Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HVF2

Protein Details
Accession A0A0L0HVF2    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-59ASNNRQLTRQQWRRLRKYQRRKEIRRSDARARDARKHydrophilic
470-520SSEIKRRTERDEKSVRKRGDNERHKTATRKRPRSRSRSRSASRRRSHRRKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-58RRLRKYQRRKEIRRSDARARDAR
474-520KRRTERDEKSVRKRGDNERHKTATRKRPRSRSRSRSASRRRSHRRKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR009145  U2AF_small  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0089701  C:U2AF complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MESTAVQSPLGSPTEDIQLPMAIASNNRQLTRQQWRRLRKYQRRKEIRRSDARARDARKEQEATDPVLIAKRLQEEKLLEEERQEQRRRYEAREQQFELAAAHRRRLEEEKAKKAQQETSMKTLDPSLGMLTQAVPGDLPASAAIVCNARANQSILSDRQTTILSPLEAGRLAAAKFLESLKSKSALSKNGISPTAEESEEHNTRTITARLDEEPTKAPPTPQLHSLAAELKEKALLVCAYHQKTGSCRFAEFCKLRHPEPTIKNTLVMKNMFQFPGKQTAGDEYTDEDEYFSAFYEDVHGEFAKIGRLTCFMVCRNEAVHLRGNVYVQYAKEEDAICAHKIMDRRWFGGRQLSCEFVPIIEWNHAICGHYERGRCTNPNCNFFHAFQNPGGMYRICNFGNTGGGSMGVAKVKHNEHGAQGKSDSRSCEVKDPSRENQGDKPPGQSVNQSDTTKEVKETHKNVTNPHIVSSEIKRRTERDEKSVRKRGDNERHKTATRKRPRSRSRSRSASRRRSHRRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.21
4 0.18
5 0.17
6 0.16
7 0.15
8 0.15
9 0.1
10 0.12
11 0.15
12 0.22
13 0.26
14 0.27
15 0.28
16 0.3
17 0.38
18 0.48
19 0.53
20 0.55
21 0.61
22 0.71
23 0.8
24 0.87
25 0.9
26 0.9
27 0.91
28 0.92
29 0.94
30 0.94
31 0.94
32 0.95
33 0.95
34 0.94
35 0.94
36 0.91
37 0.9
38 0.88
39 0.87
40 0.84
41 0.79
42 0.77
43 0.75
44 0.73
45 0.7
46 0.64
47 0.56
48 0.57
49 0.54
50 0.49
51 0.42
52 0.36
53 0.3
54 0.29
55 0.28
56 0.2
57 0.2
58 0.22
59 0.24
60 0.25
61 0.29
62 0.27
63 0.3
64 0.37
65 0.36
66 0.3
67 0.29
68 0.37
69 0.4
70 0.47
71 0.5
72 0.47
73 0.5
74 0.58
75 0.61
76 0.59
77 0.62
78 0.62
79 0.66
80 0.7
81 0.67
82 0.6
83 0.57
84 0.5
85 0.41
86 0.35
87 0.34
88 0.27
89 0.29
90 0.29
91 0.29
92 0.33
93 0.37
94 0.42
95 0.44
96 0.52
97 0.57
98 0.62
99 0.64
100 0.64
101 0.62
102 0.58
103 0.57
104 0.57
105 0.52
106 0.51
107 0.5
108 0.45
109 0.42
110 0.38
111 0.29
112 0.2
113 0.16
114 0.11
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.1
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.06
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.12
138 0.13
139 0.13
140 0.15
141 0.18
142 0.17
143 0.21
144 0.21
145 0.2
146 0.2
147 0.19
148 0.17
149 0.16
150 0.17
151 0.13
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.11
156 0.11
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.13
166 0.13
167 0.15
168 0.15
169 0.17
170 0.17
171 0.23
172 0.26
173 0.28
174 0.3
175 0.33
176 0.34
177 0.36
178 0.37
179 0.31
180 0.28
181 0.26
182 0.24
183 0.19
184 0.16
185 0.15
186 0.21
187 0.22
188 0.21
189 0.19
