FuNGI

A0A0L0HDQ4

Protein Details

Accession

A0A0L0HDQ4

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
542-602	RETGAEGSSKPKKRKRKPKLPKNIDPNVAPDPERWLPKRDRSTYAKKGKGKRDIGKGPQGA	Basic
642-661	KPAPPAQQATSNKKKKKGKK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
548-598	GSSKPKKRKRKPKLPKNIDPNVAPDPERWLPKRDRSTYAKKGKGKRDIGKG
653-661	NKKKKKGKK

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 9.333, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013699 Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd IPR026270 SRP72 IPR031545 SRP_TPR-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0005783 C:endoplasmic reticulum GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
Pfam	View protein in Pfam PF08492 SRP72 PF17004 SRP_TPR_like PF13176 TPR_7

Amino Acid Sequences

MAETTQGLFVELNSMCLGSNYDKIVETCDKILRSEPSDPDAIHTKIVALIRLEQYTNALKLIDSPTIPTFLREELVFERAYCLYRANRLQDCLDLVRKQREDAAKNFGSDVERSLRHLEAQVLYRFEKYDNCDQIYKELSTSAEEYEQGELRANILAVKAAAVANGEKLVDEMEIDVSSDSYEVAYNVACMHLAKRELDQAASLLEKAKGLCRESLAAEQYSEEEIQQELAVIAVQLAYVHQLQGRSAEAIELYETVLKLKGTDTAISAIASNNLMTVKKNRDLPDAAKLYRLATSSGLEHKLTSVQRRIIAVNGALLSLSMSKFGDARQKAKALCDQYPGDDTPYLILAGISLQEKKLPSKALEELQQYVQKLPHSLSIHLALAQLLIEQSNLRGALNLMKTFADSASEDKRYQPAVVSLLVWLYGQVNEVDTAVSLLEEATRFWKGSNNERPILKQLASYKLKCQRPQDAAQDYERLVKADPTDVESVAGLIIAYSEFDPSLAEQYQQYLPSDAQVPKSFIDVDAIESAFGSTGNNKRMRETGAEGSSKPKKRKRKPKLPKNIDPNVAPDPERWLPKRDRSTYAKKGKGKRDIGKGPQGAALAGGGLGGTGSANIEGRKSVGAKKETPPDSPQLAPVTQKPAPPAQQATSNKKKKKGKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.13
3	0.13
4	0.16
5	0.13
6	0.17
7	0.17
8	0.18
9	0.2
10	0.2
11	0.26
12	0.28
13	0.27
14	0.28
15	0.32
16	0.31
17	0.31
18	0.36
19	0.36
20	0.36
21	0.41
22	0.4
23	0.39
24	0.41
25	0.39
26	0.38
27	0.39
28	0.35
29	0.29
30	0.25
31	0.22
32	0.23
33	0.24
34	0.22
35	0.17
36	0.21
37	0.24
38	0.26
39	0.26
40	0.22
41	0.25
42	0.26
43	0.25
44	0.21
45	0.18
46	0.15
47	0.19
48	0.22
49	0.21
50	0.17
51	0.2
52	0.21
53	0.24
54	0.24
55	0.22
56	0.2
57	0.18
58	0.2
59	0.16
60	0.19
61	0.18
62	0.21
63	0.2
64	0.18
65	0.19
66	0.19
67	0.21
68	0.18
69	0.2
70	0.2
71	0.28
72	0.34
73	0.38
74	0.41
75	0.43
76	0.44
77	0.41
78	0.42
79	0.39
80	0.39
81	0.36
82	0.38
83	0.44
84	0.43
85	0.42
86	0.45
87	0.49
88	0.49
89	0.48
90	0.51
91	0.44
92	0.44
93	0.43
94	0.38
95	0.32
96	0.27
97	0.26
98	0.23
99	0.21
100	0.23
101	0.26
102	0.24
103	0.24
104	0.25
105	0.25
106	0.23
107	0.28
108	0.28
109	0.28
110	0.29
111	0.28
112	0.27
113	0.25
114	0.26
115	0.26
116	0.32
117	0.35
118	0.37
119	0.39
120	0.39
121	0.42
122	0.41
123	0.36
124	0.27
125	0.23
126	0.2
127	0.19
128	0.2
129	0.17
130	0.14
131	0.13
132	0.14
133	0.15
134	0.15
135	0.13
136	0.14
137	0.12
138	0.12
139	0.12
140	0.11
141	0.09
142	0.08
143	0.08
144	0.07
145	0.07
146	0.07
147	0.06
148	0.06
149	0.07
150	0.07
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.05
158	0.05
159	0.05
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.06
167	0.05
168	0.04
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.05
173	0.05
174	0.05
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.06
179	0.09
180	0.11
181	0.12
182	0.13
183	0.18
184	0.18
185	0.18
186	0.17
187	0.14
188	0.14
189	0.13
190	0.12
191	0.09
192	0.09
193	0.1
194	0.1
195	0.14
196	0.16
197	0.18
198	0.19
199	0.18
200	0.2
201	0.21
202	0.24
203	0.22
204	0.19
205	0.17
206	0.16
207	0.16
208	0.16
209	0.14
210	0.1
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.07
215	0.06
216	0.05
217	0.04
218	0.04
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.04
226	0.05
227	0.05
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.09
232	0.1
233	0.09
234	0.08
235	0.08
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.06
