Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FJM6

Protein Details
Accession Q6FJM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-295ANAENKNYKKQNRDKKPHFRKQKTKPKCLYCGKPHKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
267-284KKQNRDKKPHFRKQKTKP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035179  DUF5314  
KEGG cgr:CAGL0M05115g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17241  Retrotran_gag_4  
Amino Acid Sequences MELVYPLLCQTIANGELASLKQQVMSLAANTYDASTTIKLTEVGDYKKWIQMLESTLTMAHSAWSEFYHAGPYDVKTISDPTVKIQLSFLNDALVCLIKKRVSDDAVKNINKIILSLTNFSNSAFKILDYLKGRYDRNNSRTSFKQNYGWITNYQSMTHEDLFREITSMMEALLNYDEYELALLNTIPKDDQAKFIVRKENLIKQSAAGMMLGYLPEHLREGYFKQWGHTAEFQTYEIVDIVVGSNVNNSQSVNHGSLANAENKNYKKQNRDKKPHFRKQKTKPKCLYCGKPHKLSECKILFQDNPDAEVFKTFGPPSIDEELSGAYEYTIQEKPETLIWNSGASTHMCCNKQFFIEYKDLKAHTSEISQYPTTSCREAREASIHAYKEPASRHHDQDHTQNPARGLKELDSVAIIKSGGSTTYSVQAVWRGC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.15
4 0.16
5 0.17
6 0.14
7 0.13
8 0.13
9 0.14
10 0.14
11 0.15
12 0.16
13 0.14
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.13
19 0.11
20 0.1
21 0.12
22 0.11
23 0.12
24 0.12
25 0.13
26 0.13
27 0.13
28 0.19
29 0.21
30 0.24
31 0.26
32 0.3
33 0.31
34 0.33
35 0.33
36 0.28
37 0.24
38 0.24
39 0.26
40 0.25
41 0.23
42 0.21
43 0.2
44 0.2
45 0.19
46 0.14
47 0.11
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.09
52 0.11
53 0.11
54 0.12
55 0.15
56 0.14
57 0.16
58 0.17
59 0.18
60 0.2
61 0.2
62 0.2
63 0.17
64 0.2
65 0.21
66 0.23
67 0.22
68 0.2
69 0.29
70 0.28
71 0.27
72 0.26
73 0.26
74 0.26
75 0.28
76 0.25
77 0.19
78 0.19
79 0.19
80 0.18
81 0.17
82 0.12
83 0.11
84 0.15
85 0.14
86 0.15
87 0.18
88 0.22
89 0.24
90 0.33
91 0.37
92 0.43
93 0.5
94 0.5
95 0.47
96 0.43
97 0.41
98 0.33
99 0.28
100 0.2
101 0.16
102 0.17
103 0.19
104 0.19
105 0.19
106 0.19
107 0.19
108 0.2
109 0.15
110 0.15
111 0.13
112 0.12
113 0.14
114 0.14
115 0.2
116 0.21
117 0.23
118 0.25
119 0.3
120 0.31
121 0.34
122 0.42
123 0.45
124 0.48
125 0.54
126 0.52
127 0.52
128 0.56
129 0.59
130 0.56
131 0.49
132 0.49
133 0.45
134 0.48
135 0.46
136 0.43
137 0.37
138 0.34
139 0.35
140 0.3
141 0.27
142 0.23
143 0.22
144 0.23
145 0.23
146 0.21
147 0.17
148 0.17
149 0.18
150 0.16
151 0.15
152 0.11
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.06
164 0.05
165 0.04
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.1
177 0.1
178 0.13
179 0.15
180 0.21
181 0.23
182 0.27
183 0.33
184 0.3
185 0.34
186 0.35
187 0.4
188 0.37
189 0.37
190 0.33
191 0.26
192 0.28
193 0.23
194 0.19
195 0.12
196 0.08
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.06
208 0.08
209 0.11
210 0.16
211 0.15
212 0.16
213 0.19
214 0.2
215 0.23
216 0.24
217 0.23
218 0.19
219 0.2
220 0.2
221 0.17
222 0.15
223 0.12
224 0.08
225 0.07
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.08
239 0.11
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.14
245 0.16
246 0.2
247 0.18
248 0.18
249 0.23
250 0.25
251 0.32
252 0.36
253 0.4
254 0.44
255 0.53
256 0.63
257 0.69
258 0.78
259 0.82
260 0.86
261 0.92
262 0.92
263 0.93
264 0.93
265 0.92
266 0.92
267 0.93
268 0.92
269 0.92
270 0.9
271 0.87
272 0.86
273 0.85
274 0.83
275 0.83
276 0.84
277 0.79
278 0.79
279 0.74
280 0.73
281 0.71
282 0.64
283 0.63
284 0.55
285 0.51
286 0.44
287 0.44
288 0.37
289 0.33
290 0.37
291 0.28
292 0.27
293 0.25
294 0.24
295 0.2
296 0.2
297 0.18
298 0.11
299 0.14
300 0.12
301 0.15
302 0.17
303 0.18
304 0.22
305 0.26
306 0.25
307 0.22
308 0.23
309 0.19
310 0.17
311 0.16
312 0.11
313 0.06
314 0.08
315 0.08
316 0.11
317 0.12
318 0.13
319 0.13
320 0.14
321 0.15
322 0.18
323 0.21
324 0.18
325 0.2
326 0.2
327 0.21
328 0.2
329 0.2
330 0.17
331 0.15
332 0.16
333 0.17
334 0.23
335 0.23
336 0.25
337 0.28
338 0.29
339 0.3
340 0.31
341 0.3
342 0.29
343 0.37
344 0.38
345 0.37
346 0.4
347 0.39
348 0.37
349 0.35
350 0.31
351 0.24
352 0.25
353 0.25
354 0.23
355 0.28
356 0.27
357 0.26
358 0.26
359 0.27
360 0.27
361 0.27
362 0.26
363 0.26
364 0.3
365 0.32
366 0.34
367 0.36
368 0.36
369 0.37
370 0.41
371 0.38
372 0.33
373 0.34
374 0.31
375 0.31
376 0.32
377 0.32
378 0.34
379 0.39
380 0.45
381 0.5
382 0.54
383 0.53
384 0.59
385 0.6
386 0.62
387 0.62
388 0.59
389 0.55
390 0.55
391 0.53
392 0.46
393 0.41
394 0.34
395 0.34
396 0.3
397 0.28
398 0.23
399 0.23
400 0.2
401 0.18
402 0.16
403 0.1
404 0.11
405 0.11
406 0.09
407 0.1
408 0.12
409 0.12
410 0.17
411 0.18
412 0.17
413 0.18