Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3SDY2

Protein Details
Accession A0A0C3SDY2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-47ASGRGLRSSLRQRRNTPPSYHydrophilic
219-243ITPPLHHVRKRRFRKRINRRTIETVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-237RKRRFRKRINR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MEDEDLIVVDDDVSQSVPATPQPGPSNASGRGLRSSLRQRRNTPPSYAAQMEDDEMDVRRTRSSVFRNGGKPQPKLKLKLSEKAAALAPGMSFLGPYDRELDSDDEELAFEEQFILRMPAGEDCDKLRKMVQSREIGNDVWFKFKDSRRAVFHIGNRTYSAKLVDLPCVIESQKTLDNKQMFKVADICQMLVVEEPIPNEDTLRNQALNVDEFIWPHGITPPLHHVRKRRFRKRINRRTIETVEQEVERLLEEDELADEVKYDVLENVNPDLSDSEYIDHEDTMDPTTPGGFGGSEAGDMPTPGGDLGDGDAERDGGADDDAEEEGDIDEDLAAELDLALGDDEEGEGDDEDEDDDESESDEDDEDDEAVQAKKLLNEEIRDLEAAVTKKNHEIASSANPLIRRRFEDALRKLQADLDTKLVQRDEMKEKRRLQQEGGGTTGASEGGDGDDADSDDGDLFGDTGPNVNMDIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.08
4 0.09
5 0.1
6 0.14
7 0.14
8 0.2
9 0.24
10 0.26
11 0.28
12 0.31
13 0.35
14 0.33
15 0.38
16 0.34
17 0.33
18 0.34
19 0.32
20 0.3
21 0.34
22 0.43
23 0.47
24 0.55
25 0.61
26 0.64
27 0.74
28 0.82
29 0.79
30 0.74
31 0.7
32 0.65
33 0.63
34 0.58
35 0.48
36 0.4
37 0.36
38 0.3
39 0.25
40 0.2
41 0.15
42 0.14
43 0.15
44 0.15
45 0.15
46 0.15
47 0.16
48 0.18
49 0.25
50 0.31
51 0.38
52 0.43
53 0.5
54 0.54
55 0.6
56 0.66
57 0.66
58 0.65
59 0.63
60 0.66
61 0.66
62 0.67
63 0.68
64 0.7
65 0.68
66 0.7
67 0.68
68 0.64
69 0.57
70 0.53
71 0.46
72 0.36
73 0.31
74 0.23
75 0.17
76 0.12
77 0.11
78 0.08
79 0.07
80 0.06
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.13
85 0.13
86 0.14
87 0.16
88 0.18
89 0.17
90 0.17
91 0.17
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.12
96 0.09
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.1
107 0.14
108 0.14
109 0.15
110 0.17
111 0.23
112 0.23
113 0.23
114 0.24
115 0.27
116 0.32
117 0.39
118 0.43
119 0.44
120 0.46
121 0.49
122 0.48
123 0.43
124 0.39
125 0.37
126 0.3
127 0.28
128 0.26
129 0.25
130 0.3
131 0.33
132 0.41
133 0.4
134 0.46
135 0.47
136 0.52
137 0.54
138 0.53
139 0.55
140 0.54
141 0.5
142 0.45
143 0.41
144 0.38
145 0.34
146 0.29
147 0.24
148 0.15
149 0.18
150 0.18
151 0.18
152 0.16
153 0.16
154 0.15
155 0.16
156 0.15
157 0.11
158 0.1
159 0.11
160 0.15
161 0.16
162 0.17
163 0.23
164 0.27
165 0.28
166 0.29
167 0.32
168 0.28
169 0.27
170 0.3
171 0.25
172 0.26
173 0.25
174 0.23
175 0.18
176 0.18
177 0.17
178 0.12
179 0.11
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.08
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.12
190 0.14
191 0.13
192 0.12
193 0.14
194 0.14
195 0.14
196 0.13
197 0.11
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.09
207 0.11
208 0.18
209 0.24
210 0.27
211 0.31
212 0.37
213 0.46
214 0.56
215 0.66
216 0.69
217 0.72
218 0.8
219 0.87
220 0.91
221 0.92
222 0.92
223 0.88
224 0.82
225 0.79
226 0.73
227 0.66
228 0.57
229 0.48
230 0.38
231 0.31
232 0.26
233 0.18
234 0.15
235 0.1
236 0.08
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.06
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.05
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.04
312 0.05
313 0.05
314 0.04
315 0.04
316 0.03
317 0.03
318 0.04
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.02
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.1
359 0.1
360 0.12
361 0.14
362 0.18
363 0.2
364 0.22
365 0.25
366 0.26
367 0.26
368 0.24
369 0.23
370 0.19
371 0.2
372 0.19
373 0.19
374 0.19
375 0.19
376 0.22
377 0.25
378 0.25
379 0.21
380 0.21
381 0.22
382 0.28
383 0.32
384 0.3
385 0.28
386 0.3
387 0.34
388 0.39
389 0.38
390 0.36
391 0.36
392 0.4
393 0.46
394 0.53
395 0.56
396 0.6
397 0.6
398 0.56
399 0.51
400 0.5
401 0.48
402 0.42
403 0.36
404 0.32
405 0.32
406 0.32
407 0.35
408 0.31
409 0.28
410 0.28
411 0.33
412 0.38
413 0.43
414 0.5
415 0.56
416 0.63
417 0.69
418 0.73
419 0.72
420 0.66
421 0.64
422 0.65
423 0.59
424 0.55
425 0.46
426 0.37
427 0.32
428 0.27
429 0.2
430 0.11
431 0.08
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.07
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.07
450 0.08
451 0.09
452 0.09