Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FP15

Protein Details
Accession Q6FP15    Localization Confidence High Confidence Score 19.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
269-290KETPKENKPIVKKRRSEREEPSBasic
342-362NVSTETPKIGKRKKSSFFNLKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
269-290KETPKENKPIVKKRRSEREEPS
294-294K
296-296K
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0031463  C:Cul3-RING ubiquitin ligase complex  
GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG cgr:CAGL0J07414g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MKSLSEICQIHLMRHCNRIEGVNNVPYRLISGILEKLKLDQLRKLESTNVLLLLEDEELWLKLLTNNFPTNVHEIYISKKDKIINYYISYFEEHDPLLVHDNEELLRNWIQQCIKKNPDNGKYRLPYRMLYDKYESDMIEKQEESARRLRQQMRQIEEQRQKKQTELIEGKSLAFGTSRRSGSNNERSELFRKSLKDHKDRLQHFKSGGFDVTRRLDDSKRKVYNNRVAFGGGSGSINTNRSSIKVSAGNKDERIDTSNQAKPALSPGKETPKENKPIVKKRRSEREEPSIFLKNKRPNMIRRVFDTRPSRPEHSNRNTEINTSPVRHRNDTANTSPVRHVNVSTETPKIGKRKKSSFFNLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.47
3 0.42
4 0.43
5 0.44
6 0.41
7 0.39
8 0.41
9 0.4
10 0.4
11 0.38
12 0.36
13 0.3
14 0.29
15 0.23
16 0.18
17 0.12
18 0.14
19 0.2
20 0.22
21 0.24
22 0.22
23 0.23
24 0.28
25 0.32
26 0.31
27 0.29
28 0.33
29 0.38
30 0.4
31 0.4
32 0.38
33 0.37
34 0.38
35 0.34
36 0.29
37 0.22
38 0.2
39 0.19
40 0.15
41 0.12
42 0.09
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.08
48 0.07
49 0.1
50 0.13
51 0.16
52 0.21
53 0.23
54 0.23
55 0.24
56 0.26
57 0.28
58 0.26
59 0.23
60 0.19
61 0.18
62 0.22
63 0.3
64 0.3
65 0.26
66 0.29
67 0.33
68 0.35
69 0.39
70 0.39
71 0.36
72 0.37
73 0.38
74 0.36
75 0.34
76 0.31
77 0.29
78 0.25
79 0.2
80 0.17
81 0.15
82 0.14
83 0.13
84 0.16
85 0.14
86 0.13
87 0.11
88 0.12
89 0.12
90 0.14
91 0.13
92 0.12
93 0.12
94 0.15
95 0.15
96 0.19
97 0.23
98 0.25
99 0.32
100 0.38
101 0.45
102 0.47
103 0.54
104 0.59
105 0.64
106 0.67
107 0.64
108 0.63
109 0.61
110 0.6
111 0.58
112 0.52
113 0.44
114 0.42
115 0.47
116 0.4
117 0.39
118 0.39
119 0.34
120 0.34
121 0.34
122 0.28
123 0.23
124 0.23
125 0.21
126 0.19
127 0.18
128 0.17
129 0.19
130 0.21
131 0.22
132 0.25
133 0.27
134 0.29
135 0.37
136 0.42
137 0.45
138 0.51
139 0.55
140 0.54
141 0.59
142 0.59
143 0.61
144 0.64
145 0.64
146 0.63
147 0.62
148 0.57
149 0.49
150 0.5
151 0.43
152 0.44
153 0.4
154 0.35
155 0.32
156 0.32
157 0.31
158 0.26
159 0.24
160 0.14
161 0.11
162 0.09
163 0.1
164 0.15
165 0.15
166 0.16
167 0.17
168 0.22
169 0.3
170 0.39
171 0.37
172 0.33
173 0.34
174 0.36
175 0.37
176 0.36
177 0.29
178 0.23
179 0.23
180 0.26
181 0.32
182 0.38
183 0.43
184 0.46
185 0.51
186 0.57
187 0.61
188 0.66
189 0.62
190 0.57
191 0.5
192 0.47
193 0.42
194 0.34
195 0.31
196 0.22
197 0.19
198 0.19
199 0.21
200 0.18
201 0.18
202 0.19
203 0.22
204 0.29
205 0.36
206 0.42
207 0.46
208 0.5
209 0.55
210 0.62
211 0.66
212 0.63
213 0.57
214 0.48
215 0.42
216 0.38
217 0.31
218 0.22
219 0.14
220 0.08
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.1
228 0.11
229 0.15
230 0.14
231 0.17
232 0.22
233 0.24
234 0.29
235 0.34
236 0.36
237 0.34
238 0.34
239 0.32
240 0.27
241 0.28
242 0.25
243 0.24
244 0.28
245 0.3
246 0.3
247 0.3
248 0.28
249 0.25
250 0.3
251 0.33
252 0.27
253 0.27
254 0.32
255 0.41
256 0.44
257 0.47
258 0.46
259 0.48
260 0.55
261 0.55
262 0.57
263 0.57
264 0.65
265 0.73
266 0.75
267 0.75
268 0.77
269 0.84
270 0.83
271 0.81
272 0.79
273 0.79
274 0.73
275 0.68
276 0.64
277 0.62
278 0.58
279 0.55
280 0.55
281 0.53
282 0.56
283 0.62
284 0.64
285 0.63
286 0.71
287 0.74
288 0.7
289 0.68
290 0.69
291 0.62
292 0.64
293 0.64
294 0.61
295 0.59
296 0.62
297 0.6
298 0.6
299 0.66
300 0.68
301 0.69
302 0.71
303 0.67
304 0.69
305 0.65
306 0.59
307 0.53
308 0.48
309 0.44
310 0.39
311 0.42
312 0.42
313 0.48
314 0.49
315 0.5
316 0.52
317 0.55
318 0.59
319 0.56
320 0.56
321 0.52
322 0.51
323 0.52
324 0.47
325 0.44
326 0.38
327 0.35
328 0.32
329 0.35
330 0.38
331 0.37
332 0.35
333 0.32
334 0.33
335 0.38
336 0.44
337 0.47
338 0.51
339 0.58
340 0.66
341 0.73
342 0.81