Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HNB4

Protein Details
Accession A0A0L0HNB4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-46MKRPSRHHPPRGSSRAHRPYSTRYDGRRPPMSKKWKRQQTSLLISTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-36PSRHHPPRGSSRAHRPYSTRYDGRRPPMSKKWK
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 9.5, cyto_nucl 7, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MKRPSRHHPPRGSSRAHRPYSTRYDGRRPPMSKKWKRQQTSLLISTSLLVRNVPKGLPMERLKGLLRCPRQTEFFVREESGDAYTAVLTLQKSEAMRILNDLNYQDIDNHIISLEVERPEDYSDEGRIRISGLPSDVTAKELWEIYRRFGVVLLMKIYPDYTAQVLYSEPSAAQRAIQETTSLLVRNGRLRPALYAEPRGLRPVRPIGISVPQNISGRAIQNLQRSGQSTGPSPAFARAPPLGPAGTSQSHAQTPPPNLAYQSERRKQLRRPHDGMIPSKRIIVVSEDKKKVSSIPESLSTSSAPATVGTAALESTQAETFRTKHCELPTATNPQLANVELTIKQLRSKCLLVDRSRHPTPQLIAPIAYNFLYCQDLQQDRFQCITWGAPELMDDPVKQKIFVAEGAPYPQLGIFTSELYRPRRAENLQSTLNTAFRSTVTSQTLHIRNKGRIKCPEHPMVSIRCLPNENLLITSDEGSFLSVWDFRTTNDAKTTMSLKIKSGQLSGRIDVGERKVVSGGSDGFVHIWDVDGSDTLHHRNAMLPVASHDVGLPGRITCTSIHDRSARVITAATDEGSLNCIDIRMGRSSASSLITGAHRGYVTALQCHPRTEYLVLSGSDDCTVRMWDMRGKHTPVKQFTHDDKVTAVEWCPHLQDIFLSSSTDGRVIIHHKEKPQVVQRHVLHGAPVIGASWNPDPNFEGTIASLSPAQDDRPGSIHVWRGNGYIQALAEAQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.85
3 0.81
4 0.76
5 0.71
6 0.71
7 0.71
8 0.72
9 0.69
10 0.66
11 0.71
12 0.74
13 0.78
14 0.79
15 0.74
16 0.74
17 0.76
18 0.8
19 0.81
20 0.83
21 0.85
22 0.86
23 0.87
24 0.87
25 0.86
26 0.86
27 0.84
28 0.78
29 0.69
30 0.59
31 0.53
32 0.45
33 0.38
34 0.29
35 0.2
36 0.17
37 0.17
38 0.2
39 0.23
40 0.21
41 0.22
42 0.24
43 0.26
44 0.33
45 0.35
46 0.37
47 0.36
48 0.4
49 0.4
50 0.39
51 0.44
52 0.45
53 0.49
54 0.5
55 0.54
56 0.55
57 0.56
58 0.58
59 0.58
60 0.54
61 0.49
62 0.47
63 0.42
64 0.38
65 0.35
66 0.31
67 0.25
68 0.19
69 0.16
70 0.13
71 0.11
72 0.1
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.09
77 0.1
78 0.12
79 0.13
80 0.14
81 0.18
82 0.17
83 0.17
84 0.19
85 0.21
86 0.2
87 0.22
88 0.21
89 0.19
90 0.18
91 0.18
92 0.16
93 0.15
94 0.16
95 0.14
96 0.13
97 0.11
98 0.1
99 0.1
100 0.12
101 0.14
102 0.12
103 0.13
104 0.13
105 0.14
106 0.15
107 0.16
108 0.16
109 0.14
110 0.17
111 0.18
112 0.19
113 0.18
114 0.17
115 0.18
116 0.18
117 0.18
118 0.16
119 0.15
120 0.16
121 0.16
122 0.2
123 0.18
124 0.17
125 0.16
126 0.14
127 0.14
128 0.15
129 0.16
130 0.19
131 0.2
132 0.21
133 0.24
134 0.24
135 0.23
136 0.22
137 0.24
138 0.2
139 0.21
140 0.21
141 0.18
142 0.18
143 0.18
144 0.17
145 0.14
146 0.11
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.11
159 0.1
160 0.11
161 0.12
