FuNGI

A0A0L0HPU1

Protein Details

Accession

A0A0L0HPU1

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-62	DERSKGSQADDKKRSRRTRKRPGRKAKENKPRTKIVVRRLP	Basic
139-163	EFAPFQRIPKSKKKPDPRMNTIEQD	Hydrophilic
402-422	REESKGRGYRQKRRTRLEGDL	Basic
436-458	EGDTDTRKSKPRQVRSRDNTGTT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
32-59	DKKRSRRTRKRPGRKAKENKPRTKIVVR
243-285	RAKKAASRAEGSKQTKAVTDAKGKESRRSEKKKSSSKSKEGGK
362-370	KRPRGSARK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MVTAAEAAAAEVSHSSTRSVGDERSKGSQADDKKRSRRTRKRPGRKAKENKPRTKIVVRRLPPHLPEEIFKTTVDKWLGETDWWTFVAGKIATSQAKISVFSRAYLNFKNIDALLDFCRTYNGHLFVDSKGVEHRAVVEFAPFQRIPKSKKKPDPRMNTIEQDPDFLAFLKSLEEDNEAKAAASSVATGETQLEKLERTLLADQVAKEQGVAHSTVTSIVTASSSQLAGPDKPKSTPLLDALRAKKAASRAEGSKQTKAVTDAKGKESRRSEKKKSSSKSKEGGKSGSTSGMTKSVVPTGIVKRSSSPVGKKSATTPSASGASSKEATDVTPKAEQRRSRLAPTGGLFKASLGAVLGAKETKRPRGSARKQKADEDSQNDASASGDTAPEARASNGPGLQEREESKGRGYRQKRRTRLEGDLIDASADGVTAVINEGDTDTRKSKPRQVRSRDNTGTTDLSKPAEAWPEKDDSRKMSRNRVASTSSTSSMASQPPKRTGPSVTIMKRDGTTSSFNVGKNDAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.1
3	0.11
4	0.13
5	0.16
6	0.19
7	0.23
8	0.3
9	0.34
10	0.37
11	0.41
12	0.43
13	0.4
14	0.4
15	0.41
16	0.43
17	0.49
18	0.55
19	0.6
20	0.67
21	0.77
22	0.84
23	0.88
24	0.9
25	0.9
26	0.92
27	0.94
28	0.96
29	0.96
30	0.97
31	0.97
32	0.97
33	0.97
34	0.96
35	0.96
36	0.95
37	0.95
38	0.9
39	0.87
40	0.84
41	0.84
42	0.81
43	0.8
44	0.8
45	0.75
46	0.76
47	0.75
48	0.74
49	0.67
50	0.62
51	0.57
52	0.49
53	0.45
54	0.44
55	0.41
56	0.35
57	0.32
58	0.32
59	0.27
60	0.31
61	0.31
62	0.24
63	0.22
64	0.25
65	0.26
66	0.23
67	0.23
68	0.19
69	0.19
70	0.19
71	0.18
72	0.14
73	0.13
74	0.19
75	0.17
76	0.15
77	0.14
78	0.18
79	0.19
80	0.19
81	0.19
82	0.17
83	0.18
84	0.19
85	0.19
86	0.22
87	0.21
88	0.22
89	0.25
90	0.24
91	0.28
92	0.29
93	0.32
94	0.26
95	0.26
96	0.27
97	0.23
98	0.22
99	0.17
100	0.17
101	0.16
102	0.17
103	0.16
104	0.14
105	0.16
106	0.15
107	0.18
108	0.22
109	0.23
110	0.21
111	0.23
112	0.24
113	0.22
114	0.26
115	0.22
116	0.17
117	0.15
118	0.17
119	0.15
120	0.14
121	0.16
122	0.14
123	0.15
124	0.14
125	0.14
126	0.14
127	0.14
128	0.21
129	0.18
130	0.17
131	0.24
132	0.3
133	0.35
134	0.44
135	0.54
136	0.58
137	0.69
138	0.79
139	0.83
140	0.87
141	0.9
142	0.88
143	0.86
144	0.81
145	0.75
146	0.67
147	0.62
148	0.51
149	0.43
150	0.34
151	0.26
152	0.21
153	0.17
154	0.15
155	0.08
156	0.08
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.08
161	0.11
162	0.11
163	0.12
164	0.12
165	0.11
166	0.11
167	0.1
168	0.09
169	0.06
170	0.06
171	0.05
172	0.04
173	0.05
174	0.05
175	0.05
176	0.06
177	0.07
178	0.07
179	0.07
180	0.08
181	0.07
182	0.08
183	0.09
184	0.08
185	0.1
186	0.11
187	0.12
188	0.13
189	0.15
190	0.15
191	0.16
192	0.17
193	0.14
194	0.12
195	0.12
196	0.11
197	0.1
198	0.1
199	0.07
200	0.07
201	0.07
202	0.08
203	0.07
204	0.07
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.06
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.07
214	0.09
215	0.1
216	0.13
217	0.15
218	0.16
219	0.17
220	0.18
221	0.19
222	0.19
223	0.2
224	0.22
225	0.23
226	0.25
227	0.31
228	0.32
229	0.32
230	0.31
231	0.29
232	0.26
233	0.25
234	0.25
235	0.22
236	0.23
237	0.22
238	0.27
239	0.36
240	0.36
241	0.35
242	0.33
243	0.31
244	0.28
245	0.29
246	0.29
247	0.24
248	0.28
249	0.28
250	0.32
251	0.38
252	0.38
253	0.41
254	0.44
255	0.49
256	0.52
257	0.59
258	0.62
259	0.65
260	0.74
261	0.77
262	0.77
263	0.79
264	0.78
265	0.77
266	0.76
267	0.74
268	0.71
269	0.64
270	0.6
271	0.5
272	0.43
273	0.36
274	0.31
275	0.24
276	0.18
277	0.15
278	0.15
279	0.14
280	0.12
281	0.12
282	0.11
283	0.11
284	0.11
285	0.14
286	0.15
287	0.2
288	0.2
289	0.2
290	0.2
291	0.22
292	0.26
293	0.26
294	0.28
295	0.28
296	0.33
297	0.34
298	0.33
299	0.34
300	0.38
301	0.36
302	0.32
303	0.28
304	0.24
305	0.25
306	0.24
307	0.21
308	0.14
309	0.15
310	0.15
311	0.14
312	0.12
313	0.11
314	0.11
315	0.14
316	0.14
317	0.14
318	0.19
319	0.21
320	0.27
321	0.33
322	0.36
323	0.38
324	0.47
325	0.48
326	0.47
327	0.51
328	0.46
329	0.44
330	0.42
331	0.43
332	0.33
333	0.3
334	0.26
335	0.2
336	0.19
337	0.15
338	0.13
339	0.06
340	0.07
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.13
347	0.16
348	0.24
349	0.26
350	0.29
351	0.38
352	0.48
353	0.59
354	0.64
355	0.71
356	0.74
357	0.74
358	0.77
359	0.75
360	0.72
361	0.69
362	0.64
363	0.6
364	0.51
365	0.48
366	0.42
367	0.35
368	0.27
369	0.19
370	0.14
371	0.08
372	0.06
373	0.06
374	0.07
375	0.07
376	0.08
377	0.08
378	0.09
379	0.1
380	0.12
381	0.15
382	0.15
383	0.16
384	0.18
385	0.21
386	0.21
387	0.23
388	0.23
389	0.26
390	0.27
391	0.27
392	0.28
393	0.31
394	0.35
395	0.42
396	0.49
397	0.54
398	0.62
399	0.72
400	0.77
401	0.79
402	0.83
403	0.8
404	0.79
405	0.78
406	0.7
407	0.63
408	0.55
409	0.47
410	0.38
411	0.3
412	0.22
413	0.12
414	0.1
415	0.05
416	0.03
417	0.03
418	0.03
419	0.04
420	0.03
421	0.04
422	0.04
423	0.05
424	0.07
425	0.09
426	0.13
427	0.15
428	0.21
429	0.29
430	0.34
431	0.43
432	0.52
433	0.61
434	0.68
435	0.76
436	0.82
437	0.82
438	0.88
439	0.84
440	0.78
441	0.7
442	0.64
443	0.58
444	0.49
445	0.44
446	0.36
447	0.31
448	0.27
449	0.24
450	0.23
451	0.29
452	0.28
453	0.27
454	0.28
455	0.33
456	0.35
457	0.4
458	0.41
459	0.39
460	0.47
461	0.52
462	0.55
463	0.6
464	0.65
465	0.67
466	0.68
467	0.66
468	0.61
469	0.56
470	0.57
471	0.51
472	0.46
473	0.39
474	0.35
475	0.31
476	0.31
477	0.34
478	0.35
479	0.38
480	0.42
481	0.48
482	0.52
483	0.54
484	0.53
485	0.51
486	0.48
487	0.49
488	0.53
489	0.51
490	0.54
491	0.52
492	0.51
493	0.48
494	0.44
495	0.38
496	0.32
497	0.32
498	0.28
499	0.32
500	0.33
501	0.34
502	0.35

A0A0L0HPU1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer