Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HRN5

Protein Details
Accession A0A0L0HRN5    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
315-354GASIKARKTKHKRSKESGVYSDAKYKKKYRELKRKIHEIEBasic
415-445EPIPPPSTIKKPVKRKEKKPIDPNAPRRPANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
319-349KARKTKHKRSKESGVYSDAKYKKKYRELKRK
424-441KKPVKRKEKKPIDPNAPR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 10.166, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038986  Clr2  
IPR031915  Clr2_N  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0070824  C:SHREC complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0031507  P:heterochromatin formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF16761  Clr2_transil  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MPLVLNELHPPVFSDGTPDFYPTVYKSPRAPAGGYVECDPSRVQKYLDKLSIALKDAYIQSPEKIPGVDMAEVIRHGGVAFKNNVFLRRFPDHYRMFESRKPEHMPGSTPSTPAASSAPSPAVGSSTGANGGTTIDVESEGSLAAAAKTEAVSTEEDPSKSRLPKSEKFRADAFIFGHPSGSKYRSTNEFTPHLLWLVNDDSHDHRNCPCKLCSNFLKSGGPSNRKCFPKGKGTSLGPVTPSTSLKSRSQSVKHDIEPSPLTIASVSRTASPLVLPEAKKQTPRIDDVWEMDYKSSARTSPNPASRDGTDSDDEGASIKARKTKHKRSKESGVYSDAKYKKKYRELKRKIHEIEEENSKMIEEYDVTKKRLSRLRFERGLLYERLQFVHQGSIPKEPLSKESSPPSSPSSDTEQEPIPPPSTIKKPVKRKEKKPIDPNAPRRPANAFMLFCDLSREQLKKEREGLEEAEIEEKGLTNLTKALGARWKGLGEEEKGRWRALFLEQVQRYDREMLEYQGGGSGRDDTTLGVDRMGVGVPSSPALVPNEGAREGEDEVLDEEPLGSELESAAEKEDLMEGVEVVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.2
3 0.25
4 0.26
5 0.25
6 0.22
7 0.21
8 0.24
9 0.21
10 0.29
11 0.27
12 0.31
13 0.33
14 0.4
15 0.46
16 0.46
17 0.45
18 0.4
19 0.45
20 0.45
21 0.43
22 0.37
23 0.37
24 0.33
25 0.33
26 0.29
27 0.28
28 0.3
29 0.29
30 0.3
31 0.3
32 0.37
33 0.45
34 0.48
35 0.42
36 0.39
37 0.42
38 0.43
39 0.41
40 0.35
41 0.26
42 0.25
43 0.26
44 0.26
45 0.24
46 0.22
47 0.2
48 0.23
49 0.25
50 0.23
51 0.21
52 0.19
53 0.19
54 0.21
55 0.2
56 0.17
57 0.16
58 0.16
59 0.15
60 0.15
61 0.11
62 0.08
63 0.07
64 0.11
65 0.11
66 0.16
67 0.19
68 0.19
69 0.25
70 0.27
71 0.33
72 0.32
73 0.33
74 0.34
75 0.37
76 0.41
77 0.41
78 0.49
79 0.49
80 0.51
81 0.56
82 0.56
83 0.56
84 0.55
85 0.57
86 0.53
87 0.54
88 0.55
89 0.51
90 0.5
91 0.46
92 0.46
93 0.42
94 0.46
95 0.4
96 0.35
97 0.32
98 0.28
99 0.26
100 0.23
101 0.2
102 0.13
103 0.13
104 0.15
105 0.15
106 0.14
107 0.14
108 0.13
109 0.12
110 0.11
111 0.11
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.07
139 0.09
140 0.09
141 0.15
142 0.17
143 0.18
144 0.2
145 0.23
146 0.27
147 0.3
148 0.32
149 0.35
150 0.4
151 0.48
152 0.55
153 0.62
154 0.6
155 0.59
156 0.58
157 0.55
158 0.48
159 0.43
160 0.36
161 0.3
162 0.28
163 0.24
164 0.23
165 0.18
166 0.19
167 0.2
168 0.2
169 0.19
170 0.18
171 0.22
172 0.27
173 0.33
174 0.35
175 0.37
176 0.37
177 0.37
178 0.37
179 0.33
180 0.28
181 0.22
182 0.18
183 0.15
184 0.14
185 0.12
186 0.11
187 0.12
188 0.15
189 0.2
190 0.21
191 0.2
192 0.22
193 0.3
194 0.33
195 0.36
196 0.35
197 0.38
198 0.39
199 0.45
200 0.48
201 0.47
202 0.47
203 0.45
204 0.45
205 0.37
206 0.44
207 0.44
208 0.46
209 0.43
210 0.44
211 0.49
212 0.49
213 0.52
214 0.48
215 0.46
216 0.48
217 0.49
218 0.51
219 0.5
220 0.49
221 0.5
222 0.46
223 0.42
224 0.33
225 0.28
226 0.24
227 0.18
228 0.18
229 0.15
230 0.16
231 0.18
232 0.2
233 0.23
234 0.27
235 0.31
236 0.35
237 0.39
238 0.44
239 0.45
240 0.43
241 0.47
242 0.42
243 0.4
244 0.36
245 0.3
246 0.24
247 0.2
248 0.17
249 0.11
250 0.11
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.09
261 0.13
262 0.13
263 0.17
264 0.23
265 0.24
266 0.27
267 0.29
268 0.32
269 0.31
270 0.34
271 0.32
272 0.29
273 0.28
274 0.28
275 0.28
276 0.22
277 0.2
278 0.16
279 0.15
280 0.12
281 0.11
282 0.1
283 0.09
284 0.11
285 0.14
286 0.21
287 0.27
288 0.34
289 0.34
290 0.35
291 0.37
292 0.35
293 0.34
294 0.29
295 0.25
296 0.19
297 0.18
298 0.17
299 0.14
300 0.13
301 0.11
302 0.09
303 0.07
304 0.08
305 0.09
306 0.13
307 0.16
308 0.26
309 0.36
310 0.47
311 0.57
312 0.66
313 0.74
314 0.77
315 0.85
316 0.84
317 0.81
318 0.73
319 0.68
320 0.6
321 0.52
322 0.53
323 0.49
324 0.43
325 0.42
326 0.45
327 0.48
328 0.54
329 0.63
330 0.66
331 0.71
332 0.77
333 0.83
334 0.84
335 0.86
336 0.79
337 0.74
338 0.69
339 0.61
340 0.55
341 0.52
342 0.45
343 0.35
344 0.32
345 0.27
346 0.21
347 0.17
348 0.13
349 0.07
350 0.09
351 0.18
352 0.22
353 0.24
354 0.26
355 0.28
356 0.34
357 0.4
358 0.4
359 0.42
360 0.46
361 0.54
362 0.56
363 0.56
364 0.54
365 0.5
366 0.51
367 0.43
368 0.36
369 0.3
370 0.26
371 0.26
372 0.22
373 0.19
374 0.16
375 0.18
376 0.18
377 0.19
378 0.2
379 0.24
380 0.24
381 0.24
382 0.26
383 0.23
384 0.24
385 0.27
386 0.28
387 0.26
388 0.32
389 0.35
390 0.34
391 0.36
392 0.36
393 0.32
394 0.31
395 0.3
396 0.31
397 0.29
398 0.29
399 0.28
400 0.26
401 0.26
402 0.28
403 0.27
404 0.22
405 0.19
406 0.2
407 0.23
408 0.28
409 0.35
410 0.42
411 0.49
412 0.58
413 0.67
414 0.77
415 0.82
416 0.86
417 0.88
418 0.89
419 0.9
420 0.9
421 0.9
422 0.9
423 0.9
424 0.9
425 0.9
426 0.86
427 0.77
428 0.69
429 0.64
430 0.57
431 0.52
432 0.49
433 0.38
434 0.32
435 0.37
436 0.35
437 0.3
438 0.31
439 0.24
440 0.22
441 0.26
442 0.26
443 0.24
444 0.32
445 0.37
446 0.37
447 0.43
448 0.45
449 0.43
450 0.45
451 0.44
452 0.39
453 0.36
454 0.31
455 0.26
456 0.21
457 0.18
458 0.14
459 0.12
460 0.09
461 0.09
462 0.08
463 0.07
464 0.09
465 0.09
466 0.12
467 0.12
468 0.16
469 0.21
470 0.23
471 0.25
472 0.25
473 0.25
474 0.23
475 0.27
476 0.28
477 0.25
478 0.3
479 0.32
480 0.39
481 0.4
482 0.4
483 0.36
484 0.32
485 0.31
486 0.28
487 0.32
488 0.29
489 0.37
490 0.38
491 0.42
492 0.44
493 0.43
494 0.41
495 0.36
496 0.32
497 0.27
498 0.27
499 0.25
500 0.26
501 0.24
502 0.22
503 0.22
504 0.21
505 0.16
506 0.15
507 0.16
508 0.13
509 0.13
510 0.13
511 0.1
512 0.14
513 0.18
514 0.17
515 0.14
516 0.14
517 0.14
518 0.15
519 0.14
520 0.11
521 0.06
522 0.07
523 0.08
524 0.09
525 0.09
526 0.09
527 0.11
528 0.13
529 0.14
530 0.14
531 0.16
532 0.19
533 0.19
534 0.19
535 0.18
536 0.18
537 0.18
538 0.18
539 0.15
540 0.13
541 0.13
542 0.14
543 0.13
544 0.1
545 0.09
546 0.08
547 0.08
548 0.08
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.08
553 0.08
554 0.08
555 0.1
556 0.09
557 0.09
558 0.1
559 0.11
560 0.09
561 0.1
562 0.1