162 0.14
163 0.15
164 0.15
165 0.14
166 0.12
167 0.13
168 0.14
169 0.12
170 0.11
171 0.13
172 0.15
173 0.21
174 0.23
175 0.25
176 0.25
177 0.25
178 0.26
179 0.28
180 0.33
181 0.3
182 0.31
183 0.31
184 0.33
185 0.33
186 0.37
187 0.33
188 0.28
189 0.29
190 0.31
191 0.31
192 0.28
193 0.29
194 0.26
195 0.32
196 0.32
197 0.3
198 0.26
199 0.27
200 0.27
201 0.26
202 0.25
203 0.2
204 0.2
205 0.19
206 0.2
207 0.2
208 0.25
209 0.27
210 0.26
211 0.26
212 0.27
213 0.28
214 0.27
215 0.24
216 0.21
217 0.22
218 0.22
219 0.21
220 0.19
221 0.18
222 0.17
223 0.15
224 0.18
225 0.15
226 0.16
227 0.16
228 0.17
229 0.15
230 0.14
231 0.15
232 0.15
233 0.14
234 0.15
235 0.14
236 0.15
237 0.16
238 0.16
239 0.18
240 0.19
241 0.2
242 0.23
243 0.23
244 0.22
245 0.22
246 0.24
247 0.26
248 0.3
249 0.38
250 0.39
251 0.45
252 0.5
253 0.56
254 0.61
255 0.66
256 0.68
257 0.68
258 0.67
259 0.63
260 0.64
261 0.63
262 0.62
263 0.6
264 0.53
265 0.44
266 0.4
267 0.36
268 0.31
269 0.26
270 0.23
271 0.24
272 0.28
273 0.36
274 0.37
275 0.37
276 0.38
277 0.37
278 0.35
279 0.31
280 0.28
281 0.23
282 0.23
283 0.27
284 0.28
285 0.29
286 0.27
287 0.23
288 0.18
289 0.15
290 0.13
291 0.09
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.04
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.08
307 0.1
308 0.13
309 0.19
310 0.19
311 0.23
312 0.24
313 0.29
314 0.3
315 0.35
316 0.36
317 0.37
318 0.36
319 0.35
320 0.34
321 0.29
322 0.28
323 0.21
324 0.17
325 0.1
326 0.11
327 0.08
328 0.1
329 0.11
330 0.11
331 0.14
332 0.16
333 0.18
334 0.19
335 0.19
336 0.19
337 0.24
338 0.31
339 0.31
340 0.36
341 0.39
342 0.43
343 0.44
344 0.43
345 0.37
346 0.33
347 0.31
348 0.29
349 0.26
350 0.19
351 0.18
352 0.17
353 0.16
354 0.15
355 0.13
356 0.08
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.11
363 0.13
364 0.15
365 0.2
366 0.21
367 0.21
368 0.22
369 0.22
370 0.18
371 0.16
372 0.15
373 0.1
374 0.1
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.13
384 0.13
385 0.13
386 0.12
387 0.11
388 0.12
389 0.13
390 0.13
391 0.09
392 0.1
393 0.12
394 0.11
395 0.1
396 0.09
397 0.08
398 0.07
399 0.06
400 0.08
401 0.07
402 0.08
403 0.09
404 0.11
405 0.16
406 0.2
407 0.23
408 0.22
409 0.23
410 0.28
411 0.3
412 0.36
413 0.37
414 0.39
415 0.38
416 0.37
417 0.38
418 0.33
419 0.32
420 0.24
421 0.18
422 0.13
423 0.1
424 0.14
425 0.13
426 0.17
427 0.17
428 0.18
429 0.19
430 0.25
431 0.32
432 0.3
433 0.35
434 0.35
435 0.39
436 0.47
437 0.52
438 0.53
439 0.55
440 0.61
441 0.62
442 0.65
443 0.66
444 0.59
445 0.55
446 0.52
447 0.46
448 0.42
449 0.4
450 0.34
451 0.28
452 0.27
453 0.25
454 0.25
455 0.24
456 0.2
457 0.16
458 0.16
459 0.16
460 0.14
461 0.15
462 0.11
463 0.09
464 0.09
465 0.09
466 0.08
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.08
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.17
475 0.18
476 0.19
477 0.21
478 0.21
479 0.19
480 0.21
481 0.23
482 0.22
483 0.25
484 0.24
485 0.23
486 0.27
487 0.3
488 0.29
489 0.3
490 0.27
491 0.28
492 0.3
493 0.29
494 0.26
495 0.23
496 0.22
497 0.22
498 0.22
499 0.2
500 0.17
501 0.17
502 0.16
503 0.16
504 0.16
505 0.15
506 0.13
507 0.1
508 0.1
509 0.1
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.07
514 0.06
515 0.05
516 0.05
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.07
521 0.09
522 0.1
523 0.12
524 0.11
525 0.11
526 0.13
527 0.15
528 0.17
529 0.15
530 0.14
531 0.15
532 0.19
533 0.19
534 0.17
535 0.15
536 0.14
537 0.13
538 0.13
539 0.12
540 0.07
541 0.08
542 0.09
543 0.1
544 0.09
545 0.15
546 0.22
547 0.23
548 0.27
549 0.29
550 0.3
551 0.32
552 0.35
553 0.28
554 0.22
555 0.21
556 0.16
557 0.17
558 0.17
559 0.13
560 0.11
561 0.11
562 0.11
563 0.12
564 0.11
565 0.08
566 0.07
567 0.07
568 0.06
569 0.08
570 0.11
571 0.13
572 0.13
573 0.14
574 0.14
575 0.16
576 0.18
577 0.17
578 0.14
579 0.11
580 0.13
581 0.14
582 0.15
583 0.13
584 0.13
585 0.12
586 0.12
587 0.13
588 0.15
589 0.16
590 0.19
591 0.22
592 0.26
593 0.27
594 0.29
595 0.3
596 0.27
597 0.29
598 0.26
599 0.24
600 0.22
601 0.24
602 0.22
603 0.23
604 0.22
605 0.19
606 0.18
607 0.17
608 0.14
609 0.12
610 0.12
611 0.11
612 0.13
613 0.15
614 0.19
615 0.23
616 0.3
617 0.36
618 0.41
619 0.47
620 0.51
621 0.58
622 0.6
623 0.62
624 0.6
625 0.62
626 0.61
627 0.64
628 0.58
629 0.5
630 0.44
631 0.4
632 0.35
633 0.28
634 0.24
635 0.19
636 0.2
637 0.21
638 0.22
639 0.2
640 0.19
641 0.17
642 0.17
643 0.16
644 0.16
645 0.16
646 0.15
647 0.15
648 0.16
649 0.17
650 0.16
651 0.13
652 0.11
653 0.14
654 0.17
655 0.25
656 0.32
657 0.36
658 0.4
659 0.48
660 0.51
661 0.56
662 0.61
663 0.62
664 0.59
665 0.64
666 0.61
667 0.62
668 0.61
669 0.52
670 0.44
671 0.37
672 0.33
673 0.23
674 0.2
675 0.13
676 0.11
677 0.1
678 0.13
679 0.15
680 0.18
681 0.18
682 0.2
683 0.22
684 0.23
685 0.25
686 0.22
687 0.19
688 0.15
689 0.17
690 0.15
691 0.14
692 0.14
693 0.12
694 0.14
695 0.14
696 0.15
697 0.18
698 0.19
699 0.2
700 0.22
701 0.24
702 0.23
703 0.27
704 0.32
705 0.31
706 0.34
707 0.33
708 0.32
709 0.31
710 0.32
711 0.29
712 0.24
713 0.21
714 0.18