Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HLT5

Protein Details
Accession A0A0L0HLT5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-197DKKTEFSKAKYIKRKQKKFSKVFTPRRPSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
175-194KAKYIKRKQKKFSKVFTPRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MVEMAEKMEVDTPETTQSETPEGVPNLPSALDIPDIVDDGAIIAENSWAIVQMPSDNTKLVQFKANSVVNLGKFGSFHAKDLFGYPFDMPYEVYGDKQVRPASMNIYALDAFDLETEEGTTNKDLVDRREAQKLSQVEIEQMKADSLKGQVPVENLIKTIVENSETFDKKTEFSKAKYIKRKQKKFSKVFTPRRPSARGLCEHFFKDNPRRICELRVDTLSQILTTGNVRSGARYLIVDEAGGLLTCALVERMQGRGEILQLHDHETNNVDLIKHLNLPPSIHNVLKSLPWTRLTPNDDEDMENMLIRTTDETRLDRLRHRILTTRAKRALLYAGGFDGLFIISQYDIKEIIETLSPYLAGSRPVVVYSPYKETMLESFLHLRNSRDFVNAQLTESWIREYQLPTAASGTHPLMRMSGSGGYILSAIRVIDCETHAATARRVRVKNGKVAEVKSTGEEGVEQEHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.2
4 0.22
5 0.22
6 0.22
7 0.23
8 0.25
9 0.26
10 0.26
11 0.25
12 0.23
13 0.21
14 0.2
15 0.18
16 0.12
17 0.12
18 0.11
19 0.1
20 0.11
21 0.1
22 0.11
23 0.1
24 0.09
25 0.07
26 0.06
27 0.06
28 0.05
29 0.04
30 0.04
31 0.04
32 0.04
33 0.05
34 0.04
35 0.05
36 0.05
37 0.06
38 0.06
39 0.09
40 0.13
41 0.15
42 0.17
43 0.17
44 0.17
45 0.22
46 0.25
47 0.24
48 0.28
49 0.26
50 0.28
51 0.36
52 0.38
53 0.32
54 0.32
55 0.35
56 0.28
57 0.3
58 0.27
59 0.2
60 0.17
61 0.19
62 0.25
63 0.21
64 0.23
65 0.23
66 0.24
67 0.23
68 0.26
69 0.26
70 0.18
71 0.19
72 0.17
73 0.16
74 0.16
75 0.16
76 0.13
77 0.12
78 0.15
79 0.13
80 0.13
81 0.18
82 0.2
83 0.2
84 0.25
85 0.26
86 0.23
87 0.25
88 0.26
89 0.25
90 0.26
91 0.26
92 0.22
93 0.22
94 0.21
95 0.19
96 0.17
97 0.13
98 0.09
99 0.07
100 0.08
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.12
111 0.13
112 0.17
113 0.24
114 0.29
115 0.31
116 0.39
117 0.39
118 0.36
119 0.41
120 0.39
121 0.34
122 0.31
123 0.29
124 0.25
125 0.26
126 0.26
127 0.19
128 0.18
129 0.16
130 0.12
131 0.12
132 0.1
133 0.1
134 0.12
135 0.13
136 0.14
137 0.15
138 0.16
139 0.2
140 0.2
141 0.19
142 0.16
143 0.15
144 0.14
145 0.12
146 0.13
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.11
151 0.18
152 0.18
153 0.19
154 0.2
155 0.2
156 0.2
157 0.22
158 0.28
159 0.24
160 0.26
161 0.35
162 0.41
163 0.5
164 0.59
165 0.66
166 0.69
167 0.77
168 0.84
169 0.84
170 0.87
171 0.88
172 0.87
173 0.85
174 0.86
175 0.86
176 0.87
177 0.87
178 0.85
179 0.79
180 0.76
181 0.72
182 0.65
183 0.61
184 0.57
185 0.52
186 0.48
187 0.46
188 0.42
189 0.4
190 0.38
191 0.32
192 0.32
193 0.36
194 0.38
195 0.39
196 0.4
197 0.43
198 0.42
199 0.44
200 0.44
201 0.39
202 0.34
203 0.33
204 0.3
205 0.26
206 0.26
207 0.22
208 0.15
209 0.11
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.07
214 0.06
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.02
235 0.02
236 0.02
237 0.03
238 0.04
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.14
250 0.15
251 0.15
252 0.15
253 0.15
254 0.14
255 0.12
256 0.12
257 0.09
258 0.07
259 0.09
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.14
264 0.14
265 0.16
266 0.17
267 0.21
268 0.23
269 0.21
270 0.21
271 0.19
272 0.19
273 0.19
274 0.2
275 0.16
276 0.17
277 0.18
278 0.19
279 0.21
280 0.27
281 0.29
282 0.29
283 0.3
284 0.29
285 0.28
286 0.27
287 0.25
288 0.21
289 0.18
290 0.15
291 0.13
292 0.1
293 0.09
294 0.08
295 0.1
296 0.09
297 0.12
298 0.15
299 0.16
300 0.21
301 0.26
302 0.28
303 0.31
304 0.36
305 0.4
306 0.41
307 0.42
308 0.45
309 0.48
310 0.56
311 0.58
312 0.6
313 0.58
314 0.55
315 0.53
316 0.47
317 0.43
318 0.35
319 0.29
320 0.2
321 0.16
322 0.15
323 0.15
324 0.13
325 0.09
326 0.06
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.1
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.12
353 0.13
354 0.16
355 0.18
356 0.23
357 0.22
358 0.23
359 0.22
360 0.23
361 0.23
362 0.21
363 0.19
364 0.16
365 0.21
366 0.23
367 0.28
368 0.28
369 0.29
370 0.3
371 0.33
372 0.31
373 0.28
374 0.27
375 0.25
376 0.32
377 0.3
378 0.28
379 0.25
380 0.27
381 0.25
382 0.25
383 0.25
384 0.17
385 0.18
386 0.2
387 0.21
388 0.21
389 0.26
390 0.25
391 0.23
392 0.23
393 0.23
394 0.2
395 0.21
396 0.21
397 0.18
398 0.19
399 0.18
400 0.18
401 0.17
402 0.17
403 0.16
404 0.16
405 0.13
406 0.12
407 0.12
408 0.11
409 0.11
410 0.1
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.06
415 0.07
416 0.08
417 0.09
418 0.1
419 0.13
420 0.13
421 0.15
422 0.19
423 0.21
424 0.25
425 0.29
426 0.37
427 0.43
428 0.44
429 0.51
430 0.57
431 0.61
432 0.66
433 0.64
434 0.65
435 0.63
436 0.63
437 0.61
438 0.54
439 0.49
440 0.42
441 0.38
442 0.29
443 0.23
444 0.22
445 0.17