FuNGI

A0A0L0HK39

Protein Details

Accession

A0A0L0HK39

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
41-66	GEDSHANSRRRREPRPPSGRREEARE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
19-27	SGRRGQRRG
48-62	SRRRREPRPPSGRRE
355-367	RKGGKPKLGKKAS

Subcellular Location(s)

mito 10, plas 6, nucl 5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR019354 SMG8/SMG9 IPR039177 SMG9
Gene Ontology	GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF10220 Smg8_Smg9

Amino Acid Sequences

MSSPPAAHIPRTSASPRASGRRGQRRGPTPGEGDARSTGSGEDSHANSRRRREPRPPSGRREEARELYRQPSEGSQVRAPVILERRPVPQKPEGPVPKGLLLRNPPAGTTPTKTIERNLDRGTSATTPELAVQAAGVTLPLPRIHKILDQHLRFQPTETVHRALSELPGCFVVGAIGRRGTGKSTILAHFSTSLTTFPSGQTRTNGIDLHVTPERVILLDTQALLLPGGRAPHDEALQTMRLACFILSVCHVVLLVSDTHELDADLLHFVRTMEAVRHRIIPLSKEEQQSDEHRPDLVYVSTKCTSDSFFVESYANMATDFLSWFRGTRIGVLGGSVSMGKRYGQYSGLGSDDDRKGGKPKLGKKASRSSNGEVADPRSSPVSPLSVMTSPKPSDPRSGTLVREPNIFLLPRAPVVSNASSDPNPSPVGKPGGPPILDRLIGFGIPARYEVMMKELRNQVFETPRCTLTEKNPMVRRWYGMSERDWLKFATKTWETIRKSDMDRHWARVMKSRLERYSSR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.41
3	0.44
4	0.48
5	0.51
6	0.53
7	0.6
8	0.64
9	0.69
10	0.69
11	0.73
12	0.73
13	0.77
14	0.76
15	0.71
16	0.64
17	0.64
18	0.62
19	0.53
20	0.48
21	0.41
22	0.37
23	0.31
24	0.27
25	0.2
26	0.16
27	0.16
28	0.15
29	0.17
30	0.18
31	0.25
32	0.32
33	0.38
34	0.42
35	0.5
36	0.58
37	0.62
38	0.68
39	0.72
40	0.76
41	0.81
42	0.87
43	0.88
44	0.87
45	0.88
46	0.89
47	0.81
48	0.79
49	0.76
50	0.73
51	0.68
52	0.65
53	0.59
54	0.55
55	0.54
56	0.47
57	0.4
58	0.34
59	0.37
60	0.35
61	0.36
62	0.33
63	0.33
64	0.32
65	0.31
66	0.29
67	0.28
68	0.3
69	0.29
70	0.3
71	0.29
72	0.36
73	0.42
74	0.45
75	0.45
76	0.48
77	0.5
78	0.51
79	0.6
80	0.6
81	0.57
82	0.58
83	0.54
84	0.51
85	0.49
86	0.45
87	0.41
88	0.39
89	0.4
90	0.41
91	0.38
92	0.33
93	0.31
94	0.33
95	0.31
96	0.29
97	0.29
98	0.28
99	0.32
100	0.33
101	0.35
102	0.41
103	0.43
104	0.46
105	0.43
106	0.4
107	0.37
108	0.37
109	0.36
110	0.28
111	0.24
112	0.18
113	0.16
114	0.15
115	0.15
116	0.14
117	0.1
118	0.09
119	0.07
120	0.06
121	0.05
122	0.05
123	0.04
124	0.03
125	0.04
126	0.05
127	0.08
128	0.1
129	0.11
130	0.13
131	0.15
132	0.19
133	0.22
134	0.3
135	0.38
136	0.38
137	0.43
138	0.46
139	0.48
140	0.44
141	0.42
142	0.37
143	0.32
144	0.36
145	0.33
146	0.32
147	0.27
148	0.28
149	0.27
150	0.23
151	0.23
152	0.19
153	0.15
154	0.14
155	0.14
156	0.13
157	0.12
158	0.11
159	0.08
160	0.07
161	0.08
162	0.09
163	0.09
164	0.09
165	0.1
166	0.11
167	0.12
168	0.12
169	0.12
170	0.13
171	0.16
172	0.17
173	0.19
174	0.19
175	0.18
176	0.17
177	0.16
178	0.14
179	0.11
180	0.1
181	0.09
182	0.1
183	0.1
184	0.09
185	0.14
186	0.16
187	0.17
188	0.18
189	0.2
190	0.21
191	0.22
192	0.22
193	0.17
194	0.19
195	0.18
196	0.2
197	0.19
198	0.17
