Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0HTE3

Protein Details
Accession A0A0L0HTE3    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSSSKKKNTDKSKGKAAPSDHydrophilic
38-65KTITAPEPEKRKRGRQPKSAQENTKGKEHydrophilic
240-259IKSGSKKKQSSKSAKKDAAKHydrophilic
369-392EETAPAKKSKPSKKKNGSSTGPTDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-70EKRKRGRQPKSAQENTKGKENIKGK
242-270SGSKKKQSSKSAKKDAAKDAPKKRIPKSK
324-351KVKAKKDDAVKKASGDTKPKKRAAPSKK
373-383PAKKSKPSKKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044198  DEK  
IPR014876  DEK_C  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006325  P:chromatin organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF08766  DEK_C  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51998  DEK_C  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSSSKKKNTDKSKGKAAPSDASPVPSDDTSTDQPEEVKTITAPEPEKRKRGRQPKSAQENTKGKENIKGKDVVDNKKKEEQEPEDAPSPKRAKTEEDTTPTEGRVKRERKATVHYNVDAPSKAPKKIEIPEGKGQPLKDIQAIHDVITTTRASDEVLKGFHSLIWGRAAHKHLKQDLLNFKGFNFQSDKEHDVVLRKLEKWMLTGLKELSHLLCLESSGTKEVIIERIFKFLQEPSEEAIKSGSKKKQSSKSAKKDAAKDAPKKRIPKSKTAFEVFAKEKRDEVTKELGEDAEKDAIDKQLNKLFQGLSEEQKTAYEQKLEASKVKAKKDDAVKKASGDTKPKKRAAPSKKATEVVESEEDVENKNKNEETAPAKKSKPSKKKNGSSTGPTDAQIEKEIKSILKDANLQDLTSKKVRSHLQEVFNCDLSGKKEFIKEKIDQWLGEQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.78
3 0.73
4 0.68
5 0.6
6 0.59
7 0.49
8 0.44
9 0.39
10 0.33
11 0.31
12 0.25
13 0.24
14 0.19
15 0.23
16 0.24
17 0.28
18 0.27
19 0.24
20 0.25
21 0.25
22 0.26
23 0.21
24 0.18
25 0.14
26 0.18
27 0.19
28 0.24
29 0.26
30 0.3
31 0.4
32 0.46
33 0.56
34 0.59
35 0.67
36 0.72
37 0.8
38 0.83
39 0.83
40 0.87
41 0.88
42 0.91
43 0.91
44 0.87
45 0.86
46 0.85
47 0.77
48 0.76
49 0.68
50 0.59
51 0.58
52 0.57
53 0.52
54 0.47
55 0.5
56 0.41
57 0.46
58 0.52
59 0.54
60 0.57
61 0.58
62 0.59
63 0.62
64 0.64
65 0.59
66 0.61
67 0.57
68 0.56
69 0.53
70 0.53
71 0.52
72 0.53
73 0.5
74 0.5
75 0.47
76 0.42
77 0.42
78 0.39
79 0.39
80 0.41
81 0.47
82 0.46
83 0.49
84 0.5
85 0.51
86 0.5
87 0.44
88 0.45
89 0.4
90 0.38
91 0.42
92 0.43
93 0.44
94 0.51
95 0.57
96 0.55
97 0.61
98 0.63
99 0.62
100 0.63
101 0.58
102 0.53
103 0.49
104 0.46
105 0.38
106 0.3
107 0.31
108 0.28
109 0.3
110 0.27
111 0.29
112 0.32
113 0.36
114 0.45
115 0.43
116 0.46
117 0.51
118 0.53
119 0.53
120 0.5
121 0.45
122 0.39
123 0.34
124 0.29
125 0.25
126 0.22
127 0.2
128 0.24
129 0.24
130 0.21
131 0.2
132 0.19
133 0.16
134 0.17
135 0.16
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.11
141 0.13
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.13
152 0.14
153 0.14
154 0.19
155 0.22
156 0.26
157 0.29
158 0.34
159 0.33
160 0.38
161 0.38
162 0.41
163 0.45
164 0.43
165 0.42
166 0.36
167 0.33
168 0.35
169 0.33
170 0.28
171 0.24
172 0.21
173 0.23
174 0.26
175 0.29
176 0.22
177 0.23
178 0.22
179 0.21
180 0.22
181 0.22
182 0.21
183 0.19
184 0.2
185 0.21
186 0.2
187 0.18
188 0.21
189 0.18
190 0.16
191 0.18
192 0.17
193 0.15
194 0.16
195 0.15
196 0.11
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.1
211 0.1
212 0.13
213 0.13
214 0.16
215 0.16
216 0.15
217 0.16
218 0.14
219 0.16
220 0.13
221 0.14
222 0.13
223 0.16
224 0.16
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.16
229 0.22
230 0.25
231 0.29
232 0.34
233 0.42
234 0.5
235 0.59
236 0.68
237 0.71
238 0.77
239 0.79
240 0.81
241 0.79
242 0.75
243 0.73
244 0.71
245 0.69
246 0.68
247 0.66
248 0.69
249 0.7
250 0.7
251 0.7
252 0.7
253 0.66
254 0.68
255 0.66
256 0.64
257 0.65
258 0.61
259 0.58
260 0.49
261 0.51
262 0.44
263 0.43
264 0.38
265 0.32
266 0.3
267 0.28
268 0.31
269 0.26
270 0.27
271 0.29
272 0.26
273 0.27
274 0.26
275 0.25
276 0.2
277 0.19
278 0.17
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.11
283 0.13
284 0.15
285 0.16
286 0.18
287 0.21
288 0.22
289 0.22
290 0.23
291 0.2
292 0.19
293 0.24
294 0.23
295 0.22
296 0.24
297 0.24
298 0.22
299 0.22
300 0.23
301 0.2
302 0.2
303 0.18
304 0.16
305 0.19
306 0.23
307 0.25
308 0.27
309 0.28
310 0.33
311 0.37
312 0.43
313 0.45
314 0.42
315 0.47
316 0.53
317 0.58
318 0.57
319 0.57
320 0.54
321 0.5
322 0.53
323 0.53
324 0.48
325 0.49
326 0.53
327 0.57
328 0.65
329 0.69
330 0.69
331 0.71
332 0.76
333 0.76
334 0.77
335 0.75
336 0.76
337 0.76
338 0.74
339 0.66
340 0.6
341 0.52
342 0.46
343 0.39
344 0.3
345 0.27
346 0.25
347 0.25
348 0.22
349 0.23
350 0.21
351 0.2
352 0.23
353 0.21
354 0.2
355 0.21
356 0.25
357 0.3
358 0.36
359 0.4
360 0.43
361 0.45
362 0.5
363 0.59
364 0.64
365 0.67
366 0.69
367 0.75
368 0.79
369 0.87
370 0.9
371 0.9
372 0.87
373 0.84
374 0.79
375 0.75
376 0.66
377 0.56
378 0.5
379 0.41
380 0.35
381 0.32
382 0.28
383 0.21
384 0.22
385 0.23
386 0.21
387 0.22
388 0.25
389 0.23
390 0.25
391 0.3
392 0.29
393 0.37
394 0.36
395 0.34
396 0.34
397 0.33
398 0.35
399 0.35
400 0.36
401 0.28
402 0.34
403 0.42
404 0.45
405 0.52
406 0.55
407 0.59
408 0.62
409 0.67
410 0.64
411 0.59
412 0.51
413 0.42
414 0.37
415 0.31
416 0.3
417 0.25
418 0.24
419 0.31
420 0.36
421 0.41
422 0.45
423 0.45
424 0.47
425 0.55
426 0.55
427 0.48