
113 0.21
114 0.18
115 0.2
116 0.19
117 0.19
118 0.18
119 0.18
120 0.2
121 0.2
122 0.28
123 0.24
124 0.27
125 0.27
126 0.34
127 0.35
128 0.33
129 0.28
130 0.24
131 0.26
132 0.23
133 0.29
134 0.31
135 0.35
136 0.37
137 0.41
138 0.47
139 0.47
140 0.49
141 0.43
142 0.35
143 0.31
144 0.29
145 0.28
146 0.19
147 0.17
148 0.15
149 0.13
150 0.12
151 0.11
152 0.09
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.1
167 0.1
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.19
173 0.25
174 0.29
175 0.35
176 0.37
177 0.39
178 0.49
179 0.57
180 0.58
181 0.62
182 0.66
183 0.68
184 0.7
185 0.67
186 0.58
187 0.51
188 0.41
189 0.37
190 0.32
191 0.26
192 0.22
193 0.21
194 0.2
195 0.17
196 0.18
197 0.18
198 0.18
199 0.19
200 0.19
201 0.24
202 0.29
203 0.33
204 0.42
205 0.46
206 0.52
207 0.6
208 0.67
209 0.66
210 0.65
211 0.68
212 0.64
213 0.6
214 0.57
215 0.52
216 0.51
217 0.48
218 0.44
219 0.39
220 0.34
221 0.29
222 0.24
223 0.2
224 0.14
225 0.13
226 0.13
227 0.12
228 0.15
229 0.16
230 0.18
231 0.19
232 0.19
233 0.18
234 0.19
235 0.19
236 0.17
237 0.16
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.15
242 0.16
243 0.18
244 0.17
245 0.2
246 0.23
247 0.24
248 0.29
249 0.32
250 0.31
251 0.33
252 0.36
253 0.36
254 0.37
255 0.4
256 0.4
257 0.37
258 0.35
259 0.32
260 0.31
261 0.3
262 0.26
263 0.22
264 0.19
265 0.22
266 0.22
267 0.25
268 0.22
269 0.18
270 0.18
271 0.17
272 0.18
273 0.14
274 0.14
275 0.13
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.15
280 0.12
281 0.15
282 0.16
283 0.18
284 0.2
285 0.2
286 0.29
287 0.29
288 0.34
289 0.36
290 0.35
291 0.33
292 0.38
293 0.39
294 0.29
295 0.28
296 0.22
297 0.18
298 0.17
299 0.16
300 0.1
301 0.09
302 0.15
303 0.17
304 0.18
305 0.17
306 0.18
307 0.19
308 0.24
309 0.29
310 0.3
311 0.32
312 0.34
313 0.35
314 0.35
315 0.36
316 0.36