240	0.05
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.1
249	0.1
250	0.11
251	0.12
252	0.12
253	0.13
254	0.12
255	0.12
256	0.09
257	0.08
258	0.08
259	0.07
260	0.06
261	0.06
262	0.07
263	0.08
264	0.13
265	0.17
266	0.2
267	0.26
268	0.28
269	0.31
270	0.34
271	0.35
272	0.38
273	0.38
274	0.35
275	0.31
276	0.3
277	0.26
278	0.25
279	0.23
280	0.15
281	0.12
282	0.12
283	0.12
284	0.15
285	0.16
286	0.14
287	0.13
288	0.13
289	0.17
290	0.18
291	0.21
292	0.22
293	0.23
294	0.24
295	0.26
296	0.26
297	0.22
298	0.21
299	0.16
300	0.13
301	0.11
302	0.09
303	0.07
304	0.06
305	0.06
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.07
313	0.15
314	0.16
315	0.19
316	0.21
317	0.24
318	0.25
319	0.27
320	0.3
321	0.26
322	0.26
323	0.27
324	0.25
325	0.23
326	0.25
327	0.23
328	0.19
329	0.16
330	0.14
331	0.1
332	0.1
333	0.09
334	0.06
335	0.05
336	0.04
337	0.04
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.07
343	0.08
344	0.1
345	0.12
346	0.14
347	0.14
348	0.17
349	0.2
350	0.21
351	0.25
352	0.25
353	0.25
354	0.25
355	0.26
356	0.23
357	0.22
358	0.21
359	0.17
360	0.16
361	0.15
362	0.19
363	0.18
364	0.18
365	0.19
366	0.19
367	0.18
368	0.18
369	0.17
370	0.11
371	0.09
372	0.08
373	0.06
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.06
384	0.11
385	0.13
386	0.13
387	0.13
388	0.12
389	0.13
390	0.13
391	0.12
392	0.09
393	0.07
394	0.11
395	0.15
396	0.18
397	0.18
398	0.19
399	0.21
400	0.21
401	0.21
402	0.18
403	0.16
404	0.15
405	0.15
406	0.14
407	0.11
408	0.1
409	0.1
410	0.09
411	0.07
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.05
421	0.05
422	0.04
423	0.04
424	0.03
425	0.03
426	0.04
427	0.04
428	0.05
429	0.07
430	0.08
431	0.08
432	0.09
433	0.15
434	0.17
435	0.28
436	0.37
437	0.41
438	0.44
439	0.45
440	0.47
441	0.46
442	0.47
443	0.37
444	0.31
445	0.3
446	0.35
447	0.4
448	0.4
449	0.43
450	0.48
451	0.55
452	0.56
453	0.58
454	0.57
455	0.57
456	0.63
457	0.63
458	0.6
459	0.56
460	0.53
461	0.5
462	0.41
463	0.4
464	0.34
465	0.26
466	0.2
467	0.19
468	0.18
469	0.19
470	0.19
471	0.17
472	0.19
473	0.18
474	0.18
475	0.15
476	0.14
477	0.1
478	0.09
479	0.05
480	0.03
481	0.03
482	0.03
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.05
488	0.05
489	0.06
490	0.1
491	0.09
492	0.1
493	0.1
494	0.14
495	0.16
496	0.17
497	0.17
498	0.15
499	0.15
500	0.16
501	0.21
502	0.2
503	0.23
504	0.24
505	0.25
506	0.24
507	0.26
508	0.24
509	0.19
510	0.2
511	0.15
512	0.15
513	0.15
514	0.14
515	0.13
516	0.12
517	0.12
518	0.09
519	0.08
520	0.07
521	0.1
522	0.16
523	0.24
524	0.3
525	0.3
526	0.33
527	0.36
528	0.39
529	0.38
530	0.38
531	0.38
532	0.38
533	0.4
534	0.38
535	0.43
536	0.49
537	0.52
538	0.56
539	0.58
540	0.63
541	0.72
542	0.83
543	0.86
544	0.89
545	0.92
546	0.94
547	0.97
548	0.96
549	0.95
550	0.94
551	0.91
552	0.85
553	0.75
554	0.69
555	0.62
556	0.55
557	0.45
558	0.36
559	0.35
560	0.34
561	0.4
562	0.38
563	0.4
564	0.46
565	0.55
566	0.64
567	0.63
568	0.66
569	0.67
570	0.75
571	0.78
572	0.8
573	0.79
574	0.78
575	0.82
576	0.84
577	0.85
578	0.85
579	0.83
580	0.82
581	0.83
582	0.83
583	0.83
584	0.75
585	0.67
586	0.59
587	0.51
588	0.4
589	0.31
590	0.22
591	0.12
592	0.09
593	0.07
594	0.04
595	0.03
596	0.03
597	0.03
598	0.03
599	0.03
600	0.03
601	0.04
602	0.06
603	0.07
604	0.08
605	0.09
606	0.1
607	0.14
608	0.16
609	0.22
610	0.29
611	0.35
612	0.39
613	0.46
614	0.55
615	0.55
616	0.57
617	0.56
618	0.54
619	0.53
620	0.49
621	0.47
622	0.42
623	0.4
624	0.39
625	0.39
626	0.4
627	0.38
628	0.39
629	0.39
630	0.42
631	0.45
632	0.48
633	0.49
634	0.44
635	0.51
636	0.57
637	0.63
638	0.66
639	0.71
640	0.72
641	0.76

A0A0L0HDQ4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer