Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FNB3

Protein Details
Accession Q6FNB3    Localization Confidence High Confidence Score 24.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MADGSDRRRRRRKGAGAAGAAGHydrophilic
71-131NAKGASKGKGKDRRRNKGKEDKKDDKKGVSKVKRSGRKNEPGPKNSKTTKKKEAQRVQSALBasic
318-373KLTGVSESDKKKKKRKKKKKGAVEETPKEKKKRKRNKKKKEKKKKASEGNEPKADSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-17RRRRRRKGAGA
68-123SKGNAKGASKGKGKDRRRNKGKEDKKDDKKGVSKVKRSGRKNEPGPKNSKTTKKKE
326-364DKKKKKRKKKKKGAVEETPKEKKKRKRNKKKKEKKKKAS
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG cgr:CAGL0K01309g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MADGSDRRRRRRKGAGAAGAAGSAGTGGNSDAGKKDTSKEASKAGSSANGNANGNDNGGSNASAKSNSKGNAKGASKGKGKDRRRNKGKEDKKDDKKGVSKVKRSGRKNEPGPKNSKTTKKKEAQRVQSALEQDYKKLVVRLLPPMLTETQFWSTVGAPTLENKQQYFDAHGIVEHYFHQGDAYAKFATMNARKKSYSRMYLIFKDIDHAKKYVLAIKDLTFTDDHDNSNNPTFKISQYVKLFASGSTKQKSGSALEGTIDDDKIFKNFLKSMKYVREHQFEEDVEGISMLRPIEKELALKRERKELAEKAAQHAIAKLTGVSESDKKKKKRKKKKKGAVEETPKEKKKRKRNKKKKEKKKKASEGNEPKADSNNFVILEKAGKQVLKERLAKKGSMTALPALTPDKPKVPKILKRNI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.87
3 0.8
4 0.74
5 0.64
6 0.53
7 0.42
8 0.3
9 0.19
10 0.1
11 0.06
12 0.03
13 0.04
14 0.04
15 0.06
16 0.07
17 0.09
18 0.1
19 0.13
20 0.15
21 0.16
22 0.2
23 0.26
24 0.32
25 0.37
26 0.38
27 0.42
28 0.43
29 0.43
30 0.41
31 0.34
32 0.34
33 0.29
34 0.31
35 0.3
36 0.31
37 0.31
38 0.3
39 0.32
40 0.26
41 0.25
42 0.21
43 0.16
44 0.13
45 0.13
46 0.13
47 0.11
48 0.12
49 0.12
50 0.14
51 0.16
52 0.17
53 0.22
54 0.25
55 0.3
56 0.33
57 0.35
58 0.41
59 0.42
60 0.47
61 0.47
62 0.51
63 0.52
64 0.52
65 0.59
66 0.6
67 0.68
68 0.71
69 0.76
70 0.8
71 0.84
72 0.89
73 0.89
74 0.9
75 0.91
76 0.91
77 0.91
78 0.9
79 0.9
80 0.9
81 0.85
82 0.83
83 0.8
84 0.77
85 0.78
86 0.77
87 0.75
88 0.73
89 0.78
90 0.78
91 0.77
92 0.79
93 0.78
94 0.78
95 0.8
96 0.82
97 0.82
98 0.81
99 0.82
100 0.76
101 0.74
102 0.71
103 0.72
104 0.71
105 0.7
106 0.72
107 0.74
108 0.79
109 0.82
110 0.84
111 0.83
112 0.83
113 0.78
114 0.7
115 0.65
116 0.58
117 0.49
118 0.46
119 0.36
120 0.28
121 0.26
122 0.24
123 0.21
124 0.2
125 0.19
126 0.17
127 0.19
128 0.24
129 0.25
130 0.24
131 0.23
132 0.24
133 0.25
134 0.21
135 0.18
136 0.16
137 0.16
138 0.15
139 0.15
140 0.14
141 0.13
142 0.13
143 0.14
144 0.11
145 0.09
146 0.11
147 0.15
148 0.17
149 0.17
150 0.16
151 0.17
152 0.18
153 0.18
154 0.2
155 0.17
156 0.15
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.11
161 0.12
162 0.09
163 0.09
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.15
176 0.2
177 0.28
178 0.29
179 0.32
180 0.33
181 0.34
182 0.41
183 0.41
184 0.4
185 0.36
186 0.38
187 0.4
188 0.41
189 0.43
190 0.36
191 0.29
192 0.26
193 0.27
194 0.24
195 0.21
196 0.19
197 0.17
198 0.18
199 0.19
200 0.21
201 0.18
202 0.16
203 0.16
204 0.16
205 0.18
206 0.16
207 0.17
208 0.12
209 0.13
210 0.16
211 0.16
212 0.16
213 0.15
214 0.16
215 0.16
216 0.22
217 0.22
218 0.17
219 0.17
220 0.18
221 0.17
222 0.23
223 0.23
224 0.25
225 0.25
226 0.28
227 0.27
228 0.27
229 0.27
230 0.2
231 0.24
232 0.21
233 0.25
234 0.24
235 0.25
236 0.23
237 0.25
238 0.26
239 0.22
240 0.22
241 0.17
242 0.15
243 0.15
244 0.15
245 0.15
246 0.14
247 0.12
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.08
254 0.11
255 0.14
256 0.19
257 0.23
258 0.25
259 0.3
260 0.38
261 0.41
262 0.46
263 0.49
264 0.51
265 0.48
266 0.48
267 0.46
268 0.38
269 0.37
270 0.29
271 0.23
272 0.17
273 0.15
274 0.12
275 0.08
276 0.09
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.08
281 0.11
282 0.11
283 0.15
284 0.18
285 0.27
286 0.32
287 0.38
288 0.38
289 0.44
290 0.45
291 0.45
292 0.49
293 0.45
294 0.48
295 0.49
296 0.48
297 0.43
298 0.45
299 0.42
300 0.35
301 0.31
302 0.24
303 0.18
304 0.17
305 0.13
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.11
310 0.16
311 0.23
312 0.33
313 0.42
314 0.5
315 0.6
316 0.7
317 0.79
318 0.84
319 0.88
320 0.91
321 0.93
322 0.95
323 0.96
324 0.97
325 0.96
326 0.95
327 0.94
328 0.91
329 0.89
330 0.88
331 0.84
332 0.82
333 0.81
334 0.8
335 0.8
336 0.83
337 0.85
338 0.87
339 0.91
340 0.94
341 0.96
342 0.97
343 0.98
344 0.98
345 0.98
346 0.97
347 0.97
348 0.97
349 0.96
350 0.95
351 0.94
352 0.94
353 0.92
354 0.87
355 0.78
356 0.68
357 0.64
358 0.56
359 0.47
360 0.39
361 0.34
362 0.28
363 0.26
364 0.25
365 0.19
366 0.21
367 0.2
368 0.2
369 0.19
370 0.19
371 0.2
372 0.28
373 0.36
374 0.41
375 0.48
376 0.49
377 0.55
378 0.58
379 0.58
380 0.52
381 0.52
382 0.47
383 0.42
384 0.41
385 0.35
386 0.33
387 0.31
388 0.3
389 0.25
390 0.26
391 0.27
392 0.28
393 0.33
394 0.37
395 0.4
396 0.49
397 0.56
398 0.61