Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HS20

Protein Details
Accession A0A0L0HS20    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-54DASTAKSATKPKPKRANHNELERKRRQHQKCKLEELREAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-41KPKPKRANHNELERKRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
IPR002418  Tscrpt_reg_Myc  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15489  PHD_SF  
Amino Acid Sequences MISPESSAVSDTESLDASTAKSATKPKPKRANHNELERKRRQHQKCKLEELREAVPSLQTKDKPSTVVIMQKAKEYIDQLKRRIVELEMDMDRMRRGQFAGQLTKSYPVVAHGADPLIERLRRENNELKMAVQNLQNQLLKQHSMLQHYSPALDPLQPVVLSGTLSMSPVELNKPRDLNTPSKLLTGTFHTGMHTRTLSGPSSFDSQNLQQRFLNNAPASSLPHQQSFSITSSPYDTPTGLTSPVELQQPSILSAQGTPYPMDMGTSAASTGAVSFNHSLQSSVQSSQGGQSYATELNQSVKQEHGEWNLQLQSMQPLMPTSDAPLTPLTPNDLVLPTQPKKRKSNHDFHSVRNVTYSTVPPTNTNPSMVSSPTLSDFSFLQALQLTDKAPNEPADLSSLELGGNIPVPEIKCTICDKGYGETVMLDCDRCHNWFHGACVSLTDVKLIPESWLCPSCQVLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.13
4 0.11
5 0.12
6 0.12
7 0.12
8 0.16
9 0.24
10 0.33
11 0.44
12 0.52
13 0.61
14 0.71
15 0.79
16 0.86
17 0.88
18 0.9
19 0.87
20 0.89
21 0.9
22 0.89
23 0.9
24 0.88
25 0.85
26 0.84
27 0.85
28 0.85
29 0.85
30 0.86
31 0.87
32 0.87
33 0.9
34 0.89
35 0.85
36 0.8
37 0.74
38 0.68
39 0.59
40 0.5
41 0.4
42 0.36
43 0.32
44 0.3
45 0.32
46 0.31
47 0.33
48 0.38
49 0.39
50 0.37
51 0.36
52 0.36
53 0.33
54 0.37
55 0.38
56 0.4
57 0.38
58 0.39
59 0.39
60 0.35
61 0.34
62 0.3
63 0.34
64 0.37
65 0.44
66 0.44
67 0.49
68 0.49
69 0.48
70 0.46
71 0.38
72 0.32
73 0.27
74 0.29
75 0.24
76 0.25
77 0.24
78 0.22
79 0.22
80 0.2
81 0.18
82 0.14
83 0.14
84 0.16
85 0.22
86 0.28
87 0.35
88 0.33
89 0.35
90 0.34
91 0.35
92 0.32
93 0.27
94 0.2
95 0.14
96 0.15
97 0.14
98 0.14
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.14
105 0.15
106 0.15
107 0.19
108 0.27
109 0.28
110 0.35
111 0.4
112 0.41
113 0.46
114 0.46
115 0.42
116 0.38
117 0.37
118 0.34
119 0.3
120 0.3
121 0.26
122 0.3
123 0.3
124 0.26
125 0.27
126 0.26
127 0.24
128 0.2
129 0.24
130 0.22
131 0.25
132 0.27
133 0.26
134 0.27
135 0.26
136 0.27
137 0.2
138 0.19
139 0.15
140 0.14
141 0.13
142 0.1
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.06
157 0.11
158 0.15
159 0.18
160 0.2
161 0.22
162 0.23
163 0.29
164 0.33
165 0.34
166 0.32
167 0.34
168 0.32
169 0.32
170 0.3
171 0.25
172 0.21
173 0.2
174 0.2
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.17
179 0.17
180 0.18
181 0.14
182 0.12
183 0.12
184 0.14
185 0.15
186 0.14
187 0.14
188 0.13
189 0.16
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.17
194 0.24
195 0.24
196 0.25
197 0.22
198 0.23
199 0.27
200 0.26
201 0.29
202 0.22
203 0.21
204 0.2
205 0.19
206 0.21
207 0.19
208 0.23
209 0.17
210 0.19
211 0.19
212 0.18
213 0.19
214 0.19
215 0.18
216 0.14
217 0.13
218 0.12
219 0.15
220 0.15
221 0.15
222 0.13
223 0.11
224 0.11
225 0.12
226 0.12
227 0.1
228 0.09
229 0.08
230 0.09
231 0.11
232 0.11
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.11
239 0.09
240 0.07
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.1
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.09
268 0.13
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.13
273 0.14
274 0.15
275 0.16
276 0.12
277 0.1
278 0.1
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.11
283 0.1
284 0.12
285 0.14
286 0.15
287 0.13
288 0.13
289 0.14
290 0.16
291 0.19
292 0.21
293 0.21
294 0.2
295 0.22
296 0.22
297 0.21
298 0.19
299 0.16
300 0.14
301 0.12
302 0.12
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.09
309 0.11
310 0.11
311 0.12
312 0.13
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.15
317 0.13
318 0.14
319 0.14
320 0.14
321 0.13
322 0.15
323 0.23
324 0.24
325 0.32
326 0.38
327 0.44
328 0.52
329 0.6
330 0.68
331 0.7
332 0.76
333 0.74
334 0.79
335 0.74
336 0.7
337 0.72
338 0.63
339 0.53
340 0.45
341 0.39
342 0.3
343 0.3
344 0.28
345 0.22
346 0.24
347 0.24
348 0.24
349 0.28
350 0.34
351 0.32
352 0.32
353 0.27
354 0.27
355 0.28
356 0.26
357 0.24
358 0.17
359 0.17
360 0.17
361 0.18
362 0.15
363 0.14
364 0.13
365 0.14
366 0.15
367 0.13
368 0.12
369 0.12
370 0.13
371 0.13
372 0.14
373 0.13
374 0.14
375 0.16
376 0.16
377 0.17
378 0.18
379 0.19
380 0.19
381 0.19
382 0.18
383 0.18
384 0.17
385 0.15
386 0.14
387 0.11
388 0.11
389 0.1
390 0.08
391 0.09
392 0.08
393 0.08
394 0.1
395 0.11
396 0.13
397 0.14
398 0.14
399 0.16
400 0.21
401 0.25
402 0.23
403 0.25
404 0.25
405 0.28
406 0.31
407 0.28
408 0.24
409 0.21
410 0.21
411 0.21
412 0.2
413 0.16
414 0.13
415 0.17
416 0.19
417 0.19
418 0.22
419 0.21
420 0.28
421 0.29
422 0.33
423 0.34
424 0.33
425 0.31
426 0.3
427 0.31
428 0.26
429 0.25
430 0.23
431 0.18
432 0.18
433 0.19
434 0.18
435 0.17
436 0.16
437 0.18
438 0.22
439 0.24
440 0.24
441 0.24