FuNGI

A0A0C3S5L5

Protein Details

Accession

A0A0C3S5L5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
953-983	EEDDAAPKPKPKGKKRKQVKTRLVIPKHIQD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
959-973	PKPKPKGKKRKQVKT

Subcellular Location(s)

cyto 19, nucl 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1

Amino Acid Sequences

MPVLKRKKPELQVTHDADGAVIDVNVVSQPEEVEYEMPFNLITLRKHLADVMLHRRALPEDTHARQKLLEESVYDVAVARWKHEAETFEELGLGKKGLDSADLRSWMWEWHTKLKPRIAAEIAELVKSEAKLTGKSATRLAPFLSLVSAEKLSLITILEIMQLQGTGGVSEGMKTARALIHVGKAVEIEHKAQVCRKSGIAIPIPSHPRDNNIFNKFGYRTLLERRVAARKLVEDSEEWAADWSQIIRVRVGSFLVDALMDVATVTRSAVHKKTGEVVTEDQPAFYHSYEYLRGQKLGVIKLNPVVSERIAKDAVRETLHPRHLPMLVKPKPWLSHDQGGYLYHKTSVMRYKDCQEQASYLKEASKQGNLELVYASLDVLGNTPWVINREIFDVVLEVWNTGDRLGKIPPAVYDQSEPEKPENMESDPKAKVEFLARHKQYMIEKANNHSDRCSTNYKIEIARAFLGDTIYMPHNLDFRGRAYPIPPHLSHIGDDLSRGLLKFAECKPLGERGLRWLKIHIANLYGYDKASFDERVEFVHQHLDDIADSAENPLGGRGWWKNADDPWQCLATCKELHAALHSPDPLAFESNLPVHQDGTCNGLQHYAALGGDARGAQHVNLDITDRPSDVYTHVATMAEKVIAEDAQGGDMYAQMLSGKISRKIVKQTASARVMTTVYGVTFIGAREQIEKQLRDRPDILGAEHAWMASAYLARVVLACIGDLFNAAKHIQNYLTLAAKLISKSIPPDRIEEVSTPEVKNVRGGGKAVVANNRIKSEQMTSVIWTTALGLPIVQPYRQTKRKQIMTSLQTVFISDPNVPAAVNSQKQATAFPPNFVHSLDATHMMLTALECRNRDITFASVHDSYWTHPSSIDEMAEVIRETFIALHSSDVLGRLDAEFRERYAGYKIPVSVLRTGGFITKLNSASADIAAHVAGEREDDVDVSALVADAEEEEDDAAPKPKPKGKKRKQVKTRLVIPKHIQDVIEGTSNDAADHKFINVVDILPPLPQKGTFDVTKIKKSLYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.64
3	0.54
4	0.43
5	0.34
6	0.25
7	0.16
8	0.09
9	0.06
10	0.05
11	0.05
12	0.06
13	0.06
14	0.06
15	0.06
16	0.07
17	0.08
18	0.1
19	0.1
20	0.11
21	0.11
22	0.13
23	0.12
24	0.12
25	0.11
26	0.1
27	0.13
28	0.16
29	0.17
30	0.21
31	0.25
32	0.25
33	0.26
34	0.28
35	0.27
36	0.27
37	0.34
38	0.39
39	0.41
40	0.4
41	0.4
42	0.4
43	0.39
44	0.37
45	0.3
46	0.29
47	0.31
48	0.36
49	0.46
50	0.46
51	0.45
52	0.43
53	0.44
54	0.42
55	0.37
56	0.34
57	0.25
58	0.28
59	0.28
60	0.27
61	0.24
62	0.18
63	0.15
64	0.18
65	0.17
66	0.14
67	0.17
68	0.18
69	0.2
70	0.23
71	0.25
72	0.25
73	0.32
74	0.31
75	0.27
76	0.28
77	0.26
78	0.24
79	0.23
80	0.17
81	0.1
82	0.1
83	0.11
84	0.1
85	0.13
86	0.13
87	0.17
88	0.23
89	0.25
90	0.25
91	0.25
92	0.25
93	0.24
94	0.26
95	0.28
96	0.27
97	0.35
98	0.43
99	0.5
100	0.57
101	0.61
102	0.63
103	0.59
104	0.61
105	0.54
106	0.47
107	0.42
108	0.42
109	0.36
110	0.3
111	0.27
112	0.21
113	0.2
114	0.19
115	0.17
116	0.14
117	0.15
118	0.16
119	0.18
120	0.24
121	0.26
122	0.28
123	0.31
124	0.33
125	0.33
126	0.33
127	0.32
128	0.27
129	0.24
130	0.22
131	0.19
132	0.15
133	0.14
134	0.15
135	0.14
136	0.11
137	0.11
138	0.11
139	0.1
140	0.09
141	0.09
142	0.06
143	0.06
144	0.07
145	0.07
146	0.07
147	0.07
148	0.06
149	0.06
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.05
154	0.05
155	0.06
156	0.05
157	0.06
158	0.07
159	0.07
160	0.08
161	0.08
162	0.1
163	0.1
164	0.11
165	0.13
166	0.14
167	0.18
168	0.2
169	0.21
170	0.18
171	0.18
172	0.17
173	0.19
174	0.18
175	0.16
176	0.18
177	0.2
178	0.22
179	0.27
180	0.31
181	0.31
182	0.32
183	0.3
184	0.29
185	0.3
186	0.35
187	0.36
188	0.34
189	0.31
190	0.36
191	0.4
192	0.39
193	0.4
194	0.34
195	0.33
196	0.36
197	0.41
198	0.44
199	0.44
200	0.45
201	0.4
202	0.46
203	0.41
204	0.38
205	0.34
206	0.27
207	0.26
208	0.32
209	0.39
210	0.35
211	0.37
212	0.4
213	0.44
214	0.44
215	0.42
216	0.37
217	0.31
218	0.34
219	0.32
220	0.29
221	0.22
222	0.24
223	0.23
224	0.21
225	0.18
226	0.15
227	0.14
228	0.12
229	0.12
230	0.09
231	0.11
232	0.14
233	0.15
234	0.14
235	0.16
236	0.16
237	0.17
238	0.17
239	0.13
240	0.1
241	0.09
242	0.09
243	0.07
244	0.06
245	0.06
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.06
254	0.08
255	0.13
256	0.16
257	0.21
258	0.22
259	0.23
260	0.3
261	0.3
262	0.3
263	0.29
264	0.3
265	0.29
266	0.33
267	0.32
268	0.25
269	0.22
270	0.22
271	0.2
272	0.17
273	0.15
274	0.1
275	0.13
276	0.15
277	0.18
278	0.24
279	0.24
280	0.24
281	0.23
282	0.24
283	0.26
284	0.28
285	0.29
286	0.23
287	0.22
288	0.25
289	0.26
290	0.23
291	0.21
292	0.18
293	0.15
294	0.19
295	0.19
296	0.19
297	0.2
298	0.19
299	0.2
300	0.22
301	0.24
302	0.21
303	0.22
304	0.25
305	0.31
306	0.37
307	0.35
308	0.33
309	0.33
310	0.35
311	0.35
312	0.34
313	0.38
314	0.37
315	0.38
316	0.39
317	0.41
318	0.4
319	0.42
320	0.43
321	0.38
322	0.41
323	0.4
324	0.4
325	0.37
326	0.36
327	0.34
328	0.28
329	0.22
330	0.15
331	0.16
332	0.14
333	0.17
334	0.23
335	0.27
336	0.29
337	0.32
338	0.35
339	0.42
340	0.44
341	0.41
342	0.35
343	0.33
344	0.32
345	0.33
346	0.3
347	0.23
348	0.22
349	0.23
350	0.25
351	0.23
352	0.23
353	0.2
354	0.2
355	0.23
356	0.21
357	0.19
358	0.15
359	0.13
360	0.1
361	0.1
362	0.09
363	0.05
364	0.05
365	0.04
366	0.05
367	0.05
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.05
372	0.07
373	0.08
374	0.09
375	0.09
376	0.11
377	0.12
378	0.12
379	0.11
380	0.09
381	0.08
382	0.09
383	0.09
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.08
390	0.07
391	0.09
392	0.1
393	0.11
394	0.11
395	0.12
396	0.13
397	0.15
398	0.15
399	0.15
400	0.15
401	0.16
402	0.2
403	0.21
404	0.22
405	0.19
406	0.21
407	0.2
408	0.21
409	0.2
410	0.19
411	0.22
412	0.21
413	0.24
414	0.22
415	0.22
416	0.21
417	0.19
418	0.17
419	0.18
420	0.23
421	0.26
422	0.35
423	0.36
424	0.36
425	0.37
426	0.39
427	0.36
428	0.38
429	0.37
430	0.33
431	0.34
432	0.36
433	0.45
434	0.45
435	0.43
436	0.35
437	0.32
438	0.27
439	0.31
440	0.32
441	0.25
442	0.25
443	0.27
444	0.28
445	0.27
446	0.28
447	0.24
448	0.2
449	0.19
450	0.16
451	0.13
452	0.11
453	0.1
454	0.08
455	0.07
456	0.07
457	0.07
458	0.07
459	0.08
460	0.08
461	0.09
462	0.09
463	0.1
464	0.09
465	0.1
466	0.12
467	0.13
468	0.13
469	0.13
470	0.17
471	0.19
472	0.23
473	0.22
474	0.22
475	0.23
476	0.23
477	0.22
478	0.2
479	0.17
480	0.12
481	0.12
482	0.09
483	0.08
484	0.07
485	0.07
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.1
490	0.11
491	0.18
492	0.18
493	0.19
494	0.2
495	0.24
496	0.25
497	0.22
498	0.22
499	0.22
500	0.3
501	0.3
502	0.29
503	0.25
504	0.28
505	0.29
506	0.31
507	0.23
508	0.18
509	0.16
510	0.18
511	0.18
512	0.14
513	0.11
514	0.09
515	0.09
516	0.08
517	0.09
518	0.08
519	0.07
520	0.09
521	0.09
522	0.11
523	0.13
524	0.13
525	0.12
526	0.16
527	0.15
528	0.13
529	0.13
530	0.12
531	0.1
532	0.1
533	0.09
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.05
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.04
543	0.07
544	0.07
545	0.1
546	0.12
547	0.13
548	0.15
549	0.17
550	0.26
551	0.25
552	0.27
553	0.26
554	0.25
555	0.24
556	0.23
557	0.23
558	0.18
559	0.17
560	0.15
561	0.15
562	0.14
563	0.14
564	0.15
565	0.16
566	0.13
567	0.15
568	0.14
569	0.13
570	0.12
571	0.14
572	0.12
573	0.11
574	0.1
575	0.08
576	0.1
577	0.11
578	0.11
579	0.11
580	0.11
581	0.1
582	0.1
583	0.11
584	0.1
585	0.13
586	0.13
587	0.13
588	0.12
589	0.13
590	0.12
591	0.11
592	0.11
593	0.07
594	0.06
595	0.05
596	0.05
597	0.04
598	0.05
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.05
603	0.05
604	0.06
605	0.06
606	0.06
607	0.06
608	0.08
609	0.08
610	0.1
611	0.11
612	0.1
613	0.1
614	0.1
615	0.11
616	0.1
617	0.13
618	0.11
619	0.11
620	0.11
621	0.11
622	0.1
623	0.1
624	0.1
625	0.07
626	0.07
627	0.06
628	0.06
629	0.06
630	0.06
631	0.06
632	0.05
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.04
637	0.05
638	0.05
639	0.04
640	0.04
641	0.03
642	0.04
643	0.04
644	0.07
645	0.09
646	0.12
647	0.17
648	0.2
649	0.24
650	0.31
651	0.36
652	0.37
653	0.41
654	0.45
655	0.49
656	0.49
657	0.46
658	0.38
659	0.34
660	0.31
661	0.24
662	0.19
663	0.11
664	0.08
665	0.08
666	0.07
667	0.06
668	0.06
669	0.06
670	0.07
671	0.07
672	0.08
673	0.1
674	0.1
675	0.17
676	0.22
677	0.24
678	0.25
679	0.32
680	0.33
681	0.35
682	0.36
683	0.31
684	0.31
685	0.3
686	0.28
687	0.23
688	0.22
689	0.19
690	0.18
691	0.16
692	0.1
693	0.09
694	0.08
695	0.06
696	0.06
697	0.04
698	0.05
699	0.05
700	0.05
701	0.05
702	0.05
703	0.06
704	0.06
705	0.05
706	0.05
707	0.05
708	0.05
709	0.06
710	0.06
711	0.05
712	0.07
713	0.08
714	0.1
715	0.1
716	0.12
717	0.12
718	0.13
719	0.14
720	0.14
