Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HEX2

Protein Details
Accession A0A0L0HEX2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
110-134GIGGEEEKRRKKRRVQEHVNKMKEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-143KRRKKRRVQEHVNKMKEDRKGKRRRGA
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001487  Bromodomain  
IPR036427  Bromodomain-like_sf  
IPR040240  TAF1  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0001091  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00439  Bromodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50014  BROMODOMAIN_2  
Amino Acid Sequences MELDEESQRWREYGFVSSERAASPPSFGGERSLFGDLEQDETTSIAESGTSYGQAGRTKRLTIRRMVRNAFGQEEERSEVVTDMRVINAYLRQRAIIEHEETTSGEIYPGIGGEEEKRRKKRRVQEHVNKMKEDRKGKRRRGAGSDEEQERRHEPLTLKIRTPSLLLAAATAAAASSTPPLKKRQSISATDTDYLQPVHPKSYGRRRAAPEVDLASILGRVITELIAIPEAYEFCRPVSAVAVPDYYDIVKKPKTLEQIRDDVRDYRYKTAAAFLDDLELVAYNARIYNGTMHPLTTIAEGLVTRARGQLDQQREELGRIEQELAESEAVGLLSKRAHSLGHGSHVAVMVQQAGPPPAPPPPLPVVQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.3
4 0.31
5 0.32
6 0.3
7 0.29
8 0.25
9 0.2
10 0.2
11 0.17
12 0.19
13 0.18
14 0.17
15 0.22
16 0.21
17 0.22
18 0.22
19 0.23
20 0.2
21 0.19
22 0.23
23 0.17
24 0.19
25 0.18
26 0.15
27 0.13
28 0.13
29 0.14
30 0.1
31 0.1
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.09
40 0.13
41 0.18
42 0.2
43 0.25
44 0.27
45 0.31
46 0.38
47 0.46
48 0.47
49 0.52
50 0.6
51 0.63
52 0.69
53 0.68
54 0.66
55 0.63
56 0.61
57 0.54
58 0.47
59 0.39
60 0.32
61 0.31
62 0.29
63 0.23
64 0.2
65 0.17
66 0.16
67 0.13
68 0.13
69 0.12
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.09
74 0.11
75 0.15
76 0.17
77 0.19
78 0.19
79 0.19
80 0.19
81 0.2
82 0.24
83 0.23
84 0.23
85 0.2
86 0.21
87 0.21
88 0.21
89 0.21
90 0.16
91 0.11
92 0.09
93 0.08
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.04
99 0.05
100 0.08
101 0.18
102 0.26
103 0.34
104 0.44
105 0.51
106 0.6
107 0.69
108 0.75
109 0.78
110 0.81
111 0.84
112 0.85
113 0.89
114 0.91
115 0.86
116 0.77
117 0.7
118 0.64
119 0.6
120 0.59
121 0.57
122 0.58
123 0.64
124 0.72
125 0.76
126 0.78
127 0.76
128 0.74
129 0.71
130 0.67
131 0.63
132 0.6
133 0.57
134 0.52
135 0.47
136 0.42
137 0.36
138 0.31
139 0.25
140 0.23
141 0.2
142 0.26
143 0.34
144 0.34
145 0.34
146 0.33
147 0.34
148 0.3
149 0.3
150 0.21
151 0.14
152 0.12
153 0.11
154 0.09
155 0.08
156 0.07
157 0.06
158 0.05
159 0.04
160 0.02
161 0.02
162 0.02
163 0.04
164 0.06
165 0.07
166 0.1
167 0.15
168 0.19
169 0.23
170 0.26
171 0.33
172 0.37
173 0.4
174 0.43
175 0.43
176 0.43
177 0.38
178 0.37
179 0.28
180 0.24
181 0.2
182 0.15
183 0.13
184 0.12
185 0.13
186 0.14
187 0.16
188 0.23
189 0.33
190 0.41
191 0.42
192 0.48
193 0.51
194 0.57
195 0.58
196 0.52
197 0.44
198 0.37
199 0.33
200 0.26
201 0.21
202 0.13
203 0.1
204 0.09
205 0.06
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.13
237 0.15
238 0.17
239 0.2
240 0.24
241 0.33
242 0.39
243 0.46
244 0.46
245 0.53
246 0.55
247 0.55
248 0.52
249 0.46
250 0.44
251 0.42
252 0.4
253 0.36
254 0.34
255 0.32
256 0.3
257 0.31
258 0.29
259 0.25
260 0.23
261 0.18
262 0.18
263 0.17
264 0.16
265 0.11
266 0.09
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.12
276 0.13
277 0.17
278 0.17
279 0.16
280 0.16
281 0.16
282 0.17
283 0.12
284 0.11
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.13
293 0.14
294 0.14
295 0.19
296 0.26
297 0.32
298 0.34
299 0.35
300 0.37
301 0.37
302 0.37
303 0.34
304 0.28
305 0.21
306 0.19
307 0.2
308 0.16
309 0.16
310 0.16
311 0.16
312 0.13
313 0.12
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.07
319 0.07
320 0.09
321 0.09
322 0.11
323 0.11
324 0.12
325 0.14
326 0.21
327 0.23
328 0.27
329 0.28
330 0.27
331 0.28
332 0.28
333 0.26
334 0.19
335 0.16
336 0.12
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.13
341 0.13
342 0.14
343 0.15
344 0.18
345 0.22
346 0.22
347 0.26