Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HLP4

Protein Details
Accession A0A0L0HLP4    Localization Confidence High Confidence Score 25
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-59LEITKERQKHNPRYRFLWPEHydrophilic
567-622QDNRNRSRSPSRRGRIRQESSSRAERSTSRSHDRRRSHDRRRRASRRERSKSTSSSHydrophilic
643-670RSRSRTRSGSRKPGKYTHRPQHHRDYSGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
563-617RKRVQDNRNRSRSPSRRGRIRQESSSRAERSTSRSHDRRRSHDRRRRASRRERSK
645-693RSRTRSGSRKPGKYTHRPQHHRDYSGSRSPRGRQSGTPVRGKRPQDSSR
701-703SRK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039037  CHERP  
IPR006569  CID_dom  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006874  P:intracellular calcium ion homeostasis  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04818  CID  
PF01585  G-patch  
PF01805  Surp  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
PS50174  G_PATCH  
PS50128  SURP  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MASGASWQQQSLLPSVPPGVDVSILDKMAEYVARNGQEFLEITKERQKHNPRYRFLWPEDANYPYFQWKVQQFKKPGLLPSHGASPQIPVSVAQIDTGGLTSTSTDHGAAFQVAPLPPAQLDPILTQQLFSALGLTPAVVPMSAPILNPLQTAMDKVCSARDALATSLSNRDEVIKYCGLLDVLMKDCSQTNIHAGKAWIFEHCTTASHVSLLAQLLEAISEVNTAFESRLHLVYLVNDVLYHGRKRHQEWIGDSFLPHLGPMLSHTYMAATGIKKKEEKVLKVLTIWSDKRFFGQTVIDGLRSHLGKPGRPPHAMANTENAALPAVPQDPSNLLSQEAQPRTTFQGVIQTAQPIPSAPLLNLPHVAPIGLNVNRDVRREPSCTVSHSSFLSHEAPKIGNSAPASAPESHPSFRKSLTAGVNMSLPTTIQAPPTNAKYYELPAGLVVAAISLDHKPYEQIAVSKIRALSQRPPPNPDLLAAVDEFYSGLDIIRRKLEQERQKDGFEEAPGEMAADQLNSSDTGLQFDKDGWEIGYLDDWYRKVEDARRRHESHDGRADSSLTRKRVQDNRNRSRSPSRRGRIRQESSSRAERSTSRSHDRRRSHDRRRRASRRERSKSTSSSSSSSSRSRSPDSTDSGSSDDRSRSRTRSGSRKPGKYTHRPQHHRDYSGSRSPRGRQSGTPVRGKRPQDSSRWGSSGAGSRKRSESPPFSRPEASREDYMISKRNVGYKLMKKLGWSEGSGLGASAQGIAEPIRVDATGDKFVGLGAGRSGDGDEMFEQWRKARSYCYTREPPASRSEPIGCYKCGRGGHIARECNEIAPRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.19
4 0.17
5 0.17
6 0.14
7 0.12
8 0.13
9 0.15
10 0.16
11 0.16
12 0.15
13 0.14
14 0.14
15 0.14
16 0.16
17 0.13
18 0.15
19 0.2
20 0.23
21 0.23
22 0.24
23 0.23
24 0.24
25 0.23
26 0.2
27 0.23
28 0.21
29 0.24
30 0.32
31 0.36
32 0.37
33 0.47
34 0.56
35 0.59
36 0.69
37 0.76
38 0.74
39 0.76
40 0.81
41 0.8
42 0.74
43 0.74
44 0.65
45 0.61
46 0.58
47 0.55
48 0.48
49 0.4
50 0.37
51 0.31
52 0.3
53 0.24
54 0.28
55 0.32
56 0.41
57 0.47
58 0.55
59 0.55
60 0.62
61 0.7
62 0.67
63 0.67
64 0.62
65 0.58
66 0.52
67 0.5
68 0.49
69 0.42
70 0.39
71 0.32
72 0.29
73 0.26
74 0.23
75 0.21
76 0.14
77 0.16
78 0.17
79 0.17
80 0.13
81 0.12
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.09
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.11
96 0.12
97 0.11
98 0.1
99 0.13
100 0.12
101 0.13
102 0.13
103 0.12
104 0.11
105 0.12
106 0.12
107 0.09
108 0.11
109 0.12
110 0.16
111 0.19
112 0.19
113 0.18
114 0.17
115 0.18
116 0.16
117 0.14
118 0.12
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.1
133 0.12
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.12
138 0.12
139 0.14
140 0.12
141 0.13
142 0.13
143 0.14
144 0.14
145 0.13
146 0.14
147 0.13
148 0.14
149 0.13
150 0.13
151 0.16
152 0.16
153 0.16
154 0.2
155 0.19
156 0.18
157 0.17
158 0.19
159 0.17
160 0.19
161 0.23
162 0.19
163 0.19
164 0.19
165 0.19
166 0.16
167 0.15
168 0.14
169 0.12
170 0.13
171 0.14
172 0.13
173 0.13
174 0.14
175 0.16
176 0.16
177 0.14
178 0.19
179 0.21
180 0.21
181 0.23
182 0.23
183 0.23
184 0.24
185 0.23
186 0.17
187 0.18
188 0.18
189 0.18
190 0.18
191 0.16
192 0.17
193 0.19
194 0.17
195 0.15
196 0.14
197 0.12
198 0.13
199 0.12
200 0.1
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.04
207 0.03
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.12
222 0.14
223 0.11
224 0.09
225 0.08
226 0.09
227 0.12
228 0.14
229 0.16
230 0.16
231 0.21
232 0.27
233 0.31
234 0.4
235 0.42
236 0.44
237 0.47
238 0.5
239 0.48
240 0.44
241 0.39
242 0.31
243 0.27
244 0.21
245 0.16
246 0.11
247 0.07
248 0.06
249 0.08
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.12
257 0.13
258 0.1
259 0.15
260 0.18
261 0.21
262 0.22
263 0.24
264 0.31
265 0.35
266 0.37
267 0.39
268 0.41
269 0.39
270 0.39
271 0.39
272 0.34
273 0.34
274 0.33
275 0.29
276 0.26
277 0.25
278 0.26
279 0.27
280 0.24
281 0.19
282 0.19
283 0.16
284 0.19
285 0.19
286 0.18
287 0.16
288 0.16
289 0.17
290 0.16
291 0.16
292 0.15
293 0.16
294 0.18
295 0.25
296 0.33
297 0.35
298 0.36
299 0.37
300 0.39
301 0.45
302 0.46
303 0.39
304 0.35
305 0.31
306 0.3
307 0.28
308 0.21
309 0.14
310 0.11
311 0.1
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.08
318 0.1
319 0.11
320 0.1
321 0.1
322 0.11
323 0.14
324 0.21
325 0.21
326 0.2
327 0.19
328 0.2
329 0.23
330 0.23
331 0.2
332 0.13
333 0.2
334 0.19
335 0.2
336 0.19
337 0.18
338 0.17
339 0.17
340 0.16
341 0.08
342 0.09
343 0.1
344 0.09
345 0.08
346 0.14
347 0.14
348 0.15
349 0.16
350 0.15
351 0.13
352 0.13
353 0.13
354 0.07
355 0.06
356 0.1
357 0.1
358 0.11
359 0.11
360 0.17
361 0.18
362 0.2
363 0.2
364 0.19
365 0.22
366 0.25
367 0.25
368 0.25
369 0.25
370 0.27
371 0.29
372 0.26
373 0.24
374 0.21
375 0.21
376 0.16
377 0.18
378 0.18
379 0.15
380 0.14
381 0.14
382 0.14
383 0.14
384 0.15
385 0.13
386 0.12
387 0.11
388 0.13
389 0.11
390 0.12
391 0.14
392 0.13
393 0.14
394 0.14
395 0.16
396 0.15
397 0.17
398 0.18
399 0.17
400 0.17
401 0.18
402 0.16
403 0.19
404 0.21
405 0.22
406 0.2
407 0.19
408 0.2
409 0.18
410 0.17
411 0.11
412 0.08
413 0.06
414 0.07
415 0.07
416 0.08
417 0.09
418 0.11
419 0.13
420 0.16
421 0.18
422 0.17
423 0.18
424 0.17
425 0.18
426 0.19
427 0.17
428 0.14
429 0.12
430 0.11
431 0.1
432 0.08
433 0.06
434 0.03
435 0.03
436 0.02
437 0.04
438 0.03
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.05
443 0.06
444 0.07
445 0.07
446 0.08
447 0.11
448 0.15
449 0.15
450 0.17
451 0.17
452 0.18
453 0.2
454 0.22
455 0.26
456 0.32
457 0.41
458 0.41
459 0.46
460 0.45
461 0.45
462 0.42
463 0.36
464 0.28
465 0.2
466 0.18
467 0.13
468 0.12
469 0.09
470 0.08
471 0.08
472 0.05
473 0.05
474 0.04
475 0.04
476 0.06
477 0.07
478 0.09
479 0.11
480 0.12
481 0.13
482 0.2
483 0.28
484 0.34
485 0.41
486 0.49
487 0.49
488 0.5
489 0.49
490 0.45
491 0.38
492 0.3
493 0.24
494 0.15
495 0.12
496 0.11
497 0.1
498 0.08
499 0.07
500 0.06
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.05
505 0.04
506 0.05
507 0.06
508 0.06
509 0.09
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.09
514 0.1
515 0.09
516 0.1
517 0.07
518 0.08
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.08
524 0.1
525 0.1
526 0.1
527 0.11
528 0.12
529 0.14
530 0.21
531 0.3
532 0.37
533 0.44
534 0.51
535 0.53
536 0.55
537 0.62
538 0.6
539 0.59
540 0.59
541 0.54
542 0.47
543 0.45
544 0.43
545 0.34
546 0.37
547 0.35
548 0.29
549 0.3
550 0.32
551 0.39
552 0.47
553 0.56
554 0.59
555 0.64
556 0.71
557 0.77
558 0.76
559 0.73
560 0.75
561 0.75
562 0.74
563 0.74
564 0.71
565 0.73
566 0.78
567 0.83
568 0.83
569 0.81
570 0.8
571 0.77
572 0.75
573 0.7
574 0.71
575 0.62
576 0.52
577 0.48
578 0.41
579 0.4
580 0.42
581 0.43
582 0.45
583 0.52
584 0.6
585 0.67
586 0.72
587 0.75
588 0.78
589 0.82
590 0.84
591 0.85
592 0.86
593 0.87
594 0.91
595 0.92
596 0.92
597 0.92
598 0.92
599 0.93
600 0.92
601 0.9
602 0.86
603 0.83
604 0.78
605 0.73
606 0.69
607 0.61
608 0.54
609 0.49
610 0.46
611 0.42
612 0.41
613 0.38
614 0.36
615 0.37
616 0.4
617 0.39
618 0.42
619 0.43
620 0.44
621 0.44
622 0.41
623 0.38
624 0.36
625 0.34
626 0.29
627 0.27
628 0.26
629 0.24
630 0.29
631 0.32
632 0.33
633 0.38
634 0.45
635 0.49
636 0.56
637 0.64
638 0.69
639 0.74
640 0.78
641 0.78
642 0.79
643 0.81
644 0.8
645 0.82
646 0.81
647 0.82
648 0.82
649 0.82
650 0.84
651 0.83
652 0.76
653 0.71
654 0.68
655 0.64
656 0.66
657 0.63
658 0.57
659 0.55
660 0.57
661 0.6
662 0.6
663 0.56
664 0.5
665 0.56
666 0.61
667 0.62
668 0.66
669 0.62
670 0.62
671 0.67
672 0.68
673 0.65
674 0.64
675 0.64
676 0.62
677 0.66
678 0.65
679 0.63
680 0.6
681 0.54
682 0.45
683 0.42
684 0.43
685 0.42
686 0.45
687 0.41
688 0.43
689 0.46
690 0.49
691 0.51
692 0.51
693 0.53
694 0.52
695 0.58
696 0.59
697 0.6
698 0.62
699 0.58
700 0.54
701 0.52
702 0.49
703 0.43
704 0.39
705 0.38
706 0.36
707 0.39
708 0.41
709 0.34
710 0.35
711 0.35
712 0.4
713 0.39
714 0.4
715 0.45
716 0.46
717 0.55
718 0.55
719 0.54
720 0.49
721 0.52
722 0.54
723 0.47
724 0.4
725 0.34
726 0.3
727 0.31
728 0.29
729 0.23
730 0.16
731 0.13
732 0.11
733 0.09
734 0.06
735 0.05
736 0.05
737 0.06
738 0.07
739 0.07
740 0.07
741 0.08
742 0.08
743 0.09
744 0.13
745 0.17
746 0.19
747 0.19
748 0.19
749 0.18
750 0.18
751 0.19
752 0.14
753 0.11
754 0.08
755 0.09
756 0.09
757 0.1
758 0.11
759 0.09
760 0.09
761 0.11
762 0.1
763 0.12
764 0.15
765 0.17
766 0.18
767 0.2
768 0.27
769 0.28
770 0.29
771 0.34
772 0.41
773 0.48
774 0.55
775 0.61
776 0.64
777 0.66
778 0.75
779 0.71
780 0.65
781 0.65
782 0.62
783 0.54
784 0.51
785 0.5
786 0.46
787 0.5
788 0.51
789 0.44
790 0.43
791 0.44
792 0.45
793 0.42
794 0.4
795 0.41
796 0.44
797 0.51
798 0.56
799 0.59
800 0.54
801 0.58
802 0.55
803 0.49