Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FTZ4

Protein Details
Accession Q6FTZ4    Localization Confidence High Confidence Score 24
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-212KESLDKKRLKKIKQVKLHMEREKQLBasic
219-240MDSQRERMKKGSKKKIISDTGNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
193-200KKRLKKIK
224-235ERMKKGSKKKII
243-251FKWKKQRKR
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0006412  P:translation  
KEGG cgr:CAGL0F07645g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MAKLVHDIQKKQHRERSQLTGRARLGMLEKHKDYVKRAQDYHKKQNTLKALREKAKERNPDEYYHAMNTRKVDDKGLLIKSRYEDGEDPSLDMDQVKLLKTQDSNYIRTLRQVELKKLQRDKQLIGYKSQSKHTVFVDDQDSMRDFKAENYFKTTKEFLDRPENRLTVDQLTSQNLNVGDSESLLMPKESLDKKRLKKIKQVKLHMEREKQLNQIQQRMDSQRERMKKGSKKKIISDTGNVTFKWKKQRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.78
3 0.78
4 0.78
5 0.78
6 0.73
7 0.72
8 0.65
9 0.59
10 0.52
11 0.44
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13 0.36
14 0.39
15 0.38
16 0.38
17 0.38
18 0.43
19 0.44
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21 0.48
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23 0.5
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27 0.73
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29 0.77
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31 0.7
32 0.74
33 0.73
34 0.71
35 0.7
36 0.69
37 0.69
38 0.7
39 0.74
40 0.71
41 0.71
42 0.72
43 0.73
44 0.67
45 0.67
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57 0.32
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67 0.28
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69 0.26
70 0.23
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91 0.26
92 0.27
93 0.31
94 0.29
95 0.31
96 0.32
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98 0.29
99 0.29
100 0.31
101 0.36
102 0.43
103 0.47
104 0.5
105 0.53
106 0.53
107 0.53
108 0.5
109 0.5
110 0.51
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113 0.41
114 0.4
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117 0.36
118 0.3
119 0.31
120 0.29
121 0.29
122 0.23
123 0.24
124 0.24
125 0.2
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127 0.17
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129 0.13
130 0.13
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133 0.11
134 0.2
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136 0.22
137 0.29
138 0.3
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140 0.34
141 0.32
142 0.25
143 0.29
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150 0.41
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152 0.36
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154 0.25
155 0.24
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159 0.2
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166 0.09
167 0.09
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171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.13
176 0.18
177 0.23
178 0.3
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183 0.64
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188 0.82
189 0.82
190 0.84
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197 0.63
198 0.58
199 0.56
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201 0.53
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204 0.49
205 0.48
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207 0.48
208 0.5
209 0.52
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222 0.8
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227 0.57
228 0.53
229 0.5
230 0.49
231 0.53