Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HCU0

Protein Details
Accession A0A0L0HCU0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-36KITSIPRSTPTPKKPRTNASTPSIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
374-385EKAPTKKLKRKK
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 11.999, cyto_mito 10.832, mito_nucl 7.165, nucl 7, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR037379  WDR74/Nsa1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
Amino Acid Sequences MRYITSDEVGLIKITSIPRSTPTPKKPRTNASTPSIPPPRTLGTIDREAEIQFICFASSQQTVLVARKNGVAEYWDIEAGSIVRHHKVFEQEVDEQGKVVLNKHRKGEHFVGVADVDGTLVACTDRGNLHVMPPPTGSPAFPPGTYNLKRTLLFRAQVHSSNPHLLATGGDEQDLTLWDLSTLANPPTPKWTAKNVANDYLDMRVPIWITNLAFVSATRIITISAHSHLRLYDTTVARRPIINITVGESPLKSLGFYENGNSIQTIVSDTTGHLLDYTLDPHTKTAKLVGKFPVSPGAITSISASKDSVVVVGLDRFVRVYDQERKLARKVYLKQRLTGLLVDEVEEEVEEAEEEEKGEEDVWAEMDRVGEKEEKAPTKKLKRKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.18
4 0.19
5 0.22
6 0.3
7 0.38
8 0.45
9 0.53
10 0.61
11 0.68
12 0.77
13 0.82
14 0.85
15 0.85
16 0.84
17 0.81
18 0.77
19 0.77
20 0.69
21 0.7
22 0.68
23 0.6
24 0.53
25 0.5
26 0.46
27 0.4
28 0.41
29 0.36
30 0.34
31 0.4
32 0.4
33 0.36
34 0.33
35 0.3
36 0.29
37 0.23
38 0.17
39 0.11
40 0.1
41 0.1
42 0.09
43 0.09
44 0.11
45 0.12
46 0.12
47 0.11
48 0.14
49 0.15
50 0.18
51 0.23
52 0.21
53 0.21
54 0.23
55 0.23
56 0.21
57 0.19
58 0.18
59 0.14
60 0.15
61 0.15
62 0.13
63 0.12
64 0.12
65 0.11
66 0.1
67 0.09
68 0.1
69 0.11
70 0.13
71 0.14
72 0.15
73 0.18
74 0.23
75 0.26
76 0.26
77 0.3
78 0.29
79 0.33
80 0.35
81 0.31
82 0.26
83 0.23
84 0.22
85 0.17
86 0.19
87 0.23
88 0.28
89 0.33
90 0.38
91 0.44
92 0.44
93 0.51
94 0.52
95 0.5
96 0.43
97 0.39
98 0.35
99 0.29
100 0.27
101 0.19
102 0.13
103 0.07
104 0.05
105 0.05
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.05
112 0.05
113 0.07
114 0.1
115 0.1
116 0.13
117 0.17
118 0.18
119 0.18
120 0.19
121 0.18
122 0.18
123 0.18
124 0.16
125 0.13
126 0.18
127 0.18
128 0.17
129 0.18
130 0.18
131 0.26
132 0.28
133 0.28
134 0.27
135 0.29
136 0.3
137 0.3
138 0.34
139 0.3
140 0.32
141 0.31
142 0.3
143 0.3
144 0.31
145 0.31
146 0.27
147 0.25
148 0.24
149 0.23
150 0.19
151 0.17
152 0.14
153 0.13
154 0.12
155 0.13
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.09
160 0.09
161 0.1
162 0.08
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.13
175 0.15
176 0.16
177 0.18
178 0.23
179 0.28
180 0.33
181 0.41
182 0.39
183 0.42
184 0.4
185 0.38
186 0.33
187 0.28
188 0.23
189 0.14
190 0.12
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.1
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.1
210 0.08
211 0.09
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.13
217 0.12
218 0.13
219 0.18
220 0.19
221 0.22
222 0.25
223 0.27
224 0.26
225 0.26
226 0.25
227 0.21
228 0.2
229 0.19
230 0.15
231 0.17
232 0.17
233 0.17
234 0.16
235 0.13
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.08
240 0.07
241 0.09
242 0.1
243 0.11
244 0.12
245 0.13
246 0.14
247 0.14
248 0.13
249 0.12
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.09
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.13
269 0.16
270 0.16
271 0.16
272 0.22
273 0.27
274 0.27
275 0.32
276 0.36
277 0.37
278 0.37
279 0.38
280 0.37
281 0.3
282 0.29
283 0.24
284 0.23
285 0.18
286 0.18
287 0.19
288 0.15
289 0.15
290 0.16
291 0.15
292 0.11
293 0.12
294 0.11
295 0.1
296 0.08
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.11
307 0.17
308 0.26
309 0.3
310 0.37
311 0.42
312 0.47
313 0.5
314 0.54
315 0.53
316 0.53
317 0.58
318 0.62
319 0.68
320 0.66
321 0.64
322 0.63
323 0.6
324 0.53
325 0.46
326 0.37
327 0.3
328 0.27
329 0.25
330 0.2
331 0.17
332 0.14
333 0.12
334 0.09
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.07
347 0.07
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.1
353 0.11
354 0.12
355 0.12
356 0.15
357 0.17
358 0.18
359 0.23
360 0.3
361 0.38
362 0.41
363 0.49
364 0.57
365 0.65