721	0.16
722	0.13
723	0.13
724	0.13
725	0.14
726	0.13
727	0.13
728	0.11
729	0.1
730	0.15
731	0.21
732	0.26
733	0.26
734	0.29
735	0.31
736	0.32
737	0.34
738	0.3
739	0.3
740	0.27
741	0.29
742	0.26
743	0.25
744	0.25
745	0.23
746	0.25
747	0.22
748	0.21
749	0.19
750	0.2
751	0.18
752	0.2
753	0.22
754	0.23
755	0.25
756	0.26
757	0.29
758	0.31
759	0.32
760	0.28
761	0.26
762	0.26
763	0.24
764	0.24
765	0.23
766	0.21
767	0.21
768	0.22
769	0.21
770	0.19
771	0.15
772	0.13
773	0.12
774	0.12
775	0.1
776	0.08
777	0.09
778	0.13
779	0.15
780	0.13
781	0.15
782	0.22
783	0.31
784	0.4
785	0.45
786	0.5
787	0.59
788	0.67
789	0.68
790	0.7
791	0.7
792	0.67
793	0.69
794	0.61
795	0.53
796	0.44
797	0.41
798	0.33
799	0.24
800	0.21
801	0.13
802	0.12
803	0.11
804	0.11
805	0.1
806	0.09
807	0.13
808	0.17
809	0.19
810	0.19
811	0.19
812	0.2
813	0.21
814	0.23
815	0.22
816	0.26
817	0.25
818	0.27
819	0.28
820	0.3
821	0.3
822	0.29
823	0.28
824	0.18
825	0.19
826	0.17
827	0.18
828	0.15
829	0.14
830	0.14
831	0.12
832	0.11
833	0.1
834	0.14
835	0.15
836	0.18
837	0.18
838	0.2
839	0.24
840	0.24
841	0.25
842	0.21
843	0.2
844	0.2
845	0.21
846	0.23
847	0.2
848	0.2
849	0.21
850	0.19
851	0.19
852	0.22
853	0.22
854	0.18
855	0.18
856	0.2
857	0.22
858	0.23
859	0.21
860	0.15
861	0.14
862	0.14
863	0.14
864	0.12
865	0.09
866	0.07
867	0.07
868	0.07
869	0.07
870	0.07
871	0.08
872	0.08
873	0.09
874	0.09
875	0.1
876	0.1
877	0.12
878	0.11
879	0.09
880	0.1
881	0.1
882	0.11
883	0.11
884	0.15
885	0.14
886	0.15
887	0.19
888	0.18
889	0.19
890	0.22
891	0.25
892	0.23
893	0.26
894	0.26
895	0.26
896	0.3
897	0.31
898	0.3
899	0.28
900	0.27
901	0.23
902	0.24
903	0.22
904	0.2
905	0.19
906	0.18
907	0.2
908	0.2
909	0.2
910	0.2
911	0.19
912	0.18
913	0.18
914	0.16
915	0.11
916	0.11
917	0.1
918	0.09
919	0.08
920	0.07
921	0.06
922	0.07
923	0.07
924	0.07
925	0.08
926	0.08
927	0.08
928	0.08
929	0.08
930	0.07
931	0.07
932	0.06
933	0.05
934	0.05
935	0.04
936	0.04
937	0.05
938	0.05
939	0.05
940	0.05
941	0.06
942	0.07
943	0.09
944	0.12
945	0.14
946	0.19
947	0.26
948	0.33
949	0.43
950	0.54
951	0.64
952	0.71
953	0.8
954	0.86
955	0.9
956	0.94
957	0.95
958	0.95
959	0.93
960	0.93
961	0.93
962	0.88
963	0.86
964	0.82
965	0.79
966	0.73
967	0.65
968	0.55
969	0.45
970	0.42
971	0.35
972	0.34
973	0.26
974	0.23
975	0.22
976	0.22
977	0.2
978	0.19
979	0.17
980	0.13
981	0.14
982	0.13
983	0.14
984	0.14
985	0.16
986	0.15
987	0.15
988	0.15
989	0.16
990	0.16
991	0.16
992	0.17
993	0.16
994	0.17
995	0.17
996	0.19
997	0.22
998	0.27
999	0.26
1000	0.29
1001	0.38
1002	0.42
1003	0.49
1004	0.47
1005	0.46
1006	0.45

A0A0C3S5L5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer