Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FY56

Protein Details
Accession Q6FY56    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-61ESFDKNGKRKFKFSKAELKRRRKQRKGDGPWGSWDBasic
346-371IYSYSMKPKYKMHPNKKFKGHNSAGYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-53NGKRKFKFSKAELKRRRKQRKG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR032847  PRPF17  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0034399  C:nuclear periphery  
GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0000386  F:second spliceosomal transesterification activity  
GO:0000350  P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step  
GO:0000389  P:mRNA 3'-splice site recognition  
GO:0000348  P:mRNA branch site recognition  
KEGG cgr:CAGL0A02772g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MDLLAHYSDSSDELSDQEVVAKPVAEESFDKNGKRKFKFSKAELKRRRKQRKGDGPWGSWDVEVDQKTVQDIDDGGAHDLFDSDHDQETANGPTKLLNEKSTFYGRKERDYQGRSYLHPPADVDVDFKRTQFKCYLPKKVIYRYKGHHNGTTSLRLLPGTGHLILSGGNDNTVKLWDFYHDRKCLRDFVGHSKPIKTLDFTSDSSQFLSGSYDQQVKIWDTETGKVTKRLNTYSTPNSAEFRPTSGNEFVVGLSSSKIKHYDTRVSEKDGLVQVYDHHLSSILAIKYFPDGSKFISSSEDKTLRIWNNQVNIPIKQISDTTQHSMPYIGIHPEHNYFSTQSMDSVIYSYSMKPKYKMHPNKKFKGHNSAGYGIGLTFSPDGRFLCSGDARGQLFLWDWNTNRKLCDLKLPTKSPITQVSWHPKETSKVICSGPDGRIFVLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.12
4 0.15
5 0.15
6 0.16
7 0.16
8 0.16
9 0.14
10 0.17
11 0.18
12 0.16
13 0.17
14 0.21
15 0.3
16 0.34
17 0.37
18 0.4
19 0.47
20 0.55
21 0.58
22 0.62
23 0.63
24 0.69
25 0.76
26 0.77
27 0.81
28 0.82
29 0.88
30 0.88
31 0.9
32 0.89
33 0.9
34 0.93
35 0.92
36 0.92
37 0.92
38 0.93
39 0.92
40 0.93
41 0.91
42 0.82
43 0.78
44 0.71
45 0.6
46 0.49
47 0.39
48 0.3
49 0.28
50 0.25
51 0.21
52 0.18
53 0.17
54 0.18
55 0.18
56 0.16
57 0.1
58 0.1
59 0.09
60 0.11
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.13
75 0.15
76 0.18
77 0.19
78 0.18
79 0.17
80 0.19
81 0.21
82 0.26
83 0.26
84 0.27
85 0.25
86 0.27
87 0.31
88 0.38
89 0.38
90 0.36
91 0.43
92 0.41
93 0.46
94 0.51
95 0.54
96 0.55
97 0.56
98 0.56
99 0.54
100 0.55
101 0.51
102 0.49
103 0.49
104 0.4
105 0.37
106 0.34
107 0.27
108 0.26
109 0.23
110 0.21
111 0.16
112 0.2
113 0.19
114 0.19
115 0.26
116 0.24
117 0.28
118 0.29
119 0.34
120 0.39
121 0.47
122 0.56
123 0.52
124 0.58
125 0.61
126 0.67
127 0.69
128 0.64
129 0.63
130 0.58
131 0.65
132 0.67
133 0.64
134 0.58
135 0.52
136 0.52
137 0.48
138 0.48
139 0.38
140 0.3
141 0.27
142 0.22
143 0.2
144 0.15
145 0.13
146 0.12
147 0.11
148 0.1
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.09
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.09
164 0.14
165 0.19
166 0.27
167 0.32
168 0.32
169 0.35
170 0.37
171 0.38
172 0.36
173 0.36
174 0.32
175 0.35
176 0.42
177 0.44
178 0.43
179 0.41
180 0.4
181 0.37
182 0.35
183 0.27
184 0.21
185 0.2
186 0.23
187 0.22
188 0.24
189 0.23
190 0.22
191 0.21
192 0.19
193 0.15
194 0.11
195 0.12
196 0.09
197 0.09
198 0.11
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.15
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.13
207 0.12
208 0.14
209 0.16
210 0.17
211 0.18
212 0.22
213 0.24
214 0.25
215 0.27
216 0.28
217 0.29
218 0.29
219 0.33
220 0.32
221 0.34
222 0.32
223 0.3
224 0.3
225 0.27
226 0.26
227 0.21
228 0.19
229 0.18
230 0.16
231 0.19
232 0.18
233 0.18
234 0.15
235 0.16
236 0.13
237 0.11
238 0.11
239 0.07
240 0.06
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.1
245 0.11
246 0.16
247 0.21
248 0.28
249 0.32
250 0.4
251 0.41
252 0.45
253 0.46
254 0.42
255 0.41
256 0.34
257 0.29
258 0.21
259 0.19
260 0.14
261 0.15
262 0.16
263 0.12
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.16
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.13
274 0.15
275 0.14
276 0.1
277 0.11
278 0.14
279 0.18
280 0.18
281 0.17
282 0.21
283 0.22
284 0.22
285 0.29
286 0.28
287 0.25
288 0.26
289 0.33
290 0.31
291 0.34
292 0.36
293 0.33
294 0.35
295 0.36
296 0.4
297 0.36
298 0.34
299 0.33
300 0.3
301 0.25
302 0.22
303 0.21
304 0.18
305 0.2
306 0.23
307 0.23
308 0.24
309 0.24
310 0.23
311 0.23
312 0.2
313 0.17
314 0.16
315 0.14
316 0.14
317 0.15
318 0.17
319 0.19
320 0.2
321 0.19
322 0.18
323 0.17
324 0.17
325 0.19
326 0.17
327 0.15
328 0.15
329 0.14
330 0.13
331 0.13
332 0.11
333 0.1
334 0.11
335 0.12
336 0.18
337 0.24
338 0.26
339 0.29
340 0.36
341 0.44
342 0.54
343 0.63
344 0.67
345 0.72
346 0.8
347 0.86
348 0.89
349 0.9
350 0.86
351 0.85
352 0.8
353 0.77
354 0.72
355 0.65
356 0.56
357 0.46
358 0.4
359 0.29
360 0.23
361 0.15
362 0.11
363 0.09
364 0.08
365 0.09
366 0.1
367 0.11
368 0.14
369 0.15
370 0.14
371 0.19
372 0.2
373 0.22
374 0.23
375 0.28
376 0.25
377 0.25
378 0.24
379 0.2
380 0.2
381 0.2
382 0.21
383 0.2
384 0.21
385 0.3
386 0.34
387 0.35
388 0.36
389 0.37
390 0.39
391 0.36
392 0.45
393 0.44
394 0.49
395 0.56
396 0.59
397 0.6
398 0.61
399 0.62
400 0.57
401 0.56
402 0.52
403 0.48
404 0.53
405 0.58
406 0.57
407 0.57
408 0.55
409 0.52
410 0.52
411 0.53
412 0.52
413 0.44
414 0.44
415 0.43
416 0.43
417 0.44
418 0.44
419 0.42
420 0.39
421 0.37