Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3S3D1

Protein Details
Accession A0A0C3S3D1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-32RAATPSRHPHQPQPQQHQNLDHydrophilic
93-116EAERMEEKRKRKLEKIRYMSRYNDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-104KRKRK
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 9, cyto 3, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MPYRRQPQPVHRAATPSRHPHQPQPQQHQNLDVPFQQSLQYLPREIQMQQRLLAEMAQAEFLHSLQGSPVPEGKNEQEMHDLLRAQAMQKIMEAERMEEKRKRKLEKIRYMSRYNDLMTQSDKDFITRIQVSQLVTQDPYSEDFYAQVYGAVARSRMGLEAPQALLRFGSGGGVGLGLNQIKGGRRPSAMQRMEAQVERIVNNARLREKEKTSLNSLQGALGKTAGRSYKAAPRQLLQVDASGTSPIVSPAHAHISKADGTEGEGAAKEAARIAKEALSGHEGQELIKKDPLTHKEALMILERLFDLHIEADQLKNDQPPPEEFEAFQAWEVHYTDAVDRLWDGLRVMVPLETSNPHPFISLLMPIKGKKFLPRVIRLLDTSRNLTIVTLMVACFSQLDVVRDSRILDLLEDTPERKEALTQSDAFVHATIMQYVLLVTAKCSLRIVSGLLGLFLERNNVEVLVQTPAGMNMLTIFLSRVETLKQENSVSDEERPTLDELTQWQLVFDHMFQLLSPHLLYLFPSVRQALTSNIPIANIPDSDHIDRPTWQFLAALGLHSSVEQQQVLVTSLRERVLDNVASIANGWVVDEDQSRLRLSNVNLFLHSLGLDSSQIAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.66
3 0.65
4 0.61
5 0.65
6 0.67
7 0.69
8 0.75
9 0.76
10 0.77
11 0.79
12 0.84
13 0.82
14 0.79
15 0.76
16 0.7
17 0.63
18 0.57
19 0.5
20 0.43
21 0.35
22 0.34
23 0.28
24 0.24
25 0.23
26 0.24
27 0.24
28 0.22
29 0.22
30 0.24
31 0.25
32 0.27
33 0.33
34 0.35
35 0.35
36 0.36
37 0.37
38 0.35
39 0.33
40 0.31
41 0.23
42 0.17
43 0.15
44 0.13
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.1
49 0.11
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.12
54 0.12
55 0.14
56 0.19
57 0.19
58 0.2
59 0.24
60 0.26
61 0.3
62 0.3
63 0.3
64 0.3
65 0.29
66 0.31
67 0.3
68 0.28
69 0.2
70 0.22
71 0.21
72 0.17
73 0.19
74 0.18
75 0.15
76 0.15
77 0.18
78 0.16
79 0.2
80 0.2
81 0.19
82 0.26
83 0.3
84 0.36
85 0.39
86 0.45
87 0.5
88 0.58
89 0.63
90 0.65
91 0.72
92 0.76
93 0.81
94 0.84
95 0.85
96 0.84
97 0.81
98 0.76
99 0.7
100 0.63
101 0.53
102 0.48
103 0.4
104 0.35
105 0.33
106 0.31
107 0.26
108 0.26
109 0.25
110 0.2
111 0.19
112 0.17
113 0.22
114 0.2
115 0.2
116 0.19
117 0.22
118 0.23
119 0.25
120 0.27
121 0.21
122 0.21
123 0.2
124 0.18
125 0.17
126 0.18
127 0.17
128 0.16
129 0.14
130 0.14
131 0.15
132 0.14
133 0.13
134 0.11
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.1
147 0.12
148 0.13
149 0.14
150 0.14
151 0.13
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.07
156 0.07
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.07
168 0.08
169 0.12
170 0.15
171 0.17
172 0.18
173 0.22
174 0.3
175 0.39
176 0.39
177 0.38
178 0.38
179 0.39
180 0.4
181 0.37
182 0.31
183 0.23
184 0.23
185 0.2
186 0.19
187 0.18
188 0.19
189 0.21
190 0.24
191 0.24
192 0.26
193 0.31
194 0.34
195 0.36
196 0.38
197 0.41
198 0.41
199 0.45
200 0.47
201 0.44
202 0.41
203 0.38
204 0.34
205 0.31
206 0.28
207 0.21
208 0.17
209 0.15
210 0.12
211 0.14
212 0.13
213 0.12
214 0.13
215 0.16
216 0.23
217 0.29
218 0.33
219 0.32
220 0.32
221 0.36
222 0.36
223 0.35
224 0.27
225 0.22
226 0.18
227 0.17
228 0.15
229 0.1
230 0.09
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.08
238 0.15
239 0.15
240 0.15
241 0.14
242 0.16
243 0.17
244 0.17
245 0.16
246 0.09
247 0.09
248 0.11
249 0.1
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.05
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.13
269 0.12
270 0.11
271 0.15
272 0.16
273 0.14
274 0.16
275 0.16
276 0.16
277 0.23
278 0.27
279 0.28
280 0.27
281 0.26
282 0.26
283 0.27
284 0.26
285 0.22
286 0.18
287 0.12
288 0.12
289 0.11
290 0.09
291 0.08
292 0.07
293 0.05
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.11
304 0.11
305 0.13
306 0.14
307 0.19
308 0.21
309 0.2
310 0.19
311 0.2
312 0.19
313 0.18
314 0.17
315 0.12
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.08
325 0.07
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.08
340 0.1
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.13
346 0.13
347 0.13
348 0.15
349 0.14
350 0.14
351 0.16
352 0.17
353 0.18
354 0.2
355 0.2
356 0.22
357 0.26
358 0.31
359 0.37
360 0.42
361 0.45
362 0.45
363 0.46
364 0.41
365 0.4
366 0.38
367 0.32
368 0.29
369 0.24
370 0.22
371 0.2
372 0.18
373 0.15
374 0.1
375 0.08
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.04
383 0.06
384 0.07
385 0.09
386 0.1
387 0.11
388 0.12
389 0.13
390 0.14
391 0.12
392 0.12
393 0.1
394 0.09
395 0.1
396 0.1
397 0.12
398 0.12
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.13
403 0.11
404 0.12
405 0.12
406 0.17
407 0.2
408 0.2
409 0.21
410 0.22
411 0.22
412 0.2
413 0.18
414 0.12
415 0.1
416 0.09
417 0.09
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.12
427 0.12
428 0.13
429 0.13
430 0.13
431 0.13
432 0.14
433 0.14
434 0.1
435 0.12
436 0.11
437 0.1
438 0.1
439 0.09
440 0.09
441 0.08
442 0.09
443 0.06
444 0.07
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.08
457 0.06
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.06
463 0.06
464 0.07
465 0.08
466 0.09
467 0.09
468 0.11
469 0.15
470 0.17
471 0.19
472 0.19
473 0.19
474 0.22
475 0.24
476 0.24
477 0.24
478 0.23
479 0.22
480 0.21
481 0.22
482 0.2
483 0.18
484 0.16
485 0.14
486 0.15
487 0.19
488 0.2
489 0.18
490 0.17
491 0.16
492 0.17
493 0.17
494 0.15
495 0.12
496 0.1
497 0.1
498 0.1
499 0.11
500 0.11
501 0.11
502 0.1
503 0.08
504 0.08
505 0.09
506 0.1
507 0.14
508 0.15
509 0.14
510 0.17
511 0.18
512 0.18
513 0.19
514 0.19
515 0.17
516 0.19
517 0.21
518 0.22
519 0.21
520 0.21
521 0.2
522 0.21
523 0.19
524 0.15
525 0.15
526 0.15
527 0.2
528 0.23
529 0.26
530 0.26
531 0.26
532 0.29
533 0.31
534 0.32
535 0.27
536 0.24
537 0.22
538 0.2
539 0.23
540 0.2
541 0.18
542 0.14
543 0.14
544 0.13
545 0.13
546 0.15
547 0.11
548 0.13
549 0.12
550 0.11
551 0.11
552 0.13
553 0.15
554 0.14
555 0.13
556 0.14
557 0.17
558 0.19
559 0.19
560 0.18
561 0.2
562 0.24
563 0.24
564 0.22
565 0.2
566 0.19
567 0.18
568 0.18
569 0.15
570 0.1
571 0.09
572 0.08
573 0.07
574 0.07
575 0.09
576 0.1
577 0.13
578 0.15
579 0.17
580 0.18
581 0.18
582 0.2
583 0.23
584 0.25
585 0.32
586 0.35
587 0.36
588 0.35
589 0.36
590 0.35
591 0.29
592 0.26
593 0.17
594 0.12
595 0.1
596 0.1