Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FLN7

Protein Details
Accession Q6FLN7    Localization Confidence High Confidence Score 23
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-265DGTPKVTKKGKGRKPKKQDGAAPBasic
289-312SSTQSRIEKRKQLKKQGPKRPSSAHydrophilic
448-474AAHEQSTQTKKGRKKKQDPHAQDNTAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
248-271VTKKGKGRKPKKQDGAAPTKAPKE
292-308QSRIEKRKQLKKQGPKR
458-463KGRKKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0001046  F:core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0071456  P:cellular response to hypoxia  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:2000819  P:regulation of nucleotide-excision repair  
GO:0090069  P:regulation of ribosome biogenesis  
KEGG cgr:CAGL0L02013g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd22012  HMG-box_ABF2_IXR1-like_rpt2  
cd22011  HMG-box_IXR1-like_rpt1  
Amino Acid Sequences MNHIPQSGNASGGTGTGNSNSNNNSSLNQQQFQEMMYNSFLNHLNQNKPASGSSGSGSNNAASGNSNTSSGNNATAAALAQQQKYLSSQPQRYYSNPSANMMNDPLAQQSFLQQQQQQMLQQHQLHQMQGGQSSTTASTGNNHTTTNSANYSPQYMHDQLQYHPSGNGSLQYNSNGQPYQYHPQNVSYQQNQQKSSVAQYNQVNQDQSFPYQQQYNQQNMPNNINMQQAQLKAQQRTLQLNQDGTPKVTKKGKGRKPKKQDGAAPTKAPKEPAASQQQGNNANHPKKLSSTQSRIEKRKQLKKQGPKRPSSAYFLFSMSIRNELLQQFPDAKVPELSKLASARWRELSDDEKKPYYDEFRTNWEKYRVLRDEYEKTLPPKRPSGPFIQFTQEIRPIVVKENPDKNLIEITKIIGSKWRDLDPAKKNEYTEMYKKRLKEWEECYPEEAAAHEQSTQTKKGRKKKQDPHAQDNTAITDPSLLNAGNISVGVADLSSMVPKMDSMQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.11
4 0.14
5 0.14
6 0.18
7 0.19
8 0.21
9 0.22
10 0.23
11 0.22
12 0.24
13 0.32
14 0.35
15 0.35
16 0.34
17 0.34
18 0.33
19 0.33
20 0.33
21 0.25
22 0.21
23 0.21
24 0.21
25 0.18
26 0.21
27 0.22
28 0.19
29 0.25
30 0.29
31 0.31
32 0.36
33 0.39
34 0.37
35 0.38
36 0.36
37 0.33
38 0.29
39 0.25
40 0.21
41 0.23
42 0.23
43 0.22
44 0.22
45 0.19
46 0.17
47 0.16
48 0.15
49 0.12
50 0.13
51 0.15
52 0.15
53 0.15
54 0.15
55 0.16
56 0.19
57 0.18
58 0.18
59 0.14
60 0.14
61 0.13
62 0.13
63 0.12
64 0.1
65 0.14
66 0.16
67 0.16
68 0.17
69 0.17
70 0.18
71 0.2
72 0.23
73 0.27
74 0.32
75 0.38
76 0.42
77 0.49
78 0.52
79 0.53
80 0.58
81 0.57
82 0.57
83 0.52
84 0.48
85 0.44
86 0.41
87 0.41
88 0.33
89 0.27
90 0.19
91 0.18
92 0.18
93 0.15
94 0.14
95 0.12
96 0.14
97 0.18
98 0.2
99 0.24
100 0.24
101 0.27
102 0.31
103 0.33
104 0.33
105 0.32
106 0.33
107 0.35
108 0.35
109 0.37
110 0.4
111 0.39
112 0.35
113 0.32
114 0.31
115 0.25
116 0.25
117 0.21
118 0.14
119 0.12
120 0.13
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.08
125 0.11
126 0.14
127 0.18
128 0.18
129 0.18
130 0.18
131 0.19
132 0.2
133 0.21
134 0.19
135 0.16
136 0.17
137 0.18
138 0.2
139 0.19
140 0.19
141 0.21
142 0.21
143 0.22
144 0.24
145 0.25
146 0.24
147 0.3
148 0.29
149 0.24
150 0.22
151 0.21
152 0.18
153 0.16
154 0.18
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.16
159 0.18
160 0.17
161 0.2
162 0.17
163 0.15
164 0.16
165 0.2
166 0.25
167 0.28
