Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HCY5

Protein Details
Accession A0A0L0HCY5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-44SHDVGKGQRRGKKRHLKLFIHPPSIPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-33GQRRGKKRH
Subcellular Location(s) nucl 8, cyto_nucl 8, mito 6, cyto 6, extr 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010736  SHIPPO-rpt  
Pfam View protein in Pfam  
PF07004  SHIPPO-rpt  
Amino Acid Sequences MAVATAAPTAVDTLRTTISHDVGKGQRRGKKRHLKLFIHPPSIPTKFQTFHFDDREEKGFNSTAPRFNKRLDELPGPGYYRSKPNEELGDGGSFSQKGYGVGFVSKSKRFHKPPTDLETNLPIHGNPTKYNPREPTYSHSITHNPSPAFRAPLVPPPPSSAIIPSWGARFDRPTPGPGYYAPERTPRRAQAGPGAGDGGGAEEAGARSAFVSRSKRSAINDAASMPGKDAPPPGAYIVQEETIAKHVPAAVAAFKATARPNLTSKQTVNNPGPGAYNLQPSPDQGSHIRRRPGPPLSIAPPPPRPATPLSNHVSIPGSNVPPIANPGPGRYDLAAAADIILRKAPSLKAAFVSSSPRFGTDPDGRSRPGPGFYKPIDAGRMRSFHLNLESRWT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.18
4 0.2
5 0.23
6 0.24
7 0.24
8 0.29
9 0.34
10 0.42
11 0.47
12 0.51
13 0.55
14 0.62
15 0.7
16 0.74
17 0.78
18 0.8
19 0.83
20 0.86
21 0.85
22 0.85
23 0.87
24 0.86
25 0.82
26 0.72
27 0.64
28 0.62
29 0.59
30 0.52
31 0.44
32 0.41
33 0.36
34 0.38
35 0.44
36 0.41
37 0.44
38 0.47
39 0.46
40 0.44
41 0.47
42 0.48
43 0.41
44 0.36
45 0.32
46 0.28
47 0.26
48 0.31
49 0.31
50 0.34
51 0.4
52 0.45
53 0.45
54 0.48
55 0.53
56 0.5
57 0.52
58 0.5
59 0.48
60 0.45
61 0.45
62 0.44
63 0.39
64 0.36
65 0.32
66 0.29
67 0.32
68 0.32
69 0.34
70 0.34
71 0.36
72 0.39
73 0.37
74 0.37
75 0.31
76 0.28
77 0.23
78 0.21
79 0.17
80 0.13
81 0.12
82 0.11
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.1
87 0.1
88 0.11
89 0.13
90 0.16
91 0.21
92 0.25
93 0.3
94 0.34
95 0.42
96 0.48
97 0.56
98 0.61
99 0.65
100 0.69
101 0.72
102 0.73
103 0.65
104 0.61
105 0.57
106 0.48
107 0.4
108 0.32
109 0.23
110 0.2
111 0.22
112 0.22
113 0.16
114 0.23
115 0.31
116 0.34
117 0.41
118 0.43
119 0.43
120 0.45
121 0.46
122 0.46
123 0.45
124 0.45
125 0.39
126 0.37
127 0.37
128 0.36
129 0.38
130 0.36
131 0.28
132 0.26
133 0.29
134 0.28
135 0.26
136 0.24
137 0.24
138 0.2
139 0.28
140 0.31
141 0.28
142 0.27
143 0.27
144 0.29
145 0.27
146 0.25
147 0.19
148 0.16
149 0.16
150 0.17
151 0.14
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.15
157 0.16
158 0.22
159 0.22
160 0.23
161 0.24
162 0.25
163 0.25
164 0.22
165 0.26
166 0.21
167 0.23
168 0.22
169 0.29
170 0.3
171 0.33
172 0.37
173 0.35
174 0.38
175 0.36
176 0.36
177 0.34
178 0.35
179 0.31
180 0.27
181 0.24
182 0.18
183 0.17
184 0.15
185 0.09
186 0.04
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.05
197 0.1
198 0.15
199 0.16
200 0.2
201 0.22
202 0.25
203 0.26
204 0.32
205 0.3
206 0.27
207 0.27
208 0.24
209 0.24
210 0.21
211 0.19
212 0.14
213 0.13
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.12
220 0.13
221 0.12
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.12
227 0.11
228 0.1
229 0.11
230 0.11
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.1
243 0.1
244 0.13
245 0.15
246 0.17
247 0.21
248 0.25
249 0.29
250 0.31
251 0.32
252 0.35
253 0.38
254 0.43
255 0.42
256 0.42
257 0.38
258 0.34
259 0.34
260 0.27
261 0.26
262 0.21
263 0.23
264 0.19
265 0.2
266 0.2
267 0.2
268 0.25
269 0.21
270 0.22
271 0.23
272 0.32
273 0.39
274 0.46
275 0.51
276 0.5
277 0.54
278 0.59
279 0.59
280 0.54
281 0.5
282 0.49
283 0.47
284 0.48
285 0.49
286 0.47
287 0.46
288 0.45
289 0.43
290 0.38
291 0.38
292 0.37
293 0.39
294 0.38
295 0.41
296 0.41
297 0.41
298 0.4
299 0.39
300 0.35
301 0.28
302 0.28
303 0.25
304 0.21
305 0.19
306 0.2
307 0.18
308 0.17
309 0.22
310 0.19
311 0.19
312 0.18
313 0.2
314 0.23
315 0.24
316 0.25
317 0.21
318 0.21
319 0.17
320 0.18
321 0.16
322 0.12
323 0.12
324 0.11
325 0.11
326 0.1
327 0.11
328 0.09
329 0.1
330 0.13
331 0.13
332 0.18
333 0.21
334 0.23
335 0.24
336 0.26
337 0.27
338 0.26
339 0.33
340 0.28
341 0.29
342 0.28
343 0.27
344 0.25
345 0.25
346 0.31
347 0.32
348 0.36
349 0.39
350 0.43
351 0.42
352 0.43
353 0.46
354 0.41
355 0.4
356 0.39
357 0.36
358 0.4
359 0.4
360 0.46
361 0.44
362 0.44
363 0.44
364 0.43
365 0.44
366 0.43
367 0.43
368 0.39
369 0.43
370 0.4
371 0.38
372 0.44
373 0.44