Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HW78

Protein Details
Accession A0A0L0HW78    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-73MGSRDTSRTRRDRGRSISRSPERRSYSSRRDEDKDRLHRRRSPSTSSLSDAGHKDKRRRRKRSRSTSVSSYTSHydrophilic
76-127ETSSDDDRSRRKRKHSKHKKEKKKEKKSKKDKKSQKKKKSKSSKDKTKSGAVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-64RRDRGRSISRSPERRSYSSRRDEDKDRLHRRRSPSTSSLSDAGHKDKRRRRKRSR
83-123RSRRKRKHSKHKKEKKKEKKSKKDKKSQKKKKSKSSKDKTK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019532  Nucl_RNA-splicing_assoc_SR-25  
Gene Ontology GO:0016607  C:nuclear speck  
GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF10500  SR-25  
Amino Acid Sequences MGSRDTSRTRRDRGRSISRSPERRSYSSRRDEDKDRLHRRRSPSTSSLSDAGHKDKRRRRKRSRSTSVSSYTSSSETSSDDDRSRRKRKHSKHKKEKKKEKKSKKDKKSQKKKKSKSSKDKTKSGAVTAQYGAHGLITASDMYRKEAEFRTWLVEVKNTSPEVLDNQKMKLHFAEYMEDYNTATLPLKYYDLDQWERQQFVRQRAEAGVEDTGEFNILNDEERLKQHSKALRAGRLPEPSFTKDQLAELKKVSEERIAADRLRKMGYVPKDSLGVRYEEAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.8
3 0.8
4 0.82
5 0.82
6 0.83
7 0.8
8 0.79
9 0.75
10 0.74
11 0.74
12 0.73
13 0.73
14 0.75
15 0.77
16 0.74
17 0.73
18 0.73
19 0.75
20 0.75
21 0.76
22 0.76
23 0.78
24 0.79
25 0.8
26 0.81
27 0.82
28 0.78
29 0.76
30 0.71
31 0.69
32 0.64
33 0.61
34 0.55
35 0.46
36 0.43
37 0.38
38 0.39
39 0.39
40 0.42
41 0.48
42 0.55
43 0.64
44 0.71
45 0.79
46 0.84
47 0.87
48 0.92
49 0.93
50 0.95
51 0.94
52 0.9
53 0.87
54 0.81
55 0.73
56 0.63
57 0.53
58 0.44
59 0.36
60 0.29
61 0.21
62 0.16
63 0.14
64 0.15
65 0.16
66 0.17
67 0.19
68 0.24
69 0.32
70 0.41
71 0.5
72 0.54
73 0.63
74 0.71
75 0.78
76 0.85
77 0.88
78 0.89
79 0.91
80 0.95
81 0.96
82 0.96
83 0.97
84 0.97
85 0.97
86 0.96
87 0.96
88 0.97
89 0.97
90 0.96
91 0.95
92 0.95
93 0.94
94 0.95
95 0.95
96 0.95
97 0.95
98 0.95
99 0.94
100 0.94
101 0.94
102 0.94
103 0.94
104 0.94
105 0.94
106 0.9
107 0.88
108 0.81
109 0.77
110 0.67
111 0.58
112 0.51
113 0.41
114 0.35
115 0.28
116 0.24
117 0.17
118 0.16
119 0.13
120 0.08
121 0.07
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.06
128 0.06
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.11
133 0.13
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.17
138 0.16
139 0.18
140 0.15
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.18
145 0.15
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.17
151 0.19
152 0.18
153 0.19
154 0.21
155 0.21
156 0.22
157 0.19
158 0.17
159 0.15
160 0.15
161 0.16
162 0.16
163 0.17
164 0.16
165 0.16
166 0.14
167 0.12
168 0.11
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.11
177 0.13
178 0.18
179 0.22
180 0.23
181 0.29
182 0.31
183 0.32
184 0.31
185 0.37
186 0.37
187 0.42
188 0.47
189 0.4
190 0.39
191 0.39
192 0.41
193 0.34
194 0.3
195 0.22
196 0.15
197 0.15
198 0.13
199 0.12
200 0.09
201 0.08
202 0.06
203 0.07
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.09
208 0.11
209 0.13
210 0.19
211 0.2
212 0.22
213 0.28
214 0.33
215 0.36
216 0.42
217 0.48
218 0.49
219 0.51
220 0.54
221 0.53
222 0.56
223 0.52
224 0.48
225 0.47
226 0.44
227 0.44
228 0.41
229 0.39
230 0.31
231 0.33
232 0.38
233 0.37
234 0.35
235 0.33
236 0.33
237 0.32
238 0.33
239 0.32
240 0.27
241 0.24
242 0.24
243 0.28
244 0.29
245 0.3
246 0.34
247 0.36
248 0.35
249 0.36
250 0.32
251 0.3
252 0.35
253 0.4
254 0.41
255 0.4
256 0.38
257 0.41
258 0.41
259 0.43
260 0.37
261 0.32