FuNGI

A0A0C3RS78

Protein Details

Accession

A0A0C3RS78

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
277-307	AAKGRKRRRADDGSRRRKKRRKAAEEDGSEA	Basic
335-367	ASESEEDERRRRKKKKNKAKRRRARESSDDDES	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
278-326	AKGRKRRRADDGSRRRKKRRKAAEEDGSEAGSDAGGSRRAKSRAGRRRA
343-359	RRRRKKKKNKAKRRRAR
373-382	RSRKRARARR

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSANMSRKLNALEQKIHQAALSADDRTVSGRELEALAPDQGARTTALNFLLGAGLLKAMKDAHGRLAFRAVVKKELEAKKDLSGEETLVFGHIQAAGNEGIWTKHIKVKTELHQTVIDRCLKSLTQKKLVKCISGSVQHPTRKIYMLFHLEPSTEMTGGPWYTDKELDTEFIKLLTAACLKFIRDRSFPRSRPGDAAQQRLLYPPAAAPAYPTAAQVQAFLNKSRITETQLSVEHVEMLLHVLVLDGDVEKVPALGAALWESTRDDGGSSAEEEAAAAKGRKRRRADDGSRRRKKRRKAAEEDGSEAGSDAGGSRRAKSRAGRRRAHDSDAESDASESEEDERRRRKKKKNKAKRRRARESSDDDESSEAEARSRKRARARRASSSSSDSGSDSAPPRAASRTKREASSPAAELAFDADAVGGAHVYRAVHAERMARFGLGQAPCGHCPVFDFCKTGGPVNAQACGYYGDWLDAAEAKVE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.52
3	0.48
4	0.41
5	0.35
6	0.28
7	0.28
8	0.27
9	0.19
10	0.17
11	0.17
12	0.18
13	0.18
14	0.18
15	0.14
16	0.12
17	0.12
18	0.13
19	0.15
20	0.15
21	0.15
22	0.16
23	0.15
24	0.14
25	0.14
26	0.13
27	0.11
28	0.12
29	0.11
30	0.1
31	0.11
32	0.13
33	0.14
34	0.14
35	0.13
36	0.12
37	0.11
38	0.1
39	0.09
40	0.06
41	0.07
42	0.07
43	0.06
44	0.07
45	0.07
46	0.1
47	0.14
48	0.15
49	0.22
50	0.28
51	0.29
52	0.29
53	0.34
54	0.33
55	0.33
56	0.39
57	0.32
58	0.32
59	0.33
60	0.35
61	0.4
62	0.44
63	0.44
64	0.41
65	0.42
66	0.41
67	0.43
68	0.4
69	0.33
70	0.28
71	0.25
72	0.21
73	0.19
74	0.14
75	0.12
76	0.11
77	0.08
78	0.08
79	0.08
80	0.09
81	0.08
82	0.1
83	0.1
84	0.1
85	0.1
86	0.1
87	0.08
88	0.09
89	0.12
90	0.12
91	0.17
92	0.19
93	0.22
94	0.28
95	0.36
96	0.43
97	0.52
98	0.51
99	0.49
100	0.5
101	0.48
102	0.47
103	0.45
104	0.42
105	0.32
106	0.31
107	0.3
108	0.27
109	0.34
110	0.38
111	0.4
112	0.44
113	0.5
114	0.52
115	0.59
116	0.6
117	0.55
118	0.47
119	0.43
120	0.39
121	0.39
122	0.38
123	0.36
124	0.41
125	0.41
126	0.42
127	0.4
128	0.37
129	0.34
130	0.34
131	0.29
132	0.29
133	0.32
134	0.32
135	0.32
136	0.3
137	0.27
138	0.26
139	0.26
140	0.21
141	0.13
142	0.12
143	0.1
144	0.11
145	0.11
146	0.11
147	0.09
148	0.09
149	0.11
150	0.12
151	0.12
152	0.11
153	0.12
154	0.13
155	0.13
156	0.13
157	0.11
158	0.1
159	0.1
160	0.08
161	0.08
162	0.09
163	0.1
164	0.09
165	0.11
166	0.12
167	0.13
168	0.18
169	0.22
170	0.25
171	0.27
172	0.33
173	0.39
174	0.48
175	0.5
176	0.52
177	0.52
178	0.49
179	0.49
180	0.47
181	0.48
182	0.43
183	0.46
184	0.41
185	0.38
186	0.36
187	0.32
188	0.3
189	0.2
190	0.16
191	0.1
192	0.1
193	0.09
194	0.09
195	0.09
196	0.09
197	0.1
198	0.1
199	0.1
200	0.09
201	0.1
202	0.1
203	0.1
204	0.1
205	0.12
206	0.13
207	0.14
208	0.15
209	0.15
210	0.15
211	0.17
212	0.17
213	0.17
214	0.2
215	0.2
216	0.22
217	0.22
218	0.23
219	0.21
220	0.2
221	0.15
222	0.11
223	0.1
224	0.06
225	0.06
226	0.04
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.02
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.09
266	0.16
267	0.22
268	0.3
269	0.35
270	0.39
271	0.48
272	0.57
273	0.65
274	0.7
275	0.76
276	0.79
277	0.84
278	0.88
279	0.9
280	0.88
281	0.87
282	0.87
283	0.87
284	0.86
285	0.86
286	0.87
287	0.86
288	0.8
289	0.74
290	0.64
291	0.52
292	0.41
293	0.32
294	0.21
295	0.11
296	0.08
297	0.05
298	0.05
299	0.1
300	0.11
301	0.13
302	0.18
303	0.2
304	0.25
305	0.32
306	0.42
307	0.48
308	0.57
309	0.62
310	0.62
311	0.71
312	0.7
313	0.67
314	0.61
315	0.54
316	0.49
317	0.44
318	0.39
319	0.29
320	0.25
321	0.21
322	0.16
323	0.13
324	0.09
325	0.09
326	0.14
327	0.17
328	0.24
329	0.33
330	0.42
331	0.52
332	0.62
333	0.7
334	0.76
335	0.85
336	0.89
337	0.91
338	0.94
339	0.95
340	0.97
341	0.96
342	0.96
343	0.96
344	0.94
345	0.91
346	0.89
347	0.86
348	0.8
349	0.76
350	0.65
351	0.55
352	0.46
353	0.38
354	0.3
355	0.24
356	0.18
357	0.14
358	0.18
359	0.19
360	0.29
361	0.34
362	0.39
363	0.47
364	0.56
365	0.65
366	0.71
367	0.76
368	0.77
369	0.79
370	0.79
371	0.73
372	0.7
373	0.62
374	0.52
375	0.45
376	0.36
377	0.29
378	0.24
379	0.24
380	0.19
381	0.2
382	0.19
383	0.19
384	0.2
385	0.25
386	0.31
387	0.34
388	0.41
389	0.48
390	0.51
391	0.52
392	0.54
393	0.53
394	0.53
395	0.5
396	0.43
397	0.36
398	0.32
399	0.3
400	0.26
401	0.23
402	0.16
403	0.11
404	0.09
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.09
416	0.11
417	0.13
418	0.16
419	0.22
420	0.22
421	0.26
422	0.26
423	0.23
424	0.21
425	0.21
426	0.26
427	0.21
428	0.22
429	0.23
430	0.27
431	0.28
432	0.31
433	0.29
434	0.22
435	0.24
436	0.28
437	0.3
438	0.28
439	0.31
440	0.29
441	0.36
442	0.38
443	0.38
444	0.35
445	0.33
446	0.37
447	0.36
448	0.38
449	0.31
450	0.29
451	0.27
452	0.26
453	0.22
454	0.17
455	0.15
456	0.13
457	0.13
458	0.13
459	0.13
460	0.12

A0A0C3RS78

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer