Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HDG3

Protein Details
Accession A0A0L0HDG3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-137VDMKMDERRRARREAREREELEKYRKERPKIQQQFADBasic
156-177VGDLVRKGKRQKKLADKYTPVPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-129RRRARREAREREELEKYRKERP
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto 8.5, cyto_mito 7.5, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MYQFKQLVVPDFMNKKPPPNYIAGLGRGATGFTTRSDIGPAREGPSDALIEKAKAAAEGKGKTDDDEDDERFQDPDNETGLFNALPYEADDEEADRIYEEVDMKMDERRRARREAREREELEKYRKERPKIQQQFADLKRGLAVVSEDEWASIPEVGDLVRKGKRQKKLADKYTPVPDSVLLGASQQAELTTSLDAKQQLLGGLATPATADGTMTDFVQFGQARDKVLGLKLDQISDSVTGQTIIDPKGYLTDLNSIVVKTDAEISDIKKARTLLKSVITTNPKHAPGWIAAARLEEVAGKLGAARETIAKGCEECPTSEDVWLESARLNTSENAKVILAQAIRHVPQSVKVWMKACDLETDGKAKKRVLRRALEFIPNSVRIWKAAVSMEEDPEDARILLSRAVECVPLAVELWLALARLESYENAKKVLNKARLANATNHEVWITAAKLEETNGNEKGVEMIVRRAVDSLQKKGSTLDRDQWIQEAEKAEKEKYIATCQAIIRETIGMGVDEEDRKSTWMEDAESCIAHGSTATARAIYAHALKVFPNKKSIWRRAAFLEKAHGTRESLDEILQRAVRYCPQAEVLWLMGAKEKWLAGDIAAAKGILEAAFAANSNSEQIWLAAIKLEVETGEYDRARILLSNARDKANTERVWMKSAQLERQLGAVDEALSLLAEAIRRFPNFAKLWMMKGQIEQREKGDISAARDTYAQAIKQVPKSATLWLLASRLEEGAGAQIKARATLEKARIMNPKVPELWCEAVRVELRANNNPMAKALMAKALQECPSSGLLWSEAILMEPRPQRKSRSADALKKCENDPLVVITVARLFWAERKVEKARNWFNRAVKTNPDLGDSWAWWLRFEMMHGREEQQQEVVTKCVAADPRHGERWQTVAKDISNVGKNTEAILKLVAAQLHNTI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.49
3 0.5
4 0.53
5 0.5
6 0.51
7 0.51
8 0.49
9 0.52
10 0.47
11 0.42
12 0.37
13 0.33
14 0.27
15 0.24
16 0.17
17 0.13
18 0.12
19 0.11
20 0.15
21 0.15
22 0.16
23 0.2
24 0.23
25 0.24
26 0.29
27 0.3
28 0.29
29 0.3
30 0.3
31 0.26
32 0.26
33 0.25
34 0.19
35 0.21
36 0.19
37 0.18
38 0.18
39 0.18
40 0.15
41 0.15
42 0.16
43 0.18
44 0.23
45 0.25
46 0.27
47 0.32
48 0.32
49 0.31
50 0.32
51 0.29
52 0.28
53 0.32
54 0.32
55 0.3
56 0.3
57 0.3
58 0.28
59 0.27
60 0.26
61 0.23
62 0.22
63 0.21
64 0.21
65 0.2
66 0.21
67 0.21
68 0.15
69 0.13
70 0.11
71 0.09
72 0.08
73 0.09
74 0.12
75 0.1
76 0.11
77 0.12
78 0.12
79 0.14
80 0.14
81 0.13
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.1
89 0.11
90 0.12
91 0.18
92 0.23
93 0.28
94 0.36
95 0.45
96 0.49
97 0.58
98 0.67
99 0.71
100 0.77
101 0.81
102 0.8
103 0.81
104 0.79
105 0.75
106 0.76
107 0.72
108 0.69
109 0.67
110 0.63
111 0.63
112 0.68
113 0.68
114 0.69
115 0.72
116 0.75
117 0.77
118 0.81
119 0.77
120 0.76
121 0.79
122 0.72
123 0.71
124 0.59
125 0.49
126 0.42
127 0.36
128 0.29
129 0.19
130 0.18
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.08
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.1
145 0.11
146 0.15
147 0.19
148 0.24
149 0.33
150 0.41
151 0.5
152 0.56
153 0.65
154 0.71
155 0.78
156 0.83
157 0.83
158 0.81
159 0.79
160 0.79
161 0.71
162 0.6
163 0.5
164 0.4
165 0.32
166 0.27
167 0.21
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.08
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.12
182 0.13
183 0.12
184 0.13
185 0.13
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.18
209 0.19
210 0.19
211 0.2
212 0.21
213 0.17
214 0.19
215 0.21
216 0.15
217 0.21
218 0.21
219 0.21
220 0.2
221 0.19
222 0.18
223 0.16
224 0.16
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.09
239 0.13
240 0.13
241 0.15
242 0.15
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.07
248 0.1
249 0.09
250 0.1
251 0.12
252 0.13
253 0.21
254 0.24
255 0.24
256 0.23
257 0.25
258 0.3
259 0.31
260 0.33
261 0.29
262 0.33
263 0.35
264 0.35
265 0.41
266 0.4
267 0.38
268 0.4
269 0.41
270 0.36
271 0.34
272 0.32
273 0.27
274 0.23
275 0.28
276 0.24
277 0.19
278 0.18
279 0.19
280 0.18
281 0.16
282 0.15
283 0.09
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.05
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.14
301 0.14
302 0.13
303 0.14
304 0.17
305 0.17
306 0.18
307 0.17
308 0.14
309 0.15
310 0.14
311 0.13
312 0.1
313 0.11
314 0.1
315 0.1
316 0.11
317 0.1
318 0.14
319 0.16
320 0.15
321 0.16
322 0.15
323 0.15
324 0.14
325 0.16
326 0.12
327 0.1
328 0.12
329 0.13
330 0.14
331 0.14
332 0.15
333 0.12
334 0.15
335 0.18
336 0.22
337 0.22
338 0.24
339 0.26
340 0.27
341 0.29
342 0.27
343 0.24
344 0.2
345 0.19
346 0.18
347 0.17
348 0.21
349 0.22
350 0.24
351 0.26
352 0.27
353 0.31
354 0.37
355 0.45
356 0.48
357 0.53
358 0.54
359 0.58
360 0.59
361 0.6
362 0.52
363 0.45
364 0.4
365 0.34
366 0.3
367 0.24
368 0.21
369 0.14
370 0.15
371 0.13
372 0.12
373 0.12
374 0.12
375 0.14
376 0.15
377 0.15
378 0.14
379 0.13
380 0.11
381 0.1
382 0.1
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.08
394 0.07
395 0.06
396 0.05
397 0.06
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.04
408 0.04
409 0.05
410 0.09
411 0.13
412 0.13
413 0.15
414 0.16
415 0.17
416 0.23
417 0.31
418 0.33
419 0.33
420 0.35
421 0.39
422 0.42
423 0.42
424 0.39
425 0.34
426 0.31
427 0.28
428 0.26
429 0.21
430 0.16
431 0.15
432 0.12
433 0.09
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.08
440 0.09
441 0.12
442 0.12
443 0.12
444 0.12
445 0.12
446 0.12
447 0.1
448 0.09
449 0.06
450 0.07
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.15
457 0.17
458 0.2
459 0.21
460 0.21
461 0.22
462 0.23
463 0.27
464 0.26
465 0.25
466 0.27
467 0.26
468 0.27
469 0.27
470 0.27
471 0.23
472 0.19
473 0.19
474 0.16
475 0.14
476 0.16
477 0.17
478 0.16
479 0.16
480 0.16
481 0.17
482 0.16
483 0.18
484 0.18
485 0.17
486 0.21
487 0.2
488 0.22
489 0.2
490 0.18
491 0.15
492 0.12
493 0.11
494 0.08
495 0.08
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.06
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.08
505 0.09
506 0.08
507 0.09
508 0.09
509 0.11
510 0.11
511 0.13
512 0.14
513 0.13
514 0.13
515 0.11
516 0.1
517 0.07
518 0.07
519 0.05
520 0.05
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.08
527 0.08
528 0.1
529 0.09
530 0.1
531 0.1
532 0.11
533 0.19
534 0.23
535 0.22
536 0.26
537 0.26
538 0.35
539 0.44
540 0.52
541 0.53
542 0.5
543 0.52
544 0.52
545 0.59
546 0.51
547 0.43
548 0.4
549 0.34
550 0.33
551 0.32
552 0.27
553 0.2
554 0.19
555 0.19
556 0.15
557 0.13
558 0.13
559 0.13
560 0.14
561 0.15
562 0.15
563 0.13
564 0.13
565 0.14
566 0.16
567 0.17
568 0.16
569 0.15
570 0.16
571 0.17
572 0.16
573 0.16
574 0.14
575 0.12
576 0.11
577 0.1
578 0.1
579 0.1
580 0.1
581 0.09
582 0.09
583 0.08
584 0.09
585 0.09
586 0.06
587 0.1
588 0.1
589 0.1
590 0.1
591 0.1
592 0.08
593 0.08
594 0.08
595 0.04
596 0.03
597 0.03
598 0.03
599 0.04
600 0.04
601 0.04
602 0.04
603 0.04
604 0.05
605 0.05
606 0.06
607 0.06
608 0.06
609 0.06
610 0.06
611 0.06
612 0.06
613 0.07
614 0.06
615 0.06
616 0.06
617 0.05
618 0.06
619 0.07
620 0.07
621 0.11
622 0.11
623 0.11
624 0.11
625 0.11
626 0.11
627 0.1
628 0.12
629 0.14
630 0.18
631 0.26
632 0.28
633 0.29
634 0.29
635 0.3
636 0.35
637 0.37
638 0.34
639 0.3
640 0.35
641 0.35
642 0.38
643 0.37
644 0.32
645 0.29
646 0.32
647 0.33
648 0.33
649 0.32
650 0.29
651 0.3
652 0.28
653 0.22
654 0.19
655 0.15
656 0.09
657 0.07
658 0.07
659 0.06
660 0.05
661 0.05
662 0.04
663 0.04
664 0.05
665 0.05
666 0.09
667 0.12
668 0.13
669 0.15
670 0.16
671 0.24
672 0.25
673 0.27
674 0.32
675 0.3
676 0.34
677 0.35
678 0.37
679 0.29
680 0.32
681 0.36
682 0.36
683 0.39
684 0.37
685 0.34
686 0.37
687 0.36
688 0.32
689 0.3
690 0.25
691 0.26
692 0.3
693 0.29
694 0.24
695 0.25
696 0.25
697 0.24
698 0.24
699 0.2
700 0.17
701 0.23
702 0.27
703 0.3
704 0.35
705 0.31
706 0.31
707 0.32
708 0.32
709 0.28
710 0.24
711 0.22
712 0.18
713 0.19
714 0.16
715 0.16
716 0.13
717 0.11
718 0.1
719 0.09
720 0.07
721 0.11
722 0.12
723 0.11
724 0.11
725 0.14
726 0.14
727 0.15
728 0.16
729 0.13
730 0.15
731 0.23
732 0.27
733 0.32
734 0.34
735 0.38
736 0.45
737 0.47
738 0.49
739 0.44
740 0.44
741 0.41
742 0.4
743 0.36
744 0.35
745 0.35
746 0.3
747 0.29
748 0.24
749 0.25
750 0.25
751 0.25
752 0.21
753 0.21
754 0.25
755 0.3
756 0.34
757 0.34
758 0.35
759 0.34
760 0.32
761 0.3
762 0.25
763 0.21
764 0.18
765 0.19
766 0.17
767 0.18
768 0.2
769 0.22
770 0.24
771 0.23
772 0.22
773 0.19
774 0.2
775 0.19
776 0.16
777 0.14
778 0.13
779 0.12
780 0.12
781 0.1
782 0.08
783 0.09
784 0.1
785 0.09
786 0.16
787 0.21
788 0.27
789 0.33
790 0.37
791 0.42
792 0.5
793 0.57
794 0.57
795 0.63
796 0.67
797 0.71
798 0.77
799 0.79
800 0.77
801 0.72
802 0.66
803 0.61
804 0.53
805 0.44
806 0.36
807 0.31
808 0.26
809 0.23
810 0.22
811 0.17
812 0.16
813 0.14
814 0.13
815 0.1
816 0.08
817 0.13
818 0.18
819 0.21
820 0.22
821 0.3
822 0.38
823 0.45
824 0.51
825 0.57
826 0.62
827 0.69
828 0.73
829 0.74
830 0.73
831 0.75
832 0.74
833 0.68
834 0.65
835 0.59
836 0.59
837 0.52
838 0.49
839 0.4
840 0.38
841 0.37
842 0.3
843 0.31
844 0.28
845 0.27
846 0.24
847 0.24
848 0.23
849 0.2
850 0.22
851 0.26
852 0.25
853 0.28
854 0.3
855 0.31
856 0.35
857 0.37
858 0.36
859 0.29
860 0.29
861 0.28
862 0.28
863 0.27
864 0.21
865 0.18
866 0.17
867 0.19
868 0.22
869 0.22
870 0.28
871 0.34
872 0.41
873 0.47
874 0.48
875 0.46
876 0.43
877 0.48
878 0.47
879 0.42
880 0.39
881 0.38
882 0.38
883 0.38
884 0.38
885 0.38
886 0.39
887 0.36
888 0.35
889 0.33
890 0.32
891 0.31
892 0.34
893 0.27
894 0.21
895 0.21
896 0.19
897 0.18
898 0.2
899 0.2
900 0.15