Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3PRE9

Protein Details
Accession A0A0C3PRE9    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-47SQEARRKKALEEQKRRRAERFDBasic
112-143LPMSFGGPKKKGKNKRKAKSRAPKVQSSKPNNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-42RRKKALEEQKRRR
118-137GPKKKGKNKRKAKSRAPKVQ
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017336  Snurportin-1  
IPR024721  Snurportin-1_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0061015  P:snRNA import into nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF11538  Snurportin1  
Amino Acid Sequences MSHNASNDRKASYKVPPAAVRDASTSQEARRKKALEEQKRRRAERFDSSRQLDFFADLTLGASDDEEENATNEPMREGVAQFASLLPSTSSVPAIEPGSFAAEPQGPVLDSLPMSFGGPKKKGKNKRKAKSRAPKVQSSKPNNKWADKCMYAELLEMTEDTNMKDFDDGVDADGLPSDIETAWVALTPVPLGKRCLAITHAPSGIAGLVPNTTLRSRVLGKSLMKPFPSAIPPHTVLDCILDEHWQNNGILHVLDVVKWKGQDIADCETPFRFWWRDTRLAELPSFPPPSADSEPSSSQYRFSYPTTLLPVPYHTNLSLLHLSSVLIPLSRSTRSVPISVPIHVLTSGADDTSGMNVEQADASTRVDLKSEEATINSDGMLLYVAQATYEPGTSPLSLWVPVRAYAGDRSSTQEVPIGSFQTTREGPLDIFERLVHKRLAQDSYASNMAMES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.54
3 0.55
4 0.58
5 0.61
6 0.58
7 0.51
8 0.46
9 0.42
10 0.38
11 0.37
12 0.34
13 0.33
14 0.38
15 0.41
16 0.41
17 0.47
18 0.47
19 0.45
20 0.53
21 0.58
22 0.62
23 0.69
24 0.75
25 0.77
26 0.84
27 0.85
28 0.82
29 0.79
30 0.76
31 0.75
32 0.74
33 0.73
34 0.73
35 0.73
36 0.71
37 0.63
38 0.57
39 0.47
40 0.39
41 0.29
42 0.2
43 0.16
44 0.11
45 0.11
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.08
55 0.08
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.13
66 0.13
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.08
74 0.09
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.12
81 0.13
82 0.12
83 0.11
84 0.1
85 0.14
86 0.13
87 0.12
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.14
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.1
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.08
101 0.09
102 0.11
103 0.14
104 0.2
105 0.26
106 0.33
107 0.41
108 0.51
109 0.62
110 0.7
111 0.77
112 0.81
113 0.86
114 0.9
115 0.91
116 0.92
117 0.92
118 0.92
119 0.92
120 0.87
121 0.87
122 0.83
123 0.82
124 0.81
125 0.8
126 0.8
127 0.76
128 0.8
129 0.76
130 0.76
131 0.7
132 0.66
133 0.63
134 0.54
135 0.49
136 0.41
137 0.36
138 0.29
139 0.26
140 0.2
141 0.14
142 0.11
143 0.09
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.03
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.04
173 0.05
174 0.04
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.1
179 0.11
180 0.13
181 0.13
182 0.14
183 0.15
184 0.18
185 0.19
186 0.2
187 0.19
188 0.17
189 0.17
190 0.16
191 0.13
192 0.09
193 0.07
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.09
203 0.12
204 0.13
205 0.15
206 0.19
207 0.22
208 0.28
209 0.33
210 0.33
211 0.31
212 0.31
213 0.29
214 0.26
215 0.27
216 0.21
217 0.17
218 0.18
219 0.2
220 0.2
221 0.2
222 0.17
223 0.15
224 0.15
225 0.13
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.06
241 0.07
242 0.09
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.13
250 0.15
251 0.18
252 0.21
253 0.21
254 0.21
255 0.19
256 0.19
257 0.17
258 0.18
259 0.15
260 0.13
261 0.21
262 0.26
263 0.34
264 0.35
265 0.4
266 0.4
267 0.4
268 0.4
269 0.34
270 0.3
271 0.27
272 0.27
273 0.21
274 0.18
275 0.17
276 0.22
277 0.23
278 0.24
279 0.21
280 0.24
281 0.25
282 0.28
283 0.3
284 0.24
285 0.23
286 0.22
287 0.22
288 0.21
289 0.21
290 0.22
291 0.2
292 0.23
293 0.27
294 0.27
295 0.25
296 0.23
297 0.25
298 0.25
299 0.25
300 0.23
301 0.18
302 0.18
303 0.17
304 0.21
305 0.2
306 0.16
307 0.15
308 0.13
309 0.13
310 0.12
311 0.13
312 0.09
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.11
317 0.12
318 0.13
319 0.14
320 0.2
321 0.22
322 0.24
323 0.23
324 0.27
325 0.28
326 0.28
327 0.27
328 0.22
329 0.2
330 0.18
331 0.18
332 0.11
333 0.11
334 0.1
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.09
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.11
351 0.12
352 0.12
353 0.12
354 0.13
355 0.13
356 0.15
357 0.16
358 0.16
359 0.15
360 0.18
361 0.18
362 0.17
363 0.15
364 0.12
365 0.1
366 0.09
367 0.09
368 0.06
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.05
373 0.06
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.11
380 0.11
381 0.12
382 0.14
383 0.15
384 0.16
385 0.17
386 0.19
387 0.19
388 0.19
389 0.2
390 0.18
391 0.19
392 0.21
393 0.24
394 0.22
395 0.22
396 0.26
397 0.29
398 0.29
399 0.27
400 0.26
401 0.23
402 0.24
403 0.26
404 0.22
405 0.19
406 0.2
407 0.2
408 0.23
409 0.23
410 0.22
411 0.21
412 0.21
413 0.2
414 0.23
415 0.25
416 0.19
417 0.2
418 0.19
419 0.23
420 0.25
421 0.29
422 0.27
423 0.26
424 0.32
425 0.37
426 0.4
427 0.36
428 0.37
429 0.36
430 0.39
431 0.38
432 0.31