Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HPJ4

Protein Details
Accession A0A0L0HPJ4    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
139-162TFGRKVGRPRRRGRGGRKPMTNRFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
126-128KRK
142-157RKVGRPRRRGRGGRKP
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR007526  SWIRM  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF04433  SWIRM  
Amino Acid Sequences MSAVSSELMDHSALTPSDECSKTLGTPTPSFPSPPVSEVHTSSPSTTITTSQCSCAASHKTVVNSPASHNCRKIPVPHRSLPSSLTSDQKRELGIIKLDVYTAYRLEPAQLLFDREARRKALWAWKRKRVAYGDSEDETFGRKVGRPRRRGRGGRKPMTNRFAEGFSPDDMALMPKTTGTTQGAPVITWTKGEPLLITPATPYYSHLTPEELHTCSTLRLLPETYLKIKETLLTAKAERGPFKKRDAQKWCRVDVNKTGKLYDWFVALGWLEAYDAPPSTGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.15
4 0.23
5 0.23
6 0.23
7 0.23
8 0.24
9 0.23
10 0.27
11 0.3
12 0.28
13 0.31
14 0.34
15 0.36
16 0.36
17 0.37
18 0.34
19 0.35
20 0.31
21 0.3
22 0.27
23 0.27
24 0.29
25 0.29
26 0.33
27 0.3
28 0.28
29 0.28
30 0.28
31 0.23
32 0.22
33 0.2
34 0.19
35 0.18
36 0.22
37 0.22
38 0.23
39 0.23
40 0.23
41 0.22
42 0.25
43 0.28
44 0.25
45 0.28
46 0.29
47 0.3
48 0.31
49 0.34
50 0.31
51 0.27
52 0.28
53 0.34
54 0.37
55 0.4
56 0.4
57 0.4
58 0.41
59 0.43
60 0.48
61 0.48
62 0.52
63 0.55
64 0.58
65 0.61
66 0.59
67 0.57
68 0.5
69 0.45
70 0.4
71 0.34
72 0.35
73 0.33
74 0.32
75 0.33
76 0.32
77 0.28
78 0.24
79 0.24
80 0.2
81 0.19
82 0.18
83 0.17
84 0.15
85 0.15
86 0.14
87 0.13
88 0.11
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.1
95 0.09
96 0.11
97 0.11
98 0.13
99 0.13
100 0.18
101 0.21
102 0.23
103 0.25
104 0.24
105 0.24
106 0.23
107 0.27
108 0.32
109 0.36
110 0.44
111 0.49
112 0.56
113 0.61
114 0.61
115 0.63
116 0.56
117 0.53
118 0.48
119 0.45
120 0.4
121 0.34
122 0.34
123 0.28
124 0.24
125 0.21
126 0.16
127 0.12
128 0.09
129 0.1
130 0.17
131 0.27
132 0.36
133 0.44
134 0.51
135 0.61
136 0.69
137 0.76
138 0.79
139 0.81
140 0.82
141 0.81
142 0.82
143 0.8
144 0.78
145 0.74
146 0.65
147 0.56
148 0.47
149 0.4
150 0.32
151 0.26
152 0.2
153 0.15
154 0.15
155 0.13
156 0.11
157 0.09
158 0.1
159 0.09
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.09
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.16
170 0.17
171 0.15
172 0.17
173 0.16
174 0.14
175 0.13
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.1
181 0.09
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.11
186 0.12
187 0.13
188 0.13
189 0.14
190 0.14
191 0.15
192 0.17
193 0.17
194 0.18
195 0.17
196 0.22
197 0.23
198 0.2
199 0.19
200 0.19
201 0.19
202 0.17
203 0.18
204 0.15
205 0.12
206 0.14
207 0.14
208 0.16
209 0.2
210 0.23
211 0.25
212 0.26
213 0.26
214 0.25
215 0.24
216 0.24
217 0.23
218 0.23
219 0.22
220 0.23
221 0.23
222 0.26
223 0.31
224 0.33
225 0.36
226 0.37
227 0.42
228 0.43
229 0.5
230 0.55
231 0.58
232 0.65
233 0.7
234 0.75
235 0.77
236 0.8
237 0.77
238 0.77
239 0.72
240 0.68
241 0.68
242 0.68
243 0.64
244 0.58
245 0.54
246 0.49
247 0.48
248 0.46
249 0.37
250 0.28
251 0.22
252 0.2
253 0.2
254 0.17
255 0.14
256 0.1
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.09