Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HVQ1

Protein Details
Accession A0A0L0HVQ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MPPKKKGKGKKKSKKELEKERLLEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-19PKKKGKGKKKSKKELEK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031826  IC97/Casc1_N  
IPR023247  IC97/Dnai7-like  
Pfam View protein in Pfam  
PF15927  Casc1_N  
Amino Acid Sequences MPPKKKGKGKKKSKKELEKERLLEEERLRAEEEARLAEQQRKELELRESQQREALEALFRQEQERFKTEAEALASLMESQLAELTAVDEERHREMEWQTLLECRPLPNPQKEREVNTYLDLWSAEDLNIEEGSPLVPLFSELPAAEILCSQIEQELSGAGANDDAYKNRLTQHLLRLRTLIHDKWDSATSQILQHVDQFSREPNENFQLAATTQDYAFGVWGNLTKNPRYKTIEFAERKLTTSLPKPLVLSNVAIRMLLESSFSAPVPYEKQNGSRNLSVIGPVLLFDLLEMPDPAKTVDTWTIRPILSKQGKPKRISYPFKKDLTEVPEEEQEEAADASIWPMLVTYSLDPGCFANADAATVRWWNEEEKMWDDEGISDVEIEADAGLVKFRTIHFAPTATVQGTYAEFPLRDWDIHPSGPNSAIIHIRGTLSDIKIEIGEGNCRLMSPHSEYTESHLGDRWMSPPMLFKTLSRMGLKFIGPTSMKGVEIADLILKNPAVEDMCIIGIGAFASHLAFRRSPSNRHMSSSKCVFQFRPYEAEDEWPLPDEAEWQSVVFDVNWRVGEATQAAGFIASHGQAITDSTTFIVNSEDNKGTIHSTTYHLLQESIASPKGTDSSPESSPLFSKTVRQILGITRLMCFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.96
2 0.96
3 0.96
4 0.95
5 0.94
6 0.87
7 0.79
8 0.75
9 0.68
10 0.64
11 0.56
12 0.53
13 0.45
14 0.43
15 0.4
16 0.34
17 0.32
18 0.28
19 0.28
20 0.23
21 0.23
22 0.25
23 0.26
24 0.32
25 0.33
26 0.35
27 0.35
28 0.36
29 0.36
30 0.37
31 0.41
32 0.42
33 0.44
34 0.49
35 0.49
36 0.47
37 0.49
38 0.44
39 0.39
40 0.33
41 0.3
42 0.23
43 0.21
44 0.24
45 0.24
46 0.24
47 0.25
48 0.28
49 0.32
50 0.34
51 0.38
52 0.37
53 0.34
54 0.37
55 0.36
56 0.35
57 0.32
58 0.26
59 0.21
60 0.18
61 0.17
62 0.13
63 0.12
64 0.08
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.06
72 0.06
73 0.07
74 0.07
75 0.09
76 0.12
77 0.14
78 0.16
79 0.15
80 0.19
81 0.2
82 0.27
83 0.27
84 0.25
85 0.24
86 0.26
87 0.27
88 0.26
89 0.26
90 0.2
91 0.23
92 0.3
93 0.38
94 0.44
95 0.51
96 0.52
97 0.61
98 0.63
99 0.66
100 0.65
101 0.6
102 0.52
103 0.47
104 0.43
105 0.34
106 0.3
107 0.24
108 0.17
109 0.13
110 0.12
111 0.1
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.06
126 0.07
127 0.08
128 0.07
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.09
133 0.07
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.1
153 0.11
154 0.12
155 0.14
156 0.17
157 0.2
158 0.25
159 0.34
160 0.4
161 0.42
162 0.42
163 0.41
164 0.38
165 0.39
166 0.39
167 0.3
168 0.28
169 0.28
170 0.28
171 0.29
172 0.3
173 0.24
174 0.2
175 0.21
176 0.16
177 0.16
178 0.18
179 0.16
180 0.15
181 0.17
182 0.19
183 0.17
184 0.17
185 0.16
186 0.16
187 0.19
188 0.22
189 0.2
190 0.21
191 0.24
192 0.24
193 0.23
194 0.2
195 0.17
196 0.15
197 0.16
198 0.12
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.08
204 0.08
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.08
209 0.08
210 0.12
211 0.14
212 0.18
213 0.24
214 0.27
215 0.32
216 0.38
217 0.38
218 0.41
219 0.44
220 0.5
221 0.47
222 0.47
223 0.49
224 0.42
225 0.43
226 0.37
227 0.33
228 0.26
229 0.28
230 0.32
231 0.27
232 0.27
233 0.27
234 0.26
235 0.27
236 0.25
237 0.22
238 0.16
239 0.16
240 0.15
241 0.14
242 0.13
243 0.11
244 0.1
245 0.08
246 0.07
247 0.05
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.12
255 0.14
256 0.15
257 0.16
258 0.22
259 0.28
260 0.33
261 0.35
262 0.33
263 0.31
264 0.29
265 0.28
266 0.23
267 0.17
268 0.12
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.07
286 0.13
287 0.15
288 0.15
289 0.17
290 0.19
291 0.19
292 0.2
293 0.19
294 0.23
295 0.27
296 0.3
297 0.39
298 0.45
299 0.53
300 0.55
301 0.59
302 0.59
303 0.63
304 0.68
305 0.68
306 0.69
307 0.69
308 0.69
309 0.64
310 0.55
311 0.5
312 0.46
313 0.4
314 0.31
315 0.25
316 0.24
317 0.24
318 0.23
319 0.18
320 0.13
321 0.1
322 0.09
323 0.07
324 0.05
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.04
334 0.04
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.1
355 0.12
356 0.14
357 0.16
358 0.18
359 0.17
360 0.17
361 0.16
362 0.14
363 0.13
364 0.1
365 0.07
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.04
370 0.04
371 0.03
372 0.02
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.04
379 0.05
380 0.1
381 0.11
382 0.13
383 0.14
384 0.15
385 0.16
386 0.16
387 0.18
388 0.13
389 0.13
390 0.1
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.09
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.11
399 0.11
400 0.11
401 0.11
402 0.16
403 0.18
404 0.19
405 0.2
406 0.18
407 0.18
408 0.19
409 0.19
410 0.14
411 0.13
412 0.14
413 0.13
414 0.13
415 0.12
416 0.12
417 0.1
418 0.12
419 0.14
420 0.12
421 0.13
422 0.12
423 0.12
424 0.11
425 0.12
426 0.11
427 0.08
428 0.11
429 0.1
430 0.11
431 0.1
432 0.1
433 0.11
434 0.11
435 0.14
436 0.17
437 0.21
438 0.22
439 0.24
440 0.25
441 0.3
442 0.36
443 0.32
444 0.26
445 0.24
446 0.23
447 0.22
448 0.23
449 0.18
450 0.14
451 0.14
452 0.14
453 0.18
454 0.2
455 0.22
456 0.22
457 0.21
458 0.25
459 0.3
460 0.34
461 0.31
462 0.29
463 0.28
464 0.31
465 0.31
466 0.25
467 0.21
468 0.22
469 0.2
470 0.21
471 0.22
472 0.2
473 0.2
474 0.18
475 0.18
476 0.13
477 0.13
478 0.12
479 0.1
480 0.09
481 0.09
482 0.1
483 0.09
484 0.08
485 0.08
486 0.1
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.06
495 0.05
496 0.05
497 0.04
498 0.03
499 0.03
500 0.04
501 0.05
502 0.07
503 0.1
504 0.11
505 0.13
506 0.22
507 0.27
508 0.32
509 0.39
510 0.47
511 0.47
512 0.51
513 0.55
514 0.5
515 0.54
516 0.56
517 0.54
518 0.48
519 0.49
520 0.45
521 0.47
522 0.49
523 0.44
524 0.42
525 0.38
526 0.38
527 0.35
528 0.38
529 0.34
530 0.28
531 0.26
532 0.22
533 0.21
534 0.17
535 0.17
536 0.15
537 0.14
538 0.14
539 0.14
540 0.12
541 0.12
542 0.12
543 0.13
544 0.1
545 0.12
546 0.12
547 0.14
548 0.15
549 0.15
550 0.16
551 0.15
552 0.17
553 0.14
554 0.14
555 0.11
556 0.11
557 0.1
558 0.09
559 0.09
560 0.08
561 0.08
562 0.07
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.08
568 0.1
569 0.09
570 0.09
571 0.09
572 0.1
573 0.1
574 0.1
575 0.12
576 0.11
577 0.13
578 0.18
579 0.19
580 0.18
581 0.19
582 0.2
583 0.2
584 0.2
585 0.19
586 0.16
587 0.18
588 0.21
589 0.23
590 0.24
591 0.23
592 0.22
593 0.2
594 0.21
595 0.2
596 0.21
597 0.21
598 0.18
599 0.18
600 0.19
601 0.21
602 0.19
603 0.19
604 0.2
605 0.23
606 0.24
607 0.28
608 0.28
609 0.28
610 0.29
611 0.29
612 0.28
613 0.24
614 0.29
615 0.33
616 0.4
617 0.39
618 0.38
619 0.38
620 0.41
621 0.48
622 0.46
623 0.38