199	0.15
200	0.15
201	0.14
202	0.1
203	0.11
204	0.07
205	0.06
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.06
211	0.06
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.06
218	0.08
219	0.09
220	0.1
221	0.1
222	0.1
223	0.11
224	0.12
225	0.11
226	0.1
227	0.08
228	0.08
229	0.08
230	0.07
231	0.06
232	0.05
233	0.06
234	0.06
235	0.07
236	0.07
237	0.06
238	0.06
239	0.05
240	0.05
241	0.06
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.06
248	0.05
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.07
261	0.11
262	0.14
263	0.15
264	0.17
265	0.17
266	0.19
267	0.2
268	0.19
269	0.2
270	0.23
271	0.28
272	0.28
273	0.28
274	0.27
275	0.29
276	0.32
277	0.32
278	0.29
279	0.24
280	0.22
281	0.21
282	0.2
283	0.19
284	0.15
285	0.14
286	0.13
287	0.17
288	0.18
289	0.18
290	0.18
291	0.17
292	0.18
293	0.16
294	0.17
295	0.15
296	0.14
297	0.15
298	0.15
299	0.14
300	0.14
301	0.12
302	0.1
303	0.07
304	0.07
305	0.06
306	0.06
307	0.07
308	0.06
309	0.07
310	0.07
311	0.08
312	0.08
313	0.1
314	0.1
315	0.11
316	0.12
317	0.11
318	0.11
319	0.11
320	0.1
321	0.08
322	0.08
323	0.07
324	0.05
325	0.05
326	0.06
327	0.06
328	0.08
329	0.09
330	0.1
331	0.11
332	0.12
333	0.13
334	0.14
335	0.14
336	0.13
337	0.13
338	0.16
339	0.16
340	0.16
341	0.15
342	0.15
343	0.2
344	0.22
345	0.27
346	0.29
347	0.37
348	0.46
349	0.55
350	0.59
351	0.62
352	0.69
353	0.72
354	0.73
355	0.7
356	0.64
357	0.61
358	0.57
359	0.52
360	0.44
361	0.39
362	0.33
363	0.27
364	0.23
365	0.19
366	0.18
367	0.16
368	0.16
369	0.15
370	0.13
371	0.14
372	0.16
373	0.17
374	0.19
375	0.2
376	0.24
377	0.23
378	0.26
379	0.31
380	0.3
381	0.35
382	0.37
383	0.39
384	0.4
385	0.43
386	0.41
387	0.44
388	0.48
389	0.41
390	0.39
391	0.36
392	0.32
393	0.31
394	0.29
395	0.21
396	0.18
397	0.18
398	0.16
399	0.18
400	0.16
401	0.15
402	0.19
403	0.2
404	0.19
405	0.2
406	0.22
407	0.2
408	0.23
409	0.22
410	0.2
411	0.2
412	0.21
413	0.21
414	0.22
415	0.28
416	0.26
417	0.27
418	0.3
419	0.34
420	0.33
421	0.32
422	0.33
423	0.31
424	0.3
425	0.28
426	0.25
427	0.2
428	0.19
429	0.18
430	0.16
431	0.13
432	0.13
433	0.14
434	0.12
435	0.12
436	0.13
437	0.13
438	0.16
439	0.2
440	0.2
441	0.27
442	0.34
443	0.35
444	0.36
445	0.37
446	0.37
447	0.41
448	0.43
449	0.42
450	0.38
451	0.38
452	0.38
453	0.4
454	0.39
455	0.37
456	0.46
457	0.46
458	0.52
459	0.57
460	0.58
461	0.62
462	0.6
463	0.56
464	0.5
465	0.51
466	0.48
467	0.46
468	0.46
469	0.47
470	0.48
471	0.47
472	0.44
473	0.38
474	0.35
475	0.32
476	0.32
477	0.33
478	0.31
479	0.34
480	0.4
481	0.49
482	0.49
483	0.51
484	0.53
485	0.5
486	0.52
487	0.57
488	0.56
489	0.57
490	0.57
491	0.59
492	0.62
493	0.61
494	0.59
495	0.6
496	0.59
497	0.58
498	0.63
499	0.66
500	0.65

A0A0L0HK39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer