Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FSB0

Protein Details
Accession Q6FSB0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
122-150RFIPKPKVAGPPKPKNKKKRSGAPAGRGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-24GGSRGGFGGRGGA
125-222PKPKVAGPPKPKNKKKRSGAPAGRGGARGGFGGRGGSRGGFGGRGGSRGGFGGRGGSRGGFGGRGGSRGGFGGRGGSRGGFGGRGGSRGGFGGRGGRS
Subcellular Location(s) mito 13, cyto_nucl 8, nucl 7, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0031429  C:box H/ACA snoRNP complex  
GO:0034513  F:box H/ACA snoRNA binding  
GO:0000454  P:snoRNA guided rRNA pseudouridine synthesis  
GO:0031120  P:snRNA pseudouridine synthesis  
KEGG cgr:CAGL0H02057g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MSFRGGFRGGRGGSRGGFGGRGGARGGRPIQQGPPDTVLEMGEFMHPCEGDVVCRSINTKVPYFNAPIYLENKTQVGKVDEILGPLNEVYFTIKCGEGVQATSFKEGDKFYIAPDKLLPIERFIPKPKVAGPPKPKNKKKRSGAPAGRGGARGGFGGRGGSRGGFGGRGGSRGGFGGRGGSRGGFGGRGGSRGGFGGRGGSRGGFGGRGGSRGGFGGRGGRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.19
4 0.19
5 0.16
6 0.2
7 0.17
8 0.17
9 0.17
10 0.18
11 0.18
12 0.22
13 0.24
14 0.23
15 0.26
16 0.28
17 0.32
18 0.36
19 0.37
20 0.36
21 0.37
22 0.33
23 0.29
24 0.27
25 0.22
26 0.16
27 0.14
28 0.11
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.12
36 0.11
37 0.1
38 0.12
39 0.14
40 0.12
41 0.13
42 0.14
43 0.15
44 0.21
45 0.22
46 0.23
47 0.23
48 0.26
49 0.28
50 0.3
51 0.28
52 0.26
53 0.24
54 0.24
55 0.25
56 0.26
57 0.23
58 0.21
59 0.22
60 0.19
61 0.18
62 0.17
63 0.17
64 0.14
65 0.14
66 0.16
67 0.15
68 0.15
69 0.15
70 0.12
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.11
91 0.1
92 0.12
93 0.11
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.17
99 0.17
100 0.16
101 0.16
102 0.16
103 0.15
104 0.18
105 0.18
106 0.13
107 0.17
108 0.19
109 0.22
110 0.25
111 0.28
112 0.25
113 0.27
114 0.28
115 0.34
116 0.36
117 0.43
118 0.5
119 0.56
120 0.66
121 0.75
122 0.8
123 0.82
124 0.87
125 0.88
126 0.87
127 0.87
128 0.85
129 0.85
130 0.85
131 0.81
132 0.78
133 0.7
134 0.62
135 0.52
136 0.44
137 0.33
138 0.25
139 0.17
140 0.1
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.12
159 0.13
160 0.14
161 0.09
162 0.09
163 0.13
164 0.13
165 0.14
166 0.14
167 0.13
168 0.12
169 0.13
170 0.14
171 0.09
172 0.09
173 0.13
174 0.13
175 0.14
176 0.14
177 0.13
178 0.12
179 0.13
180 0.14
181 0.09
182 0.09
183 0.13
184 0.13
185 0.14
186 0.14
187 0.13
188 0.12
189 0.13
190 0.14
191 0.09
192 0.09
193 0.13
194 0.13
195 0.14
196 0.14
197 0.13
198 0.12
199 0.13
200 0.14
201 0.09
202 0.1