FuNGI

A0A0L0HCC1

Protein Details

Accession

A0A0L0HCC1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
966-988	IYDLGKKKLLRKCENKQFPNNIL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 7, mito 6, cyto 5, pero 4, mito_nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MFLYNVTLQQTTGINQAVIGNFAGTKQQEILVARNSVLELLQPDPSTGKVHSLLTHNVFGIIRSVVPFRLTGSSKDYIVVGSDSGRIVILEYNPAKNTFDRVHEETYGKSGCRRIVPGQYLAADPKGRAVMIGAIEKQKLVYILNRDASTRLTISSPLEAHKSHTLVHDLIGVDVGFENPVFACIEVDYSDVDQDPTGEAFQNAEKVLTYYELDLGLNHVVRKWSDPIDPRSNKLIPVPGGVDGPSGVLVCSENYITWRHQDYPSVRVPIPRRPDPLLSSPSANGEDMEMGRGVIIVSSVMHKLKKGFFILAQTEDGDVFKITMDYTAGADGVIGGIQNLKIKYFDTIPVATNMCLLKTGFLFVASEFANHYLYQIENLGDDDEAQMEYQSAELPQGDDADEVIVYFNPRGLRNLAIVDELESISPLIDAKVLNLAEDDSPQIYALCGRGARSSFRILRHGLEVSEMAVSELPGNPNAVWTVKANAQEEFDSFIIVSFVDATLVLSIGETVEEVTDTGFLNSTPTLTVAQLGEDALVQVYPRGIRHIRADRRVSEWKAPGNKTIVRAACNRKQVVIALSGGEVVYFELDSHGQLNEFQDRKEMAAPITALSIGPIPEGRQRSGFLAVGCEDNTVRILSLDPDNCLQSLGMQAVSYMPVSLALVEMSDTGTATGTLYLNIGLQSGLLLRTTVDSITGALSDTRFRFLGSRPVKLFKVQIQGSPAVLALSSRPWLSFTYQSRTKLIPLSAPMLEYGSSFCSEQCPEGIVAIESNNLHIFTVEKLSTVFNHSIIPLKYTPRRFIYHQPSGNFVIIESEHNTWCPSDKVKRIAEKADQMDEGEEYEELPPEQFGLPRAEAGKWASCIRILNSMTSETAHLLELDNNEAAFSITTCIFHGQKGEAFLIVGTAADVTLSPKTCSSGFLHTYRFVDGGNALELLHKTPIDDVPYALCAFQGRLLVGMGKILRIYDLGKKKLLRKCENKQFPNNILTLHTQGDRIVVGDVQESVHFASYRHFDNRIVIFADDTTPRWITATTMVDYDTVAGGDKFGNIFIDRLPAETSEEVDEDPTGNKLVYEKGYLQGAPHKVEHAADFFIGESPTSVTKTVIVPGGREIIVYTTLLGTIGCLIPFQSKEDVEFFQQLEMHMRNKFPPLCGRDHLAYRSYYIPVRNVIDGDLCEQFNLLPNEVKRQIAEDMDRTVSELSKKVEDVRNRAAF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.16
3	0.19
4	0.17
5	0.17
6	0.15
7	0.12
8	0.11
9	0.11
10	0.16
11	0.13
12	0.14
13	0.14
14	0.16
15	0.19
16	0.22
17	0.26
18	0.26
19	0.27
20	0.26
21	0.25
22	0.24
23	0.2
24	0.18
25	0.16
26	0.13
27	0.13
28	0.17
29	0.16
30	0.17
31	0.17
32	0.19
33	0.2
34	0.18
35	0.21
36	0.2
37	0.22
38	0.25
39	0.29
40	0.34
41	0.36
42	0.37
43	0.32
44	0.32
45	0.3
46	0.26
47	0.24
48	0.18
49	0.14
50	0.14
51	0.16
52	0.14
53	0.16
54	0.15
55	0.16
56	0.22
57	0.23
58	0.24
59	0.29
60	0.3
61	0.29
62	0.3
63	0.27
64	0.21
65	0.21
66	0.18
67	0.13
68	0.11
69	0.13
70	0.12
71	0.12
72	0.11
73	0.09
74	0.09
75	0.12
76	0.11
77	0.18
78	0.21
79	0.24
80	0.26
81	0.28
82	0.29
83	0.27
84	0.32
85	0.28
86	0.31
87	0.35
88	0.38
89	0.41
90	0.43
91	0.43
92	0.39
93	0.41
94	0.38
95	0.31
96	0.31
97	0.31
98	0.31
99	0.34
100	0.38
101	0.39
102	0.45
103	0.49
104	0.48
105	0.47
106	0.44
107	0.42
108	0.39
109	0.37
110	0.28
111	0.23
112	0.23
113	0.21
114	0.19
115	0.17
116	0.16
117	0.15
