Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FS36

Protein Details
Accession Q6FS36    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-61DPEILLRKRRNADRTRLEKQELARQRQEQRKKEQIKNKKKFIRAESLVHydrophilic
277-296SLNKLKKLEQREVEKKTRKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-56RKRRNADRTRLEKQELARQRQEQRKKEQIKNKKKFIR
69-85REKERIKRISKLEHKKL
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036919  L30_ferredoxin-like_sf  
IPR018038  Ribosomal_L30_CS  
IPR016082  Ribosomal_L30_ferredoxin-like  
IPR039699  Ribosomal_L7/L30  
IPR035808  Ribosomal_L7_euk_arc  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0000465  P:exonucleolytic trimming to generate mature 5'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG cgr:CAGL0H03773g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00327  Ribosomal_L30  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00634  RIBOSOMAL_L30  
CDD cd01657  Ribosomal_L7_archeal_euk  
Amino Acid Sequences MSDITNEKKPLNSDPEILLRKRRNADRTRLEKQELARQRQEQRKKEQIKNKKKFIRAESLVANSLATSREKERIKRISKLEHKKLKGDVSHLPSEKNFFLKVTEKPQSEETDDLIDEDEEDGFEREKVAYNGEEQLLFVLRVKGPVAASIPHKAYRILSTLRLEEVNTAVFIKLTETTFSLLKIIAPYVIVGKPSLKSIRSLIQKRSKIVYKREDEEEAKEIILNDNNIVEEKLGDCGVICIDDIIHEIATLGENFTKCNFFLQPFKLNREVSGFSSLNKLKKLEQREVEKKTRKVSNASTAPIVQIDIDALIAKIN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.48
3 0.51
4 0.51
5 0.53
6 0.52
7 0.56
8 0.62
9 0.67
10 0.68
11 0.7
12 0.78
13 0.79
14 0.81
15 0.81
16 0.79
17 0.75
18 0.69
19 0.64
20 0.64
21 0.62
22 0.61
23 0.61
24 0.62
25 0.67
26 0.73
27 0.8
28 0.78
29 0.78
30 0.81
31 0.83
32 0.85
33 0.86
34 0.87
35 0.88
36 0.9
37 0.9
38 0.89
39 0.86
40 0.85
41 0.82
42 0.81
43 0.74
44 0.69
45 0.63
46 0.57
47 0.51
48 0.42
49 0.35
50 0.24
51 0.2
52 0.17
53 0.13
54 0.13
55 0.14
56 0.22
57 0.27
58 0.33
59 0.41
60 0.5
61 0.55
62 0.6
63 0.64
64 0.67
65 0.72
66 0.78
67 0.79
68 0.78
69 0.76
70 0.73
71 0.71
72 0.67
73 0.59
74 0.53
75 0.5
76 0.46
77 0.5
78 0.46
79 0.42
80 0.36
81 0.38
82 0.34
83 0.28
84 0.23
85 0.16
86 0.18
87 0.21
88 0.24
89 0.28
90 0.34
91 0.32
92 0.34
93 0.37
94 0.37
95 0.35
96 0.33
97 0.26
98 0.21
99 0.2
100 0.18
101 0.15
102 0.11
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.05
107 0.05
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.08
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.07
126 0.08
127 0.07
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.12
136 0.14
137 0.15
138 0.16
139 0.16
140 0.16
141 0.16
142 0.16
143 0.17
144 0.16
145 0.18
146 0.17
147 0.18
148 0.18
149 0.17
150 0.15
151 0.13
152 0.12
153 0.09
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.13
182 0.15
183 0.14
184 0.15
185 0.17
186 0.24
187 0.32
188 0.37
189 0.43
190 0.5
191 0.53
192 0.54
193 0.57
194 0.57
195 0.55
196 0.59
197 0.59
198 0.55
199 0.56
200 0.57
201 0.56
202 0.51
203 0.48
204 0.41
205 0.33
206 0.27
207 0.23
208 0.2
209 0.17
210 0.17
211 0.13
212 0.11
213 0.1
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.12
244 0.13
245 0.12
246 0.16
247 0.17
248 0.18
249 0.25
250 0.3
251 0.37
252 0.41
253 0.46
254 0.5
255 0.48
256 0.46
257 0.45
258 0.42
259 0.36
260 0.39
261 0.33
262 0.27
263 0.35
264 0.38
265 0.37
266 0.37
267 0.36
268 0.36
269 0.44
270 0.51
271 0.52
272 0.56
273 0.62
274 0.69
275 0.75
276 0.79
277 0.8
278 0.78
279 0.77
280 0.77
281 0.72
282 0.7
283 0.69
284 0.69
285 0.66
286 0.64
287 0.59
288 0.51
289 0.47
290 0.39
291 0.32
292 0.21
293 0.15
294 0.12
295 0.08
296 0.08
297 0.07