Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3RR88

Protein Details
Accession A0A0C3RR88    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-41EALLKHEKRREEKQQDSQLLPHydrophilic
51-72VTVKQMHPEKKLKPHKIPLAHPHydrophilic
320-341ADGSSKKKRKTAKDDKTSARAPHydrophilic
375-396GDGGEKKLKKKAKGDDKPAESPBasic
414-435ASGLGKKKEKALKVKRSAKEALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
284-343KPTKAKGKKRAAEDEEAQPKTKRAKATPGDAPSTPAADGSSKKKRKTAKDDKTSARAPAA
350-391PVPAGDKPSKKAKGKQPGVAAPDAEGDGGEKKLKKKAKGDDK
409-441KRKRGASGLGKKKEKALKVKRSAKEALIGKKGL
Subcellular Location(s) cyto 16.5, cyto_nucl 13.333, nucl 9, mito_nucl 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MVAAELIDEHVSANQCKLAVEALLKHEKRREEKQQDSQLLPGKEQHVWLQVTVKQMHPEKKLKPHKIPLAHPLVDPRTSPVCLITKDPQREYKDLLETNKIRFISRVVGVTKLKGKFKPFEARRLLLKENDLFLADERVVPLLPGLLGKKFFEAKKQPIPVCLTRKDLKGELERAISSTYFHQNQGTCSSIKVGAVSHPSAHVIANLKTALPAVAKAIKGGWENIQSLHIKTSTSTSLPIWSCELGADVGGRWDGLVEQETSGEPEEEEAASGAEAEVEVEASKPTKAKGKKRAAEDEEAQPKTKRAKATPGDAPSTPAADGSSKKKRKTAKDDKTSARAPAASSADSAPVPAGDKPSKKAKGKQPGVAAPDAEGDGGEKKLKKKAKGDDKPAESPAATPATVSVEDVKRKRGASGLGKKKEKALKVKRSAKEALIGKKGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.16
4 0.16
5 0.14
6 0.14
7 0.16
8 0.18
9 0.24
10 0.34
11 0.35
12 0.4
13 0.44
14 0.5
15 0.55
16 0.61
17 0.65
18 0.66
19 0.74
20 0.79
21 0.84
22 0.82
23 0.76
24 0.72
25 0.69
26 0.6
27 0.51
28 0.46
29 0.39
30 0.34
31 0.34
32 0.32
33 0.31
34 0.3
35 0.3
36 0.3
37 0.29
38 0.34
39 0.34
40 0.33
41 0.34
42 0.4
43 0.46
44 0.5
45 0.55
46 0.57
47 0.65
48 0.74
49 0.76
50 0.79
51 0.81
52 0.82
53 0.82
54 0.8
55 0.78
56 0.76
57 0.68
58 0.59
59 0.56
60 0.51
61 0.44
62 0.39
63 0.35
64 0.29
65 0.28
66 0.27
67 0.25
68 0.26
69 0.25
70 0.3
71 0.34
72 0.39
73 0.45
74 0.49
75 0.53
76 0.54
77 0.56
78 0.55
79 0.53
80 0.52
81 0.49
82 0.48
83 0.49
84 0.46
85 0.46
86 0.47
87 0.41
88 0.34
89 0.31
90 0.3
91 0.26
92 0.25
93 0.27
94 0.23
95 0.28
96 0.28
97 0.31
98 0.35
99 0.35
100 0.38
101 0.38
102 0.42
103 0.41
104 0.47
105 0.55
106 0.52
107 0.57
108 0.58
109 0.57
110 0.58
111 0.59
112 0.55
113 0.47
114 0.47
115 0.39
116 0.34
117 0.31
118 0.26
119 0.21
120 0.18
121 0.17
122 0.13
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.07
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.07
133 0.08
134 0.1
135 0.1
136 0.12
137 0.17
138 0.17
139 0.24
140 0.31
141 0.37
142 0.43
143 0.51
144 0.49
145 0.5
146 0.55
147 0.54
148 0.53
149 0.49
150 0.47
151 0.43
152 0.45
153 0.44
154 0.4
155 0.38
156 0.37
157 0.37
158 0.33
159 0.31
160 0.29
161 0.26
162 0.24
163 0.19
164 0.14
165 0.14
166 0.17
167 0.17
168 0.18
169 0.2
170 0.2
171 0.21
172 0.23
173 0.22
174 0.17
175 0.16
176 0.17
177 0.14
178 0.13
179 0.12
180 0.1
181 0.1
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.12
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.13
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.16
213 0.15
214 0.14
215 0.15
216 0.13
217 0.11
218 0.1
219 0.12
220 0.11
221 0.11
222 0.12
223 0.11
224 0.15
225 0.16
226 0.16
227 0.15
228 0.14
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.08
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.05
260 0.04
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.04
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.08
273 0.17
274 0.25
275 0.34
276 0.45
277 0.55
278 0.6
279 0.67
280 0.75
281 0.72
282 0.7
283 0.64
284 0.62
285 0.59
286 0.55
287 0.5
288 0.41
289 0.39
290 0.4
291 0.4
292 0.37
293 0.33
294 0.42
295 0.45
296 0.5
297 0.55
298 0.53
299 0.52
300 0.46
301 0.45
302 0.36
303 0.32
304 0.25
305 0.17
306 0.14
307 0.13
308 0.16
309 0.21
310 0.32
311 0.37
312 0.4
313 0.46
314 0.54
315 0.62
316 0.7
317 0.74
318 0.74
319 0.78
320 0.84
321 0.84
322 0.83
323 0.75
324 0.66
325 0.57
326 0.47
327 0.38
328 0.34
329 0.3
330 0.24
331 0.22
332 0.2
333 0.19
334 0.18
335 0.17
336 0.11
337 0.09
338 0.1
339 0.1
340 0.16
341 0.2
342 0.24
343 0.28
344 0.38
345 0.46
346 0.52
347 0.6
348 0.64
349 0.69
350 0.74
351 0.76
352 0.74
353 0.71
354 0.69
355 0.62
356 0.52
357 0.41
358 0.35
359 0.28
360 0.2
361 0.14
362 0.1
363 0.1
364 0.11
365 0.15
366 0.18
367 0.22
368 0.3
369 0.38
370 0.45
371 0.52
372 0.61
373 0.68
374 0.75
375 0.81
376 0.83
377 0.83
378 0.8
379 0.73
380 0.65
381 0.54
382 0.44
383 0.39
384 0.32
385 0.24
386 0.19
387 0.17
388 0.18
389 0.18
390 0.19
391 0.2
392 0.23
393 0.32
394 0.35
395 0.4
396 0.41
397 0.41
398 0.42
399 0.4
400 0.43
401 0.46
402 0.54
403 0.59
404 0.64
405 0.7
406 0.69
407 0.73
408 0.72
409 0.7
410 0.7
411 0.71
412 0.72
413 0.77
414 0.85
415 0.83
416 0.82
417 0.79
418 0.7
419 0.68
420 0.65
421 0.63