118	0.16
119	0.2
120	0.2
121	0.22
122	0.22
123	0.22
124	0.21
125	0.19
126	0.17
127	0.15
128	0.18
129	0.22
130	0.29
131	0.33
132	0.34
133	0.34
134	0.34
135	0.34
136	0.31
137	0.25
138	0.2
139	0.16
140	0.18
141	0.19
142	0.22
143	0.21
144	0.2
145	0.23
146	0.23
147	0.26
148	0.29
149	0.28
150	0.26
151	0.27
152	0.29
153	0.26
154	0.26
155	0.25
156	0.2
157	0.19
158	0.18
159	0.14
160	0.11
161	0.1
162	0.1
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.05
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.07
171	0.07
172	0.08
173	0.08
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.1
178	0.1
179	0.1
180	0.09
181	0.09
182	0.09
183	0.09
184	0.1
185	0.09
186	0.09
187	0.1
188	0.11
189	0.14
190	0.12
191	0.12
192	0.11
193	0.11
194	0.12
195	0.12
196	0.12
197	0.1
198	0.11
199	0.11
200	0.11
201	0.1
202	0.12
203	0.12
204	0.13
205	0.12
206	0.13
207	0.14
208	0.15
209	0.19
210	0.2
211	0.21
212	0.27
213	0.34
214	0.41
215	0.5
216	0.52
217	0.52
218	0.55
219	0.53
220	0.48
221	0.44
222	0.42
223	0.33
224	0.32
225	0.3
226	0.24
227	0.23
228	0.22
229	0.18
230	0.12
231	0.11
232	0.09
233	0.07
234	0.06
235	0.05
236	0.06
237	0.06
238	0.07
239	0.07
240	0.07
241	0.09
242	0.12
243	0.13
244	0.17
245	0.21
246	0.23
247	0.25
248	0.32
249	0.33
250	0.37
251	0.41
252	0.42
253	0.39
254	0.42
255	0.45
256	0.46
257	0.51
258	0.51
259	0.5
260	0.49
261	0.53
262	0.51
263	0.54
264	0.51
265	0.44
266	0.4
267	0.36
268	0.34
269	0.31
270	0.26
271	0.19
272	0.14
273	0.14
274	0.12
275	0.12
276	0.1
277	0.08
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.05
282	0.04
283	0.03
284	0.04
285	0.06
286	0.08
287	0.1
288	0.11
289	0.13
290	0.17
291	0.2
292	0.24
293	0.25
294	0.25
295	0.24
296	0.29
297	0.31
298	0.29
299	0.27
300	0.23
301	0.21
302	0.19
303	0.17
304	0.12
305	0.09
306	0.07
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.07
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.05
319	0.04
320	0.04
321	0.03
322	0.03
323	0.04
324	0.05
325	0.08
326	0.09
327	0.09
328	0.1
329	0.1
330	0.12
331	0.14
332	0.16
333	0.16
334	0.18
335	0.18
336	0.21
337	0.21
338	0.19
339	0.2
340	0.18
341	0.14
342	0.13
343	0.12
344	0.11
345	0.1
346	0.11
347	0.08
348	0.08
349	0.09
350	0.07
351	0.1
352	0.08
353	0.09
354	0.08
355	0.09
356	0.1
357	0.09
358	0.1
359	0.08
360	0.08
361	0.09
362	0.1
363	0.09
364	0.08
365	0.08
366	0.08
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.07
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.08
395	0.1
396	0.1
397	0.13
398	0.14
399	0.15
400	0.16
401	0.17
402	0.15