168 0.29
169 0.27
170 0.3
171 0.35
172 0.37
173 0.38
174 0.34
175 0.38
176 0.43
177 0.47
178 0.45
179 0.42
180 0.39
181 0.35
182 0.36
183 0.33
184 0.27
185 0.28
186 0.29
187 0.33
188 0.35
189 0.36
190 0.32
191 0.26
192 0.28
193 0.24
194 0.23
195 0.2
196 0.16
197 0.16
198 0.18
199 0.19
200 0.24
201 0.28
202 0.31
203 0.33
204 0.36
205 0.39
206 0.39
207 0.4
208 0.33
209 0.29
210 0.27
211 0.25
212 0.21
213 0.18
214 0.18
215 0.16
216 0.17
217 0.22
218 0.24
219 0.23
220 0.25
221 0.28
222 0.28
223 0.32
224 0.32
225 0.31
226 0.29
227 0.29
228 0.28
229 0.29
230 0.26
231 0.22
232 0.24
233 0.2
234 0.23
235 0.26
236 0.3
237 0.35
238 0.45
239 0.53
240 0.6
241 0.7
242 0.75
243 0.81
244 0.86
245 0.84
246 0.81
247 0.79
248 0.76
249 0.76
250 0.69
251 0.62
252 0.54
253 0.49
254 0.43
255 0.37
256 0.3
257 0.25
258 0.24
259 0.27
260 0.32
261 0.31
262 0.32
263 0.33
264 0.38
265 0.4
266 0.38
267 0.38
268 0.38
269 0.38
270 0.38
271 0.36
272 0.31
273 0.27
274 0.31
275 0.33
276 0.33
277 0.37
278 0.42
279 0.51
280 0.59
281 0.63
282 0.65
283 0.66
284 0.67
285 0.72
286 0.74
287 0.75
288 0.77
289 0.81
290 0.85
291 0.87
292 0.86
293 0.81
294 0.78
295 0.74
296 0.67
297 0.63
298 0.55
299 0.47
300 0.39
301 0.34
302 0.3
303 0.22
304 0.22
305 0.16
306 0.15
307 0.13
308 0.12
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.13
313 0.14
314 0.14
315 0.15
316 0.18
317 0.16
318 0.16
319 0.17
320 0.17
321 0.18
322 0.17
323 0.17
324 0.16
325 0.17
326 0.18
327 0.21
328 0.22
329 0.23
330 0.25
331 0.26
332 0.25
333 0.27
334 0.32
335 0.34
336 0.38
337 0.39
338 0.37
339 0.37
340 0.36
341 0.37
342 0.36
343 0.33
344 0.33
345 0.31
346 0.37
347 0.44
348 0.45
349 0.48
350 0.46
351 0.45
352 0.42
353 0.5
354 0.46
355 0.43
356 0.46
357 0.46
358 0.47
359 0.48
360 0.5
361 0.44
362 0.44
363 0.48
364 0.5
365 0.48
366 0.5
367 0.51
368 0.53
369 0.53
370 0.58
371 0.57
372 0.53
373 0.52
374 0.49
375 0.46
376 0.42
377 0.43
378 0.38
379 0.31
380 0.29
381 0.28
382 0.24
383 0.26
384 0.28
385 0.28
386 0.31
387 0.38
388 0.4
389 0.41
390 0.4
391 0.37
392 0.4
393 0.35
394 0.3
395 0.23
396 0.23
397 0.24
398 0.23
399 0.22
400 0.22
401 0.24
402 0.28
403 0.31
404 0.31
405 0.32
406 0.35
407 0.45
408 0.48
409 0.54
410 0.54
411 0.53
412 0.51
413 0.52
414 0.55
415 0.53
416 0.53
417 0.53
418 0.55
419 0.57
420 0.58
421 0.6
422 0.62
423 0.6
424 0.59
425 0.57
426 0.6
427 0.63
428 0.63
429 0.58
430 0.5
431 0.45
432 0.36
433 0.3
434 0.23
435 0.18
436 0.17
437 0.15
438 0.16
439 0.22
440 0.26
441 0.31
442 0.34
443 0.41
444 0.5
445 0.59
446 0.68
447 0.74
448 0.8
449 0.85
450 0.88
451 0.92
452 0.92
453 0.92
454 0.91
455 0.83
456 0.75
457 0.67
458 0.61
459 0.51
460 0.41
461 0.31
462 0.24
463 0.2
464 0.17
465 0.17
466 0.12
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.08
471 0.08
472 0.07
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.04
477 0.04
478 0.04
479 0.05
480 0.06
481 0.06
482 0.07
483 0.07