Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HLQ5

Protein Details
Accession A0A0L0HLQ5    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-71TNATLSKRKKDNEDLSKKKKAKKEAKNEHVNGDHydrophilic
426-451RSRPNKAKAATKGKPYTKPKRSVAKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-115KRKKDNEDLSKKKKAKKEAKNEHVNGDPQQKAGRGKLQKKEQDVVEKGKGNKTSKREESASGTRKQKKSQK
133-141SKKTGGKKS
401-451AKKKRLIATEGTRAKKGAATGAGKIRSRPNKAKAATKGKPYTKPKRSVAKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14.833, mito_nucl 10.999, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034221  RBM34_RRM2  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12394  RRM1_RBM34  
cd12395  RRM2_RBM34  
Amino Acid Sequences MSGLSKALVGSAQLDKDLDALFGKAAVPSNSSILSQPATNATLSKRKKDNEDLSKKKKAKKEAKNEHVNGDPQQKAGRGKLQKKEQDVVEKGKGNKTSKREESASGTRKQKKSQKVAAEPTETEIKPTEKTESKKTGGKKSAKQEVKGSVEAQDGAKVSADKDTEDPTESLDGDVESESESGEDQDDVEDDKETNPTGKTRRQVKAEKLEKEERTIFVGNLPLSVTEKAGVKELKKLFSQYGNLKSIRFRSIARLENMPRKAAFITKNFHPGRDTLNAYIVYGEKESVEKALVENGKLFMGKHIRVDRSVKDNKHDVKRSVFVGALPFDINEEAVRAHFSQCGDIEYVRLIRDKTTNVGKGIGYVQFADRAAVGLAMKLHQSELEGRKIRVNRCKDVSPEAKKKRLIATEGTRAKKGAATGAGKIRSRPNKAKAATKGKPYTKPKRSVAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.16
4 0.16
5 0.13
6 0.1
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.1
11 0.1
12 0.13
13 0.13
14 0.15
15 0.15
16 0.17
17 0.18
18 0.18
19 0.17
20 0.17
21 0.17
22 0.15
23 0.15
24 0.16
25 0.17
26 0.16
27 0.18
28 0.21
29 0.29
30 0.34
31 0.41
32 0.46
33 0.5
34 0.58
35 0.66
36 0.72
37 0.73
38 0.8
39 0.82
40 0.82
41 0.88
42 0.87
43 0.85
44 0.82
45 0.82
46 0.81
47 0.81
48 0.84
49 0.84
50 0.87
51 0.9
52 0.85
53 0.79
54 0.73
55 0.66
56 0.6
57 0.57
58 0.47
59 0.38
60 0.38
61 0.38
62 0.36
63 0.37
64 0.41
65 0.43
66 0.5
67 0.58
68 0.65
69 0.68
70 0.7
71 0.71
72 0.67
73 0.67
74 0.64
75 0.61
76 0.58
77 0.57
78 0.54
79 0.54
80 0.56
81 0.52
82 0.54
83 0.54
84 0.57
85 0.57
86 0.6
87 0.57
88 0.54
89 0.56
90 0.59
91 0.59
92 0.57
93 0.6
94 0.63
95 0.65
96 0.7
97 0.71
98 0.71
99 0.75
100 0.76
101 0.76
102 0.76
103 0.8
104 0.77
105 0.72
106 0.62
107 0.55
108 0.53
109 0.43
110 0.35
111 0.29
112 0.25
113 0.22
114 0.23
115 0.27
116 0.26
117 0.31
118 0.38
119 0.43
120 0.45
121 0.49
122 0.54
123 0.58
124 0.61
125 0.65
126 0.64
127 0.65
128 0.72
129 0.71
130 0.67
131 0.63
132 0.61
133 0.58
134 0.52
135 0.44
136 0.36
137 0.32
138 0.3
139 0.24
140 0.18
141 0.14
142 0.12
143 0.12
144 0.1
145 0.09
146 0.11
147 0.12
148 0.11
149 0.12
150 0.14
151 0.14
152 0.16
153 0.16
154 0.14
155 0.15
156 0.14
157 0.12
158 0.1
159 0.09
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.13
184 0.17
185 0.22
186 0.29
187 0.37
188 0.43
189 0.49
190 0.55
191 0.59
192 0.65
193 0.68
194 0.65
195 0.63
196 0.65
197 0.58
198 0.56
199 0.49
200 0.39
201 0.35
202 0.31
203 0.24
204 0.17
205 0.19
206 0.15
207 0.13
208 0.12
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.09
213 0.07
214 0.09
215 0.09
216 0.12
217 0.14
218 0.13
219 0.2
220 0.22
221 0.24
222 0.23
223 0.24
224 0.23
225 0.24
226 0.29
227 0.27
228 0.31
229 0.33
230 0.33
231 0.32
232 0.32
233 0.32
234 0.3
235 0.26
236 0.21
237 0.24
238 0.3
239 0.34
240 0.34
241 0.37
242 0.38
243 0.44
244 0.45
245 0.39
246 0.33
247 0.29
248 0.28
249 0.27
250 0.27
251 0.24
252 0.27
253 0.27
254 0.37
255 0.36
256 0.36
257 0.32
258 0.29
259 0.29
260 0.3
261 0.3
262 0.21
263 0.24
264 0.23
265 0.22
266 0.21
267 0.17
268 0.13
269 0.11
270 0.1
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.12
279 0.13
280 0.13
281 0.14
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.13
287 0.18
288 0.19
289 0.24
290 0.29
291 0.31
292 0.34
293 0.39
294 0.37
295 0.41
296 0.48
297 0.44
298 0.44
299 0.5
300 0.55
301 0.6
302 0.63
303 0.58
304 0.55
305 0.56
306 0.52
307 0.45
308 0.37
309 0.29
310 0.25
311 0.22
312 0.18
313 0.14
314 0.13
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.12
326 0.13
327 0.15
328 0.15
329 0.17
330 0.16
331 0.15
332 0.15
333 0.14
334 0.15
335 0.14
336 0.16
337 0.14
338 0.16
339 0.19
340 0.21
341 0.24
342 0.31
343 0.33
344 0.32
345 0.34
346 0.31
347 0.29
348 0.3
349 0.26
350 0.19
351 0.16
352 0.16
353 0.16
354 0.16
355 0.14
356 0.11
357 0.1
358 0.09
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.08
368 0.1
369 0.17
370 0.21
371 0.3
372 0.33
373 0.34
374 0.41
375 0.48
376 0.55
377 0.56
378 0.6
379 0.59
380 0.61
381 0.65
382 0.63
383 0.66
384 0.67
385 0.68
386 0.71
387 0.72
388 0.74
389 0.73
390 0.73
391 0.72
392 0.68
393 0.63
394 0.61
395 0.6
396 0.63
397 0.67
398 0.66
399 0.59
400 0.53
401 0.49
402 0.42
403 0.35
404 0.3
405 0.29
406 0.29
407 0.33
408 0.4
409 0.45
410 0.44
411 0.47
412 0.51
413 0.53
414 0.59
415 0.63
416 0.64
417 0.68
418 0.71
419 0.77
420 0.77
421 0.79
422 0.76
423 0.77
424 0.79
425 0.77
426 0.82
427 0.83
428 0.84
429 0.83
430 0.86
431 0.85