190 0.16
191 0.17
192 0.19
193 0.19
194 0.13
195 0.14
196 0.15
197 0.16
198 0.19
199 0.19
200 0.19
201 0.2
202 0.2
203 0.21
204 0.19
205 0.18
206 0.22
207 0.25
208 0.24
209 0.25
210 0.28
211 0.26
212 0.27
213 0.27
214 0.24
215 0.21
216 0.21
217 0.18
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.11
222 0.09
223 0.07
224 0.06
225 0.1
226 0.17
227 0.18
228 0.19
229 0.2
230 0.19
231 0.22
232 0.28
233 0.29
234 0.23
235 0.22
236 0.23
237 0.24
238 0.32
239 0.3
240 0.26
241 0.3
242 0.32
243 0.32
244 0.35
245 0.38
246 0.38
247 0.42
248 0.46
249 0.42
250 0.4
251 0.42
252 0.4
253 0.38
254 0.33
255 0.28
256 0.22
257 0.2
258 0.22
259 0.2
260 0.17
261 0.17
262 0.15
263 0.22
264 0.21
265 0.19
266 0.17
267 0.19
268 0.2
269 0.19
270 0.18
271 0.11
272 0.13
273 0.13
274 0.12
275 0.1
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.1
296 0.11
297 0.12
298 0.15
299 0.14
300 0.16
301 0.17
302 0.17
303 0.16
304 0.19
305 0.2
306 0.2
307 0.22
308 0.21
309 0.22
310 0.22
311 0.21
312 0.18
313 0.18
314 0.17
315 0.12
316 0.14
317 0.13
318 0.13
319 0.15
320 0.15
321 0.13
322 0.14
323 0.16
324 0.14
325 0.14
326 0.14
327 0.13
328 0.16
329 0.19
330 0.24
331 0.24
332 0.26
333 0.3
334 0.32
335 0.32
336 0.37
337 0.36
338 0.33
339 0.32
340 0.32
341 0.28
342 0.27
343 0.25
344 0.16
345 0.17
346 0.12
347 0.12
348 0.11
349 0.12
350 0.1
351 0.12
352 0.12
353 0.11
354 0.11
355 0.13
356 0.15
357 0.2
358 0.22
359 0.24
360 0.3
361 0.34
362 0.38
363 0.38
364 0.45
365 0.47
366 0.52
367 0.51
368 0.51
369 0.5
370 0.47
371 0.51
372 0.43
373 0.4
374 0.32
375 0.34
376 0.28
377 0.26
378 0.27
379 0.19
380 0.17
381 0.16
382 0.2
383 0.16
384 0.17
385 0.16
386 0.15
387 0.17
388 0.16
389 0.15
390 0.11
391 0.11
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.09
396 0.09
397 0.1
398 0.15
399 0.16
400 0.2
401 0.23
402 0.23
403 0.27
404 0.35
405 0.36
406 0.33
407 0.34
408 0.35
409 0.35
410 0.36
411 0.33
412 0.29
413 0.32
414 0.32
415 0.38
416 0.41
417 0.45
418 0.52
419 0.55
420 0.57
421 0.62
422 0.62
423 0.58
424 0.6
425 0.61
426 0.6
427 0.55
428 0.54
429 0.48
430 0.48
431 0.45
432 0.43
433 0.38
434 0.37
435 0.43
436 0.39
437 0.36
438 0.37
439 0.39
440 0.34
441 0.33
442 0.32
443 0.33
444 0.42
445 0.46
446 0.51
447 0.56
448 0.57
449 0.58
450 0.61
451 0.61
452 0.52
453 0.5
454 0.42
455 0.35
456 0.37
457 0.41
458 0.43
459 0.41
460 0.45
461 0.46
462 0.49
463 0.56
464 0.62
465 0.6
466 0.6
467 0.64
468 0.7
469 0.77
470 0.84
471 0.8
472 0.78
473 0.8
474 0.81
475 0.81
476 0.82
477 0.79
478 0.79
479 0.81
480 0.77
481 0.79
482 0.78
483 0.78
484 0.79
485 0.82
486 0.82
487 0.87
488 0.93
489 0.94
490 0.94
491 0.94
492 0.93
493 0.93
494 0.92
495 0.92
496 0.93
497 0.93
498 0.91
499 0.92
500 0.93