403	0.14
404	0.13
405	0.12
406	0.11
407	0.1
408	0.08
409	0.07
410	0.07
411	0.06
412	0.06
413	0.05
414	0.04
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.09
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.1
423	0.09
424	0.1
425	0.1
426	0.06
427	0.07
428	0.07
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.07
434	0.07
435	0.08
436	0.11
437	0.12
438	0.14
439	0.16
440	0.22
441	0.24
442	0.26
443	0.3
444	0.29
445	0.29
446	0.29
447	0.28
448	0.21
449	0.18
450	0.16
451	0.12
452	0.11
453	0.09
454	0.07
455	0.06
456	0.06
457	0.05
458	0.06
459	0.06
460	0.07
461	0.08
462	0.07
463	0.08
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.08
468	0.1
469	0.12
470	0.16
471	0.17
472	0.17
473	0.18
474	0.17
475	0.17
476	0.17
477	0.14
478	0.11
479	0.1
480	0.09
481	0.08
482	0.07
483	0.06
484	0.03
485	0.03
486	0.03
487	0.03
488	0.03
489	0.03
490	0.03
491	0.03
492	0.03
493	0.03
494	0.03
495	0.03
496	0.03
497	0.03
498	0.03
499	0.03
500	0.03
501	0.03
502	0.04
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.05
508	0.05
509	0.06
510	0.05
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.08
515	0.07
516	0.07
517	0.07
518	0.06
519	0.06
520	0.05
521	0.05
522	0.03
523	0.03
524	0.03
525	0.03
526	0.04
527	0.05
528	0.05
529	0.1
530	0.11
531	0.13
532	0.2
533	0.3
534	0.36
535	0.43
536	0.46
537	0.44
538	0.49
539	0.54
540	0.49
541	0.45
542	0.42
543	0.4
544	0.43
545	0.42
546	0.39
547	0.37
548	0.36
549	0.32
550	0.35
551	0.31
552	0.27
553	0.32
554	0.37
555	0.38
556	0.42
557	0.4
558	0.35
559	0.34
560	0.32
561	0.27
562	0.22
563	0.16
564	0.1
565	0.1
566	0.09
567	0.08
568	0.07
569	0.05
570	0.03
571	0.03
572	0.03
573	0.03
574	0.03
575	0.04
576	0.04
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.06
581	0.07
582	0.13
583	0.13
584	0.13
585	0.14
586	0.15
587	0.16
588	0.16
589	0.16
590	0.1
591	0.11
592	0.11
593	0.09
594	0.09
595	0.08
596	0.06
597	0.06
598	0.06
599	0.04
600	0.05
601	0.04
602	0.05
603	0.1
604	0.12
605	0.12
606	0.13
607	0.14
608	0.15
609	0.17
610	0.17
611	0.13
612	0.13
613	0.13
614	0.12
615	0.11
616	0.1
617	0.08
618	0.07
619	0.07
620	0.06
621	0.05
622	0.05
623	0.05
624	0.06
625	0.1
626	0.1
627	0.1
628	0.11
629	0.12
630	0.11
631	0.11
632	0.1
633	0.06
634	0.07
635	0.06
636	0.06
637	0.05
638	0.05
639	0.05
640	0.06
641	0.05
642	0.04
643	0.03
644	0.03
645	0.04
646	0.04
647	0.04
648	0.03
649	0.03
650	0.03
651	0.03
652	0.03
653	0.03
654	0.03
655	0.03
656	0.03
657	0.04
658	0.04
659	0.05
660	0.04
661	0.05
662	0.05
663	0.05
664	0.05
665	0.05
666	0.05
667	0.04
668	0.04
669	0.04
670	0.04
671	0.04
672	0.04
673	0.04
674	0.04
675	0.05
676	0.05
677	0.05
678	0.05
679	0.05
680	0.05
681	0.05
682	0.05
683	0.05
684	0.05
685	0.05
686	0.08
687	0.08
688	0.1
689	0.1
690	0.1
691	0.12
692	0.13
693	0.23
694	0.23
695	0.28
696	0.29
697	0.33
698	0.33
699	0.33
700	0.35
701	0.29
702	0.34
703	0.3
704	0.29
705	0.29
706	0.29
707	0.27
708	0.24
709	0.19
710	0.11
711	0.1
712	0.08
713	0.05
714	0.05
715	0.06
716	0.06
717	0.06
718	0.08
719	0.09
720	0.12
721	0.19
722	0.21
723	0.28
724	0.33
725	0.35
726	0.36
727	0.36
728	0.35
729	0.32
730	0.29
731	0.24
732	0.21
733	0.21
734	0.19
735	0.18
736	0.16
737	0.13
738	0.13
739	0.1
740	0.09
741	0.07
742	0.08
743	0.08
744	0.08
745	0.1
746	0.1
747	0.11
748	0.1
749	0.1
750	0.1
751	0.1
752	0.1
753	0.08
754	0.07
755	0.07
756	0.08
757	0.07
758	0.07
759	0.08
760	0.07
761	0.07
762	0.07
763	0.07
764	0.07
765	0.1
766	0.09
767	0.09
768	0.1
769	0.11
770	0.11
771	0.15
772	0.15
773	0.12
774	0.13
775	0.13
776	0.17
777	0.17
778	0.19
779	0.17
780	0.23
781	0.29
782	0.32
783	0.37
784	0.36
785	0.4
786	0.41
787	0.49
788	0.52
789	0.55
790	0.57
791	0.52
792	0.52
793	0.51
794	0.47
795	0.37
796	0.27
797	0.19
798	0.15
799	0.15
800	0.14
801	0.13
802	0.13
803	0.13
804	0.14
805	0.12
806	0.13
807	0.14
808	0.17
809	0.23
810	0.29
811	0.36
812	0.42
813	0.48
814	0.51
815	0.54
816	0.53
817	0.53
818	0.5
819	0.45
820	0.39
821	0.32
822	0.29
823	0.24
824	0.19
825	0.12
826	0.09
827	0.07
828	0.07
829	0.07
830	0.07
831	0.07
832	0.06
833	0.07
834	0.07
835	0.08
836	0.09
837	0.13
838	0.13
839	0.14
840	0.16
841	0.15
842	0.16
843	0.18
844	0.18
845	0.17
846	0.18
847	0.16
848	0.17
849	0.18
850	0.18
851	0.23
852	0.21
853	0.21
854	0.21
855	0.22
856	0.21
857	0.2
858	0.19
859	0.12
860	0.12
861	0.1
862	0.09
863	0.09
864	0.1
865	0.11
866	0.12
867	0.11
868	0.1
869	0.1
870	0.09
871	0.09
872	0.07
873	0.06
874	0.06
875	0.06
876	0.07
877	0.08
878	0.11
879	0.11
880	0.12
881	0.14
882	0.14
883	0.15
884	0.17
885	0.17
886	0.14
887	0.13
888	0.12
889	0.1
890	0.08
891	0.07
892	0.04
893	0.03
894	0.03
895	0.03
896	0.03
897	0.05
898	0.07
899	0.09
900	0.1
901	0.1
902	0.12
903	0.13
904	0.16
905	0.17
906	0.22
907	0.26
908	0.28
909	0.31
910	0.32
911	0.33
912	0.31
913	0.29
914	0.21
915	0.18
916	0.15
917	0.13
918	0.11
919	0.1
920	0.09
921	0.1
922	0.11
923	0.11
924	0.12
925	0.1
926	0.1
927	0.11
928	0.14
929	0.15
930	0.16
931	0.15
932	0.15
933	0.17
934	0.17
935	0.14
936	0.13
937	0.1
938	0.1
939	0.11
940	0.11
941	0.09
942	0.1
943	0.1
944	0.11
945	0.1
946	0.12
947	0.11
948	0.1
949	0.1
950	0.09
951	0.09
952	0.09
953	0.11
954	0.17
955	0.25
956	0.28
957	0.34
958	0.39
959	0.47
960	0.51
961	0.59
962	0.61
963	0.63
964	0.71
965	0.77
966	0.83
967	0.83
968	0.87
969	0.85
970	0.8
971	0.74
972	0.64
973	0.54
974	0.46
975	0.4
976	0.33
977	0.28
978	0.23
979	0.19
980	0.18
981	0.18
982	0.15
983	0.13
984	0.11
985	0.09
986	0.08
987	0.09
988	0.09
989	0.08
990	0.08
991	0.08
992	0.08
993	0.1
994	0.1
995	0.09
996	0.13
997	0.16
998	0.2
999	0.23
1000	0.25
1001	0.24
1002	0.3
1003	0.32
1004	0.3
1005	0.29
1006	0.24
1007	0.22
1008	0.2
1009	0.22
1010	0.17
1011	0.17
1012	0.18
1013	0.17
1014	0.16
1015	0.16
1016	0.16
1017	0.15
1018	0.2
1019	0.22
1020	0.19
1021	0.19
1022	0.19
1023	0.19
1024	0.19
1025	0.18
1026	0.11
1027	0.08
1028	0.08
1029	0.07
1030	0.07
1031	0.07
1032	0.08
1033	0.07
1034	0.08
1035	0.09
1036	0.09
1037	0.1
1038	0.1
1039	0.14
1040	0.14
1041	0.15
1042	0.16
1043	0.15
1044	0.18
1045	0.18
1046	0.19
1047	0.16
1048	0.17
1049	0.15
1050	0.15
1051	0.14
1052	0.12
1053	0.12
1054	0.11
1055	0.1
1056	0.09
1057	0.09
1058	0.1
1059	0.14
1060	0.15
1061	0.18
1062	0.19
1063	0.21
1064	0.24
1065	0.23
1066	0.24
1067	0.28
1068	0.3
1069	0.29
1070	0.28
1071	0.27
1072	0.26
1073	0.27
1074	0.27
1075	0.22
1076	0.19
1077	0.16
1078	0.15
1079	0.14
1080	0.15
1081	0.13
1082	0.11
1083	0.09
1084	0.1
1085	0.12
1086	0.13
1087	0.13
1088	0.12
1089	0.14
1090	0.15
1091	0.17
1092	0.21
1093	0.2
1094	0.19
1095	0.21
1096	0.24
1097	0.22
1098	0.2
1099	0.18
1100	0.15
1101	0.15
1102	0.14
1103	0.12
1104	0.09
1105	0.09
1106	0.09
1107	0.08
1108	0.07
1109	0.08
1110	0.08
1111	0.08
1112	0.08
1113	0.09
1114	0.13
1115	0.14
1116	0.17
1117	0.2
1118	0.19
1119	0.22
1120	0.26
1121	0.27
1122	0.27
1123	0.29
1124	0.27
1125	0.24
1126	0.25
1127	0.23
1128	0.26
1129	0.26
1130	0.27
1131	0.27
1132	0.29
1133	0.29
1134	0.37
1135	0.39
1136	0.37
1137	0.43
1138	0.45
1139	0.48
1140	0.49
1141	0.52
1142	0.49
1143	0.53
1144	0.52
1145	0.46
1146	0.42
1147	0.38
1148	0.37
1149	0.35
1150	0.34
1151	0.31
1152	0.31
1153	0.32
1154	0.34
1155	0.33
1156	0.31
1157	0.29
1158	0.28
1159	0.25
1160	0.25
1161	0.23
1162	0.2
1163	0.17
1164	0.17
1165	0.16
1166	0.2
1167	0.22
1168	0.21
1169	0.24
1170	0.26
1171	0.34
1172	0.37
1173	0.38
1174	0.32
1175	0.32
1176	0.33
1177	0.33
1178	0.37
1179	0.32
1180	0.33
1181	0.33
1182	0.33
1183	0.31
1184	0.29
1185	0.26
1186	0.24
1187	0.25
1188	0.25
1189	0.27
1190	0.28
1191	0.35
1192	0.42
1193	0.47
1194	0.51

A0A0L0HCC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer