Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3NGM6

Protein Details
Accession A0A0C3NGM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
239-259SRSPSRSRSGSRYRSRSRSISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
199-254SPSRSPSRSRSPSRSLSRSRSVISAKSRGRTPSNAGSRYVSRSPSRSRSGSRYRSR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13, mito 5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANTTVRGAQAIHGQNPQFLVETVIRNRIYEDPFWKEHCFALTAESLIDKTLELKAVGGVYGNNKPTEFMCLLLKLLQIQPEKEILLEYLQADEFKYLRALAAMYIRMTFRAAEVYEILEPLMRDFRKIRYRNAGGYNLTFMDEFVDQLLNEERVCDIILPRMTKREVLEDSGELGPRKSRLLDAMEGKSDGDSEKSRSPSRSPSRSRSPSRSLSRSRSVISAKSRGRTPSNAGSRYVSRSPSRSRSGSRYRSRSRSISPDRLNGGSERFRSRSKSISPDRMETDAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.32
4 0.31
5 0.24
6 0.19
7 0.2
8 0.18
9 0.23
10 0.25
11 0.31
12 0.31
13 0.29
14 0.32
15 0.34
16 0.34
17 0.34
18 0.37
19 0.36
20 0.4
21 0.44
22 0.44
23 0.39
24 0.37
25 0.33
26 0.29
27 0.22
28 0.22
29 0.19
30 0.16
31 0.15
32 0.14
33 0.13
34 0.11
35 0.11
36 0.07
37 0.08
38 0.09
39 0.1
40 0.09
41 0.09
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.11
48 0.16
49 0.17
50 0.17
51 0.17
52 0.18
53 0.18
54 0.22
55 0.19
56 0.16
57 0.16
58 0.16
59 0.17
60 0.17
61 0.17
62 0.14
63 0.15
64 0.19
65 0.19
66 0.19
67 0.2
68 0.2
69 0.2
70 0.18
71 0.17
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.08
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.07
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.12
110 0.11
111 0.13
112 0.14
113 0.22
114 0.31
115 0.34
116 0.38
117 0.42
118 0.45
119 0.49
120 0.52
121 0.48
122 0.4
123 0.37
124 0.33
125 0.24
126 0.21
127 0.16
128 0.11
129 0.09
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.06
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.09
146 0.12
147 0.13
148 0.14
149 0.17
150 0.18
151 0.2
152 0.2
153 0.22
154 0.21
155 0.21
156 0.22
157 0.19
158 0.21
159 0.2
160 0.21
161 0.15
162 0.14
163 0.13
164 0.12
165 0.13
166 0.11
167 0.11
168 0.13
169 0.16
170 0.2
171 0.24
172 0.25
173 0.25
174 0.24
175 0.24
176 0.2
177 0.17
178 0.13
179 0.11
180 0.11
181 0.14
182 0.18
183 0.23
184 0.26
185 0.29
186 0.32
187 0.39
188 0.47
189 0.53
190 0.56
191 0.59
192 0.67
193 0.73
194 0.78
195 0.75
196 0.73
197 0.73
198 0.74
199 0.75
200 0.72
201 0.7
202 0.69
203 0.64
204 0.59
205 0.54
206 0.49
207 0.47
208 0.46
209 0.48
210 0.45
211 0.46
212 0.48
213 0.48
214 0.49
215 0.47
216 0.47
217 0.48
218 0.53
219 0.51
220 0.49
221 0.48
222 0.46
223 0.48
224 0.45
225 0.41
226 0.36
227 0.41
228 0.46
229 0.5
230 0.54
231 0.54
232 0.56
233 0.6
234 0.67
235 0.71
236 0.73
237 0.75
238 0.78
239 0.8
240 0.81
241 0.78
242 0.75
243 0.75
244 0.75
245 0.75
246 0.71
247 0.7
248 0.67
249 0.62
250 0.57
251 0.48
252 0.45
253 0.41
254 0.4
255 0.4
256 0.4
257 0.43
258 0.47
259 0.49
260 0.51
261 0.51
262 0.57
263 0.6
264 0.67
265 0.68
266 0.68
267 0.68